MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776 plasmid

Total Repeats: 1141

Go To Repeat Summary Page

< Previous 1 23Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022046	A	7	7	48443	48449	100 %	0 %	0 %	0 %	530314103
1002	NC_022046	AAG	2	6	48471	48476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314103
1003	NC_022046	TGA	2	6	48559	48564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314103
1004	NC_022046	ATT	2	6	48577	48582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314103
1005	NC_022046	CGA	2	6	48607	48612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314103
1006	NC_022046	CTA	2	6	48648	48653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314103
1007	NC_022046	CAAT	2	8	48723	48730	50 %	25 %	0 %	25 %	530314103
1008	NC_022046	GATG	2	8	48753	48760	25 %	25 %	50 %	0 %	530314103
1009	NC_022046	TGG	2	6	48847	48852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530314103
1010	NC_022046	ACT	2	6	48883	48888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314103
1011	NC_022046	A	6	6	48938	48943	100 %	0 %	0 %	0 %	530314103
1012	NC_022046	AAT	2	6	48968	48973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314103
1013	NC_022046	ACA	2	6	49011	49016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314103
1014	NC_022046	CAA	2	6	49132	49137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314103
1015	NC_022046	TA	3	6	49167	49172	50 %	50 %	0 %	0 %	530314103
1016	NC_022046	A	6	6	49172	49177	100 %	0 %	0 %	0 %	530314103
1017	NC_022046	TAG	2	6	49213	49218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314103
1018	NC_022046	ATG	2	6	49220	49225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314103
1019	NC_022046	CTT	2	6	49358	49363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314103
1020	NC_022046	AT	3	6	49404	49409	50 %	50 %	0 %	0 %	530314103
1021	NC_022046	ATG	2	6	49430	49435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314103
1022	NC_022046	GAA	2	6	49508	49513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314049
1023	NC_022046	A	6	6	49512	49517	100 %	0 %	0 %	0 %	530314049
1024	NC_022046	ATT	2	6	49554	49559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314049
1025	NC_022046	AAT	2	6	49610	49615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314049
1026	NC_022046	TGTA	2	8	49666	49673	25 %	50 %	25 %	0 %	530314049
1027	NC_022046	TGA	2	6	49726	49731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314049
1028	NC_022046	GAT	2	6	49733	49738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314049
1029	NC_022046	TAA	2	6	49855	49860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314049
1030	NC_022046	ATA	2	6	49872	49877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314049
1031	NC_022046	TAG	2	6	49900	49905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314049
1032	NC_022046	ACA	2	6	49940	49945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314049
1033	NC_022046	TAA	2	6	49984	49989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314049
1034	NC_022046	A	6	6	50071	50076	100 %	0 %	0 %	0 %	530314049
1035	NC_022046	ATG	2	6	50097	50102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314049
1036	NC_022046	TGG	2	6	50152	50157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530314049
1037	NC_022046	TAA	2	6	50222	50227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314104
1038	NC_022046	TTAGT	2	10	50237	50246	20 %	60 %	20 %	0 %	530314104
1039	NC_022046	AAG	2	6	50297	50302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314104
1040	NC_022046	TTG	2	6	50305	50310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314104
1041	NC_022046	GTAT	2	8	50316	50323	25 %	50 %	25 %	0 %	530314104
1042	NC_022046	GAA	2	6	50371	50376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314104
1043	NC_022046	GCA	2	6	50380	50385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314104
1044	NC_022046	AAT	2	6	50407	50412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314104
1045	NC_022046	ATTT	2	8	50413	50420	25 %	75 %	0 %	0 %	530314104
1046	NC_022046	AGA	2	6	50427	50432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314104
1047	NC_022046	A	8	8	50497	50504	100 %	0 %	0 %	0 %	530314104
1048	NC_022046	TTAA	2	8	50569	50576	50 %	50 %	0 %	0 %	530314104
1049	NC_022046	TAT	2	6	50608	50613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314104
1050	NC_022046	ATGT	2	8	50677	50684	25 %	50 %	25 %	0 %	530314104
1051	NC_022046	CTT	2	6	50698	50703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314104
1052	NC_022046	TCAT	2	8	50707	50714	25 %	50 %	0 %	25 %	530314104
1053	NC_022046	ATT	2	6	50827	50832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314104
1054	NC_022046	AAAT	2	8	50834	50841	75 %	25 %	0 %	0 %	530314104
1055	NC_022046	GGAA	2	8	50967	50974	50 %	0 %	50 %	0 %	530314104
1056	NC_022046	CAA	2	6	51072	51077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314104
1057	NC_022046	TAAA	2	8	51101	51108	75 %	25 %	0 %	0 %	530314104
1058	NC_022046	AT	3	6	51121	51126	50 %	50 %	0 %	0 %	530314104
1059	NC_022046	TTGA	2	8	51130	51137	25 %	50 %	25 %	0 %	530314104
1060	NC_022046	A	6	6	51174	51179	100 %	0 %	0 %	0 %	530314104
1061	NC_022046	AT	3	6	51212	51217	50 %	50 %	0 %	0 %	530314104
1062	NC_022046	AGATAA	2	12	51222	51233	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	530314104
1063	NC_022046	GTT	2	6	51244	51249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314104
1064	NC_022046	AAT	2	6	51262	51267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314104
1065	NC_022046	AGG	2	6	51287	51292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530314104
1066	NC_022046	TTG	2	6	51341	51346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314104
1067	NC_022046	G	6	6	51436	51441	0 %	0 %	100 %	0 %	530314104
1068	NC_022046	GTT	2	6	51472	51477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314104
1069	NC_022046	GTA	2	6	51491	51496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314104
1070	NC_022046	A	8	8	51623	51630	100 %	0 %	0 %	0 %	530314105
1071	NC_022046	T	6	6	51633	51638	0 %	100 %	0 %	0 %	530314105
1072	NC_022046	GATA	2	8	51650	51657	50 %	25 %	25 %	0 %	530314105
1073	NC_022046	GTA	2	6	51696	51701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314105
1074	NC_022046	AAG	2	6	51711	51716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314105
1075	NC_022046	A	6	6	51738	51743	100 %	0 %	0 %	0 %	530314105
1076	NC_022046	GAT	2	6	51817	51822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314106
1077	NC_022046	ATT	2	6	51848	51853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314106
1078	NC_022046	AAT	2	6	51890	51895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314106
1079	NC_022046	GAAT	2	8	51957	51964	50 %	25 %	25 %	0 %	530314106
1080	NC_022046	CTT	2	6	51981	51986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314106
1081	NC_022046	TGC	2	6	51997	52002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314106
1082	NC_022046	TAC	2	6	52099	52104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314106
1083	NC_022046	ATC	2	6	52155	52160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314106
1084	NC_022046	GTA	2	6	52166	52171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314106
1085	NC_022046	ATGG	2	8	52241	52248	25 %	25 %	50 %	0 %	530314106
1086	NC_022046	GAT	2	6	52249	52254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314106
1087	NC_022046	GTT	2	6	52301	52306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314106
1088	NC_022046	AAG	3	9	52329	52337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314106
1089	NC_022046	AGATG	2	10	52363	52372	40 %	20 %	40 %	0 %	530314106
1090	NC_022046	AAT	2	6	52385	52390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314106
1091	NC_022046	TTA	2	6	52718	52723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314107
1092	NC_022046	TATT	2	8	52787	52794	25 %	75 %	0 %	0 %	530314107
1093	NC_022046	CTT	2	6	52807	52812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314107
1094	NC_022046	A	6	6	52859	52864	100 %	0 %	0 %	0 %	530314107
1095	NC_022046	AGG	2	6	52895	52900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530314107
1096	NC_022046	TCG	2	6	52934	52939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314107
1097	NC_022046	TTTG	2	8	53142	53149	0 %	75 %	25 %	0 %	530314108
1098	NC_022046	CGA	2	6	53303	53308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314108
1099	NC_022046	T	6	6	53364	53369	0 %	100 %	0 %	0 %	530314108
1100	NC_022046	T	7	7	53512	53518	0 %	100 %	0 %	0 %	530314109
1101	NC_022046	TTC	2	6	53525	53530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314109
1102	NC_022046	GA	3	6	53567	53572	50 %	0 %	50 %	0 %	530314109
1103	NC_022046	CGTA	2	8	53641	53648	25 %	25 %	25 %	25 %	530314109
1104	NC_022046	TA	3	6	53767	53772	50 %	50 %	0 %	0 %	530314109
1105	NC_022046	TCT	3	9	53810	53818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314109
1106	NC_022046	TTC	3	9	53833	53841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314109
1107	NC_022046	GAA	2	6	53842	53847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314109
1108	NC_022046	ACTA	2	8	54175	54182	50 %	25 %	0 %	25 %	530314050
1109	NC_022046	ACT	2	6	54200	54205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314050
1110	NC_022046	AAT	2	6	54228	54233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314050
1111	NC_022046	ACA	2	6	54246	54251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314050
1112	NC_022046	TA	3	6	54352	54357	50 %	50 %	0 %	0 %	530314050
1113	NC_022046	ACA	2	6	54423	54428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314050
1114	NC_022046	CAT	2	6	54532	54537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314050
1115	NC_022046	TGT	2	6	54591	54596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314050
1116	NC_022046	ATC	2	6	54644	54649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314050
1117	NC_022046	AGC	2	6	54728	54733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314050
1118	NC_022046	ATT	2	6	54777	54782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314050
1119	NC_022046	CGCCTG	2	12	54815	54826	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	530314050
1120	NC_022046	ATC	2	6	54851	54856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314050
1121	NC_022046	ATCA	2	8	54911	54918	50 %	25 %	0 %	25 %	530314050
1122	NC_022046	ATTA	2	8	54995	55002	50 %	50 %	0 %	0 %	530314050
1123	NC_022046	TGA	2	6	55025	55030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314050
1124	NC_022046	CAG	2	6	55042	55047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314050
1125	NC_022046	TTC	2	6	55075	55080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314050
1126	NC_022046	ATA	2	6	55089	55094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314050
1127	NC_022046	GAC	2	6	55142	55147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314050
1128	NC_022046	T	6	6	55185	55190	0 %	100 %	0 %	0 %	530314050
1129	NC_022046	AAT	2	6	55274	55279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314050
1130	NC_022046	ATC	2	6	55299	55304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314050
1131	NC_022046	CATAC	2	10	55333	55342	40 %	20 %	0 %	40 %	530314050
1132	NC_022046	T	6	6	55408	55413	0 %	100 %	0 %	0 %	530314050
1133	NC_022046	ACA	2	6	55465	55470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314050
1134	NC_022046	TTA	2	6	55518	55523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314050
1135	NC_022046	CAA	2	6	55615	55620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314050
1136	NC_022046	AAT	2	6	55676	55681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314050
1137	NC_022046	TTC	2	6	55682	55687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314050
1138	NC_022046	TAA	2	6	55699	55704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314050
1139	NC_022046	TTGC	2	8	55735	55742	0 %	50 %	25 %	25 %	530314050
1140	NC_022046	CAG	2	6	55762	55767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314050
1141	NC_022046	TGAAGC	2	12	55769	55780	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	530314050

< Previous 1 23Next >