MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain N1-011A plasmid

Total Repeats: 1775

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022045	GCT	2	6	2538	2543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313891
2	NC_022045	CTT	2	6	2837	2842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313892
3	NC_022045	TCT	2	6	2911	2916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313892
4	NC_022045	GAC	2	6	2942	2947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313892
5	NC_022045	TGG	2	6	2954	2959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530313892
6	NC_022045	TGC	2	6	3091	3096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313892
7	NC_022045	GCC	2	6	3145	3150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530313893
8	NC_022045	AAT	2	6	3201	3206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313893
9	NC_022045	GAA	2	6	3518	3523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313894
10	NC_022045	AAC	2	6	3561	3566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313894
11	NC_022045	ATT	2	6	3642	3647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313894
12	NC_022045	CAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313894
13	NC_022045	AAT	2	6	3713	3718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313894
14	NC_022045	ATC	2	6	3768	3773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313894
15	NC_022045	ATC	2	6	3834	3839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313894
16	NC_022045	ACC	2	6	3856	3861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313894
17	NC_022045	TAG	2	6	4191	4196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313873
18	NC_022045	TAT	2	6	4212	4217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313873
19	NC_022045	TGG	2	6	4267	4272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530313873
20	NC_022045	CAA	2	6	4320	4325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313873
21	NC_022045	AAG	2	6	4347	4352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313873
22	NC_022045	ACA	2	6	4373	4378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313873
23	NC_022045	CAT	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313873
24	NC_022045	CGG	2	6	4435	4440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530313873
25	NC_022045	AAT	2	6	4736	4741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313873
26	NC_022045	TGG	2	6	4831	4836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530313873
27	NC_022045	ATT	2	6	4901	4906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313873
28	NC_022045	TCT	2	6	4937	4942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313873
29	NC_022045	GAA	2	6	4949	4954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313873
30	NC_022045	AGA	2	6	4975	4980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313873
31	NC_022045	AGC	2	6	4981	4986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313873
32	NC_022045	CTT	2	6	5325	5330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313895
33	NC_022045	AAG	2	6	5345	5350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313895
34	NC_022045	GAA	3	9	5377	5385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313895
35	NC_022045	GAA	2	6	5454	5459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313895
36	NC_022045	TTC	2	6	5536	5541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313895
37	NC_022045	TCT	2	6	5570	5575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313895
38	NC_022045	AGT	2	6	5632	5637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313895
39	NC_022045	CAC	2	6	5706	5711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313895
40	NC_022045	ATG	2	6	5726	5731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313895
41	NC_022045	CGA	2	6	5741	5746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313895
42	NC_022045	CAA	2	6	5862	5867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313895
43	NC_022045	ATA	2	6	5933	5938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313895
44	NC_022045	ACA	2	6	5972	5977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313895
45	NC_022045	GTT	2	6	5989	5994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313895
46	NC_022045	TTC	2	6	6049	6054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313895
47	NC_022045	AGA	2	6	6068	6073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313895
48	NC_022045	CAA	2	6	6114	6119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313895
49	NC_022045	ACT	2	6	6125	6130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313895
50	NC_022045	TGC	2	6	6163	6168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313895
51	NC_022045	CAA	2	6	6192	6197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313895
52	NC_022045	AGA	2	6	6264	6269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313895
53	NC_022045	ACC	2	6	6313	6318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313895
54	NC_022045	AGT	2	6	6367	6372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313895
55	NC_022045	ATG	2	6	6453	6458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313895
56	NC_022045	TCT	2	6	6500	6505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313895
57	NC_022045	CTA	2	6	6630	6635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313895
58	NC_022045	CAG	2	6	6867	6872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313896
59	NC_022045	ATT	2	6	6879	6884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313896
60	NC_022045	CTA	2	6	6896	6901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313896
61	NC_022045	ACG	2	6	6972	6977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313896
62	NC_022045	ACT	2	6	7007	7012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313896
63	NC_022045	AGC	2	6	7172	7177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313896
64	NC_022045	ATT	2	6	7311	7316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313897
65	NC_022045	CTA	2	6	7328	7333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313897
66	NC_022045	CAC	2	6	7403	7408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313897
67	NC_022045	ACT	2	6	7439	7444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313897
68	NC_022045	ACA	2	6	7447	7452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313897
69	NC_022045	AGC	2	6	7604	7609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313897
70	NC_022045	ATC	2	6	7777	7782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313897
71	NC_022045	AGA	2	6	7873	7878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313897
72	NC_022045	AAG	2	6	7885	7890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313897
73	NC_022045	ATT	2	6	7931	7936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313897
74	NC_022045	TTC	2	6	8113	8118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313898
75	NC_022045	AAT	2	6	8230	8235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313898
76	NC_022045	TTC	2	6	8236	8241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313898
77	NC_022045	AGG	2	6	8257	8262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530313898
78	NC_022045	ATA	2	6	8317	8322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313898
79	NC_022045	GTA	2	6	8400	8405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313898
80	NC_022045	TGC	2	6	8560	8565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313899
81	NC_022045	TTC	2	6	8572	8577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313899
82	NC_022045	TCA	2	6	8633	8638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313899
83	NC_022045	ACC	2	6	8653	8658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313899
84	NC_022045	TTC	2	6	8689	8694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313899
85	NC_022045	GCA	2	6	8730	8735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313899
86	NC_022045	TTC	2	6	8824	8829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313899
87	NC_022045	ATC	2	6	8836	8841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313899
88	NC_022045	CTT	2	6	8958	8963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313899
89	NC_022045	CTA	2	6	8964	8969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313899
90	NC_022045	TCA	2	6	9161	9166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313899
91	NC_022045	CAT	2	6	9228	9233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313899
92	NC_022045	TTC	2	6	9234	9239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313899
93	NC_022045	ATT	2	6	9340	9345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313899
94	NC_022045	TGT	2	6	9398	9403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313899
95	NC_022045	TAT	2	6	9417	9422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313899
96	NC_022045	TAG	2	6	9457	9462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313899
97	NC_022045	GAT	2	6	9499	9504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313899
98	NC_022045	AGC	2	6	9866	9871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313899
99	NC_022045	TCA	2	6	9875	9880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313899
100	NC_022045	CTG	2	6	9899	9904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313899
101	NC_022045	CTT	2	6	10032	10037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313900
102	NC_022045	CTT	3	9	10043	10051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313900
103	NC_022045	ATA	2	6	10094	10099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313900
104	NC_022045	AAT	2	6	10198	10203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313900
105	NC_022045	CCA	2	6	10258	10263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313900
106	NC_022045	AAG	2	6	10370	10375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313900
107	NC_022045	ATC	2	6	10660	10665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313901
108	NC_022045	ATT	2	6	10676	10681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313901
109	NC_022045	TAC	2	6	10707	10712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313901
110	NC_022045	GTG	2	6	10717	10722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530313901
111	NC_022045	GAA	3	9	10869	10877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313901
112	NC_022045	GCT	2	6	11032	11037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313902
113	NC_022045	AGT	2	6	11126	11131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313902
114	NC_022045	GTC	2	6	11334	11339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313902
115	NC_022045	CTT	2	6	11456	11461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313902
116	NC_022045	AAT	2	6	11467	11472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313902
117	NC_022045	TCT	2	6	11482	11487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313902
118	NC_022045	ATC	2	6	11624	11629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313903
119	NC_022045	TCT	2	6	11778	11783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313903
120	NC_022045	TGG	2	6	11798	11803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530313903
121	NC_022045	TCA	2	6	11830	11835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313903
122	NC_022045	ATC	2	6	11921	11926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313903
123	NC_022045	TTC	2	6	11951	11956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313903
124	NC_022045	TTG	2	6	11993	11998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313903
125	NC_022045	TTG	2	6	12127	12132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313903
126	NC_022045	TAT	2	6	12247	12252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313903
127	NC_022045	ATA	2	6	12258	12263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313903
128	NC_022045	ATT	2	6	12375	12380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313903
129	NC_022045	GCT	2	6	12441	12446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313904
130	NC_022045	AAT	2	6	12501	12506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313904
131	NC_022045	CTT	2	6	12542	12547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313904
132	NC_022045	CCT	2	6	12555	12560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530313904
133	NC_022045	GTC	2	6	12583	12588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313904
134	NC_022045	ACT	3	9	12634	12642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313904
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136	NC_022045	ATC	2	6	12696	12701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313904
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138	NC_022045	TTC	2	6	12842	12847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313905
139	NC_022045	CTG	2	6	12976	12981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313905
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142	NC_022045	CTT	2	6	13134	13139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313905
143	NC_022045	TCT	2	6	13187	13192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313905
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146	NC_022045	ACC	2	6	13232	13237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313905
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154	NC_022045	TCT	2	6	13646	13651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313905
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162	NC_022045	CTT	2	6	14164	14169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313906
163	NC_022045	TCG	2	6	14195	14200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313906
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240	NC_022045	CCA	2	6	19983	19988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313913
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244	NC_022045	TGA	2	6	20469	20474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313913
245	NC_022045	CAT	2	6	20614	20619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313914
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250	NC_022045	TAA	2	6	21098	21103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313915
251	NC_022045	TTC	2	6	21156	21161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313915
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254	NC_022045	ATT	2	6	21690	21695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313915
255	NC_022045	TCA	2	6	21722	21727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313915
256	NC_022045	AAG	2	6	21760	21765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313915
257	NC_022045	GAA	2	6	21792	21797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313915
258	NC_022045	GTA	2	6	21958	21963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313915
259	NC_022045	TTG	2	6	22032	22037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313915
260	NC_022045	TTG	2	6	22068	22073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313915
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262	NC_022045	CTT	2	6	22187	22192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313915
263	NC_022045	TGC	2	6	22284	22289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313915
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271	NC_022045	ATG	2	6	23384	23389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313917
272	NC_022045	GAA	2	6	23425	23430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313917
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274	NC_022045	TGA	2	6	23586	23591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313917
275	NC_022045	TGC	2	6	23655	23660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313917
276	NC_022045	CAA	2	6	23689	23694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313917
277	NC_022045	TAG	2	6	23744	23749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313917
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283	NC_022045	TTA	2	6	24332	24337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313918
284	NC_022045	ACA	2	6	24370	24375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313918
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371	NC_022045	AAC	2	6	31783	31788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313922
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378	NC_022045	TTA	2	6	32471	32476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313878
379	NC_022045	TCA	2	6	32517	32522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313878
380	NC_022045	AAT	2	6	32536	32541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313878
381	NC_022045	GTC	2	6	32636	32641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313878
382	NC_022045	ATC	2	6	32668	32673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313878
383	NC_022045	TTA	2	6	33352	33357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313924
384	NC_022045	ATC	2	6	33360	33365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313924
385	NC_022045	GTT	2	6	33417	33422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313924
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390	NC_022045	GTT	2	6	33598	33603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313924
391	NC_022045	ATA	2	6	33793	33798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313924
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400	NC_022045	ATC	2	6	34283	34288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313925
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405	NC_022045	AAT	2	6	34702	34707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313925
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409	NC_022045	TAA	2	6	34984	34989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313925
410	NC_022045	TCC	2	6	35137	35142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530313925
411	NC_022045	TTA	2	6	35154	35159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313925
412	NC_022045	TAA	2	6	35239	35244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313925
413	NC_022045	ATC	2	6	35303	35308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313925
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453	NC_022045	GTA	2	6	38885	38890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313927
454	NC_022045	TCT	2	6	38894	38899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313927
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470	NC_022045	TCC	2	6	41290	41295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530313931
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473	NC_022045	TAA	2	6	41426	41431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313931
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477	NC_022045	CTT	2	6	41543	41548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313931
478	NC_022045	TAT	2	6	41751	41756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313932
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485	NC_022045	AAT	2	6	42166	42171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313933
486	NC_022045	GAT	2	6	42174	42179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313933
487	NC_022045	AGC	2	6	42343	42348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313934
488	NC_022045	TCA	2	6	42377	42382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313934
489	NC_022045	ACC	2	6	42911	42916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313935
490	NC_022045	TGA	2	6	42947	42952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313935
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494	NC_022045	CAT	2	6	43130	43135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313935
495	NC_022045	ATA	2	6	43291	43296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313935
496	NC_022045	TAA	2	6	43328	43333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313935
497	NC_022045	ATA	2	6	43509	43514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313935
498	NC_022045	TAA	2	6	43616	43621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313935
499	NC_022045	TGC	2	6	43659	43664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313935
500	NC_022045	ATG	2	6	43666	43671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313935

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