MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926 plasmid

Total Repeats: 1107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022051	TTC	2	6	26141	26146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341485
502	NC_022051	AGG	2	6	26162	26167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530341485
503	NC_022051	TC	4	8	26180	26187	0 %	50 %	0 %	50 %	530341485
504	NC_022051	ATA	2	6	26222	26227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341485
505	NC_022051	TCAT	2	8	26292	26299	25 %	50 %	0 %	25 %	530341485
506	NC_022051	GTA	2	6	26305	26310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341485
507	NC_022051	ACA	2	6	26685	26690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341486
508	NC_022051	ATT	2	6	26739	26744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341486
509	NC_022051	T	6	6	26753	26758	0 %	100 %	0 %	0 %	530341486
510	NC_022051	AG	4	8	26791	26798	50 %	0 %	50 %	0 %	530341486
511	NC_022051	A	7	7	26805	26811	100 %	0 %	0 %	0 %	530341486
512	NC_022051	GAA	2	6	26838	26843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341486
513	NC_022051	AGAA	2	8	26858	26865	75 %	0 %	25 %	0 %	530341486
514	NC_022051	TGA	2	6	26879	26884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341486
515	NC_022051	A	9	9	26893	26901	100 %	0 %	0 %	0 %	530341486
516	NC_022051	T	7	7	26908	26914	0 %	100 %	0 %	0 %	530341486
517	NC_022051	T	6	6	26922	26927	0 %	100 %	0 %	0 %	530341486
518	NC_022051	TTC	2	6	27004	27009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341486
519	NC_022051	CCACT	2	10	27111	27120	20 %	20 %	0 %	60 %	530341486
520	NC_022051	T	6	6	27120	27125	0 %	100 %	0 %	0 %	530341486
521	NC_022051	T	6	6	27176	27181	0 %	100 %	0 %	0 %	530341486
522	NC_022051	ACAAAA	2	12	27197	27208	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	530341486
523	NC_022051	CAA	2	6	27252	27257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341486
524	NC_022051	GAA	2	6	27278	27283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341487
525	NC_022051	A	6	6	27297	27302	100 %	0 %	0 %	0 %	530341487
526	NC_022051	AAGA	2	8	27317	27324	75 %	0 %	25 %	0 %	530341487
527	NC_022051	A	7	7	27326	27332	100 %	0 %	0 %	0 %	530341487
528	NC_022051	CAAA	3	12	27338	27349	75 %	0 %	0 %	25 %	530341487
529	NC_022051	TTC	2	6	27351	27356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341487
530	NC_022051	TTATC	2	10	27372	27381	20 %	60 %	0 %	20 %	530341487
531	NC_022051	ATC	2	6	27406	27411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341487
532	NC_022051	ATT	2	6	27414	27419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341487
533	NC_022051	ATT	2	6	27429	27434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341487
534	NC_022051	GA	3	6	27459	27464	50 %	0 %	50 %	0 %	530341487
535	NC_022051	AAGT	2	8	27588	27595	50 %	25 %	25 %	0 %	530341487
536	NC_022051	GAT	2	6	27665	27670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341487
537	NC_022051	GTA	2	6	27680	27685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341487
538	NC_022051	A	6	6	27714	27719	100 %	0 %	0 %	0 %	530341487
539	NC_022051	GAT	2	6	27734	27739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341487
540	NC_022051	GAA	2	6	27746	27751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341487
541	NC_022051	TGA	2	6	27793	27798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341487
542	NC_022051	A	6	6	27804	27809	100 %	0 %	0 %	0 %	530341487
543	NC_022051	A	6	6	27842	27847	100 %	0 %	0 %	0 %	530341487
544	NC_022051	AAC	2	6	27868	27873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341487
545	NC_022051	A	6	6	27884	27889	100 %	0 %	0 %	0 %	530341487
546	NC_022051	AAT	2	6	27907	27912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341487
547	NC_022051	ACA	2	6	27924	27929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341487
548	NC_022051	GAA	2	6	27934	27939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341487
549	NC_022051	GAA	2	6	27962	27967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341487
550	NC_022051	A	7	7	27966	27972	100 %	0 %	0 %	0 %	530341487
551	NC_022051	ATT	2	6	27977	27982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341487
552	NC_022051	CAA	2	6	27992	27997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341487
553	NC_022051	GAA	2	6	28031	28036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341487
554	NC_022051	ATA	2	6	28086	28091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341487
555	NC_022051	AAG	2	6	28110	28115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341487
556	NC_022051	GCT	2	6	28124	28129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530341487
557	NC_022051	GAA	2	6	28133	28138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341487
558	NC_022051	GAA	2	6	28153	28158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341487
559	NC_022051	TAAA	2	8	28186	28193	75 %	25 %	0 %	0 %	530341487
560	NC_022051	ATT	2	6	28552	28557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341488
561	NC_022051	A	7	7	28624	28630	100 %	0 %	0 %	0 %	530341488
562	NC_022051	CG	3	6	28636	28641	0 %	0 %	50 %	50 %	530341488
563	NC_022051	TGC	2	6	28673	28678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530341488
564	NC_022051	GGA	2	6	28682	28687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530341488
565	NC_022051	ATC	2	6	28693	28698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341488
566	NC_022051	AAG	2	6	28711	28716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341488
567	NC_022051	A	6	6	28726	28731	100 %	0 %	0 %	0 %	530341488
568	NC_022051	ATC	2	6	28743	28748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341488
569	NC_022051	ATT	2	6	28772	28777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341488
570	NC_022051	AAGA	2	8	28865	28872	75 %	0 %	25 %	0 %	530341489
571	NC_022051	CAAT	2	8	28899	28906	50 %	25 %	0 %	25 %	530341489
572	NC_022051	TAT	2	6	28909	28914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341489
573	NC_022051	AAC	2	6	28932	28937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341489
574	NC_022051	GAA	2	6	28976	28981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341489
575	NC_022051	A	6	6	29028	29033	100 %	0 %	0 %	0 %	530341489
576	NC_022051	TCA	2	6	29127	29132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341489
577	NC_022051	CA	3	6	29131	29136	50 %	0 %	0 %	50 %	530341489
578	NC_022051	AGA	3	9	29143	29151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341489
579	NC_022051	ACG	2	6	29158	29163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341489
580	NC_022051	AAG	2	6	29190	29195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341489
581	NC_022051	A	6	6	29204	29209	100 %	0 %	0 %	0 %	530341489
582	NC_022051	CAG	2	6	29254	29259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341490
583	NC_022051	GTATT	2	10	29260	29269	20 %	60 %	20 %	0 %	530341490
584	NC_022051	AT	3	6	29339	29344	50 %	50 %	0 %	0 %	530341490
585	NC_022051	TGA	2	6	29351	29356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341490
586	NC_022051	GAA	3	9	29403	29411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341490
587	NC_022051	AGA	3	9	29417	29425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341490
588	NC_022051	A	6	6	29439	29444	100 %	0 %	0 %	0 %	530341490
589	NC_022051	A	6	6	29470	29475	100 %	0 %	0 %	0 %	530341490
590	NC_022051	CAG	2	6	29512	29517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341490
591	NC_022051	GAAAA	2	10	29520	29529	80 %	0 %	20 %	0 %	530341490
592	NC_022051	A	6	6	29526	29531	100 %	0 %	0 %	0 %	530341490
593	NC_022051	ATA	3	9	29560	29568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341490
594	NC_022051	A	6	6	29656	29661	100 %	0 %	0 %	0 %	530341490
595	NC_022051	CAA	2	6	29667	29672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341490
596	NC_022051	AGA	2	6	29708	29713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341490
597	NC_022051	AGC	2	6	29738	29743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341490
598	NC_022051	AACC	2	8	29791	29798	50 %	0 %	0 %	50 %	530341490
599	NC_022051	A	6	6	29823	29828	100 %	0 %	0 %	0 %	530341490
600	NC_022051	CAA	2	6	29890	29895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341490
601	NC_022051	T	6	6	29944	29949	0 %	100 %	0 %	0 %	530341490
602	NC_022051	TGA	2	6	29960	29965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341490
603	NC_022051	CTT	2	6	29982	29987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341490
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606	NC_022051	T	6	6	30042	30047	0 %	100 %	0 %	0 %	530341490
607	NC_022051	A	6	6	30116	30121	100 %	0 %	0 %	0 %	530341490
608	NC_022051	GGT	2	6	30122	30127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530341490
609	NC_022051	ATT	2	6	30145	30150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341490
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611	NC_022051	AGA	2	6	30167	30172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341490
612	NC_022051	GCA	2	6	30215	30220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341490
613	NC_022051	GA	3	6	30232	30237	50 %	0 %	50 %	0 %	530341490
614	NC_022051	AC	3	6	30254	30259	50 %	0 %	0 %	50 %	530341490
615	NC_022051	AG	3	6	30266	30271	50 %	0 %	50 %	0 %	530341490
616	NC_022051	TA	3	6	30286	30291	50 %	50 %	0 %	0 %	530341490
617	NC_022051	TTC	2	6	30310	30315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341490
618	NC_022051	A	7	7	30323	30329	100 %	0 %	0 %	0 %	530341490
619	NC_022051	ATT	2	6	30367	30372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341490
620	NC_022051	CAG	2	6	30378	30383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341490
621	NC_022051	GA	3	6	30429	30434	50 %	0 %	50 %	0 %	530341490
622	NC_022051	GAA	2	6	30512	30517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341490
623	NC_022051	GAA	2	6	30531	30536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341490
624	NC_022051	A	6	6	30596	30601	100 %	0 %	0 %	0 %	530341491
625	NC_022051	AAGA	2	8	30612	30619	75 %	0 %	25 %	0 %	530341491
626	NC_022051	GAT	2	6	30658	30663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341491
627	NC_022051	AAG	2	6	30689	30694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341491
628	NC_022051	AGT	3	9	30717	30725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341491
629	NC_022051	AAAGAA	2	12	30739	30750	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	530341491
630	NC_022051	GAC	2	6	30771	30776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341491
631	NC_022051	AGG	2	6	30799	30804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530341491
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761	NC_022051	TAA	2	6	37323	37328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341500
762	NC_022051	GTC	2	6	37346	37351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530341500
763	NC_022051	CAT	2	6	37450	37455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341500
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777	NC_022051	A	6	6	37915	37920	100 %	0 %	0 %	0 %	530341500
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783	NC_022051	A	6	6	38147	38152	100 %	0 %	0 %	0 %	530341500
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792	NC_022051	A	6	6	38473	38478	100 %	0 %	0 %	0 %	530341500
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802	NC_022051	AAT	2	6	38997	39002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341455
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882	NC_022051	TCC	2	6	43752	43757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530341505
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887	NC_022051	A	6	6	44004	44009	100 %	0 %	0 %	0 %	530341505
888	NC_022051	AGA	2	6	44022	44027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341505
889	NC_022051	A	6	6	44045	44050	100 %	0 %	0 %	0 %	530341505
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