MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817 plasmid

Total Repeats: 1112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022047	CGAA	2	8	26627	26634	50 %	0 %	25 %	25 %	530314148
502	NC_022047	TTC	2	6	26671	26676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314148
503	NC_022047	CTT	2	6	26703	26708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314148
504	NC_022047	ATTTCA	2	12	26724	26735	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	530314148
505	NC_022047	TGA	2	6	26741	26746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314148
506	NC_022047	AAT	2	6	26773	26778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314148
507	NC_022047	AAGC	2	8	26803	26810	50 %	0 %	25 %	25 %	530314148
508	NC_022047	GCA	2	6	26829	26834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314148
509	NC_022047	ATGTT	2	10	26903	26912	20 %	60 %	20 %	0 %	530314148
510	NC_022047	CTTG	2	8	26923	26930	0 %	50 %	25 %	25 %	530314148
511	NC_022047	CTGAA	2	10	26999	27008	40 %	20 %	20 %	20 %	530314148
512	NC_022047	GT	3	6	27164	27169	0 %	50 %	50 %	0 %	530314148
513	NC_022047	A	6	6	27181	27186	100 %	0 %	0 %	0 %	530314148
514	NC_022047	GAA	2	6	27307	27312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314148
515	NC_022047	A	6	6	27337	27342	100 %	0 %	0 %	0 %	530314148
516	NC_022047	ATT	2	6	27364	27369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314148
517	NC_022047	A	8	8	27461	27468	100 %	0 %	0 %	0 %	530314148
518	NC_022047	TTG	2	6	27494	27499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314148
519	NC_022047	CAG	2	6	27512	27517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314148
520	NC_022047	AG	3	6	27558	27563	50 %	0 %	50 %	0 %	530314148
521	NC_022047	AGT	2	6	27673	27678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314148
522	NC_022047	ACA	2	6	27808	27813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314149
523	NC_022047	ATG	2	6	27849	27854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314149
524	NC_022047	A	8	8	27961	27968	100 %	0 %	0 %	0 %	530314150
525	NC_022047	A	6	6	27974	27979	100 %	0 %	0 %	0 %	530314150
526	NC_022047	TCA	2	6	27994	27999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314150
527	NC_022047	TAT	3	9	28220	28228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314150
528	NC_022047	TGGA	2	8	28338	28345	25 %	25 %	50 %	0 %	530314150
529	NC_022047	A	6	6	28384	28389	100 %	0 %	0 %	0 %	530314150
530	NC_022047	GAA	2	6	28402	28407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314150
531	NC_022047	AAG	2	6	28444	28449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314117
532	NC_022047	CTT	2	6	28517	28522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314117
533	NC_022047	CGA	2	6	28540	28545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314117
534	NC_022047	TTC	2	6	28551	28556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314117
535	NC_022047	TTC	2	6	28558	28563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314117
536	NC_022047	AAAG	2	8	28572	28579	75 %	0 %	25 %	0 %	530314117
537	NC_022047	GCTC	2	8	28735	28742	0 %	25 %	25 %	50 %	530314117
538	NC_022047	GA	3	6	28805	28810	50 %	0 %	50 %	0 %	530314117
539	NC_022047	T	7	7	28845	28851	0 %	100 %	0 %	0 %	530314117
540	NC_022047	AGA	2	6	28935	28940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314117
541	NC_022047	CTT	2	6	29188	29193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314151
542	NC_022047	TTTC	2	8	29252	29259	0 %	75 %	0 %	25 %	530314151
543	NC_022047	AAGT	2	8	29284	29291	50 %	25 %	25 %	0 %	530314151
544	NC_022047	TCT	2	6	29297	29302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314151
545	NC_022047	TCG	2	6	29327	29332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314151
546	NC_022047	T	7	7	29359	29365	0 %	100 %	0 %	0 %	530314151
547	NC_022047	AACA	2	8	29435	29442	75 %	0 %	0 %	25 %	530314151
548	NC_022047	CGAT	2	8	29453	29460	25 %	25 %	25 %	25 %	530314151
549	NC_022047	TAA	2	6	29557	29562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314151
550	NC_022047	CTT	2	6	29575	29580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314151
551	NC_022047	T	6	6	29579	29584	0 %	100 %	0 %	0 %	530314151
552	NC_022047	T	7	7	29657	29663	0 %	100 %	0 %	0 %	530314151
553	NC_022047	CTTT	2	8	29666	29673	0 %	75 %	0 %	25 %	530314151
554	NC_022047	T	6	6	29671	29676	0 %	100 %	0 %	0 %	530314151
555	NC_022047	TTG	2	6	29692	29697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314151
556	NC_022047	TTTC	2	8	29769	29776	0 %	75 %	0 %	25 %	530314151
557	NC_022047	AATTC	2	10	29787	29796	40 %	40 %	0 %	20 %	530314151
558	NC_022047	CAT	2	6	29830	29835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314151
559	NC_022047	TCC	2	6	29837	29842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530314151
560	NC_022047	ATC	2	6	29870	29875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314152
561	NC_022047	TTC	2	6	29891	29896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314152
562	NC_022047	TCT	2	6	29898	29903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314152
563	NC_022047	CAAA	2	8	30009	30016	75 %	0 %	0 %	25 %	530314152
564	NC_022047	CTT	2	6	30046	30051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314152
565	NC_022047	AT	3	6	30057	30062	50 %	50 %	0 %	0 %	530314152
566	NC_022047	GATG	2	8	30169	30176	25 %	25 %	50 %	0 %	530314152
567	NC_022047	TGT	2	6	30220	30225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314152
568	NC_022047	AT	3	6	30269	30274	50 %	50 %	0 %	0 %	530314152
569	NC_022047	TTTG	2	8	30363	30370	0 %	75 %	25 %	0 %	530314152
570	NC_022047	GAC	2	6	30382	30387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314152
571	NC_022047	TG	3	6	30450	30455	0 %	50 %	50 %	0 %	530314152
572	NC_022047	TAC	2	6	30466	30471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314152
573	NC_022047	TTTC	2	8	30679	30686	0 %	75 %	0 %	25 %	530314152
574	NC_022047	TTC	2	6	30749	30754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314152
575	NC_022047	T	6	6	30806	30811	0 %	100 %	0 %	0 %	530314152
576	NC_022047	AAT	2	6	30866	30871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314152
577	NC_022047	TTC	2	6	30872	30877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314152
578	NC_022047	AGG	2	6	30893	30898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530314152
579	NC_022047	TC	4	8	30911	30918	0 %	50 %	0 %	50 %	530314152
580	NC_022047	ATA	2	6	30953	30958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314152
581	NC_022047	TCAT	2	8	31023	31030	25 %	50 %	0 %	25 %	530314152
582	NC_022047	GTA	2	6	31036	31041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314152
583	NC_022047	ACA	2	6	31416	31421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314153
584	NC_022047	ATT	2	6	31470	31475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314153
585	NC_022047	T	6	6	31484	31489	0 %	100 %	0 %	0 %	530314153
586	NC_022047	AG	4	8	31522	31529	50 %	0 %	50 %	0 %	530314153
587	NC_022047	A	7	7	31536	31542	100 %	0 %	0 %	0 %	530314153
588	NC_022047	GAA	2	6	31569	31574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314153
589	NC_022047	AGAA	2	8	31589	31596	75 %	0 %	25 %	0 %	530314153
590	NC_022047	TGA	2	6	31610	31615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314153
591	NC_022047	A	9	9	31624	31632	100 %	0 %	0 %	0 %	530314153
592	NC_022047	T	7	7	31639	31645	0 %	100 %	0 %	0 %	530314153
593	NC_022047	T	6	6	31653	31658	0 %	100 %	0 %	0 %	530314153
594	NC_022047	TTC	2	6	31735	31740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314153
595	NC_022047	CCACT	2	10	31842	31851	20 %	20 %	0 %	60 %	530314153
596	NC_022047	T	6	6	31851	31856	0 %	100 %	0 %	0 %	530314153
597	NC_022047	T	6	6	31907	31912	0 %	100 %	0 %	0 %	530314153
598	NC_022047	ACAAAA	2	12	31928	31939	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	530314153
599	NC_022047	CAA	2	6	31983	31988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314153
600	NC_022047	GAA	2	6	32009	32014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314154
601	NC_022047	A	6	6	32028	32033	100 %	0 %	0 %	0 %	530314154
602	NC_022047	AAGA	2	8	32048	32055	75 %	0 %	25 %	0 %	530314154
603	NC_022047	A	7	7	32057	32063	100 %	0 %	0 %	0 %	530314154
604	NC_022047	CAAA	3	12	32069	32080	75 %	0 %	0 %	25 %	530314154
605	NC_022047	TTC	2	6	32082	32087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314154
606	NC_022047	TTATC	2	10	32103	32112	20 %	60 %	0 %	20 %	530314154
607	NC_022047	ATC	2	6	32137	32142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314154
608	NC_022047	ATT	2	6	32145	32150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314154
609	NC_022047	ATT	2	6	32160	32165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314154
610	NC_022047	GA	3	6	32190	32195	50 %	0 %	50 %	0 %	530314154
611	NC_022047	AAGT	2	8	32319	32326	50 %	25 %	25 %	0 %	530314154
612	NC_022047	GAT	2	6	32396	32401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314154
613	NC_022047	GTA	2	6	32411	32416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314154
614	NC_022047	A	6	6	32445	32450	100 %	0 %	0 %	0 %	530314154
615	NC_022047	GAT	2	6	32465	32470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314154
616	NC_022047	GAA	2	6	32477	32482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314154
617	NC_022047	TGA	2	6	32524	32529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314154
618	NC_022047	A	6	6	32535	32540	100 %	0 %	0 %	0 %	530314154
619	NC_022047	A	6	6	32573	32578	100 %	0 %	0 %	0 %	530314154
620	NC_022047	AAC	2	6	32599	32604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314154
621	NC_022047	A	6	6	32615	32620	100 %	0 %	0 %	0 %	530314154
622	NC_022047	AAT	2	6	32638	32643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314154
623	NC_022047	ACA	2	6	32655	32660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314154
624	NC_022047	GAA	2	6	32665	32670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314154
625	NC_022047	GAA	2	6	32693	32698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314154
626	NC_022047	A	7	7	32697	32703	100 %	0 %	0 %	0 %	530314154
627	NC_022047	ATT	2	6	32708	32713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314154
628	NC_022047	CAA	2	6	32723	32728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314154
629	NC_022047	GAA	2	6	32762	32767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314154
630	NC_022047	ATA	2	6	32817	32822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314154
631	NC_022047	AAG	2	6	32841	32846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314154
632	NC_022047	GCT	2	6	32855	32860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314154
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762	NC_022047	GCT	2	6	38210	38215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314163
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777	NC_022047	GAAA	2	8	39015	39022	75 %	0 %	25 %	0 %	530314163
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879	NC_022047	GTA	2	6	43759	43764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314118
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882	NC_022047	TAA	2	6	43805	43810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314118
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885	NC_022047	T	7	7	43885	43891	0 %	100 %	0 %	0 %	530314118
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