MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 6487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_006814	TAA	2	6	1194703	1194708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_006814	TA	3	6	1194752	1194757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_006814	TCT	2	6	1194766	1194771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_006814	AAT	2	6	1194833	1194838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_006814	T	6	6	1194884	1194889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_006814	TCT	2	6	1194946	1194951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_006814	TTA	2	6	1194966	1194971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_006814	CAT	2	6	1195012	1195017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4010	NC_006814	AAT	2	6	1198494	1198499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_006814	AATTT	2	10	1198503	1198512	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_006814	T	6	6	1198510	1198515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_006814	TAA	2	6	1198532	1198537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_006814	TATT	2	8	1199899	1199906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_006814	ACA	2	6	1199942	1199947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4019	NC_006814	T	6	6	1200218	1200223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_006814	T	6	6	1201639	1201644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_006814	ATT	2	6	1203239	1203244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_006814	CAT	2	6	1203251	1203256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_006814	GAA	2	6	1203258	1203263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_006814	ACC	2	6	1203985	1203990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4025	NC_006814	ATT	2	6	1204627	1204632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_006814	TA	3	6	1204651	1204656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4031	NC_006814	ATT	3	9	1206685	1206693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_006814	ATT	2	6	1207276	1207281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_006814	TAC	2	6	1207285	1207290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4042	NC_006814	AT	3	6	1212720	1212725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_006814	T	6	6	1212752	1212757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_006814	TAA	2	6	1212787	1212792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_006814	TAA	2	6	1212815	1212820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_006814	AGG	2	6	1212824	1212829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4048	NC_006814	ATTC	2	8	1214595	1214602	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4049	NC_006814	AT	3	6	1214660	1214665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_006814	AAAG	2	8	1215796	1215803	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_006814	A	6	6	1216646	1216651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4054	NC_006814	AT	3	6	1216772	1216777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_006814	ATA	2	6	1216786	1216791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4059	NC_006814	TAT	2	6	1216939	1216944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4062	NC_006814	ATT	2	6	1217075	1217080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_006814	TTTTG	2	10	1217081	1217090	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_006814	AT	3	6	1217108	1217113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_006814	CAAAA	2	10	1217121	1217130	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4066	NC_006814	TAA	2	6	1217136	1217141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4075	NC_006814	TCTA	2	8	1220827	1220834	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4076	NC_006814	TTTC	2	8	1221568	1221575	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4082	NC_006814	TAT	3	9	1223604	1223612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4088	NC_006814	CCT	2	6	1227402	1227407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4102	NC_006814	TAG	2	6	1246556	1246561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4104	NC_006814	ATT	2	6	1247810	1247815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4106	NC_006814	T	6	6	1247875	1247880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_006814	A	6	6	1247889	1247894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_006814	A	7	7	1247905	1247911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4112	NC_006814	TAA	2	6	1248983	1248988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_006814	TCC	2	6	1248991	1248996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4114	NC_006814	A	6	6	1249012	1249017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_006814	TCC	2	6	1249807	1249812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4116	NC_006814	TTCAT	2	10	1249837	1249846	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4124	NC_006814	ATT	2	6	1251738	1251743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_006814	ATT	2	6	1251754	1251759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_006814	GGA	2	6	1251760	1251765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_006814	AAT	2	6	1252965	1252970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_006814	ATT	2	6	1252993	1252998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_006814	ATA	2	6	1254961	1254966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_006814	ATT	2	6	1254967	1254972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_006814	TAT	2	6	1254987	1254992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_006814	A	6	6	1254996	1255001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4134	NC_006814	TCAC	2	8	1258594	1258601	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4137	NC_006814	A	6	6	1258621	1258626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_006814	AC	3	6	1258653	1258658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4250	NC_006814	TAA	2	6	1315622	1315627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4260	NC_006814	T	6	6	1318414	1318419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4264	NC_006814	CTT	2	6	1320394	1320399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4265	NC_006814	T	6	6	1320487	1320492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4266	NC_006814	TAAT	2	8	1320501	1320508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4404	NC_006814	CAT	2	6	1366916	1366921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4405	NC_006814	ACTA	2	8	1366969	1366976	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4406	NC_006814	TTA	2	6	1366978	1366983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4407	NC_006814	T	6	6	1366991	1366996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4408	NC_006814	T	6	6	1367027	1367032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4409	NC_006814	ATTA	2	8	1367042	1367049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4410	NC_006814	TTTAAT	2	12	1367057	1367068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4420	NC_006814	TAAT	2	8	1371344	1371351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4433	NC_006814	ATT	2	6	1385301	1385306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4434	NC_006814	A	7	7	1385339	1385345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4436	NC_006814	A	6	6	1385394	1385399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4437	NC_006814	T	6	6	1385433	1385438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4444	NC_006814	A	6	6	1386504	1386509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4451	NC_006814	T	6	6	1386749	1386754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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