MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii NCC 533

Total Repeats: 798

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005362	TAAA	2	8	1505	1512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005362	TGCT	2	8	11004	11011	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_005362	AAGC	2	8	11025	11032	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_005362	AGGA	2	8	11096	11103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005362	ATTA	2	8	14994	15001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005362	TAAT	2	8	21242	21249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005362	AGAT	2	8	22685	22692	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005362	TTCA	2	8	23664	23671	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_005362	AAAG	2	8	25467	25474	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005362	TAGG	2	8	28130	28137	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005362	TTTC	2	8	30745	30752	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_005362	TAAT	2	8	30987	30994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005362	AGAT	2	8	32822	32829	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005362	TTTA	2	8	33682	33689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005362	TGGC	2	8	37668	37675	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_005362	TAAT	2	8	44320	44327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005362	AATC	2	8	44418	44425	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_005362	TAGC	2	8	44449	44456	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_005362	AATC	2	8	44459	44466	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_005362	ATTA	2	8	51361	51368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005362	GAAA	2	8	51447	51454	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005362	CTTT	2	8	54012	54019	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_005362	TAAG	2	8	55942	55949	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005362	AGAT	2	8	55978	55985	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005362	AAAT	2	8	70481	70488	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005362	AAAT	2	8	76626	76633	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005362	CTAA	2	8	79802	79809	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_005362	TTCT	2	8	81179	81186	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_005362	TAAG	2	8	81268	81275	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005362	AATG	2	8	81308	81315	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005362	GATT	2	8	81369	81376	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005362	GGTA	2	8	81436	81443	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005362	ATTA	2	8	85872	85879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005362	TAAA	2	8	94886	94893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005362	TTTA	2	8	96301	96308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005362	TAAA	2	8	98238	98245	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005362	CTTT	2	8	108528	108535	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_005362	AAAT	2	8	108653	108660	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005362	TAAA	2	8	111183	111190	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005362	GAAA	2	8	111323	111330	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005362	ATTT	2	8	111331	111338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005362	ATTT	2	8	111423	111430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005362	CTTT	2	8	113841	113848	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_005362	TAAA	2	8	113916	113923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005362	GTTA	2	8	113926	113933	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005362	AAAC	2	8	119564	119571	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_005362	TAAA	2	8	119595	119602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005362	ACGC	2	8	119677	119684	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_005362	AAGG	2	8	122866	122873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005362	TTAA	2	8	123956	123963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005362	ACAA	2	8	124048	124055	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_005362	AATT	2	8	124067	124074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005362	ATTA	2	8	125566	125573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005362	AAGG	2	8	126353	126360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005362	AACA	2	8	126644	126651	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_005362	AAGT	2	8	127304	127311	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005362	ATTA	2	8	127435	127442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005362	AATT	2	8	140670	140677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005362	TAAG	2	8	144748	144755	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005362	TAAT	2	8	148854	148861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005362	GATC	2	8	149465	149472	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_005362	GAAC	2	8	149554	149561	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_005362	TAAA	2	8	150743	150750	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005362	TTAG	2	8	150753	150760	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005362	TTTG	2	8	176994	177001	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005362	TTTA	2	8	177007	177014	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005362	ATTT	2	8	177027	177034	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005362	AATA	2	8	180949	180956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005362	ATTA	2	8	181068	181075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005362	ATAA	2	8	183122	183129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005362	CTTA	2	8	184818	184825	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_005362	ATTA	2	8	184934	184941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005362	ATTT	2	8	184974	184981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005362	ATCA	2	8	184988	184995	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_005362	ATAA	2	8	185188	185195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005362	TGTT	2	8	185588	185595	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005362	GGAG	2	8	185646	185653	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005362	TATC	2	8	195491	195498	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_005362	TAGT	2	8	196097	196104	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005362	AATT	2	8	197216	197223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005362	CTAT	2	8	197623	197630	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_005362	AGTA	2	8	198106	198113	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005362	AAAG	2	8	198144	198151	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005362	TGAT	2	8	198184	198191	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005362	GTAA	2	8	199772	199779	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005362	AATT	2	8	200587	200594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005362	GTGG	2	8	207618	207625	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005362	TGAA	2	8	212663	212670	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005362	TAAG	2	8	220168	220175	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005362	TGTC	2	8	220673	220680	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_005362	TCTA	2	8	220685	220692	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_005362	TAGA	2	8	223368	223375	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005362	AGCA	2	8	223428	223435	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_005362	GTTA	2	8	224149	224156	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005362	ATTT	2	8	227147	227154	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005362	CTTT	2	8	229611	229618	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_005362	CAGC	2	8	232009	232016	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_005362	TGTT	2	8	232118	232125	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005362	GATA	2	8	238727	238734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005362	ATCT	2	8	241251	241258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_005362	AAAC	2	8	245908	245915	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_005362	TAAA	2	8	245953	245960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005362	ATTG	2	8	250061	250068	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005362	TTTG	2	8	253668	253675	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005362	AAAT	2	8	256736	256743	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005362	AATT	2	8	263077	263084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005362	AATG	2	8	271257	271264	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005362	AAAG	2	8	271350	271357	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005362	ATTT	2	8	273058	273065	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005362	ATAA	2	8	275396	275403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005362	AATT	2	8	275963	275970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005362	TTTG	2	8	276330	276337	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005362	AATA	2	8	277675	277682	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005362	TGAT	2	8	282714	282721	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005362	TAAT	2	8	283874	283881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005362	TTAT	2	8	284672	284679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005362	ATTA	2	8	284683	284690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005362	AGTA	2	8	284797	284804	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005362	TAAA	2	8	284823	284830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005362	TTAC	2	8	285191	285198	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_005362	TATT	2	8	285955	285962	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005362	TAAA	2	8	285977	285984	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005362	CATC	2	8	286477	286484	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_005362	AGTA	2	8	287356	287363	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005362	TATT	2	8	287460	287467	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005362	TACT	2	8	288913	288920	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_005362	GCTG	2	8	297160	297167	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_005362	TATT	2	8	297170	297177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005362	TAGG	2	8	302136	302143	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005362	ATTT	2	8	302148	302155	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005362	AAGC	2	8	306592	306599	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_005362	CTTC	2	8	308434	308441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_005362	ATTT	2	8	308452	308459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_005362	TAAT	2	8	309720	309727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005362	GTAA	2	8	309733	309740	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005362	AATA	2	8	332589	332596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005362	TAGA	2	8	334083	334090	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005362	ACTG	2	8	334791	334798	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_005362	ATGT	2	8	338015	338022	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005362	TTTA	2	8	339870	339877	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005362	TGAC	2	8	340037	340044	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_005362	TTTG	2	8	340677	340684	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_005362	AATT	2	8	340812	340819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_005362	GTAG	2	8	341113	341120	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_005362	GTAA	2	8	352620	352627	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_005362	ATTA	2	8	364838	364845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_005362	AATT	2	8	367169	367176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_005362	TTAC	2	8	367244	367251	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_005362	AATT	2	8	367815	367822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_005362	ATAA	2	8	367945	367952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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