MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus paracasei subsp. paracasei 8700:2

Total Repeats: 47092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6004	NC_022112	TAC	2	6	390404	390409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355872
6005	NC_022112	AAG	2	6	390514	390519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355872
6006	NC_022112	TGAT	2	8	390520	390527	25 %	50 %	25 %	0 %	532355872
6007	NC_022112	GACA	2	8	390561	390568	50 %	0 %	25 %	25 %	532355872
6008	NC_022112	ATT	2	6	390592	390597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532355872
6009	NC_022112	GTG	2	6	390631	390636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532355872
6010	NC_022112	A	6	6	390655	390660	100 %	0 %	0 %	0 %	532355872
6011	NC_022112	TAA	2	6	390719	390724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532355872
6012	NC_022112	AT	3	6	390819	390824	50 %	50 %	0 %	0 %	532355872
6013	NC_022112	TAT	2	6	390849	390854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532355872
6014	NC_022112	A	6	6	390889	390894	100 %	0 %	0 %	0 %	532355872
6015	NC_022112	GTTG	2	8	390895	390902	0 %	50 %	50 %	0 %	532355872
6016	NC_022112	TAT	2	6	390909	390914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532355872
6017	NC_022112	CAA	2	6	390915	390920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355872
6018	NC_022112	AAG	2	6	390927	390932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355872
6019	NC_022112	AGG	2	6	391082	391087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532355872
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6021	NC_022112	TTC	2	6	391190	391195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532355872
6022	NC_022112	TAA	2	6	391250	391255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532355872
6023	NC_022112	AT	4	8	391272	391279	50 %	50 %	0 %	0 %	532355872
6024	NC_022112	CGA	2	6	391280	391285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355872
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6029	NC_022112	GAAA	2	8	391767	391774	75 %	0 %	25 %	0 %	532355873
6030	NC_022112	CAT	2	6	391780	391785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355873
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6035	NC_022112	TAAGAT	2	12	392014	392025	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532355873
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6039	NC_022112	GCA	2	6	392729	392734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355874
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6043	NC_022112	ACA	2	6	392870	392875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355874
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6054	NC_022112	A	6	6	393342	393347	100 %	0 %	0 %	0 %	532355874
6055	NC_022112	ATTT	2	8	393586	393593	25 %	75 %	0 %	0 %	532355875
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6061	NC_022112	TGC	2	6	393783	393788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355875
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6065	NC_022112	CAA	2	6	393944	393949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355875
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6122	NC_022112	GTT	2	6	396880	396885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532355877
6123	NC_022112	TGT	2	6	397005	397010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532355877
6124	NC_022112	AAT	2	6	397021	397026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532355877
6125	NC_022112	CAT	2	6	397080	397085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355877
6126	NC_022112	GTG	2	6	397103	397108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532355877
6127	NC_022112	ATG	2	6	397115	397120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355877
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6129	NC_022112	ATGT	2	8	397165	397172	25 %	50 %	25 %	0 %	532355877
6130	NC_022112	ATG	2	6	397186	397191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355877
6131	NC_022112	GCA	2	6	397192	397197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355877
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6133	NC_022112	TGGGAT	2	12	397209	397220	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	532355877
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6137	NC_022112	TGC	2	6	397716	397721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355878
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6142	NC_022112	ATC	2	6	397922	397927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355878
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6152	NC_022112	CGTA	2	8	398623	398630	25 %	25 %	25 %	25 %	532355879
6153	NC_022112	GTG	2	6	398633	398638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532355879
6154	NC_022112	TATTT	2	10	398659	398668	20 %	80 %	0 %	0 %	532355879
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6156	NC_022112	GTG	2	6	398833	398838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532355879
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6162	NC_022112	AAAG	2	8	399145	399152	75 %	0 %	25 %	0 %	532355879
6163	NC_022112	GCA	2	6	399165	399170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355880
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6165	NC_022112	TTG	2	6	399274	399279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532355880
6166	NC_022112	GGT	2	6	399383	399388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532355880
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6185	NC_022112	TTGG	2	8	400158	400165	0 %	50 %	50 %	0 %	532355880
6186	NC_022112	GAT	2	6	400322	400327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355880
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6194	NC_022112	GAT	2	6	400622	400627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355880
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6196	NC_022112	TGG	2	6	400691	400696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532355880
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6224	NC_022112	CAT	2	6	402396	402401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355882
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6226	NC_022112	ATG	2	6	402647	402652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355882
6227	NC_022112	GCGT	2	8	402656	402663	0 %	25 %	50 %	25 %	532355882
6228	NC_022112	ACTT	2	8	402664	402671	25 %	50 %	0 %	25 %	532355882
6229	NC_022112	TGAT	2	8	402773	402780	25 %	50 %	25 %	0 %	532355882
6230	NC_022112	TGC	2	6	402878	402883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355882
6231	NC_022112	ATG	2	6	402887	402892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355882
6232	NC_022112	CGC	2	6	402893	402898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532355882
6233	NC_022112	AAG	2	6	403048	403053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355882
6234	NC_022112	TGA	2	6	403064	403069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355882
6235	NC_022112	CAA	2	6	403074	403079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355882
6236	NC_022112	CGCAC	2	10	403093	403102	20 %	0 %	20 %	60 %	532355882
6237	NC_022112	TG	3	6	403133	403138	0 %	50 %	50 %	0 %	532355882
6238	NC_022112	TGA	2	6	403161	403166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355882
6239	NC_022112	GAT	2	6	403222	403227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355882
6240	NC_022112	GCG	2	6	403260	403265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532355882
6241	NC_022112	ATC	2	6	403286	403291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355882
6242	NC_022112	CAT	3	9	403296	403304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355882
6243	NC_022112	GCT	2	6	403354	403359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355882
6244	NC_022112	AGTG	2	8	403419	403426	25 %	25 %	50 %	0 %	532355882
6245	NC_022112	CGA	2	6	403436	403441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355882
6246	NC_022112	CTGG	2	8	403449	403456	0 %	25 %	50 %	25 %	532355882
6247	NC_022112	TCT	2	6	403577	403582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532355882
6248	NC_022112	TCA	2	6	403587	403592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355882
6249	NC_022112	GGC	2	6	403603	403608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532355882
6250	NC_022112	CAA	2	6	403645	403650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355882
6251	NC_022112	TAT	2	6	403663	403668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532355882
6252	NC_022112	TGG	2	6	403674	403679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532355882
6253	NC_022112	ACA	2	6	403700	403705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355882
6254	NC_022112	AAG	2	6	403771	403776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355882
6255	NC_022112	AATTT	2	10	403865	403874	40 %	60 %	0 %	0 %	532355882
6256	NC_022112	AAC	2	6	403947	403952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355882
6257	NC_022112	ATC	2	6	403999	404004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355882
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6262	NC_022112	CCA	2	6	404235	404240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532355882
6263	NC_022112	ATTG	2	8	404241	404248	25 %	50 %	25 %	0 %	532355882
6264	NC_022112	CTTG	2	8	404301	404308	0 %	50 %	25 %	25 %	532355882
6265	NC_022112	ACA	2	6	404318	404323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355882
6266	NC_022112	GTC	2	6	404395	404400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355882
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6269	NC_022112	TGC	2	6	404540	404545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355882
6270	NC_022112	AGC	2	6	404640	404645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355882
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6273	NC_022112	TTTG	2	8	404679	404686	0 %	75 %	25 %	0 %	532355882
6274	NC_022112	GT	3	6	404798	404803	0 %	50 %	50 %	0 %	532355882
6275	NC_022112	GCT	2	6	404830	404835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355882
6276	NC_022112	TGA	2	6	404955	404960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355882
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6280	NC_022112	CAA	2	6	405142	405147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355883
6281	NC_022112	TGA	2	6	405196	405201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355883
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6302	NC_022112	ATG	2	6	406030	406035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355883
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6343	NC_022112	AAAAC	2	10	408009	408018	80 %	0 %	0 %	20 %	532355884
6344	NC_022112	CGA	2	6	408034	408039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355884
6345	NC_022112	ATCT	2	8	408045	408052	25 %	50 %	0 %	25 %	532355884
6346	NC_022112	ATC	2	6	408063	408068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355884
6347	NC_022112	AAAT	2	8	408549	408556	75 %	25 %	0 %	0 %	532355885
6348	NC_022112	TAC	2	6	408658	408663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355885
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6351	NC_022112	TCA	2	6	408717	408722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355885
6352	NC_022112	CG	3	6	408728	408733	0 %	0 %	50 %	50 %	532355885
6353	NC_022112	CTT	2	6	408741	408746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532355885
6354	NC_022112	CCA	2	6	408751	408756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532355885
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6356	NC_022112	TTTA	2	8	408874	408881	25 %	75 %	0 %	0 %	532355885
6357	NC_022112	ATT	2	6	408912	408917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532355885
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6360	NC_022112	ATC	2	6	408947	408952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355885
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6363	NC_022112	CAG	2	6	409042	409047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355885
6364	NC_022112	ATG	2	6	409244	409249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355885
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6484	NC_022112	AAG	2	6	416475	416480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355892
6485	NC_022112	CTT	2	6	416569	416574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532355892
6486	NC_022112	GATGTT	2	12	416638	416649	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532355892
6487	NC_022112	GCA	2	6	416671	416676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355892
6488	NC_022112	CG	3	6	416684	416689	0 %	0 %	50 %	50 %	532355892
6489	NC_022112	GTT	2	6	416690	416695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532355892
6490	NC_022112	GAC	2	6	416696	416701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355892
6491	NC_022112	AAG	2	6	416729	416734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355892
6492	NC_022112	CAG	2	6	416741	416746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355892
6493	NC_022112	T	6	6	417069	417074	0 %	100 %	0 %	0 %	532355893
6494	NC_022112	CAAA	2	8	417129	417136	75 %	0 %	0 %	25 %	532355893
6495	NC_022112	AAT	2	6	417153	417158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532355893
6496	NC_022112	CAT	3	9	417208	417216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355893
6497	NC_022112	GTA	2	6	417265	417270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355893
6498	NC_022112	A	6	6	417294	417299	100 %	0 %	0 %	0 %	532355893
6499	NC_022112	AAC	2	6	417347	417352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355893
6500	NC_022112	AGT	2	6	417420	417425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355893

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