MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii NCC 533

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005362	TTTTTA	2	12	25596	25607	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005362	TAAAAT	2	12	29064	29075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005362	ATATTT	2	12	35847	35858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005362	AAAAAT	2	12	94851	94862	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005362	CTTTTT	2	12	122363	122374	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_005362	ATAGCA	2	12	197491	197502	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_005362	TATTTT	2	12	218789	218800	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005362	TATAAA	2	12	227018	227029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005362	GAAAAG	2	12	269201	269212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005362	GAAAAA	2	12	271276	271287	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005362	AGATTG	2	12	283892	283903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005362	CTTTTT	2	12	297205	297216	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_005362	GTAATA	2	12	340506	340517	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005362	TCATGG	2	12	400581	400592	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_005362	AGTTAA	2	12	422792	422803	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005362	TATAAG	2	12	441339	441350	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005362	AAAATA	2	12	484083	484094	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005362	AGTCAA	2	12	485204	485215	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_005362	TTTTTG	2	12	492291	492302	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005362	ATATTA	2	12	494734	494745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005362	CAATTT	2	12	505280	505291	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_005362	CGGAGC	2	12	561019	561030	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_005362	TTTAAC	2	12	576005	576016	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_005362	GGAACT	2	12	579397	579408	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_005362	TAAAAA	2	12	613125	613136	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005362	ATTTAA	2	12	650710	650721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005362	TATTTT	2	12	654090	654101	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005362	TTATTT	2	12	689233	689244	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005362	TAAAAT	2	12	699766	699777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005362	TCAATT	2	12	711938	711949	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_005362	ACATTT	2	12	712060	712071	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_005362	ATTTAA	2	12	742169	742180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005362	ATGGTG	2	12	798640	798651	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005362	TTTTTA	2	12	830983	830994	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005362	TGAAAT	2	12	835388	835399	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005362	AATTAT	2	12	866863	866874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005362	TTTTAT	2	12	888089	888100	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005362	TAATAT	2	12	905674	905685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005362	TCTAAT	2	12	944066	944077	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_005362	AAATTA	2	12	952234	952245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005362	AAATAA	2	12	1054582	1054593	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005362	TTGATT	2	12	1089575	1089586	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005362	TAAAAT	2	12	1105087	1105098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005362	TTAATT	2	12	1146966	1146977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005362	AATATA	2	12	1149503	1149514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005362	CCACTA	2	12	1174803	1174814	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_005362	AAAAAG	2	12	1223181	1223192	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005362	ATCAAA	2	12	1227268	1227279	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_005362	AAAAGA	2	12	1332491	1332502	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005362	CAATAT	2	12	1397871	1397882	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_005362	CTTTTT	2	12	1443239	1443250	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_005362	TAAAAT	2	12	1454274	1454285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005362	GCTTAT	2	12	1479754	1479765	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_005362	ATTTAT	2	12	1562948	1562959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005362	GCTCCG	2	12	1662224	1662235	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_005362	ATGATA	2	12	1666035	1666046	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005362	GCTCCG	2	12	1668891	1668902	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_005362	TAATTT	2	12	1678457	1678468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005362	ATGATA	2	12	1680484	1680495	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005362	GCTCCG	2	12	1683340	1683351	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_005362	AAAATA	2	12	1709153	1709164	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005362	ATATAA	2	12	1710731	1710742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005362	TAAAAT	2	12	1742029	1742040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005362	ACTTTA	2	12	1785225	1785236	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_005362	CAAGAG	2	12	1796657	1796668	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_005362	ATTCAT	2	12	1834031	1834042	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_005362	AAAAGA	2	12	1851959	1851970	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005362	TACCTT	2	12	1855214	1855225	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_005362	GCTCCG	2	12	1881760	1881771	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_005362	GCTCCG	2	12	1887275	1887286	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_005362	AATTAA	2	12	1891845	1891856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005362	TTTATC	2	12	1903858	1903869	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_005362	GAAATA	2	12	1925345	1925356	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005362	AAACTT	2	12	1992507	1992518	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.