MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome I

Total Repeats: 3537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005823	TCAT	2	8	23	30	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_005823	GTTT	2	8	169	176	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005823	ATTC	2	8	1625	1632	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_005823	GGTT	2	8	2116	2123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005823	TTTA	2	8	2442	2449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005823	TAAA	2	8	2591	2598	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005823	AATT	2	8	2821	2828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005823	AAAT	2	8	3057	3064	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005823	TTAA	2	8	3250	3257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005823	GATT	2	8	13595	13602	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005823	TTCT	2	8	13781	13788	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_005823	TGTA	2	8	14871	14878	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005823	ACTT	2	8	15022	15029	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_005823	TAAA	2	8	19907	19914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005823	AAAG	2	8	21784	21791	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005823	TGTT	2	8	24053	24060	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005823	AATT	2	8	25920	25927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005823	GTTT	2	8	26087	26094	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005823	TAGT	2	8	26442	26449	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005823	ATAA	2	8	26664	26671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005823	TTCA	2	8	27138	27145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_005823	AGAC	2	8	27280	27287	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_005823	AATT	2	8	27396	27403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005823	TTAA	2	8	27483	27490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005823	TAAT	2	8	27935	27942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005823	GAAT	2	8	27966	27973	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005823	TTTC	2	8	28107	28114	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_005823	ATGA	2	8	28141	28148	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005823	GTTT	2	8	31545	31552	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005823	ACAG	2	8	32019	32026	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_005823	AATT	2	8	32197	32204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005823	GTTT	2	8	33979	33986	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005823	ATGT	2	8	37116	37123	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005823	AATT	2	8	37365	37372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005823	TCTT	2	8	37497	37504	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_005823	CTTT	2	8	39625	39632	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_005823	GAAA	2	8	39634	39641	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005823	TTAA	2	8	39643	39650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005823	AAAT	2	8	44179	44186	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005823	CCAT	2	8	44326	44333	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_005823	AATT	2	8	48206	48213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005823	TTTA	2	8	51038	51045	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005823	AATT	2	8	51662	51669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005823	GAAT	2	8	51834	51841	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005823	CAGG	2	8	54090	54097	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_005823	GATT	2	8	54302	54309	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005823	CTTA	2	8	62522	62529	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_005823	AAAT	2	8	67879	67886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005823	TTCT	2	8	68998	69005	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_005823	GGCA	2	8	71533	71540	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_005823	ATGT	2	8	71582	71589	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005823	AAGA	2	8	79234	79241	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005823	ATTT	2	8	79587	79594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005823	AAAT	2	8	83167	83174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005823	AAAT	2	8	83385	83392	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005823	CGAG	2	8	86682	86689	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_005823	ATTT	2	8	92684	92691	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005823	TTTA	2	8	94600	94607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005823	GATT	2	8	94887	94894	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005823	TGGG	2	8	95084	95091	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005823	GGTT	2	8	95273	95280	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005823	TGAT	2	8	95344	95351	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005823	AGAA	2	8	95786	95793	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005823	AATT	2	8	98898	98905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005823	AAAC	2	8	99360	99367	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_005823	TAGA	2	8	100697	100704	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005823	AATT	2	8	101998	102005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005823	TACT	2	8	103073	103080	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_005823	CGTA	2	8	103311	103318	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_005823	TATT	2	8	103555	103562	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005823	AACA	2	8	103752	103759	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_005823	TATT	2	8	109520	109527	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005823	ATTT	2	8	109593	109600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005823	TAAC	2	8	109773	109780	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_005823	ACTT	2	8	109902	109909	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_005823	TCAA	2	8	113152	113159	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_005823	GTTT	2	8	114238	114245	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005823	TTTA	2	8	119234	119241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005823	TCGA	2	8	119445	119452	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_005823	AATT	2	8	119477	119484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005823	CATT	2	8	119877	119884	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_005823	TTAA	2	8	120058	120065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005823	TAAA	2	8	120103	120110	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005823	TGAA	2	8	122770	122777	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005823	TTTA	2	8	125030	125037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005823	TCAT	2	8	126572	126579	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_005823	TAAA	2	8	126697	126704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005823	ACTT	2	8	126820	126827	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_005823	AATT	2	8	126848	126855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005823	TGTT	2	8	128928	128935	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005823	TGTT	2	8	129107	129114	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005823	TGTT	2	8	129286	129293	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005823	TGTT	2	8	129465	129472	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005823	TGTT	2	8	129644	129651	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005823	TGTT	2	8	129823	129830	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005823	TTTC	2	8	131995	132002	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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99	NC_005823	TTCT	2	8	134165	134172	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_005823	ATTG	2	8	136070	136077	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005823	TTAC	2	8	136676	136683	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_005823	TTTA	2	8	137903	137910	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005823	ATTT	2	8	138658	138665	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005823	AATA	2	8	139487	139494	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005823	TAAT	2	8	139532	139539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005823	ATTT	2	8	150548	150555	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005823	AATT	2	8	150727	150734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005823	TTCT	2	8	154360	154367	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_005823	GTTT	2	8	156806	156813	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005823	AAAC	2	8	157020	157027	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_005823	AGAA	2	8	159343	159350	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005823	TAAA	2	8	166004	166011	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005823	AAAT	2	8	166185	166192	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005823	TAAG	2	8	166515	166522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005823	ATAA	2	8	166834	166841	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005823	AATT	2	8	169715	169722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005823	GTAG	2	8	169905	169912	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005823	GTTG	2	8	172418	172425	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005823	CAAA	2	8	173100	173107	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_005823	GTTT	2	8	173157	173164	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005823	CAAA	2	8	173317	173324	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_005823	TCAA	2	8	175516	175523	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_005823	GATT	2	8	176001	176008	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005823	TTCC	2	8	177351	177358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_005823	CTTT	2	8	177379	177386	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_005823	TAAA	2	8	178637	178644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005823	AAAT	2	8	178672	178679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005823	AGAA	2	8	179333	179340	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005823	ATAG	2	8	179368	179375	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005823	TAAA	2	8	179476	179483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005823	ATCT	2	8	179650	179657	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_005823	ATAA	2	8	179665	179672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_005823	CTTA	2	8	179771	179778	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_005823	GAAA	2	8	179779	179786	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005823	CTTT	2	8	183522	183529	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_005823	ATAA	2	8	183573	183580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005823	TTCG	2	8	184513	184520	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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139	NC_005823	AATT	2	8	190759	190766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_005823	ATTT	2	8	190971	190978	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_005823	TTTA	2	8	193521	193528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_005823	TTCT	2	8	196258	196265	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_005823	TTTA	2	8	196327	196334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_005823	TGAA	2	8	196958	196965	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_005823	ATTG	2	8	199107	199114	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_005823	ATTA	2	8	199235	199242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_005823	ATTT	2	8	201251	201258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_005823	GTTT	2	8	201705	201712	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_005823	TCGC	2	8	206078	206085	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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