MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain N1-011A plasmid

Total Repeats: 2987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_022045	CTTT	2	8	120430	120437	0 %	75 %	0 %	25 %	530314009
2502	NC_022045	A	6	6	120484	120489	100 %	0 %	0 %	0 %	530314009
2503	NC_022045	TAA	2	6	120526	120531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314009
2504	NC_022045	T	8	8	120553	120560	0 %	100 %	0 %	0 %	530314009
2505	NC_022045	A	6	6	120615	120620	100 %	0 %	0 %	0 %	530314009
2506	NC_022045	TACG	2	8	120690	120697	25 %	25 %	25 %	25 %	530314009
2507	NC_022045	TTC	2	6	120698	120703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314009
2508	NC_022045	TCA	2	6	120753	120758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314009
2509	NC_022045	T	6	6	120826	120831	0 %	100 %	0 %	0 %	530314009
2510	NC_022045	CTT	2	6	120946	120951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314009
2511	NC_022045	T	6	6	121038	121043	0 %	100 %	0 %	0 %	530314009
2512	NC_022045	ATG	2	6	121053	121058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314009
2513	NC_022045	AAAG	2	8	121113	121120	75 %	0 %	25 %	0 %	530314009
2514	NC_022045	CAT	2	6	121163	121168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314009
2515	NC_022045	GC	3	6	121225	121230	0 %	0 %	50 %	50 %	530314009
2516	NC_022045	GAAA	2	8	121231	121238	75 %	0 %	25 %	0 %	530314009
2517	NC_022045	TATCGA	2	12	121480	121491	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	530314009
2518	NC_022045	TGT	2	6	121509	121514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314009
2519	NC_022045	TTCTT	2	10	121518	121527	0 %	80 %	0 %	20 %	530314009
2520	NC_022045	GTAT	2	8	121577	121584	25 %	50 %	25 %	0 %	530314009
2521	NC_022045	CTT	2	6	121627	121632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314009
2522	NC_022045	ACG	2	6	121692	121697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314009
2523	NC_022045	TGC	2	6	121724	121729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314009
2524	NC_022045	CACG	2	8	121750	121757	25 %	0 %	25 %	50 %	530314009
2525	NC_022045	T	8	8	121776	121783	0 %	100 %	0 %	0 %	530314009
2526	NC_022045	ACC	2	6	121809	121814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314009
2527	NC_022045	GTAT	2	8	121832	121839	25 %	50 %	25 %	0 %	530314009
2528	NC_022045	TAA	2	6	122496	122501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314010
2529	NC_022045	A	7	7	122531	122537	100 %	0 %	0 %	0 %	530314010
2530	NC_022045	AGG	2	6	122571	122576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530314010
2531	NC_022045	ACA	2	6	122587	122592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314010
2532	NC_022045	AAAG	2	8	122622	122629	75 %	0 %	25 %	0 %	530314010
2533	NC_022045	A	7	7	122759	122765	100 %	0 %	0 %	0 %	530314010
2534	NC_022045	TA	3	6	122849	122854	50 %	50 %	0 %	0 %	530314010
2535	NC_022045	AGA	3	9	122874	122882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314010
2536	NC_022045	TAT	2	6	122884	122889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314010
2537	NC_022045	A	6	6	122892	122897	100 %	0 %	0 %	0 %	530314010
2538	NC_022045	TCC	2	6	122946	122951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530314010
2539	NC_022045	GTG	2	6	123035	123040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530314010
2540	NC_022045	AGA	2	6	123054	123059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314010
2541	NC_022045	TAAA	2	8	123062	123069	75 %	25 %	0 %	0 %	530314010
2542	NC_022045	AAT	2	6	123130	123135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314010
2543	NC_022045	GTT	2	6	123205	123210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314010
2544	NC_022045	GA	3	6	123220	123225	50 %	0 %	50 %	0 %	530314010
2545	NC_022045	TAGA	2	8	123317	123324	50 %	25 %	25 %	0 %	530314010
2546	NC_022045	ATTA	2	8	123325	123332	50 %	50 %	0 %	0 %	530314010
2547	NC_022045	GAA	3	9	123337	123345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314010
2548	NC_022045	AAG	2	6	123347	123352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314010
2549	NC_022045	AAACC	2	10	123401	123410	60 %	0 %	0 %	40 %	530314011
2550	NC_022045	CTTC	2	8	123458	123465	0 %	50 %	0 %	50 %	530314011
2551	NC_022045	GCT	2	6	123506	123511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314011
2552	NC_022045	AGA	2	6	123559	123564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314011
2553	NC_022045	ATT	2	6	123611	123616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314011
2554	NC_022045	AAC	2	6	123660	123665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314011
2555	NC_022045	CCA	2	6	124064	124069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313888
2556	NC_022045	CTA	2	6	124104	124109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313888
2557	NC_022045	GCAT	2	8	124118	124125	25 %	25 %	25 %	25 %	530313888
2558	NC_022045	CT	3	6	124147	124152	0 %	50 %	0 %	50 %	530313888
2559	NC_022045	ATT	2	6	124279	124284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313888
2560	NC_022045	T	7	7	124355	124361	0 %	100 %	0 %	0 %	530313888
2561	NC_022045	ATGA	2	8	124411	124418	50 %	25 %	25 %	0 %	530313888
2562	NC_022045	TGA	2	6	124433	124438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313888
2563	NC_022045	CTT	2	6	124458	124463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313888
2564	NC_022045	CCA	2	6	124464	124469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313888
2565	NC_022045	ATA	2	6	124600	124605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313888
2566	NC_022045	AGG	2	6	124644	124649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530313888
2567	NC_022045	TCGG	2	8	124740	124747	0 %	25 %	50 %	25 %	530313888
2568	NC_022045	AAG	2	6	124840	124845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313888
2569	NC_022045	T	6	6	124910	124915	0 %	100 %	0 %	0 %	530313888
2570	NC_022045	TCG	2	6	124973	124978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313888
2571	NC_022045	ATAGA	2	10	124979	124988	60 %	20 %	20 %	0 %	530313888
2572	NC_022045	GAAG	2	8	125016	125023	50 %	0 %	50 %	0 %	530313888
2573	NC_022045	AAT	2	6	125077	125082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313888
2574	NC_022045	T	6	6	125143	125148	0 %	100 %	0 %	0 %	530313888
2575	NC_022045	TGC	2	6	125161	125166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313888
2576	NC_022045	TCC	2	6	125176	125181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530313888
2577	NC_022045	GAC	2	6	125203	125208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313888
2578	NC_022045	A	6	6	125260	125265	100 %	0 %	0 %	0 %	530313888
2579	NC_022045	TCT	2	6	125315	125320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313888
2580	NC_022045	TGAT	2	8	125356	125363	25 %	50 %	25 %	0 %	530314012
2581	NC_022045	TC	3	6	125387	125392	0 %	50 %	0 %	50 %	530314012
2582	NC_022045	TC	3	6	125401	125406	0 %	50 %	0 %	50 %	530314012
2583	NC_022045	TCT	2	6	125476	125481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314012
2584	NC_022045	TGC	2	6	125506	125511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314012
2585	NC_022045	TTC	2	6	125547	125552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314012
2586	NC_022045	TGC	2	6	125557	125562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314012
2587	NC_022045	CTTT	2	8	125577	125584	0 %	75 %	0 %	25 %	530314012
2588	NC_022045	GTT	2	6	125597	125602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314012
2589	NC_022045	CTCGAT	2	12	125645	125656	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	530314012
2590	NC_022045	TAAT	2	8	125822	125829	50 %	50 %	0 %	0 %	530314013
2591	NC_022045	TCA	2	6	125865	125870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314013
2592	NC_022045	ATA	2	6	125891	125896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314013
2593	NC_022045	T	6	6	125906	125911	0 %	100 %	0 %	0 %	530314013
2594	NC_022045	AGATA	2	10	125934	125943	60 %	20 %	20 %	0 %	530314013
2595	NC_022045	CTT	3	9	125972	125980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314013
2596	NC_022045	T	7	7	126005	126011	0 %	100 %	0 %	0 %	530314013
2597	NC_022045	TCTT	2	8	126045	126052	0 %	75 %	0 %	25 %	530314013
2598	NC_022045	AGATTC	2	12	126086	126097	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	530314013
2599	NC_022045	T	6	6	126170	126175	0 %	100 %	0 %	0 %	530314013
2600	NC_022045	GTA	2	6	126191	126196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314013
2601	NC_022045	AAT	2	6	126260	126265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314013
2602	NC_022045	T	7	7	126268	126274	0 %	100 %	0 %	0 %	530314013
2603	NC_022045	T	6	6	126294	126299	0 %	100 %	0 %	0 %	530314014
2604	NC_022045	GCT	2	6	126354	126359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314014
2605	NC_022045	GTT	2	6	126381	126386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314014
2606	NC_022045	AAT	2	6	126451	126456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314014
2607	NC_022045	TAGC	2	8	126552	126559	25 %	25 %	25 %	25 %	530314014
2608	NC_022045	TTA	2	6	126564	126569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314014
2609	NC_022045	AAT	2	6	126607	126612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314014
2610	NC_022045	T	7	7	126623	126629	0 %	100 %	0 %	0 %	530314014
2611	NC_022045	ATT	3	9	126683	126691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314014
2612	NC_022045	TCC	2	6	126725	126730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530314014
2613	NC_022045	TAG	2	6	126760	126765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314014
2614	NC_022045	CAAT	2	8	126799	126806	50 %	25 %	0 %	25 %	530314014
2615	NC_022045	AT	3	6	126805	126810	50 %	50 %	0 %	0 %	530314014
2616	NC_022045	T	6	6	126815	126820	0 %	100 %	0 %	0 %	530314014
2617	NC_022045	TC	3	6	126934	126939	0 %	50 %	0 %	50 %	530314014
2618	NC_022045	ATT	2	6	126947	126952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314014
2619	NC_022045	ATA	2	6	126972	126977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314014
2620	NC_022045	TTA	2	6	127044	127049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314014
2621	NC_022045	CTTT	2	8	127057	127064	0 %	75 %	0 %	25 %	530314014
2622	NC_022045	ATC	2	6	127103	127108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314014
2623	NC_022045	TGC	2	6	127124	127129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314014
2624	NC_022045	TTG	2	6	127133	127138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314014
2625	NC_022045	CAA	2	6	127154	127159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314014
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