MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis KLDS 4.0325

Total Repeats: 992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022593	TTGCTG	2	12	422	433	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	554463092
2	NC_022593	TTGAAG	2	12	1631	1642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554463093
3	NC_022593	AATTGA	2	12	6202	6213	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	554463095
4	NC_022593	AAAGAT	2	12	11236	11247	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554463098
5	NC_022593	AAAAAT	2	12	13350	13361	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	554464822
6	NC_022593	TTTTGC	2	12	14771	14782	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	554464822
7	NC_022593	GATTGA	2	12	14919	14930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554464823
8	NC_022593	TTGACA	2	12	19085	19096	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554463101
9	NC_022593	GTTTTT	2	12	20599	20610	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	554464826
10	NC_022593	AAGAAA	2	12	20652	20663	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	554464826
11	NC_022593	AAAGAA	2	12	22351	22362	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	554463105
12	NC_022593	CAGATA	2	12	23393	23404	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	554463105
13	NC_022593	GAAATT	2	12	24525	24536	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	554463106
14	NC_022593	GTAAAA	2	12	25766	25777	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554463108
15	NC_022593	CAGGTA	2	12	26232	26243	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	554463108
16	NC_022593	TGTCGG	2	12	26326	26337	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	554463108
17	NC_022593	TACATC	2	12	31884	31895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554463109
18	NC_022593	AGAAAA	2	12	31985	31996	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	554463109
19	NC_022593	GTTGAC	2	12	35007	35018	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	554463112
20	NC_022593	CGGCTG	2	12	37208	37219	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	554463114
21	NC_022593	GATAAT	2	12	37570	37581	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	554463115
22	NC_022593	AAGGTA	2	12	37848	37859	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	554463115
23	NC_022593	ATCTTT	2	12	45061	45072	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	554463120
24	NC_022593	GAGCAA	2	12	49019	49030	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	554463124
25	NC_022593	GGTCAG	2	12	49567	49578	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	554463125
26	NC_022593	TTGCTT	2	12	51523	51534	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	554463127
27	NC_022593	TTTTTA	2	12	51835	51846	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	554463127
28	NC_022593	ACCATT	2	12	52086	52097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554463127
29	NC_022593	GGCTCA	2	12	52265	52276	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	554463127
30	NC_022593	TTTAGG	2	12	52538	52549	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	554463127
31	NC_022593	TAGTTT	2	12	52860	52871	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	554464830
32	NC_022593	TCGTAA	2	12	56589	56600	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554463130
33	NC_022593	TCTTTG	2	12	58178	58189	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	554463131
34	NC_022593	AGGTTT	2	12	64726	64737	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	554464833
35	NC_022593	TCATTG	2	12	66603	66614	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	554464833
36	NC_022593	TTTCAT	2	12	70741	70752	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	554464838
37	NC_022593	TTAGTT	2	12	77808	77819	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	554464850
38	NC_022593	TTTTAG	2	12	83822	83833	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	554464856
39	NC_022593	CCTAAA	2	12	85970	85981	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	554464858
40	NC_022593	CAAAAA	2	12	86835	86846	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	554464859
41	NC_022593	ATATTG	2	12	89210	89221	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	554464862
42	NC_022593	TTGAAA	2	12	90524	90535	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	554464863
43	NC_022593	AGGTTT	2	12	92299	92310	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	554464865
44	NC_022593	CTAATT	2	12	92703	92714	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	554464866
45	NC_022593	AATAAA	2	12	99071	99082	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	554463139
46	NC_022593	CTTTTG	2	12	104132	104143	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	554463142
47	NC_022593	AAAATT	2	12	104379	104390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554463142
48	NC_022593	ATCAAA	2	12	106382	106393	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	554463144
49	NC_022593	TGGACG	2	12	109489	109500	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	554463147
50	NC_022593	AAGCCG	2	12	115277	115288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554463153
51	NC_022593	AATTAG	2	12	118539	118550	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	554463157
52	NC_022593	TTTTGA	2	12	120782	120793	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	554463159
53	NC_022593	TATGGG	2	12	128579	128590	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	554463165
54	NC_022593	ATTAAT	2	12	128955	128966	50 %	50 %	0 %	0 %	554464877
55	NC_022593	TTTTCT	2	12	131766	131777	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	554463169
56	NC_022593	TTATGT	2	12	133774	133785	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	554463170
57	NC_022593	TTTTGA	2	12	139768	139779	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	554464881
58	NC_022593	AAAAAC	2	12	143386	143397	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	554464884
59	NC_022593	AAAGCT	2	12	146314	146325	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	554464886
60	NC_022593	TAATTC	2	12	147291	147302	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	554464888
61	NC_022593	CAAATA	2	12	147335	147346	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	554464888
62	NC_022593	AAAGAA	2	12	149797	149808	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	554464893
63	NC_022593	AGCTGA	2	12	150465	150476	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	554464893
64	NC_022593	AGTGAA	2	12	151031	151042	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	554464894
65	NC_022593	CAAAAA	2	12	154877	154888	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	554464900
66	NC_022593	GAAGGG	2	12	166219	166230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	554464911
67	NC_022593	AGGAAA	2	12	167158	167169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554463174
68	NC_022593	TGAAAT	2	12	170345	170356	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	554463176
69	NC_022593	TTCATA	2	12	172869	172880	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	554463180
70	NC_022593	TCATAA	2	12	179184	179195	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	554463187
71	NC_022593	CATGAT	2	12	183049	183060	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554463192
72	NC_022593	AATTAA	2	12	185205	185216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554464915
73	NC_022593	AAAGAA	2	12	185485	185496	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	554464915
74	NC_022593	AAAGTA	2	12	189874	189885	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554464915
75	NC_022593	GTCAAG	2	12	189947	189958	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	554464915
76	NC_022593	ATAATT	2	12	195880	195891	50 %	50 %	0 %	0 %	554463198
77	NC_022593	AGTCGT	2	12	196709	196720	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	554463199
78	NC_022593	TGCCTT	2	12	197850	197861	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	554463201
79	NC_022593	TTGCTT	2	12	202401	202412	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	554463205
80	NC_022593	AATACA	2	12	204002	204013	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	554463206
81	NC_022593	ATTGAA	2	12	204215	204226	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	554463206
82	NC_022593	GCTTAT	2	12	204395	204406	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	554463206
83	NC_022593	AAAAAT	2	12	206334	206345	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	554463207
84	NC_022593	AGTTTG	2	12	211564	211575	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	554463213
85	NC_022593	ATAAAA	2	12	215673	215684	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	554463217
86	NC_022593	TTCGGC	2	12	215875	215886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554463218
87	NC_022593	ATTGGG	2	12	216876	216887	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	554463218
88	NC_022593	AAATAG	2	12	219371	219382	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554463220
89	NC_022593	TCGTAA	2	12	220125	220136	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554463221
90	NC_022593	CTTTTT	2	12	223933	223944	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	554463225
91	NC_022593	ATGTTG	2	12	229335	229346	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	554463229
92	NC_022593	AGAAGT	2	12	230435	230446	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	554463230
93	NC_022593	AACTTT	2	12	230510	230521	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	554463230
94	NC_022593	TTGGAA	2	12	232859	232870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554463233
95	NC_022593	GAAGGT	2	12	235845	235856	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	554463237
96	NC_022593	GAAAAC	2	12	236388	236399	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	554463237
97	NC_022593	AAAAGC	2	12	237941	237952	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	554463238
98	NC_022593	TGAGCT	2	12	246658	246669	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	554464924
99	NC_022593	ACCAGA	2	12	248595	248606	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	554464926
100	NC_022593	AAAATA	2	12	256393	256404	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	554464935
101	NC_022593	TGAAAA	2	12	263808	263819	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554463244
102	NC_022593	GAGTTA	2	12	266733	266744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554463246
103	NC_022593	TGAAGA	2	12	268194	268205	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	554463249
104	NC_022593	TGGCTT	2	12	270509	270520	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	554463253
105	NC_022593	CTGACC	2	12	272593	272604	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	554463254
106	NC_022593	GATGAC	2	12	272838	272849	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	554463254
107	NC_022593	ACGTAA	2	12	278228	278239	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	554463260
108	NC_022593	ACGTAA	2	12	278252	278263	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	554463260
109	NC_022593	TGGAAT	2	12	281285	281296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554463263
110	NC_022593	GCTGTC	2	12	284391	284402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554463266
111	NC_022593	TGTTAT	2	12	294473	294484	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	554463271
112	NC_022593	CATAGT	2	12	301023	301034	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554463275
113	NC_022593	GTTGAA	2	12	302519	302530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554463277
114	NC_022593	TTATTG	2	12	315264	315275	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	554463288
115	NC_022593	CTCTTT	2	12	317102	317113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554463290
116	NC_022593	CTTAAA	2	12	317585	317596	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	554463290
117	NC_022593	CAAGCC	2	12	318660	318671	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	554463291
118	NC_022593	TCTGGT	2	12	320383	320394	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	554463293
119	NC_022593	AAAAAC	2	12	320483	320494	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	554463293
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220	NC_022593	TGGTGT	2	12	583291	583302	0 %	50 %	50 %	0 %	554463493
221	NC_022593	TACAGC	2	12	583843	583854	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	554465015
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225	NC_022593	AAGCTG	2	12	606554	606565	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	554463506
226	NC_022593	CTTGTT	2	12	607181	607192	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	554463507
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228	NC_022593	CTGGTG	2	12	608159	608170	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	554463508
229	NC_022593	TTTGAA	2	12	608553	608564	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	554463509
230	NC_022593	CAAGGA	2	12	611063	611074	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	554463512
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232	NC_022593	GTGCTG	2	12	615858	615869	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	554463517
233	NC_022593	AATATT	2	12	616715	616726	50 %	50 %	0 %	0 %	554463517
234	NC_022593	TTTTGC	2	12	619911	619922	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	554465030
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337	NC_022593	CTATGA	2	12	841140	841151	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554463682
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340	NC_022593	ACATGA	2	12	846473	846484	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	554463686
341	NC_022593	TGGCAA	2	12	848778	848789	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	554463688
342	NC_022593	ACAAAA	2	12	849035	849046	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	554463688
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344	NC_022593	CTTTCA	2	12	855147	855158	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	554463691
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346	NC_022593	TGGTCC	2	12	860930	860941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554463696
347	NC_022593	ATTGCC	2	12	861320	861331	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	554463696
348	NC_022593	TTGAAG	2	12	864912	864923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554463700
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353	NC_022593	TTCAAG	2	12	876498	876509	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554465069
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443	NC_022593	TGAACG	2	12	1120176	1120187	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	554463882
444	NC_022593	GAAAAT	2	12	1121898	1121909	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554463883
445	NC_022593	TGCTGA	2	12	1123664	1123675	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	554465161
446	NC_022593	GACGGT	2	12	1124753	1124764	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	554463884
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449	NC_022593	TGAAGA	2	12	1126843	1126854	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	554463884
450	NC_022593	AAAGCA	2	12	1128670	1128681	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	554463886
451	NC_022593	TGCTGA	2	12	1128816	1128827	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	554463886
452	NC_022593	ATGACC	2	12	1129871	1129882	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	554465162
453	NC_022593	TCTGGT	2	12	1138619	1138630	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	554463888
454	NC_022593	AAGAAC	2	12	1139479	1139490	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	554463889
455	NC_022593	AGTTAA	2	12	1141185	1141196	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	554463891
456	NC_022593	AAATTC	2	12	1141391	1141402	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	554463891
457	NC_022593	AATTGC	2	12	1142243	1142254	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554463892
458	NC_022593	GATTGG	2	12	1147878	1147889	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	554463897
459	NC_022593	AAAAGC	2	12	1151496	1151507	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	554463900
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