MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007576	TTTTTA	2	12	78	89	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007576	TTTTAT	2	12	72052	72063	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007576	AAATTT	2	12	78114	78125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007576	TAAAAT	2	12	79691	79702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007576	GGTATA	2	12	99810	99821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007576	GAAAAT	2	12	143864	143875	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007576	TAAAAA	2	12	198727	198738	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007576	AATTTA	2	12	233914	233925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007576	ATAAAA	2	12	294929	294940	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007576	TAATAG	2	12	301645	301656	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007576	AACTTT	2	12	331167	331178	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_007576	CAAAGC	2	12	417416	417427	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007576	TAAAAT	2	12	425928	425939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007576	TTCTCT	2	12	437228	437239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007576	CAAGGA	2	12	444325	444336	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_007576	TTAAGT	2	12	489151	489162	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007576	TCAAAG	2	12	549856	549867	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_007576	TTAGTT	2	12	579614	579625	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007576	AAATTT	2	12	681906	681917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007576	AGTGTG	2	12	694138	694149	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007576	TTTTCA	2	12	701541	701552	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_007576	TAGTAT	2	12	722683	722694	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007576	GTCCCA	2	12	758250	758261	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007576	CATTGT	2	12	933298	933309	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_007576	GAATTC	2	12	1004168	1004179	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_007576	TTAAAT	2	12	1035318	1035329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007576	CGTTTT	2	12	1062789	1062800	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_007576	ATACAT	2	12	1142700	1142711	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_007576	TTTAAA	2	12	1173755	1173766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007576	ATTGTT	2	12	1274226	1274237	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007576	GCTTAT	2	12	1289824	1289835	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_007576	TTTCTA	2	12	1291948	1291959	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_007576	AAATTC	2	12	1348187	1348198	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_007576	AATATT	2	12	1375670	1375681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007576	ATTAAA	2	12	1416429	1416440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007576	CAAATT	2	12	1463445	1463456	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_007576	ATTAAA	2	12	1470888	1470899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007576	TTTCAG	2	12	1478752	1478763	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_007576	TGAAAA	2	12	1500429	1500440	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007576	AGGACT	2	12	1533177	1533188	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_007576	TAGTGC	2	12	1592075	1592086	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_007576	AAAAAG	2	12	1598070	1598081	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007576	CTTTTA	2	12	1609086	1609097	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_007576	AAAAAC	2	12	1615613	1615624	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_007576	TATTCT	2	12	1638517	1638528	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_007576	TCAAAG	2	12	1641355	1641366	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_007576	CTTTGA	2	12	1656919	1656930	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_007576	TTGATA	2	12	1690270	1690281	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007576	TAAAAA	2	12	1768236	1768247	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007576	GATTAT	2	12	1773273	1773284	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007576	CCCCTA	2	12	1831673	1831684	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_007576	AATTAA	2	12	1838267	1838278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007576	GATTAA	2	12	1852598	1852609	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007576	TTTTAA	2	12	1882869	1882880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.