MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776 plasmid

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022046	CAAGA	2	10	833	842	60 %	0 %	20 %	20 %	530314052
2	NC_022046	TTTCT	2	10	4251	4260	0 %	80 %	0 %	20 %	530314055
3	NC_022046	TACTT	2	10	5185	5194	20 %	60 %	0 %	20 %	530314057
4	NC_022046	CTTTG	2	10	11908	11917	0 %	60 %	20 %	20 %	530314039
5	NC_022046	TATAC	2	10	12592	12601	40 %	40 %	0 %	20 %	530314063
6	NC_022046	TGTTA	2	10	12741	12750	20 %	60 %	20 %	0 %	530314063
7	NC_022046	TGAAA	2	10	16305	16314	60 %	20 %	20 %	0 %	530314042
8	NC_022046	TTGGA	2	10	17105	17114	20 %	40 %	40 %	0 %	530314066
9	NC_022046	TCTAT	2	10	18276	18285	20 %	60 %	0 %	20 %	530314043
10	NC_022046	TTTTA	2	10	21698	21707	20 %	80 %	0 %	0 %	530314071
11	NC_022046	ATGTT	2	10	22108	22117	20 %	60 %	20 %	0 %	530314071
12	NC_022046	CTGAA	2	10	22204	22213	40 %	20 %	20 %	20 %	530314071
13	NC_022046	AATTC	2	10	24992	25001	40 %	40 %	0 %	20 %	530314074
14	NC_022046	CCACT	2	10	27047	27056	20 %	20 %	0 %	60 %	530314076
15	NC_022046	TTATC	2	10	27308	27317	20 %	60 %	0 %	20 %	530314077
16	NC_022046	GTATT	2	10	29196	29205	20 %	60 %	20 %	0 %	530314080
17	NC_022046	GAAAA	2	10	29456	29465	80 %	0 %	20 %	0 %	530314080
18	NC_022046	GATCG	2	10	32897	32906	20 %	20 %	40 %	20 %	530314085
19	NC_022046	CAAGA	2	10	34182	34191	60 %	0 %	20 %	20 %	530314086
20	NC_022046	AAACA	2	10	34407	34416	80 %	0 %	0 %	20 %	530314086
21	NC_022046	GGGTG	2	10	34622	34631	0 %	20 %	80 %	0 %	530314086
22	NC_022046	GAATT	2	10	36124	36133	40 %	40 %	20 %	0 %	530314088
23	NC_022046	CATAA	2	10	37844	37853	60 %	20 %	0 %	20 %	530314090
24	NC_022046	GATTT	2	10	38757	38766	20 %	60 %	20 %	0 %	530314045
25	NC_022046	AGAAA	2	10	43620	43629	80 %	0 %	20 %	0 %	530314095
26	NC_022046	TAAAC	2	10	43866	43875	60 %	20 %	0 %	20 %	530314095
27	NC_022046	TTAAT	2	10	46441	46450	40 %	60 %	0 %	0 %	530314100
28	NC_022046	TTAAC	2	10	47528	47537	40 %	40 %	0 %	20 %	530314102
29	NC_022046	TTAGT	2	10	50237	50246	20 %	60 %	20 %	0 %	530314104
30	NC_022046	AGATG	2	10	52363	52372	40 %	20 %	40 %	0 %	530314106
31	NC_022046	CATAC	2	10	55333	55342	40 %	20 %	0 %	40 %	530314050

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.