MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii NCC 533

Total Repeats: 2778

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005362	TAA	2	6	1370	1375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005362	TTA	2	6	1406	1411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005362	CTA	3	9	1472	1480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_005362	AGG	2	6	1534	1539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005362	AGA	2	6	2941	2946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005362	TAA	3	9	8725	8733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005362	ATT	2	6	8816	8821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005362	AGG	2	6	8867	8872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005362	ATT	2	6	8877	8882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005362	TAA	2	6	10007	10012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005362	TAT	2	6	10055	10060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005362	AAG	2	6	10063	10068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005362	GAT	2	6	11019	11024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005362	TGA	2	6	11074	11079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005362	TAT	2	6	17186	17191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005362	CTT	2	6	17266	17271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_005362	TTA	2	6	19351	19356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005362	ATT	2	6	19382	19387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005362	TAA	2	6	19461	19466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005362	ATG	2	6	19540	19545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005362	GAG	2	6	21118	21123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005362	GAA	2	6	21124	21129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005362	ATT	2	6	21203	21208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005362	ATA	2	6	21218	21223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005362	ATC	2	6	21281	21286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_005362	ATG	2	6	21352	21357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005362	TAT	2	6	21465	21470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005362	TTA	2	6	22699	22704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005362	AGG	2	6	23704	23709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005362	TAT	2	6	24501	24506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005362	TTA	2	6	24507	24512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005362	TAA	2	6	24527	24532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005362	ATG	2	6	25449	25454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005362	TAA	2	6	25509	25514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005362	AAG	2	6	25522	25527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005362	ATG	2	6	25616	25621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005362	GGT	2	6	25627	25632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005362	ATT	2	6	28111	28116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005362	TGT	2	6	28119	28124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005362	TTA	2	6	28200	28205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005362	ATA	2	6	28209	28214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005362	TCC	2	6	29004	29009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_005362	ATA	2	6	29010	29015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005362	GAA	2	6	29115	29120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005362	ATA	2	6	30761	30766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005362	TAA	2	6	30853	30858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005362	GCC	2	6	30859	30864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_005362	TAA	2	6	31000	31005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005362	CTT	2	6	31027	31032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_005362	TTA	2	6	31098	31103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005362	ATG	2	6	31186	31191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005362	GAA	2	6	31200	31205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005362	AAT	3	9	33673	33681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005362	GAT	2	6	33713	33718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005362	AAT	2	6	33719	33724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005362	TAA	2	6	33736	33741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005362	TAA	2	6	33746	33751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005362	ACA	2	6	33761	33766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_005362	ATT	2	6	33769	33774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005362	TGC	2	6	35723	35728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_005362	AAT	2	6	35751	35756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005362	ATT	2	6	35777	35782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005362	TAG	2	6	35820	35825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005362	CGA	2	6	35869	35874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_005362	CTT	2	6	37318	37323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_005362	GTT	2	6	37334	37339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005362	AGA	2	6	37359	37364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005362	ATA	2	6	37376	37381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005362	CTA	2	6	37397	37402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_005362	TAA	2	6	37420	37425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005362	ACT	2	6	37528	37533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_005362	ATC	2	6	37699	37704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_005362	CAT	2	6	37786	37791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_005362	TTG	2	6	39596	39601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005362	ATT	2	6	39626	39631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005362	TAA	2	6	39633	39638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005362	ATT	2	6	39652	39657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005362	TTC	2	6	40626	40631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_005362	AAT	2	6	40661	40666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005362	ATA	2	6	40679	40684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005362	ACA	2	6	40690	40695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_005362	AAT	2	6	42099	42104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005362	GCT	2	6	42120	42125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_005362	TGT	2	6	43184	43189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005362	TGA	2	6	44274	44279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005362	TTA	2	6	44340	44345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005362	AGG	2	6	44689	44694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005362	GGC	2	6	45038	45043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_005362	AGA	2	6	45956	45961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005362	TCT	2	6	45971	45976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_005362	ATA	2	6	48882	48887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005362	ATT	2	6	48888	48893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005362	TGG	2	6	49458	49463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005362	AGC	2	6	49487	49492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_005362	TAA	2	6	49530	49535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005362	AGA	2	6	49831	49836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005362	TCT	2	6	49848	49853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_005362	TAA	2	6	50187	50192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005362	AGC	2	6	51271	51276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_005362	GCT	2	6	51284	51289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_005362	TAA	2	6	54652	54657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005362	TAT	2	6	55782	55787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005362	TAA	2	6	55802	55807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005362	CTT	2	6	55834	55839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_005362	CTA	2	6	55950	55955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_005362	TTA	2	6	55961	55966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005362	ATG	2	6	58685	58690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005362	AAT	2	6	58697	58702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005362	CTA	2	6	58793	58798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_005362	AGG	2	6	58842	58847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005362	TAG	2	6	58884	58889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005362	AGC	2	6	58910	58915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_005362	ATA	2	6	59004	59009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005362	ATA	2	6	59033	59038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005362	ATT	2	6	59044	59049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005362	TAA	2	6	59154	59159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005362	GGA	2	6	59213	59218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005362	TAA	2	6	70370	70375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005362	TTA	2	6	71458	71463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005362	TAA	2	6	71499	71504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005362	AAT	2	6	73462	73467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005362	GGA	2	6	73477	73482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005362	ATA	2	6	74895	74900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005362	ATA	2	6	76647	76652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005362	TAA	2	6	77364	77369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005362	TTA	2	6	81219	81224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005362	GTC	2	6	81258	81263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_005362	AAT	2	6	81285	81290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005362	TTA	2	6	81294	81299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005362	TAA	2	6	81316	81321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005362	GGT	2	6	85939	85944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_005362	ACC	2	6	86003	86008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_005362	TAT	2	6	86030	86035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_005362	TGA	2	6	86114	86119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005362	CTT	2	6	86193	86198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_005362	CTT	2	6	87515	87520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_005362	GAA	2	6	87563	87568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005362	GGT	2	6	87619	87624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_005362	ACC	2	6	87683	87688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_005362	CAA	2	6	87700	87705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_005362	TAT	2	6	87710	87715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_005362	TAA	2	6	183093	183098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_005362	TAA	2	6	183202	183207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_005362	CCT	2	6	184796	184801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
279	NC_005362	TTG	2	6	184854	184859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_005362	AAG	2	6	185062	185067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_005362	GAA	2	6	185080	185085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_005362	GAT	2	6	185125	185130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_005362	TAA	2	6	185624	185629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_005362	GGA	2	6	187795	187800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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309	NC_005362	TAG	2	6	207493	207498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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311	NC_005362	TAA	2	6	207635	207640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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324	NC_005362	TAA	2	6	214397	214402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
325	NC_005362	TAA	2	6	215996	216001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
326	NC_005362	ATT	2	6	216012	216017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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