MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome I

Total Repeats: 1285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004342	TATAA	2	10	2310	2319	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004342	GAAAA	2	10	3074	3083	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004342	TTTAA	2	10	4423	4432	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004342	ATTTA	2	10	19462	19471	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004342	ATAAA	2	10	19891	19900	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004342	AGATT	2	10	19909	19918	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004342	GCCTT	2	10	20709	20718	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_004342	TTATT	2	10	25847	25856	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004342	TAAAA	2	10	26312	26321	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004342	ACTAA	2	10	27361	27370	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_004342	TGTAA	2	10	37058	37067	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004342	TAAAA	2	10	39505	39514	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004342	TTCAA	2	10	47983	47992	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_004342	TTTAT	2	10	63953	63962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004342	AGATA	2	10	71417	71426	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004342	CTAAA	2	10	83242	83251	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_004342	TTCTT	2	10	85564	85573	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_004342	ATTAA	2	10	86553	86562	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004342	TTGAG	2	10	94658	94667	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004342	CCCAC	2	10	94825	94834	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
21	NC_004342	ATTTT	2	10	96711	96720	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004342	GTTTT	2	10	98200	98209	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004342	ATTTT	2	10	100496	100505	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004342	TAAAA	2	10	104105	104114	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004342	ATATT	2	10	104729	104738	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004342	AATTT	2	10	117826	117835	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004342	ATACA	2	10	120677	120686	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_004342	CCTTT	2	10	123941	123950	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_004342	AATCG	2	10	127810	127819	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_004342	ATTTT	2	10	129003	129012	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004342	TTTTA	2	10	134059	134068	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004342	ATTCG	2	10	137389	137398	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_004342	AGTAT	2	10	151789	151798	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004342	AAATT	2	10	151822	151831	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004342	ATTTT	2	10	151977	151986	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004342	TAATA	2	10	152739	152748	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004342	AAAAT	2	10	157860	157869	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004342	TAAAT	2	10	166656	166665	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004342	TGGTT	2	10	170832	170841	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004342	TCTAA	2	10	176556	176565	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_004342	ATTTT	2	10	177273	177282	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004342	ATTGG	2	10	179301	179310	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004342	AGATT	2	10	179475	179484	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004342	ATTTT	2	10	183851	183860	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004342	TTTTC	2	10	184255	184264	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_004342	TATTC	2	10	190686	190695	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_004342	TGGAA	2	10	191031	191040	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004342	ATATT	2	10	194776	194785	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004342	ATAAA	2	10	198974	198983	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004342	CAATA	2	10	199825	199834	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_004342	TAATT	2	10	201609	201618	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004342	TTTTA	2	10	217516	217525	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004342	AAAAG	2	10	225691	225700	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004342	TGAAA	2	10	226956	226965	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004342	TTTAT	2	10	227055	227064	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004342	CGATT	2	10	240178	240187	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_004342	TAATA	2	10	240946	240955	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004342	TAAAA	2	10	247285	247294	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004342	TAAAA	2	10	257057	257066	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004342	ATTGG	2	10	263367	263376	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004342	ATTTT	2	10	271445	271454	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004342	ACAAA	2	10	272701	272710	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_004342	TTTAT	2	10	276226	276235	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004342	TTTCT	2	10	278419	278428	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_004342	ATTCT	2	10	280015	280024	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_004342	CAAAA	2	10	282979	282988	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_004342	AAAGA	2	10	283056	283065	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004342	AATTT	2	10	300634	300643	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004342	GTTCT	2	10	305004	305013	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_004342	ATTTT	2	10	305744	305753	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004342	GAAAT	2	10	305808	305817	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004342	ATTTT	2	10	317352	317361	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004342	ATTTG	2	10	321199	321208	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004342	TATAA	2	10	321698	321707	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004342	TAATA	2	10	321744	321753	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004342	GGGAA	2	10	329905	329914	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004342	TTTTA	2	10	330425	330434	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004342	TATTC	2	10	335175	335184	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_004342	ATTGA	2	10	335508	335517	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004342	AAATA	2	10	336422	336431	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004342	ATTTT	2	10	336441	336450	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004342	TCAAT	2	10	338100	338109	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_004342	TTTAT	2	10	345401	345410	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004342	AATTC	2	10	347222	347231	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_004342	TTAAT	2	10	348271	348280	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004342	TCTAT	2	10	348293	348302	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_004342	CATTG	2	10	350971	350980	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_004342	ATTCT	2	10	356605	356614	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_004342	TATAG	2	10	357394	357403	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004342	CATTT	2	10	358160	358169	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_004342	GTGAA	2	10	373560	373569	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004342	CAAAA	2	10	375091	375100	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_004342	TCAAT	2	10	376921	376930	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_004342	AGATT	2	10	377135	377144	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004342	TTTAA	2	10	387795	387804	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004342	TTTTG	2	10	388705	388714	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004342	TCTTA	2	10	389513	389522	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_004342	GAATA	2	10	390021	390030	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004342	GTTGT	2	10	393660	393669	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004342	AATAG	2	10	393743	393752	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004342	TGCAC	2	10	395223	395232	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_004342	ATTTT	2	10	396957	396966	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004342	AATTA	2	10	397961	397970	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004342	TTGGT	2	10	404608	404617	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004342	GCATT	2	10	414492	414501	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_004342	AAATT	2	10	418740	418749	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004342	TTTAA	2	10	419880	419889	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004342	TATTC	2	10	420236	420245	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_004342	GAATT	2	10	420328	420337	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004342	AGGGT	2	10	422058	422067	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004342	AGGGT	2	10	425802	425811	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004342	TTTAT	2	10	426098	426107	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004342	TTTTG	2	10	428607	428616	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004342	TCTAT	2	10	428739	428748	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_004342	ATTTC	2	10	429566	429575	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_004342	TATTC	2	10	431089	431098	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_004342	TTTAT	2	10	433679	433688	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004342	AAAAT	2	10	433921	433930	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004342	ATTAT	2	10	436015	436024	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004342	CTTTC	2	10	438229	438238	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_004342	ATTGA	2	10	438382	438391	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004342	ATTTT	2	10	443934	443943	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004342	AATTT	2	10	446612	446621	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004342	AATTG	2	10	451694	451703	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004342	TAAAA	2	10	453688	453697	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004342	TTCTA	2	10	454540	454549	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_004342	AATTC	2	10	455511	455520	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_004342	TTTTA	2	10	460512	460521	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004342	TCTAT	2	10	465776	465785	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_004342	TTTTA	2	10	467324	467333	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004342	TGCAG	2	10	469789	469798	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_004342	TCCTT	2	10	470628	470637	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_004342	ATGAA	2	10	473402	473411	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004342	ATTAA	2	10	475594	475603	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004342	ATTTA	2	10	478683	478692	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004342	TGGGA	2	10	483228	483237	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004342	TTTAT	2	10	483656	483665	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004342	GTTTT	2	10	483728	483737	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004342	TATAA	2	10	483875	483884	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004342	TTCAG	2	10	485960	485969	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_004342	ACTCA	2	10	486568	486577	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_004342	ATAAA	2	10	487592	487601	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004342	TTATT	2	10	488338	488347	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004342	TCTTG	2	10	489083	489092	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_004342	CAATC	2	10	499604	499613	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_004342	TATTC	2	10	501676	501685	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_004342	ATTTT	2	10	502299	502308	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004342	TAAAG	2	10	504492	504501	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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275	NC_004342	TTAAG	2	10	929094	929103	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_004342	AAAAG	2	10	1005395	1005404	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_004342	TCAAA	2	10	1695165	1695174	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
498	NC_004342	ATGGA	2	10	1695568	1695577	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_004342	ATTGA	2	10	1703079	1703088	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

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