MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum WCFS1

Total Repeats: 1867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004567	AATA	2	8	2693	2700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004567	TAAA	2	8	2709	2716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004567	CGCT	2	8	2934	2941	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_004567	AATG	2	8	2949	2956	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004567	ATTG	2	8	9687	9694	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004567	TTTA	2	8	11115	11122	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004567	GAGT	2	8	13267	13274	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004567	TTGG	2	8	15269	15276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004567	TAAA	2	8	15338	15345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004567	TCAG	2	8	20770	20777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_004567	TAAG	2	8	20995	21002	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004567	AAGG	2	8	29152	29159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004567	ATTA	2	8	31297	31304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004567	GTTT	2	8	32204	32211	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004567	TGAA	2	8	35807	35814	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004567	TGAT	2	8	36611	36618	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004567	CAGT	2	8	36651	36658	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_004567	TAAT	2	8	37534	37541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004567	AAAG	2	8	37612	37619	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004567	CAAC	2	8	37665	37672	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_004567	GCTT	2	8	42817	42824	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_004567	TAAA	2	8	45535	45542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004567	ATTG	2	8	46368	46375	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004567	TAGC	2	8	49656	49663	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_004567	TTTA	2	8	50951	50958	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004567	TGAT	2	8	57073	57080	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004567	AAAT	2	8	59325	59332	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004567	TAGT	2	8	59412	59419	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004567	CAAA	2	8	59495	59502	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_004567	CAAA	2	8	60484	60491	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_004567	CAAT	2	8	64027	64034	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_004567	ATAA	2	8	72213	72220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004567	AATA	2	8	72297	72304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004567	TTAT	2	8	76973	76980	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004567	TTAG	2	8	78273	78280	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004567	CTTA	2	8	79354	79361	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_004567	ATGG	2	8	79891	79898	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004567	GTCG	2	8	81308	81315	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_004567	AGTG	2	8	82618	82625	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004567	TTTG	2	8	83592	83599	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004567	ACGT	2	8	84539	84546	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_004567	ATTT	2	8	86864	86871	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004567	TAAA	2	8	87295	87302	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004567	ATTG	2	8	87330	87337	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004567	ATTA	2	8	87364	87371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004567	CAAA	2	8	88349	88356	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_004567	TAAT	2	8	99156	99163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004567	AATG	2	8	103825	103832	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004567	AATT	2	8	105587	105594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004567	CTGA	2	8	106207	106214	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_004567	TGTT	2	8	106219	106226	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004567	TACT	2	8	116575	116582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_004567	TAGT	2	8	117860	117867	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004567	TAAT	2	8	120640	120647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004567	TTTG	2	8	121568	121575	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004567	GTTA	2	8	122125	122132	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004567	CATA	2	8	122177	122184	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_004567	CAAT	2	8	125230	125237	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_004567	CAAA	2	8	128263	128270	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_004567	GAAT	2	8	131457	131464	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004567	ATTC	2	8	131882	131889	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_004567	TTAA	2	8	131936	131943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004567	ATTG	2	8	132850	132857	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004567	AAAG	2	8	132860	132867	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004567	TAAA	2	8	135014	135021	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004567	GTTA	2	8	135046	135053	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004567	GAGT	2	8	136919	136926	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004567	CAAT	2	8	141908	141915	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_004567	TTAA	2	8	142003	142010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004567	TAAT	2	8	142016	142023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004567	AGGA	2	8	144424	144431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004567	TAAA	2	8	147176	147183	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004567	TTAA	2	8	151023	151030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004567	ATTT	2	8	151102	151109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004567	ATTT	2	8	152557	152564	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004567	ATTC	2	8	160552	160559	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_004567	TAGC	2	8	163799	163806	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_004567	GTAT	2	8	163842	163849	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004567	TCAA	2	8	163924	163931	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_004567	AACG	2	8	164014	164021	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_004567	CTAG	2	8	164059	164066	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_004567	TTAT	2	8	165376	165383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004567	TAAA	2	8	172988	172995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004567	GATT	2	8	174680	174687	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004567	CACT	2	8	174727	174734	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_004567	TCGT	2	8	174875	174882	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_004567	AAAT	2	8	174960	174967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004567	GTTG	2	8	177908	177915	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004567	TGAT	2	8	177950	177957	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004567	AATT	2	8	178029	178036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004567	ATTA	2	8	178672	178679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004567	ATAA	2	8	178687	178694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004567	TTTA	2	8	181921	181928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004567	GCCA	2	8	182021	182028	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_004567	CGCT	2	8	183160	183167	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_004567	TTAA	2	8	186874	186881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004567	TTAG	2	8	189806	189813	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004567	CAGT	2	8	189856	189863	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_004567	AGCA	2	8	189885	189892	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_004567	AACG	2	8	190615	190622	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_004567	TTAG	2	8	192021	192028	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004567	ACGT	2	8	192099	192106	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_004567	GTTA	2	8	193641	193648	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004567	GAAT	2	8	193671	193678	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004567	TTGA	2	8	193752	193759	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004567	ATTG	2	8	195080	195087	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004567	TTTA	2	8	195179	195186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004567	AGTT	2	8	195367	195374	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004567	TAAT	2	8	196270	196277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004567	ATTA	2	8	196333	196340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004567	ATGA	2	8	202697	202704	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004567	CAAT	2	8	202738	202745	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_004567	AAGA	2	8	203362	203369	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004567	CGAT	2	8	204691	204698	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_004567	TTGA	2	8	205978	205985	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004567	AAAT	2	8	205995	206002	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004567	AATT	2	8	206129	206136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004567	CAAA	2	8	206255	206262	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_004567	AGGA	2	8	208895	208902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004567	GGTA	2	8	214634	214641	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004567	GGTA	2	8	214680	214687	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004567	AAGT	2	8	214703	214710	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004567	CAAT	2	8	215836	215843	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_004567	AGTT	2	8	217622	217629	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004567	AAAG	2	8	219892	219899	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004567	TACT	2	8	220070	220077	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_004567	TTAT	2	8	220777	220784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004567	CAAC	2	8	221873	221880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_004567	TTGG	2	8	222076	222083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004567	GAAT	2	8	231740	231747	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004567	GATT	2	8	231916	231923	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004567	ACTA	2	8	231927	231934	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_004567	TTGG	2	8	235026	235033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004567	CTGG	2	8	235198	235205	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_004567	TAAT	2	8	239725	239732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004567	TCCC	2	8	242727	242734	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
137	NC_004567	TAAT	2	8	247761	247768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004567	ATTA	2	8	247784	247791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004567	TTTG	2	8	247804	247811	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004567	TAAA	2	8	249636	249643	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004567	AGTG	2	8	250552	250559	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004567	GTTT	2	8	253531	253538	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004567	GCAA	2	8	255234	255241	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_004567	GATG	2	8	259189	259196	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004567	ATTG	2	8	259345	259352	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004567	CTTA	2	8	259361	259368	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_004567	GACA	2	8	261718	261725	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_004567	TTAA	2	8	262912	262919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004567	TCCA	2	8	265824	265831	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_004567	ATTA	2	8	265973	265980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_004567	TTGT	2	8	266615	266622	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_004567	TAAA	2	8	271770	271777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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