MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes EGD-e chromosome

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003210	CTATTA	2	12	1786	1797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_003210	ATTTAT	2	12	77122	77133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003210	GTGGCT	2	12	82642	82653	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_003210	AATAAA	2	12	199547	199558	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003210	GAAAAC	2	12	226563	226574	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_003210	ATTCAA	2	12	237450	237461	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_003210	AAGGAA	2	12	239021	239032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003210	TAGGCG	2	12	240674	240685	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_003210	ATTCAA	2	12	243471	243482	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_003210	AAGGAA	2	12	245042	245053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003210	TAGGCG	2	12	246695	246706	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_003210	AGTCAA	2	12	248509	248520	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_003210	TTATAT	2	12	263293	263304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003210	AACTTT	2	12	288996	289007	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_003210	AATACA	2	12	297586	297597	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_003210	TTGGTT	2	12	327540	327551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003210	AAATGA	2	12	389738	389749	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003210	ATGATA	2	12	391558	391569	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003210	AGTGCT	2	12	403196	403207	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_003210	TTGTTT	2	12	411890	411901	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003210	TCTCCC	2	12	435823	435834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_003210	ACAAAA	2	12	473838	473849	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_003210	ACACGG	2	12	507267	507278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_003210	CTATAA	2	12	511627	511638	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_003210	GGGGAA	2	12	544246	544257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003210	TTTAGT	2	12	544436	544447	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003210	AGATTT	2	12	570858	570869	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003210	ATCATT	2	12	639510	639521	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_003210	TTAAGA	2	12	679325	679336	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003210	ATCATT	2	12	681514	681525	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_003210	GTTTTA	2	12	708787	708798	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003210	TATAGG	2	12	726005	726016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003210	TTACTT	2	12	852635	852646	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_003210	TGAAAT	2	12	863770	863781	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003210	AAATAG	2	12	890413	890424	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003210	GTAATC	2	12	897216	897227	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_003210	TTACAA	2	12	897234	897245	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_003210	ATGAAA	2	12	905829	905840	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003210	TTGACT	2	12	1029085	1029096	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_003210	AGGAAG	2	12	1039278	1039289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003210	CTTTTT	2	12	1099016	1099027	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_003210	TTATGG	2	12	1160007	1160018	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003210	TTTAGT	2	12	1164015	1164026	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003210	CTTTTT	2	12	1236603	1236614	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_003210	GAAAAA	2	12	1266579	1266590	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003210	AAAAAC	2	12	1275719	1275730	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_003210	TATTAA	2	12	1293057	1293068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003210	TATTAA	2	12	1443850	1443861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003210	ATAAAA	2	12	1478031	1478042	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003210	TTTCAT	2	12	1486425	1486436	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_003210	CTCTTC	2	12	1589105	1589116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_003210	TAATTA	2	12	1625428	1625439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003210	GGTTGT	2	12	1639755	1639766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003210	GGTTGT	2	12	1641216	1641227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003210	GAATAA	2	12	1642770	1642781	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003210	GTAAAC	2	12	1643920	1643931	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_003210	ACAAAA	2	12	1652544	1652555	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_003210	AAAATA	2	12	1656861	1656872	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003210	TAAAAA	2	12	1657771	1657782	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003210	TAAAAA	2	12	1684516	1684527	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003210	AAATAA	2	12	1702328	1702339	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003210	ATGAAA	2	12	1704018	1704029	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003210	TAGATT	2	12	1708796	1708807	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003210	CGCCTA	2	12	1744601	1744612	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_003210	TTTCCT	2	12	1746253	1746264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_003210	TTGAAT	2	12	1747825	1747836	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003210	CTATAA	2	12	1795454	1795465	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_003210	AAAAAC	2	12	1820087	1820098	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_003210	CGCCTA	2	12	1850522	1850533	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_003210	TTTCCT	2	12	1852174	1852185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_003210	TTGAAT	2	12	1853746	1853757	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003210	GTTTTA	2	12	1861666	1861677	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003210	AAAAAG	2	12	1944860	1944871	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003210	CTCTAT	2	12	1962577	1962588	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_003210	TCATTT	2	12	1963775	1963786	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_003210	GTTTTC	2	12	1990944	1990955	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_003210	CAAAAA	2	12	2008668	2008679	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_003210	GAAAAA	2	12	2012529	2012540	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003210	AGAAAA	2	12	2019365	2019376	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003210	TTTTAT	2	12	2108229	2108240	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003210	ATTCAA	2	12	2165896	2165907	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_003210	TTATAT	2	12	2227368	2227379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003210	AATTTT	2	12	2280181	2280192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003210	AAATTG	2	12	2286356	2286367	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003210	CTCTGT	2	12	2293202	2293213	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_003210	AAATTA	2	12	2395493	2395504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003210	TAATAC	2	12	2418740	2418751	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_003210	CGCCTA	2	12	2439542	2439553	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_003210	TTTCCT	2	12	2441445	2441456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_003210	TTGAAT	2	12	2443017	2443028	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003210	TTCAAA	2	12	2527569	2527580	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_003210	CTTTTT	2	12	2592798	2592809	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_003210	ATCCCA	2	12	2612712	2612723	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_003210	AAAAGA	2	12	2618543	2618554	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003210	TTTTTA	2	12	2624539	2624550	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003210	CGCCTA	2	12	2674551	2674562	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_003210	TTTCCT	2	12	2676454	2676465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_003210	TTGAAT	2	12	2678026	2678037	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003210	CCTCTT	2	12	2721514	2721525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_003210	TATTTT	2	12	2725938	2725949	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003210	TAAATC	2	12	2742985	2742996	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_003210	TTTTAT	2	12	2813935	2813946	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003210	ATATTT	2	12	2860846	2860857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003210	TTAACT	2	12	2861153	2861164	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_003210	TATCAA	2	12	2887374	2887385	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_003210	AAATGA	2	12	2887388	2887399	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003210	TAAAAA	2	12	2887458	2887469	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003210	AAGTAT	2	12	2888325	2888336	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.