MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain N1-011A plasmid

Total Repeats: 2987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022045	TAT	2	6	50887	50892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313939
1002	NC_022045	T	6	6	50939	50944	0 %	100 %	0 %	0 %	530313939
1003	NC_022045	ATT	2	6	50981	50986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313939
1004	NC_022045	CTT	2	6	50989	50994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313939
1005	NC_022045	GAG	2	6	50995	51000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530313939
1006	NC_022045	CAA	2	6	51034	51039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313939
1007	NC_022045	GAT	2	6	51055	51060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313939
1008	NC_022045	ATT	2	6	51104	51109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313939
1009	NC_022045	CAT	2	6	51179	51184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313939
1010	NC_022045	TGT	2	6	51198	51203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313939
1011	NC_022045	GTT	2	6	51356	51361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313939
1012	NC_022045	TACT	2	8	51400	51407	25 %	50 %	0 %	25 %	530313939
1013	NC_022045	AG	3	6	51440	51445	50 %	0 %	50 %	0 %	530313939
1014	NC_022045	TGTAC	2	10	51540	51549	20 %	40 %	20 %	20 %	530313939
1015	NC_022045	CAT	3	9	51577	51585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313939
1016	NC_022045	T	7	7	51602	51608	0 %	100 %	0 %	0 %	530313939
1017	NC_022045	CTT	2	6	51733	51738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313939
1018	NC_022045	ATCA	2	8	51752	51759	50 %	25 %	0 %	25 %	530313939
1019	NC_022045	TTC	2	6	51795	51800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313939
1020	NC_022045	TAA	2	6	51848	51853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313939
1021	NC_022045	ATTAAA	2	12	51858	51869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313939
1022	NC_022045	TG	3	6	51900	51905	0 %	50 %	50 %	0 %	530313939
1023	NC_022045	CAA	2	6	51976	51981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313939
1024	NC_022045	TCA	2	6	51985	51990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313939
1025	NC_022045	T	6	6	51998	52003	0 %	100 %	0 %	0 %	530313939
1026	NC_022045	TCC	2	6	52043	52048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530313939
1027	NC_022045	CAATC	2	10	52081	52090	40 %	20 %	0 %	40 %	530313939
1028	NC_022045	CAT	2	6	52130	52135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313939
1029	NC_022045	ATA	2	6	52146	52151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313939
1030	NC_022045	ATG	2	6	52202	52207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313939
1031	NC_022045	TGA	2	6	52251	52256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313939
1032	NC_022045	ATG	2	6	52259	52264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313939
1033	NC_022045	TGA	2	6	52302	52307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313939
1034	NC_022045	ATG	2	6	52310	52315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313939
1035	NC_022045	T	6	6	52331	52336	0 %	100 %	0 %	0 %	530313939
1036	NC_022045	GATT	2	8	52767	52774	25 %	50 %	25 %	0 %	530313884
1037	NC_022045	TAGG	2	8	52820	52827	25 %	25 %	50 %	0 %	530313884
1038	NC_022045	TCAA	2	8	52853	52860	50 %	25 %	0 %	25 %	530313884
1039	NC_022045	GCT	2	6	52954	52959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313884
1040	NC_022045	GCA	2	6	52999	53004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313884
1041	NC_022045	GCT	2	6	53014	53019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313884
1042	NC_022045	TGG	2	6	53037	53042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530313884
1043	NC_022045	CCGG	2	8	53043	53050	0 %	0 %	50 %	50 %	530313884
1044	NC_022045	CAG	2	6	53060	53065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313884
1045	NC_022045	TGC	2	6	53121	53126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313884
1046	NC_022045	AAC	2	6	53145	53150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313884
1047	NC_022045	CAA	2	6	53166	53171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313884
1048	NC_022045	AATA	2	8	53183	53190	75 %	25 %	0 %	0 %	530313884
1049	NC_022045	TGA	2	6	53467	53472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313940
1050	NC_022045	ATTA	2	8	53477	53484	50 %	50 %	0 %	0 %	530313940
1051	NC_022045	TAA	2	6	53497	53502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313940
1052	NC_022045	A	7	7	53506	53512	100 %	0 %	0 %	0 %	530313940
1053	NC_022045	A	6	6	53529	53534	100 %	0 %	0 %	0 %	530313940
1054	NC_022045	GAA	2	6	53612	53617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313940
1055	NC_022045	AGA	2	6	53698	53703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313940
1056	NC_022045	GAA	2	6	53723	53728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313940
1057	NC_022045	A	6	6	53813	53818	100 %	0 %	0 %	0 %	530313940
1058	NC_022045	TTTA	2	8	53883	53890	25 %	75 %	0 %	0 %	530313940
1059	NC_022045	TTC	2	6	53899	53904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313940
1060	NC_022045	TGAAT	2	10	53971	53980	40 %	40 %	20 %	0 %	530313940
1061	NC_022045	TTTA	2	8	53981	53988	25 %	75 %	0 %	0 %	530313940
1062	NC_022045	AT	3	6	54010	54015	50 %	50 %	0 %	0 %	530313940
1063	NC_022045	AT	3	6	54043	54048	50 %	50 %	0 %	0 %	530313940
1064	NC_022045	A	7	7	54140	54146	100 %	0 %	0 %	0 %	530313940
1065	NC_022045	AAGAT	2	10	54150	54159	60 %	20 %	20 %	0 %	530313940
1066	NC_022045	AT	3	6	54158	54163	50 %	50 %	0 %	0 %	530313940
1067	NC_022045	GAAA	2	8	54175	54182	75 %	0 %	25 %	0 %	530313940
1068	NC_022045	TGA	2	6	54207	54212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313940
1069	NC_022045	ATTA	2	8	54310	54317	50 %	50 %	0 %	0 %	530313940
1070	NC_022045	CGA	2	6	54337	54342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313940
1071	NC_022045	AAT	2	6	54355	54360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313940
1072	NC_022045	AAT	2	6	54365	54370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313940
1073	NC_022045	CTT	2	6	54381	54386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313940
1074	NC_022045	ATC	2	6	54395	54400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313940
1075	NC_022045	TGA	2	6	54430	54435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313940
1076	NC_022045	GAT	2	6	54473	54478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313940
1077	NC_022045	A	6	6	54502	54507	100 %	0 %	0 %	0 %	530313940
1078	NC_022045	ATT	2	6	54516	54521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313940
1079	NC_022045	TAA	2	6	54523	54528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313940
1080	NC_022045	TTG	2	6	54531	54536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313940
1081	NC_022045	GAA	2	6	54563	54568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313940
1082	NC_022045	A	6	6	54579	54584	100 %	0 %	0 %	0 %	530313940
1083	NC_022045	GGA	2	6	54629	54634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530313940
1084	NC_022045	AAT	2	6	54645	54650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313940
1085	NC_022045	TTA	2	6	54673	54678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313941
1086	NC_022045	TAA	2	6	54707	54712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313941
1087	NC_022045	TA	3	6	54723	54728	50 %	50 %	0 %	0 %	530313941
1088	NC_022045	GA	3	6	54757	54762	50 %	0 %	50 %	0 %	530313941
1089	NC_022045	TAT	2	6	54814	54819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313941
1090	NC_022045	TAG	2	6	54872	54877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313941
1091	NC_022045	TAA	2	6	54911	54916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313941
1092	NC_022045	T	6	6	54924	54929	0 %	100 %	0 %	0 %	530313941
1093	NC_022045	GAA	2	6	54981	54986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313941
1094	NC_022045	T	6	6	55116	55121	0 %	100 %	0 %	0 %	530313941
1095	NC_022045	AAT	2	6	55181	55186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313941
1096	NC_022045	AT	4	8	55192	55199	50 %	50 %	0 %	0 %	530313941
1097	NC_022045	ATT	2	6	55210	55215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313941
1098	NC_022045	TGAT	2	8	55240	55247	25 %	50 %	25 %	0 %	530313941
1099	NC_022045	AGA	2	6	55283	55288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313941
1100	NC_022045	ATA	2	6	55291	55296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313941
1101	NC_022045	GAT	2	6	55374	55379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313941
1102	NC_022045	A	6	6	55405	55410	100 %	0 %	0 %	0 %	530313941
1103	NC_022045	AGT	2	6	55442	55447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313941
1104	NC_022045	TTTTC	2	10	55453	55462	0 %	80 %	0 %	20 %	530313941
1105	NC_022045	ATA	2	6	55465	55470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313941
1106	NC_022045	CTA	2	6	55507	55512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313941
1107	NC_022045	ATC	2	6	55538	55543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313941
1108	NC_022045	ATT	2	6	55571	55576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313941
1109	NC_022045	ATG	2	6	55621	55626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313941
1110	NC_022045	A	6	6	55627	55632	100 %	0 %	0 %	0 %	530313941
1111	NC_022045	A	6	6	55681	55686	100 %	0 %	0 %	0 %	530313941
1112	NC_022045	T	6	6	55694	55699	0 %	100 %	0 %	0 %	530313941
1113	NC_022045	GAA	2	6	55728	55733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313941
1114	NC_022045	TAA	2	6	55766	55771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313941
1115	NC_022045	T	6	6	55772	55777	0 %	100 %	0 %	0 %	530313941
1116	NC_022045	GAAG	2	8	55806	55813	50 %	0 %	50 %	0 %	530313941
1117	NC_022045	TAG	2	6	55873	55878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313941
1118	NC_022045	TAG	2	6	55889	55894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313941
1119	NC_022045	T	7	7	55931	55937	0 %	100 %	0 %	0 %	530313941
1120	NC_022045	ATGA	2	8	55986	55993	50 %	25 %	25 %	0 %	530313941
1121	NC_022045	GCTA	2	8	56021	56028	25 %	25 %	25 %	25 %	530313941
1122	NC_022045	AAT	2	6	56030	56035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313941
1123	NC_022045	A	8	8	56059	56066	100 %	0 %	0 %	0 %	530313941
1124	NC_022045	TTAT	2	8	56085	56092	25 %	75 %	0 %	0 %	530313941
1125	NC_022045	GAA	2	6	56094	56099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313941
1126	NC_022045	TA	3	6	56109	56114	50 %	50 %	0 %	0 %	530313941
1127	NC_022045	ATA	2	6	56119	56124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313941
1128	NC_022045	AT	3	6	56152	56157	50 %	50 %	0 %	0 %	530313941
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1378	NC_022045	T	7	7	70059	70065	0 %	100 %	0 %	0 %	530313952
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