MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776 plasmid

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022046	AT	3	6	732	737	50 %	50 %	0 %	0 %	530314052
2	NC_022046	TA	3	6	2516	2521	50 %	50 %	0 %	0 %	530314054
3	NC_022046	AT	3	6	2665	2670	50 %	50 %	0 %	0 %	530314054
4	NC_022046	AG	3	6	3820	3825	50 %	0 %	50 %	0 %	530314055
5	NC_022046	AT	3	6	4209	4214	50 %	50 %	0 %	0 %	530314055
6	NC_022046	TG	3	6	4313	4318	0 %	50 %	50 %	0 %	530314055
7	NC_022046	GA	3	6	4976	4981	50 %	0 %	50 %	0 %	530314056
8	NC_022046	AT	3	6	5212	5217	50 %	50 %	0 %	0 %	530314057
9	NC_022046	AT	3	6	5233	5238	50 %	50 %	0 %	0 %	530314057
10	NC_022046	CT	3	6	5400	5405	0 %	50 %	0 %	50 %	530314057
11	NC_022046	GT	3	6	6127	6132	0 %	50 %	50 %	0 %	530314058
12	NC_022046	AT	3	6	7412	7417	50 %	50 %	0 %	0 %	530314058
13	NC_022046	AG	3	6	7489	7494	50 %	0 %	50 %	0 %	530314058
14	NC_022046	CT	3	6	8500	8505	0 %	50 %	0 %	50 %	530314060
15	NC_022046	CT	3	6	8619	8624	0 %	50 %	0 %	50 %	530314060
16	NC_022046	AT	4	8	9583	9590	50 %	50 %	0 %	0 %	530314061
17	NC_022046	AG	3	6	10468	10473	50 %	0 %	50 %	0 %	530314061
18	NC_022046	GA	3	6	10918	10923	50 %	0 %	50 %	0 %	530314062
19	NC_022046	TG	3	6	11406	11411	0 %	50 %	50 %	0 %	530314039
20	NC_022046	AT	3	6	12099	12104	50 %	50 %	0 %	0 %	530314063
21	NC_022046	TA	3	6	14207	14212	50 %	50 %	0 %	0 %	530314064
22	NC_022046	CT	3	6	16148	16153	0 %	50 %	0 %	50 %	530314042
23	NC_022046	GA	3	6	16299	16304	50 %	0 %	50 %	0 %	530314042
24	NC_022046	TA	3	6	16318	16323	50 %	50 %	0 %	0 %	530314065
25	NC_022046	TA	3	6	16685	16690	50 %	50 %	0 %	0 %	530314065
26	NC_022046	TA	3	6	16876	16881	50 %	50 %	0 %	0 %	530314066
27	NC_022046	GA	3	6	17872	17877	50 %	0 %	50 %	0 %	530314067
28	NC_022046	AT	3	6	19798	19803	50 %	50 %	0 %	0 %	530314069
29	NC_022046	AG	3	6	20108	20113	50 %	0 %	50 %	0 %	530314069
30	NC_022046	TA	3	6	20489	20494	50 %	50 %	0 %	0 %	530314069
31	NC_022046	AG	3	6	21233	21238	50 %	0 %	50 %	0 %	530314071
32	NC_022046	GA	3	6	21239	21244	50 %	0 %	50 %	0 %	530314071
33	NC_022046	GT	3	6	22369	22374	0 %	50 %	50 %	0 %	530314071
34	NC_022046	AG	3	6	22763	22768	50 %	0 %	50 %	0 %	530314071
35	NC_022046	GA	3	6	24010	24015	50 %	0 %	50 %	0 %	530314044
36	NC_022046	AT	3	6	25262	25267	50 %	50 %	0 %	0 %	530314075
37	NC_022046	AT	3	6	25474	25479	50 %	50 %	0 %	0 %	530314075
38	NC_022046	TG	3	6	25655	25660	0 %	50 %	50 %	0 %	530314075
39	NC_022046	TC	4	8	26116	26123	0 %	50 %	0 %	50 %	530314075
40	NC_022046	AG	4	8	26727	26734	50 %	0 %	50 %	0 %	530314076
41	NC_022046	GA	3	6	27395	27400	50 %	0 %	50 %	0 %	530314077
42	NC_022046	CG	3	6	28572	28577	0 %	0 %	50 %	50 %	530314078
43	NC_022046	CA	3	6	29067	29072	50 %	0 %	0 %	50 %	530314079
44	NC_022046	AT	3	6	29275	29280	50 %	50 %	0 %	0 %	530314080
45	NC_022046	GA	3	6	30168	30173	50 %	0 %	50 %	0 %	530314080
46	NC_022046	AC	3	6	30190	30195	50 %	0 %	0 %	50 %	530314080
47	NC_022046	AG	3	6	30202	30207	50 %	0 %	50 %	0 %	530314080
48	NC_022046	TA	3	6	30222	30227	50 %	50 %	0 %	0 %	530314080
49	NC_022046	GA	3	6	30365	30370	50 %	0 %	50 %	0 %	530314080
50	NC_022046	TG	3	6	32129	32134	0 %	50 %	50 %	0 %	530314083
51	NC_022046	AT	3	6	32889	32894	50 %	50 %	0 %	0 %	530314085
52	NC_022046	AT	3	6	33558	33563	50 %	50 %	0 %	0 %	530314086
53	NC_022046	AT	3	6	34602	34607	50 %	50 %	0 %	0 %	530314086
54	NC_022046	AG	4	8	35001	35008	50 %	0 %	50 %	0 %	530314087
55	NC_022046	CA	3	6	35465	35470	50 %	0 %	0 %	50 %	530314087
56	NC_022046	AT	3	6	35646	35651	50 %	50 %	0 %	0 %	530314087
57	NC_022046	AT	3	6	35858	35863	50 %	50 %	0 %	0 %	530314087
58	NC_022046	AC	3	6	38343	38348	50 %	0 %	0 %	50 %	530314090
59	NC_022046	AG	3	6	39252	39257	50 %	0 %	50 %	0 %	530314045
60	NC_022046	TA	4	8	39807	39814	50 %	50 %	0 %	0 %	530314046
61	NC_022046	AT	4	8	42055	42062	50 %	50 %	0 %	0 %	530314093
62	NC_022046	CA	3	6	42387	42392	50 %	0 %	0 %	50 %	530314094
63	NC_022046	AT	3	6	42491	42496	50 %	50 %	0 %	0 %	530314094
64	NC_022046	TC	3	6	42879	42884	0 %	50 %	0 %	50 %	530314094
65	NC_022046	AT	3	6	43992	43997	50 %	50 %	0 %	0 %	530314095
66	NC_022046	GT	3	6	44194	44199	0 %	50 %	50 %	0 %	530314095
67	NC_022046	GT	3	6	45376	45381	0 %	50 %	50 %	0 %	530314099
68	NC_022046	TC	3	6	46286	46291	0 %	50 %	0 %	50 %	530314048
69	NC_022046	AT	3	6	47846	47851	50 %	50 %	0 %	0 %	530314102
70	NC_022046	TA	3	6	47853	47858	50 %	50 %	0 %	0 %	530314102
71	NC_022046	AT	3	6	47959	47964	50 %	50 %	0 %	0 %	530314103
72	NC_022046	TA	3	6	49167	49172	50 %	50 %	0 %	0 %	530314103
73	NC_022046	AT	3	6	49404	49409	50 %	50 %	0 %	0 %	530314103
74	NC_022046	AT	3	6	51121	51126	50 %	50 %	0 %	0 %	530314104
75	NC_022046	AT	3	6	51212	51217	50 %	50 %	0 %	0 %	530314104
76	NC_022046	GA	3	6	53567	53572	50 %	0 %	50 %	0 %	530314109
77	NC_022046	TA	3	6	53767	53772	50 %	50 %	0 %	0 %	530314109
78	NC_022046	TA	3	6	54352	54357	50 %	50 %	0 %	0 %	530314050

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.