MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis KLDS 4.0325 strain Lactococcus lactis subsp. lactis strain plasmid 1

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022587	GCC	2	6	232	237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	554074372
2	NC_022587	CAA	2	6	273	278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554074372
3	NC_022587	ATT	2	6	373	378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074373
4	NC_022587	ATT	2	6	421	426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074373
5	NC_022587	ATT	2	6	472	477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074373
6	NC_022587	TAC	2	6	491	496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554074373
7	NC_022587	ATT	2	6	498	503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074373
8	NC_022587	ATT	2	6	521	526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074373
9	NC_022587	AAT	2	6	573	578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554074373
10	NC_022587	ATG	2	6	653	658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554074373
11	NC_022587	TAA	2	6	701	706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554074373
12	NC_022587	TCA	2	6	773	778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554074373
13	NC_022587	AAT	2	6	792	797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554074373
14	NC_022587	GAA	2	6	821	826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554074373
15	NC_022587	ATT	2	6	878	883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074373
16	NC_022587	AAC	2	6	894	899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554074373
17	NC_022587	AAT	2	6	904	909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554074373
18	NC_022587	ATT	2	6	1023	1028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074373
19	NC_022587	ATG	2	6	1340	1345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554074373
20	NC_022587	AAC	2	6	1407	1412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554074373
21	NC_022587	TGG	2	6	1449	1454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	554074373
22	NC_022587	TTG	2	6	1682	1687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554074373
23	NC_022587	TAT	2	6	1703	1708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074373
24	NC_022587	TAT	3	9	1745	1753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074373
25	NC_022587	TAT	2	6	1769	1774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074373
26	NC_022587	TAT	2	6	1905	1910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074373
27	NC_022587	AGA	2	6	2442	2447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554074374
28	NC_022587	TGA	2	6	2604	2609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554074374
29	NC_022587	TTA	2	6	2634	2639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074375
30	NC_022587	CAA	2	6	2725	2730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554074375
31	NC_022587	GAA	3	9	2812	2820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554074375
32	NC_022587	AAT	2	6	2896	2901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554074375
33	NC_022587	GGA	2	6	2976	2981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	554074375
34	NC_022587	TGA	2	6	3036	3041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554074375
35	NC_022587	GAA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554074375
36	NC_022587	TAA	2	6	3129	3134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554074375
37	NC_022587	CAA	2	6	3207	3212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554074376
38	NC_022587	CAA	2	6	3309	3314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554074377
39	NC_022587	AGA	2	6	3509	3514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554074377
40	NC_022587	GAA	2	6	3618	3623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554074377
41	NC_022587	ATC	2	6	3634	3639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554074377
42	NC_022587	CTT	2	6	3654	3659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554074377
43	NC_022587	CAA	2	6	3729	3734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554074377
44	NC_022587	ATT	2	6	3748	3753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074377
45	NC_022587	GAA	2	6	3785	3790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554074377
46	NC_022587	TGG	2	6	3938	3943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	554074377
47	NC_022587	ATT	2	6	4078	4083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074377
48	NC_022587	TTA	2	6	4084	4089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074377

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.