MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome I

Total Repeats: 23572

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005823	TCAT	2	8	23	30	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_005823	GTTT	2	8	169	176	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005823	CTT	2	6	184	189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_005823	T	7	7	247	253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005823	TA	3	6	264	269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005823	AG	4	8	280	287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005823	ATTC	2	8	1625	1632	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_005823	TAT	2	6	1688	1693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005823	A	6	6	1755	1760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005823	TAA	2	6	1788	1793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005823	AGT	2	6	1799	1804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005823	TCA	2	6	1814	1819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_005823	C	6	6	1986	1991	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14	NC_005823	TCA	2	6	2011	2016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_005823	AGA	2	6	2063	2068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005823	CGA	2	6	2083	2088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_005823	ATT	2	6	2105	2110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005823	GGTT	2	8	2116	2123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005823	AGT	2	6	2195	2200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005823	T	9	9	2241	2249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005823	T	7	7	2289	2295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005823	AAG	2	6	2334	2339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005823	TATAA	2	10	2368	2377	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005823	CAA	2	6	2396	2401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_005823	TGA	2	6	2431	2436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005823	TTTA	2	8	2442	2449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005823	ATG	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005823	AAT	2	6	2564	2569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005823	TAAA	2	8	2591	2598	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005823	TA	3	6	2607	2612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005823	TCA	2	6	2678	2683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_005823	GTA	2	6	2691	2696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005823	TAC	2	6	2710	2715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_005823	GTT	2	6	2743	2748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005823	AATT	2	8	2821	2828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005823	TAT	2	6	2849	2854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005823	ATT	2	6	2915	2920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005823	TA	3	6	3013	3018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005823	TAA	2	6	3025	3030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005823	A	6	6	3049	3054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005823	AAAT	2	8	3057	3064	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005823	ATT	2	6	3088	3093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005823	GAAAA	2	10	3132	3141	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005823	A	8	8	3152	3159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005823	TAC	2	6	3214	3219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_005823	AAT	2	6	3234	3239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005823	TTAA	2	8	3250	3257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005823	A	7	7	3272	3278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005823	TAT	2	6	4404	4409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005823	TAT	2	6	4415	4420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005823	ATA	2	6	4421	4426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005823	TTTAA	2	10	4481	4490	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005823	TAT	2	6	4567	4572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005823	GTTTT	2	10	4576	4585	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005823	A	6	6	4625	4630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005823	TA	3	6	4660	4665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005823	A	7	7	4698	4704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005823	TTA	2	6	4750	4755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005823	AGA	2	6	4890	4895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005823	T	6	6	4909	4914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005823	TAT	2	6	5055	5060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005823	CAT	2	6	12570	12575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_005823	A	6	6	13473	13478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005823	T	6	6	13500	13505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005823	TCT	2	6	13523	13528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_005823	T	6	6	13528	13533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005823	A	6	6	13569	13574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005823	GATT	2	8	13595	13602	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005823	CA	3	6	13682	13687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_005823	ACT	2	6	13717	13722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_005823	TTCT	2	8	13781	13788	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_005823	TGTA	2	8	14871	14878	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005823	A	6	6	14930	14935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005823	ACA	2	6	14942	14947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_005823	ACTT	2	8	15022	15029	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_005823	T	7	7	15044	15050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005823	A	7	7	15056	15062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005823	ACT	2	6	15071	15076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_005823	ATA	2	6	15098	15103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005823	A	7	7	15123	15129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005823	A	6	6	15156	15161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005823	AT	3	6	15188	15193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005823	CTA	2	6	15792	15797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_005823	A	6	6	15802	15807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005823	T	6	6	15838	15843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005823	T	6	6	19412	19417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005823	A	7	7	19461	19467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005823	GTT	2	6	19493	19498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005823	ATTTA	2	10	19522	19531	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005823	T	6	6	19628	19633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005823	AAC	2	6	19634	19639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_005823	TTA	2	6	19845	19850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005823	TAAA	2	8	19907	19914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005823	T	7	7	19927	19933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005823	ATAAA	2	10	19952	19961	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005823	AGATT	2	10	19970	19979	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005823	GCCTT	2	10	20770	20779	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_005823	GTT	2	6	21714	21719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005823	TAT	2	6	21751	21756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005823	AAAG	2	8	21784	21791	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005823	AT	3	6	21812	21817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005823	AGA	2	6	21822	21827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005823	A	6	6	21827	21832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005823	TA	3	6	23769	23774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005823	TTG	2	6	23781	23786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005823	AAC	2	6	23870	23875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_005823	TGA	2	6	23878	23883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005823	T	7	7	23936	23942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005823	TAA	2	6	23958	23963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005823	TGTT	2	8	24053	24060	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005823	A	7	7	24103	24109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005823	TCT	2	6	24164	24169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_005823	AATT	2	8	25920	25927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005823	A	6	6	25961	25966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005823	TTC	2	6	25992	25997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_005823	GTA	2	6	26051	26056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005823	GTTT	2	8	26087	26094	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005823	ATG	2	6	26100	26105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005823	GAA	2	6	26134	26139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005823	T	6	6	26175	26180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005823	TGA	2	6	26217	26222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005823	GAT	3	9	26261	26269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005823	TAG	2	6	26285	26290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005823	T	6	6	26351	26356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005823	TAAAA	2	10	26372	26381	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005823	TAGT	2	8	26442	26449	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005823	ATT	2	6	26473	26478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005823	ATA	2	6	26638	26643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005823	ATAA	2	8	26664	26671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005823	AAT	2	6	26687	26692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005823	TAC	2	6	26714	26719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_005823	TAT	2	6	26720	26725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_005823	T	6	6	27107	27112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_005823	TTCA	2	8	27138	27145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_005823	TTA	2	6	27158	27163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005823	T	6	6	27173	27178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005823	ATA	2	6	27181	27186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005823	GTT	2	6	27209	27214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_005823	AGAC	2	8	27280	27287	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_005823	ATT	2	6	27295	27300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005823	ACT	2	6	27353	27358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_005823	AATT	2	8	27396	27403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_005823	TAT	2	6	27466	27471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_005823	ACTAA	2	10	27472	27481	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_005823	TTAA	2	8	27483	27490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_005823	ATA	2	6	27528	27533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_005823	A	6	6	27580	27585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_005823	TAT	2	6	27646	27651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_005823	TAT	2	6	27763	27768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_005823	CA	3	6	27879	27884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_005823	TTG	2	6	27917	27922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_005823	TAAT	2	8	27935	27942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_005823	GAAT	2	8	27966	27973	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_005823	TTA	2	6	28006	28011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_005823	ATGA	2	8	28141	28148	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
158	NC_005823	T	6	6	29240	29245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_005823	T	6	6	31874	31879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_005823	AAT	2	6	31902	31907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_005823	CTT	2	6	32013	32018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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169	NC_005823	A	7	7	32058	32064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_005823	TAT	2	6	32070	32075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_005823	T	6	6	32078	32083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_005823	A	6	6	32084	32089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_005823	ATT	2	6	32099	32104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_005823	T	6	6	34038	34043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_005823	A	6	6	37152	37157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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295	NC_005823	GGA	2	6	71595	71600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_005823	TAAC	2	8	109773	109780	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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