MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Listonella anguillarum M3 plasmid

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022225	AT	3	6	1889	1894	50 %	50 %	0 %	0 %	537457742
2	NC_022225	CA	3	6	2010	2015	50 %	0 %	0 %	50 %	537457742
3	NC_022225	TA	3	6	2212	2217	50 %	50 %	0 %	0 %	537457742
4	NC_022225	AG	3	6	3651	3656	50 %	0 %	50 %	0 %	537457724
5	NC_022225	GT	3	6	4952	4957	0 %	50 %	50 %	0 %	537457725
6	NC_022225	AT	3	6	5461	5466	50 %	50 %	0 %	0 %	537457725
7	NC_022225	TA	3	6	6411	6416	50 %	50 %	0 %	0 %	537457726
8	NC_022225	CA	3	6	8749	8754	50 %	0 %	0 %	50 %	537457728
9	NC_022225	AT	3	6	9195	9200	50 %	50 %	0 %	0 %	537457728
10	NC_022225	GT	3	6	9587	9592	0 %	50 %	50 %	0 %	537457729
11	NC_022225	CG	3	6	10071	10076	0 %	0 %	50 %	50 %	537457729
12	NC_022225	CT	3	6	15034	15039	0 %	50 %	0 %	50 %	537457747
13	NC_022225	AT	3	6	15230	15235	50 %	50 %	0 %	0 %	537457747
14	NC_022225	GA	3	6	15887	15892	50 %	0 %	50 %	0 %	537457747
15	NC_022225	AT	3	6	17054	17059	50 %	50 %	0 %	0 %	537457748
16	NC_022225	AT	3	6	17194	17199	50 %	50 %	0 %	0 %	537457748
17	NC_022225	CT	3	6	18856	18861	0 %	50 %	0 %	50 %	537457748
18	NC_022225	AC	3	6	19247	19252	50 %	0 %	0 %	50 %	537457748
19	NC_022225	AC	3	6	20291	20296	50 %	0 %	0 %	50 %	537457749
20	NC_022225	CT	3	6	21467	21472	0 %	50 %	0 %	50 %	537457749
21	NC_022225	AG	3	6	21678	21683	50 %	0 %	50 %	0 %	537457750
22	NC_022225	AG	3	6	26554	26559	50 %	0 %	50 %	0 %	537457734
23	NC_022225	TG	3	6	28311	28316	0 %	50 %	50 %	0 %	537457753
24	NC_022225	AC	3	6	28949	28954	50 %	0 %	0 %	50 %	537457753
25	NC_022225	CT	3	6	29212	29217	0 %	50 %	0 %	50 %	537457754
26	NC_022225	AT	3	6	30544	30549	50 %	50 %	0 %	0 %	537457755
27	NC_022225	AT	4	8	31483	31490	50 %	50 %	0 %	0 %	537457755
28	NC_022225	CA	3	6	31553	31558	50 %	0 %	0 %	50 %	537457755
29	NC_022225	AC	3	6	31708	31713	50 %	0 %	0 %	50 %	537457755
30	NC_022225	AT	3	6	32207	32212	50 %	50 %	0 %	0 %	537457755
31	NC_022225	AT	3	6	33101	33106	50 %	50 %	0 %	0 %	537457756
32	NC_022225	GT	3	6	33494	33499	0 %	50 %	50 %	0 %	537457756
33	NC_022225	TA	3	6	33945	33950	50 %	50 %	0 %	0 %	537457756
34	NC_022225	TC	3	6	34102	34107	0 %	50 %	0 %	50 %	537457756
35	NC_022225	GC	3	6	35928	35933	0 %	0 %	50 %	50 %	537457757
36	NC_022225	TA	3	6	36338	36343	50 %	50 %	0 %	0 %	537457757
37	NC_022225	AT	3	6	37081	37086	50 %	50 %	0 %	0 %	537457758
38	NC_022225	AC	3	6	37216	37221	50 %	0 %	0 %	50 %	537457758
39	NC_022225	TA	3	6	39030	39035	50 %	50 %	0 %	0 %	537457759
40	NC_022225	AG	3	6	39139	39144	50 %	0 %	50 %	0 %	537457759
41	NC_022225	GA	3	6	39500	39505	50 %	0 %	50 %	0 %	537457759
42	NC_022225	TA	3	6	40318	40323	50 %	50 %	0 %	0 %	537457760
43	NC_022225	GC	3	6	41916	41921	0 %	0 %	50 %	50 %	537457761
44	NC_022225	CA	3	6	42613	42618	50 %	0 %	0 %	50 %	537457761
45	NC_022225	AG	3	6	43142	43147	50 %	0 %	50 %	0 %	537457762
46	NC_022225	TA	3	6	43239	43244	50 %	50 %	0 %	0 %	537457762
47	NC_022225	AG	3	6	43550	43555	50 %	0 %	50 %	0 %	537457762
48	NC_022225	CA	3	6	44020	44025	50 %	0 %	0 %	50 %	537457762
49	NC_022225	CT	4	8	44567	44574	0 %	50 %	0 %	50 %	537457763
50	NC_022225	AC	3	6	47388	47393	50 %	0 %	0 %	50 %	537457764
51	NC_022225	CG	3	6	49349	49354	0 %	0 %	50 %	50 %	537457738
52	NC_022225	AC	3	6	49833	49838	50 %	0 %	0 %	50 %	537457738
53	NC_022225	TA	3	6	51030	51035	50 %	50 %	0 %	0 %	537457766
54	NC_022225	CG	3	6	51543	51548	0 %	0 %	50 %	50 %	537457766
55	NC_022225	CA	3	6	53074	53079	50 %	0 %	0 %	50 %	537457739
56	NC_022225	TG	3	6	53679	53684	0 %	50 %	50 %	0 %	537457739
57	NC_022225	AG	3	6	53783	53788	50 %	0 %	50 %	0 %	537457739
58	NC_022225	GT	3	6	53897	53902	0 %	50 %	50 %	0 %	537457739
59	NC_022225	GT	3	6	54165	54170	0 %	50 %	50 %	0 %	537457739
60	NC_022225	AT	3	6	54481	54486	50 %	50 %	0 %	0 %	537457767
61	NC_022225	AT	3	6	55230	55235	50 %	50 %	0 %	0 %	537457769
62	NC_022225	TA	3	6	55352	55357	50 %	50 %	0 %	0 %	537457769
63	NC_022225	AG	3	6	55789	55794	50 %	0 %	50 %	0 %	537457770
64	NC_022225	CA	3	6	56261	56266	50 %	0 %	0 %	50 %	537457770
65	NC_022225	TG	3	6	56686	56691	0 %	50 %	50 %	0 %	537457770
66	NC_022225	CT	3	6	56697	56702	0 %	50 %	0 %	50 %	537457770
67	NC_022225	AG	3	6	59983	59988	50 %	0 %	50 %	0 %	537457740
68	NC_022225	TC	3	6	60002	60007	0 %	50 %	0 %	50 %	537457740
69	NC_022225	TG	3	6	61168	61173	0 %	50 %	50 %	0 %	537457775
70	NC_022225	CA	3	6	61931	61936	50 %	0 %	0 %	50 %	537457741
71	NC_022225	TG	3	6	62536	62541	0 %	50 %	50 %	0 %	537457741
72	NC_022225	AG	3	6	62640	62645	50 %	0 %	50 %	0 %	537457741
73	NC_022225	GT	3	6	62754	62759	0 %	50 %	50 %	0 %	537457741
74	NC_022225	GT	3	6	63022	63027	0 %	50 %	50 %	0 %	537457741
75	NC_022225	AT	3	6	63597	63602	50 %	50 %	0 %	0 %	537457776
76	NC_022225	GT	3	6	63665	63670	0 %	50 %	50 %	0 %	537457776
77	NC_022225	CA	3	6	64043	64048	50 %	0 %	0 %	50 %	537457776
78	NC_022225	CG	3	6	64064	64069	0 %	0 %	50 %	50 %	537457776
79	NC_022225	CA	3	6	64070	64075	50 %	0 %	0 %	50 %	537457776
80	NC_022225	GT	3	6	65791	65796	0 %	50 %	50 %	0 %	537457781

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.