MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pSF118-44

Total Repeats: 232

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006530	CAA	2	6	9	14	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_006530	CAT	2	6	77	82	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_006530	TCA	2	6	286	291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_006530	GCT	2	6	352	357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_006530	CCG	2	6	382	387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_006530	GGC	2	6	414	419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_006530	CGC	2	6	436	441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_006530	TCG	2	6	497	502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_006530	ATG	2	6	523	528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006530	AAT	2	6	582	587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006530	ACC	2	6	748	753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_006530	CGG	2	6	799	804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_006530	GTA	2	6	849	854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006530	GCA	2	6	997	1002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_006530	ATG	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006530	CTC	2	6	1732	1737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_006530	TAA	2	6	2284	2289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006530	TTA	2	6	2325	2330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006530	CAG	2	6	2342	2347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_006530	TGA	2	6	2389	2394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006530	CAT	2	6	2537	2542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_006530	AAG	2	6	2660	2665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006530	GAC	2	6	2720	2725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_006530	TGT	2	6	2815	2820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006530	GTC	2	6	2865	2870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_006530	TAA	2	6	2898	2903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006530	CGT	2	6	2913	2918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_006530	ACT	2	6	2975	2980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_006530	GCT	2	6	3003	3008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_006530	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006530	TGC	2	6	3154	3159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_006530	ATA	2	6	3206	3211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006530	AGA	2	6	4796	4801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006530	TGA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006530	CAT	2	6	5019	5024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_006530	AAG	2	6	5142	5147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006530	GAC	2	6	5202	5207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_006530	TGT	2	6	5297	5302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006530	GTC	2	6	5347	5352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_006530	TAG	2	6	5372	5377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006530	CGT	2	6	5396	5401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_006530	ACT	2	6	5458	5463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_006530	GCT	2	6	5486	5491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_006530	AGA	2	6	5548	5553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006530	TAT	2	6	5796	5801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006530	TAG	3	9	5809	5817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006530	ATA	2	6	5829	5834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006530	CAT	2	6	7244	7249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_006530	AGG	2	6	7276	7281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006530	ATA	2	6	8076	8081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006530	ATG	2	6	8083	8088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006530	GAT	2	6	8408	8413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006530	ATA	2	6	8514	8519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006530	TCT	2	6	8597	8602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_006530	AAC	2	6	8696	8701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_006530	GTT	2	6	8969	8974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006530	CAC	2	6	9040	9045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_006530	GAC	2	6	10391	10396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_006530	AGG	2	6	10663	10668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006530	AAT	2	6	12081	12086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006530	CAG	2	6	12181	12186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_006530	TGT	2	6	12235	12240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006530	ACA	2	6	12281	12286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_006530	ACA	2	6	14449	14454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_006530	CAA	2	6	14477	14482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_006530	GAA	2	6	14564	14569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006530	CCG	2	6	14670	14675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_006530	GAG	2	6	14804	14809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006530	TGA	2	6	15012	15017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006530	GAT	2	6	15375	15380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006530	ATT	2	6	15410	15415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006530	TAC	2	6	15444	15449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_006530	CTT	2	6	15483	15488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_006530	AAT	2	6	15543	15548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006530	TCT	2	6	15572	15577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_006530	ATA	2	6	17903	17908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006530	AAG	2	6	17924	17929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006530	ATT	2	6	18010	18015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006530	TCA	2	6	18029	18034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_006530	AAC	2	6	18069	18074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_006530	TCG	2	6	20743	20748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_006530	AAC	2	6	20850	20855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_006530	TGA	2	6	20880	20885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006530	TGC	2	6	20896	20901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_006530	TGT	2	6	20941	20946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006530	TCT	2	6	21130	21135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_006530	TTA	2	6	21144	21149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006530	TCG	2	6	21166	21171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_006530	GGT	2	6	21176	21181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006530	GAA	2	6	21206	21211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006530	GCC	2	6	21285	21290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_006530	GGC	2	6	21302	21307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_006530	GAT	2	6	21344	21349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006530	CGA	2	6	21475	21480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_006530	AAC	2	6	21483	21488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_006530	AGT	2	6	21525	21530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006530	CCG	2	6	21588	21593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_006530	AGT	3	9	21772	21780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006530	TGA	2	6	21844	21849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006530	TCC	2	6	21855	21860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_006530	AGG	2	6	21885	21890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006530	CGT	2	6	21998	22003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_006530	GAC	2	6	22094	22099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_006530	TGC	2	6	22140	22145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_006530	ATA	2	6	22147	22152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006530	CTT	2	6	22369	22374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_006530	TAT	2	6	22383	22388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006530	CAA	2	6	22402	22407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_006530	GTA	2	6	22443	22448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006530	ATG	3	9	23402	23410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006530	ATT	2	6	23481	23486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006530	CTT	2	6	23542	23547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_006530	TAA	2	6	23651	23656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006530	CTG	2	6	23659	23664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_006530	AAG	2	6	23744	23749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006530	ATG	2	6	23805	23810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006530	TAA	2	6	23879	23884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006530	AAT	2	6	23889	23894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006530	TTC	3	9	25329	25337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_006530	AGG	2	6	25340	25345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006530	TAA	2	6	25364	25369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006530	ACT	2	6	25431	25436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_006530	CAT	2	6	25475	25480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_006530	TGA	2	6	25487	25492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006530	TAC	2	6	25559	25564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_006530	ATT	2	6	25574	25579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006530	TTA	2	6	25611	25616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006530	CTT	2	6	25628	25633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_006530	TCT	2	6	25726	25731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_006530	AGC	2	6	25745	25750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_006530	TTG	2	6	25808	25813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006530	TTG	2	6	25866	25871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006530	GTT	2	6	25922	25927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006530	TCT	2	6	25996	26001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_006530	AAC	2	6	26075	26080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_006530	TAA	2	6	26093	26098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006530	ATC	2	6	26135	26140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_006530	GTA	2	6	26172	26177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006530	TGA	2	6	26231	26236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006530	CTT	2	6	26260	26265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_006530	TCT	2	6	26284	26289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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176	NC_006530	CCT	2	6	28335	28340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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231	NC_006530	TTA	2	6	43849	43854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_006530	TTC	2	6	43923	43928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.