MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817 plasmid

Total Repeats: 1112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022047	TCT	2	6	50758	50763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314121
1002	NC_022047	AATA	2	8	50767	50774	75 %	25 %	0 %	0 %	530314121
1003	NC_022047	CCA	2	6	50802	50807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314121
1004	NC_022047	ACC	2	6	50819	50824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314121
1005	NC_022047	ATC	2	6	50852	50857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314121
1006	NC_022047	ATA	2	6	50904	50909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314121
1007	NC_022047	AAC	2	6	50928	50933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314121
1008	NC_022047	CAA	2	6	50938	50943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314121
1009	NC_022047	CAA	2	6	50986	50991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314121
1010	NC_022047	AATA	2	8	51034	51041	75 %	25 %	0 %	0 %	530314121
1011	NC_022047	AAAT	2	8	51058	51065	75 %	25 %	0 %	0 %	530314121
1012	NC_022047	TC	3	6	51081	51086	0 %	50 %	0 %	50 %	530314121
1013	NC_022047	TTAAT	2	10	51236	51245	40 %	60 %	0 %	0 %	530314177
1014	NC_022047	A	7	7	51247	51253	100 %	0 %	0 %	0 %	530314177
1015	NC_022047	TAT	2	6	51266	51271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314177
1016	NC_022047	T	6	6	51271	51276	0 %	100 %	0 %	0 %	530314177
1017	NC_022047	AAT	2	6	51424	51429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314177
1018	NC_022047	CTT	2	6	51532	51537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314177
1019	NC_022047	A	6	6	51571	51576	100 %	0 %	0 %	0 %	530314177
1020	NC_022047	GAT	2	6	51624	51629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314177
1021	NC_022047	T	6	6	51658	51663	0 %	100 %	0 %	0 %	530314177
1022	NC_022047	TCA	2	6	51684	51689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314177
1023	NC_022047	T	6	6	51694	51699	0 %	100 %	0 %	0 %	530314177
1024	NC_022047	ATG	2	6	51704	51709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314177
1025	NC_022047	T	6	6	51747	51752	0 %	100 %	0 %	0 %	530314177
1026	NC_022047	TTA	2	6	51781	51786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314177
1027	NC_022047	ACA	2	6	51814	51819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314177
1028	NC_022047	TCA	2	6	51822	51827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314177
1029	NC_022047	TAA	2	6	51834	51839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314177
1030	NC_022047	AGA	2	6	51840	51845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314177
1031	NC_022047	TAA	2	6	51965	51970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314178
1032	NC_022047	CAA	2	6	52010	52015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314178
1033	NC_022047	TAA	2	6	52022	52027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314178
1034	NC_022047	GTT	2	6	52032	52037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314178
1035	NC_022047	A	6	6	52068	52073	100 %	0 %	0 %	0 %	530314178
1036	NC_022047	TAC	2	6	52081	52086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314178
1037	NC_022047	AAG	2	6	52099	52104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314178
1038	NC_022047	CTA	2	6	52176	52181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314178
1039	NC_022047	GGA	2	6	52212	52217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530314178
1040	NC_022047	CAA	3	9	52269	52277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314179
1041	NC_022047	A	7	7	52283	52289	100 %	0 %	0 %	0 %	530314179
1042	NC_022047	TGGA	2	8	52299	52306	25 %	25 %	50 %	0 %	530314179
1043	NC_022047	TTAAC	2	10	52323	52332	40 %	40 %	0 %	20 %	530314179
1044	NC_022047	ATG	2	6	52356	52361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314179
1045	NC_022047	A	8	8	52429	52436	100 %	0 %	0 %	0 %	530314179
1046	NC_022047	GAAT	2	8	52464	52471	50 %	25 %	25 %	0 %	530314179
1047	NC_022047	CAA	2	6	52485	52490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314179
1048	NC_022047	CAGT	2	8	52521	52528	25 %	25 %	25 %	25 %	530314179
1049	NC_022047	ATTAAC	2	12	52582	52593	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	530314179
1050	NC_022047	ACT	2	6	52606	52611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314179
1051	NC_022047	A	6	6	52612	52617	100 %	0 %	0 %	0 %	530314179
1052	NC_022047	AT	3	6	52641	52646	50 %	50 %	0 %	0 %	530314179
1053	NC_022047	TA	3	6	52648	52653	50 %	50 %	0 %	0 %	530314179
1054	NC_022047	AATATA	2	12	52654	52665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314179
1055	NC_022047	G	6	6	52669	52674	0 %	0 %	100 %	0 %	530314180
1056	NC_022047	T	8	8	52697	52704	0 %	100 %	0 %	0 %	530314180
1057	NC_022047	ATA	2	6	52716	52721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314180
1058	NC_022047	GAT	2	6	52731	52736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314180
1059	NC_022047	GAA	2	6	52742	52747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314180
1060	NC_022047	TAA	2	6	52748	52753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314180
1061	NC_022047	AT	3	6	52754	52759	50 %	50 %	0 %	0 %	530314180
1062	NC_022047	AGC	2	6	52766	52771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314180
1063	NC_022047	AAC	2	6	52772	52777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314180
1064	NC_022047	CAG	2	6	52821	52826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314180
1065	NC_022047	AGG	2	6	52831	52836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530314180
1066	NC_022047	TATC	2	8	52850	52857	25 %	50 %	0 %	25 %	530314180
1067	NC_022047	AAG	2	6	52858	52863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314180
1068	NC_022047	AAC	2	6	52864	52869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314180
1069	NC_022047	ATG	2	6	52896	52901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314180
1070	NC_022047	AAG	2	6	52912	52917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314180
1071	NC_022047	ATGG	2	8	53043	53050	25 %	25 %	50 %	0 %	530314180
1072	NC_022047	A	6	6	53053	53058	100 %	0 %	0 %	0 %	530314180
1073	NC_022047	T	6	6	53084	53089	0 %	100 %	0 %	0 %	530314180
1074	NC_022047	TTA	2	6	53098	53103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314180
1075	NC_022047	A	6	6	53109	53114	100 %	0 %	0 %	0 %	530314180
1076	NC_022047	AAT	2	6	53142	53147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314180
1077	NC_022047	A	7	7	53238	53244	100 %	0 %	0 %	0 %	530314180
1078	NC_022047	AAG	2	6	53266	53271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314180
1079	NC_022047	TGA	2	6	53354	53359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314180
1080	NC_022047	ATT	2	6	53372	53377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314180
1081	NC_022047	CGA	2	6	53402	53407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314180
1082	NC_022047	CTA	2	6	53443	53448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314180
1083	NC_022047	CAAT	2	8	53518	53525	50 %	25 %	0 %	25 %	530314180
1084	NC_022047	GATG	2	8	53548	53555	25 %	25 %	50 %	0 %	530314180
1085	NC_022047	TGG	2	6	53642	53647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530314180
1086	NC_022047	ACT	2	6	53678	53683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314180
1087	NC_022047	A	6	6	53733	53738	100 %	0 %	0 %	0 %	530314180
1088	NC_022047	AAT	2	6	53763	53768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314180
1089	NC_022047	ACA	2	6	53806	53811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314180
1090	NC_022047	CAA	2	6	53927	53932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314180
1091	NC_022047	TA	3	6	53962	53967	50 %	50 %	0 %	0 %	530314180
1092	NC_022047	A	6	6	53967	53972	100 %	0 %	0 %	0 %	530314180
1093	NC_022047	TAG	2	6	54008	54013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314180
1094	NC_022047	ATG	2	6	54015	54020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314180
1095	NC_022047	CTT	2	6	54153	54158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314180
1096	NC_022047	AT	3	6	54199	54204	50 %	50 %	0 %	0 %	530314180
1097	NC_022047	ATG	2	6	54225	54230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314180
1098	NC_022047	GAA	2	6	54303	54308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314122
1099	NC_022047	A	6	6	54307	54312	100 %	0 %	0 %	0 %	530314122
1100	NC_022047	ATT	2	6	54349	54354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314122
1101	NC_022047	AAT	2	6	54405	54410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314122
1102	NC_022047	TGTA	2	8	54461	54468	25 %	50 %	25 %	0 %	530314122
1103	NC_022047	TGA	2	6	54521	54526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314122
1104	NC_022047	GAT	2	6	54528	54533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314122
1105	NC_022047	TAA	2	6	54650	54655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314122
1106	NC_022047	ATA	2	6	54667	54672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314122
1107	NC_022047	TAG	2	6	54695	54700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314122
1108	NC_022047	ACA	2	6	54735	54740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314122
1109	NC_022047	TAA	2	6	54779	54784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314122
1110	NC_022047	A	6	6	54866	54871	100 %	0 %	0 %	0 %	530314122
1111	NC_022047	ATG	2	6	54892	54897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314122
1112	NC_022047	TGG	2	6	54947	54952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530314122

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