MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus paracasei subsp. paracasei 8700:2 plasmid 1

Total Repeats: 279

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022114	AAC	2	6	289	294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532360756
2	NC_022114	GTG	2	6	518	523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532360756
3	NC_022114	TGC	2	6	549	554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532360756
4	NC_022114	TGC	2	6	603	608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532360756
5	NC_022114	TGC	2	6	669	674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532360756
6	NC_022114	CAG	2	6	788	793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532360756
7	NC_022114	CTT	2	6	837	842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532360756
8	NC_022114	TGA	2	6	846	851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532360756
9	NC_022114	ACT	2	6	894	899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532360756
10	NC_022114	CAA	2	6	922	927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532360756
11	NC_022114	GCG	2	6	930	935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532360756
12	NC_022114	GAC	2	6	1012	1017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532360756
13	NC_022114	GAA	2	6	1018	1023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360756
14	NC_022114	TGA	2	6	1034	1039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532360756
15	NC_022114	AAG	2	6	1071	1076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360756
16	NC_022114	ACT	2	6	1106	1111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532360756
17	NC_022114	TGG	2	6	1144	1149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532360756
18	NC_022114	GAA	2	6	1189	1194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360756
19	NC_022114	ATA	2	6	1686	1691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532360757
20	NC_022114	TTG	2	6	1758	1763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532360757
21	NC_022114	GAA	3	9	1799	1807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360757
22	NC_022114	AAG	2	6	1872	1877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360757
23	NC_022114	TGA	2	6	1951	1956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532360758
24	NC_022114	TTA	2	6	2116	2121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532360758
25	NC_022114	TTG	2	6	2166	2171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532360759
26	NC_022114	TGA	2	6	2251	2256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532360759
27	NC_022114	AGA	2	6	2317	2322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360759
28	NC_022114	AAC	2	6	2328	2333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532360759
29	NC_022114	ACA	2	6	2375	2380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532360759
30	NC_022114	TAT	2	6	2451	2456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532360759
31	NC_022114	GGT	2	6	2516	2521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532360759
32	NC_022114	ATA	2	6	2619	2624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532360759
33	NC_022114	TTA	2	6	2815	2820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532360759
34	NC_022114	TTG	2	6	3054	3059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532360760
35	NC_022114	TGA	2	6	3213	3218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532360761
36	NC_022114	GTT	2	6	3234	3239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532360761
37	NC_022114	CTT	2	6	3291	3296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532360761
38	NC_022114	GTG	2	6	3580	3585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532360762
39	NC_022114	GAA	2	6	3638	3643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360762
40	NC_022114	ATT	2	6	3681	3686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532360762
41	NC_022114	AAG	2	6	3695	3700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360762
42	NC_022114	TGA	2	6	3930	3935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532360762
43	NC_022114	GGC	2	6	4166	4171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532360762
44	NC_022114	CAA	2	6	4324	4329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532360762
45	NC_022114	GAT	2	6	4495	4500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532360762
46	NC_022114	GCG	2	6	4503	4508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532360762
47	NC_022114	ATT	2	6	4575	4580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532360762
48	NC_022114	CAA	2	6	4591	4596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532360762
49	NC_022114	TGA	2	6	4785	4790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532360762
50	NC_022114	TTG	2	6	4792	4797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532360762
51	NC_022114	CAA	2	6	4801	4806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532360762
52	NC_022114	TTA	2	6	4846	4851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532360762
53	NC_022114	TGA	2	6	4895	4900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532360762
54	NC_022114	GAT	2	6	5086	5091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532360762
55	NC_022114	CCA	2	6	5194	5199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532360762
56	NC_022114	ATC	2	6	5276	5281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532360762
57	NC_022114	ATG	2	6	5303	5308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532360762
58	NC_022114	CAA	2	6	5398	5403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532360762
59	NC_022114	GAC	2	6	5410	5415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532360762
60	NC_022114	ACT	3	9	5477	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532360762
61	NC_022114	TGA	2	6	5532	5537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532360762
62	NC_022114	AGA	2	6	5747	5752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360763
63	NC_022114	TAG	2	6	5945	5950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532360763
64	NC_022114	CCT	2	6	5996	6001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532360763
65	NC_022114	AGT	2	6	6286	6291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532360764
66	NC_022114	TCA	2	6	6303	6308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532360764
67	NC_022114	TCA	2	6	6360	6365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532360764
68	NC_022114	CTT	2	6	6408	6413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532360764
69	NC_022114	CTT	2	6	6420	6425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532360764
70	NC_022114	TAC	2	6	6523	6528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532360764
71	NC_022114	AGA	2	6	6630	6635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360764
72	NC_022114	AGA	2	6	6669	6674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360764
73	NC_022114	ACT	2	6	6725	6730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532360765
74	NC_022114	GTT	2	6	6770	6775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532360765
75	NC_022114	GGC	2	6	6778	6783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532360765
76	NC_022114	ATC	2	6	6890	6895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532360765
77	NC_022114	GGC	3	9	6979	6987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532360765
78	NC_022114	GAA	2	6	7053	7058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360766
79	NC_022114	GCG	2	6	7141	7146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532360766
80	NC_022114	TTG	2	6	7223	7228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532360766
81	NC_022114	GCG	2	6	7276	7281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532360766
82	NC_022114	GAA	2	6	7284	7289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360766
83	NC_022114	CGC	2	6	7321	7326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532360766
84	NC_022114	GTT	2	6	7344	7349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532360766
85	NC_022114	GAA	2	6	7362	7367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360766
86	NC_022114	GAA	2	6	7390	7395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360766
87	NC_022114	CGG	2	6	7456	7461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532360767
88	NC_022114	TGA	2	6	7474	7479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532360767
89	NC_022114	TGG	3	9	7488	7496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532360767
90	NC_022114	AAC	2	6	7590	7595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532360767
91	NC_022114	TGA	2	6	7651	7656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532360767
92	NC_022114	CGG	2	6	7721	7726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532360767
93	NC_022114	GAC	2	6	7828	7833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532360767
94	NC_022114	AAG	2	6	7995	8000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360767
95	NC_022114	GAA	2	6	8014	8019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360767
96	NC_022114	TAA	2	6	8130	8135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532360768
97	NC_022114	AAG	2	6	8389	8394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360768
98	NC_022114	AGA	2	6	8447	8452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360768
99	NC_022114	GAC	2	6	8749	8754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532360768
100	NC_022114	AAG	2	6	8778	8783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360768
101	NC_022114	CAA	2	6	8799	8804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532360768
102	NC_022114	ACC	2	6	8899	8904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532360768
103	NC_022114	ATT	2	6	8956	8961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532360768
104	NC_022114	TTG	2	6	8987	8992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532360768
105	NC_022114	GAA	2	6	9067	9072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360768
106	NC_022114	TGA	2	6	9195	9200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532360768
107	NC_022114	CTA	2	6	9357	9362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532360768
108	NC_022114	TGA	2	6	9564	9569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532360768
109	NC_022114	GCC	2	6	9598	9603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532360768
110	NC_022114	CCA	2	6	9612	9617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532360768
111	NC_022114	ATT	2	6	9727	9732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532360768
112	NC_022114	TGA	2	6	9780	9785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532360768
113	NC_022114	ATT	2	6	9831	9836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532360768
114	NC_022114	GCC	2	6	9842	9847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532360768
115	NC_022114	TGA	2	6	9863	9868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532360768
116	NC_022114	GAA	3	9	9910	9918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360768
117	NC_022114	AAC	2	6	10029	10034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532360768
118	NC_022114	AGA	2	6	10038	10043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360768
119	NC_022114	GGT	2	6	10351	10356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532360769
120	NC_022114	ATG	2	6	10458	10463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532360769
121	NC_022114	CTA	2	6	10535	10540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532360769
122	NC_022114	AAG	2	6	10551	10556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360769
123	NC_022114	GAC	2	6	10574	10579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532360769
124	NC_022114	ACA	2	6	10585	10590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532360769
125	NC_022114	CGT	2	6	10605	10610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532360769
126	NC_022114	CAG	2	6	10688	10693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532360769
127	NC_022114	AAC	2	6	10701	10706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532360769
128	NC_022114	CAA	2	6	11017	11022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532360769
129	NC_022114	ACG	2	6	11150	11155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532360769
130	NC_022114	AAG	2	6	11324	11329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360769
131	NC_022114	CAA	2	6	11341	11346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532360769
132	NC_022114	AAG	2	6	11378	11383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360769
133	NC_022114	CAG	2	6	11430	11435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532360769
134	NC_022114	AAG	2	6	11510	11515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360770
135	NC_022114	GCG	2	6	11541	11546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532360770
136	NC_022114	ATC	2	6	11558	11563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532360770
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153	NC_022114	GGT	2	6	12905	12910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532360771
154	NC_022114	CGT	2	6	13121	13126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532360771
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162	NC_022114	ATT	2	6	13842	13847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532360773
163	NC_022114	ATT	2	6	13981	13986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532360773
164	NC_022114	ACT	2	6	14010	14015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532360773
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242	NC_022114	TGA	3	9	19253	19261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532360779
243	NC_022114	ACA	2	6	19472	19477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532360779
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246	NC_022114	GCC	2	6	19623	19628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532360779
247	NC_022114	AGA	2	6	20230	20235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360780
248	NC_022114	AGA	2	6	20239	20244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360780
249	NC_022114	GAA	2	6	20248	20253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360780
250	NC_022114	TAT	2	6	20482	20487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532360780
251	NC_022114	GAA	2	6	20531	20536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532360780
252	NC_022114	GCG	2	6	20589	20594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532360780
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254	NC_022114	TGG	2	6	20782	20787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532360780
255	NC_022114	ACT	2	6	20958	20963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532360780
256	NC_022114	CAA	2	6	21040	21045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532360780
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279	NC_022114	GAT	2	6	23789	23794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532360782

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.