MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 6487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_006814	AGA	2	6	290604	290609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_006814	AGG	2	6	290615	290620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_006814	AGG	2	6	292534	292539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_006814	AGG	2	6	293389	293394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_006814	TTAA	2	8	293396	293403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_006814	GTA	2	6	293410	293415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_006814	A	6	6	293418	293423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_006814	AAG	2	6	293451	293456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_006814	AGGA	2	8	293689	293696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_006814	GGA	2	6	295679	295684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_006814	GGA	2	6	296317	296322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_006814	GGA	2	6	296872	296877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_006814	AGG	2	6	297078	297083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_006814	AGT	2	6	298050	298055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_006814	GAG	2	6	299164	299169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_006814	T	6	6	301600	301605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_006814	GGA	2	6	301644	301649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_006814	AGG	2	6	302021	302026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_006814	AGG	2	6	302397	302402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_006814	ACGTT	2	10	302821	302830	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1021	NC_006814	AGG	2	6	303798	303803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_006814	AAT	2	6	304200	304205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_006814	GAT	2	6	304258	304263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_006814	GAT	2	6	304286	304291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_006814	ATC	2	6	304297	304302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_006814	T	8	8	304318	304325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_006814	T	6	6	304330	304335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_006814	TAGTA	2	10	307680	307689	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_006814	GGA	2	6	307743	307748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_006814	TGT	2	6	308623	308628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_006814	ATC	2	6	309763	309768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_006814	T	6	6	311168	311173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_006814	CATTT	2	10	311186	311195	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1034	NC_006814	AT	3	6	311225	311230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_006814	T	6	6	311236	311241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_006814	ATA	2	6	311242	311247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_006814	AGA	2	6	311255	311260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1039	NC_006814	T	6	6	313270	313275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_006814	TAAT	2	8	313278	313285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_006814	T	6	6	313290	313295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_006814	T	6	6	313320	313325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_006814	TATC	2	8	313339	313346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_006814	AGT	2	6	313354	313359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_006814	TAAA	2	8	313372	313379	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_006814	CTA	2	6	313397	313402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_006814	T	6	6	313404	313409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_006814	A	6	6	314315	314320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_006814	A	6	6	317558	317563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_006814	TAT	2	6	317584	317589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_006814	AGAA	2	8	317597	317604	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_006814	TAG	2	6	317617	317622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_006814	TGTA	2	8	317640	317647	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_006814	TTA	2	6	317654	317659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_006814	TGGTTA	2	12	317696	317707	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_006814	TCTT	2	8	317733	317740	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1058	NC_006814	A	7	7	317782	317788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_006814	TAAG	2	8	317812	317819	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_006814	TAA	2	6	317867	317872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_006814	ATA	2	6	317893	317898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_006814	AATT	2	8	317904	317911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_006814	GAT	2	6	317955	317960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_006814	TA	3	6	318017	318022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_006814	T	7	7	318049	318055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_006814	TAGA	2	8	318058	318065	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_006814	TAA	2	6	318386	318391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_006814	A	6	6	318399	318404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_006814	GAA	2	6	318410	318415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_006814	AT	3	6	318417	318422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_006814	CTTT	2	8	319046	319053	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1072	NC_006814	TAT	2	6	319069	319074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_006814	CTT	2	6	319747	319752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1076	NC_006814	TTA	2	6	320586	320591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1082	NC_006814	TGG	2	6	322433	322438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1084	NC_006814	ATG	2	6	322515	322520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_006814	CAA	2	6	322544	322549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_006814	A	7	7	322552	322558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1088	NC_006814	TAG	2	6	322647	322652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_006814	TAT	2	6	322668	322673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1092	NC_006814	CCT	2	6	325572	325577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_006814	ATT	3	9	325587	325595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_006814	ATC	2	6	325621	325626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1096	NC_006814	AT	3	6	326018	326023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_006814	AAAAG	2	10	326031	326040	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_006814	AAT	2	6	329576	329581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_006814	AGA	2	6	329586	329591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_006814	CTT	2	6	329610	329615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_006814	TTTC	2	8	329616	329623	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_006814	TAAAA	2	10	329627	329636	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_006814	A	6	6	329633	329638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_006814	T	6	6	332306	332311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_006814	A	6	6	332388	332393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_006814	T	6	6	332979	332984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_006814	TAA	2	6	333009	333014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_006814	AGG	2	6	333031	333036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1114	NC_006814	T	7	7	333341	333347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_006814	TAAA	2	8	333354	333361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_006814	ATT	2	6	333383	333388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1118	NC_006814	TGT	2	6	336394	336399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_006814	ACT	2	6	336422	336427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1123	NC_006814	ATA	2	6	338261	338266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1126	NC_006814	GTTT	2	8	338360	338367	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_006814	AC	3	6	338382	338387	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_006814	AAAG	2	8	338405	338412	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_006814	GAA	2	6	338436	338441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_006814	ACT	2	6	338477	338482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_006814	TAA	2	6	338575	338580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_006814	AAT	2	6	338763	338768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_006814	TAA	2	6	338795	338800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_006814	GAA	2	6	338811	338816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_006814	T	7	7	338831	338837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_006814	TAATTA	2	12	339440	339451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_006814	GAG	2	6	339490	339495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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