MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome II

Total Repeats: 1736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004343	TGT	2	6	219581	219586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_004343	GATTC	2	10	219589	219598	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1003	NC_004343	ATGA	2	8	219634	219641	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_004343	CTT	2	6	219718	219723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_004343	CATTG	2	10	223041	223050	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1006	NC_004343	CGT	2	6	223064	223069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_004343	AG	3	6	223108	223113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_004343	CTT	2	6	223115	223120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_004343	ATT	2	6	223159	223164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_004343	AAT	2	6	223234	223239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_004343	TG	3	6	223246	223251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_004343	GTCTT	2	10	223327	223336	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1013	NC_004343	T	6	6	223377	223382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_004343	AAC	2	6	223387	223392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_004343	TTA	2	6	223450	223455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_004343	ATTT	2	8	223495	223502	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_004343	T	6	6	223543	223548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_004343	ATC	2	6	223604	223609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_004343	TCAA	2	8	223637	223644	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_004343	TTC	2	6	223685	223690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_004343	T	6	6	223749	223754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_004343	ACC	2	6	223766	223771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_004343	TA	3	6	223963	223968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_004343	AGA	2	6	224032	224037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_004343	ATA	2	6	224091	224096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_004343	AG	3	6	224099	224104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_004343	TTTAT	2	10	225361	225370	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_004343	TTCA	2	8	225431	225438	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1029	NC_004343	ATT	2	6	225544	225549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_004343	ATT	2	6	225594	225599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_004343	CA	3	6	225635	225640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_004343	T	6	6	225650	225655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_004343	TCG	2	6	225659	225664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_004343	A	6	6	225697	225702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_004343	TAC	2	6	225772	225777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_004343	TAT	2	6	225796	225801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_004343	TTA	2	6	225808	225813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_004343	TCA	2	6	225827	225832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_004343	TAT	2	6	225849	225854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_004343	ATA	2	6	225861	225866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_004343	TTA	2	6	225944	225949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_004343	TA	4	8	225958	225965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_004343	AT	3	6	226040	226045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_004343	T	6	6	226050	226055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_004343	AT	3	6	226070	226075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_004343	T	6	6	226103	226108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_004343	A	6	6	226138	226143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_004343	TAA	2	6	226172	226177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_004343	AGT	2	6	226183	226188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_004343	T	7	7	226256	226262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_004343	ACT	2	6	227450	227455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_004343	TACT	2	8	227461	227468	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_004343	CCT	2	6	227489	227494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_004343	AT	4	8	227561	227568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_004343	ATT	2	6	227573	227578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_004343	GAT	2	6	227582	227587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_004343	A	8	8	227623	227630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_004343	TTTA	2	8	227738	227745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_004343	TAAG	2	8	227746	227753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_004343	AGA	2	6	227812	227817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_004343	AAC	2	6	227827	227832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_004343	A	6	6	227855	227860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_004343	TTA	2	6	227875	227880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_004343	AC	3	6	227886	227891	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_004343	ATTTA	2	10	227892	227901	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_004343	AGA	2	6	227942	227947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_004343	TAA	2	6	228006	228011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_004343	AGT	2	6	228017	228022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_004343	CAA	2	6	228057	228062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_004343	GTA	2	6	228084	228089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_004343	GTT	2	6	228123	228128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_004343	TGGG	2	8	228151	228158	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_004343	A	6	6	228191	228196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_004343	TAT	2	6	228209	228214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_004343	GAA	2	6	228218	228223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_004343	TTA	2	6	228225	228230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_004343	ATT	2	6	228251	228256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_004343	TTA	2	6	228257	228262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_004343	T	6	6	228278	228283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_004343	AGAA	2	8	228297	228304	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_004343	ACAA	2	8	228339	228346	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_004343	TAT	2	6	228390	228395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_004343	ATTAT	2	10	228445	228454	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_004343	A	6	6	228901	228906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_004343	TA	3	6	228932	228937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_004343	TTC	2	6	229005	229010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_004343	T	6	6	229053	229058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_004343	ATT	2	6	229069	229074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_004343	GAA	2	6	229113	229118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_004343	ACG	2	6	229163	229168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_004343	ACT	2	6	229275	229280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_004343	AGT	2	6	229304	229309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_004343	A	6	6	229315	229320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_004343	CAT	2	6	229329	229334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_004343	T	7	7	229334	229340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_004343	GTTT	2	8	229369	229376	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_004343	TAT	2	6	229429	229434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_004343	T	6	6	229441	229446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_004343	A	6	6	229452	229457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_004343	A	6	6	229534	229539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_004343	ACT	2	6	229576	229581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_004343	TTA	2	6	229587	229592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_004343	T	6	6	229621	229626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_004343	AGT	2	6	229655	229660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_004343	GTA	2	6	229682	229687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_004343	CTT	2	6	229804	229809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_004343	TA	3	6	229814	229819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_004343	TTAA	2	8	229900	229907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_004343	AGT	2	6	229997	230002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_004343	T	6	6	230106	230111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_004343	TAAT	2	8	230146	230153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_004343	TA	3	6	230221	230226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_004343	AG	3	6	232121	232126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_004343	TAGAA	2	10	232238	232247	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_004343	CAA	2	6	232253	232258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_004343	CTTCT	2	10	232279	232288	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1117	NC_004343	ATT	2	6	232329	232334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_004343	T	6	6	232387	232392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_004343	TTAAAA	2	12	232436	232447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_004343	T	6	6	232466	232471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_004343	GAA	2	6	233066	233071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_004343	ACA	2	6	233085	233090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_004343	AAAG	2	8	233101	233108	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_004343	TA	3	6	233155	233160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_004343	TCA	2	6	234225	234230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_004343	ATCAAA	2	12	234234	234245	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1127	NC_004343	GAT	2	6	234300	234305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_004343	ACAAAA	2	12	234323	234334	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1129	NC_004343	TTTC	2	8	234354	234361	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_004343	ATT	2	6	234446	234451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_004343	TTA	2	6	234452	234457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_004343	AAT	2	6	234469	234474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_004343	ATA	2	6	234498	234503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_004343	AAT	2	6	234507	234512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_004343	TCT	2	6	236054	236059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_004343	T	7	7	236059	236065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_004343	TTG	2	6	236082	236087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_004343	TTCAG	2	10	236100	236109	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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