MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain N1-011A plasmid

Total Repeats: 2987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022045	TA	3	6	26711	26716	50 %	50 %	0 %	0 %	530313920
502	NC_022045	TAA	2	6	26726	26731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313920
503	NC_022045	GTC	2	6	26740	26745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313920
504	NC_022045	TCT	2	6	26786	26791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313920
505	NC_022045	T	6	6	26818	26823	0 %	100 %	0 %	0 %	530313920
506	NC_022045	ATTCC	2	10	26852	26861	20 %	40 %	0 %	40 %	530313920
507	NC_022045	TA	3	6	26933	26938	50 %	50 %	0 %	0 %	530313920
508	NC_022045	TCT	2	6	27024	27029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313920
509	NC_022045	ATTC	2	8	27032	27039	25 %	50 %	0 %	25 %	530313920
510	NC_022045	AGA	2	6	27199	27204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313921
511	NC_022045	T	6	6	27232	27237	0 %	100 %	0 %	0 %	530313921
512	NC_022045	T	6	6	27240	27245	0 %	100 %	0 %	0 %	530313921
513	NC_022045	GAT	2	6	27254	27259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313921
514	NC_022045	TGT	2	6	27260	27265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313921
515	NC_022045	TCT	2	6	27315	27320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313921
516	NC_022045	ATA	2	6	27326	27331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313921
517	NC_022045	AT	3	6	27478	27483	50 %	50 %	0 %	0 %	530313921
518	NC_022045	CAT	2	6	27512	27517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313921
519	NC_022045	GTG	2	6	27570	27575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530313921
520	NC_022045	CAA	2	6	27578	27583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313921
521	NC_022045	TTC	2	6	27715	27720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313921
522	NC_022045	GCT	2	6	27766	27771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313921
523	NC_022045	TTG	2	6	27776	27781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313921
524	NC_022045	TTC	2	6	27806	27811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313921
525	NC_022045	T	7	7	27815	27821	0 %	100 %	0 %	0 %	530313921
526	NC_022045	ATT	2	6	27829	27834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313921
527	NC_022045	TCT	2	6	27884	27889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313921
528	NC_022045	TA	3	6	27905	27910	50 %	50 %	0 %	0 %	530313921
529	NC_022045	CATT	2	8	27943	27950	25 %	50 %	0 %	25 %	530313921
530	NC_022045	CTA	2	6	27961	27966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313921
531	NC_022045	TAA	2	6	27976	27981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313921
532	NC_022045	CAA	2	6	28031	28036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313921
533	NC_022045	AAT	2	6	28050	28055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313921
534	NC_022045	TTAA	2	8	28060	28067	50 %	50 %	0 %	0 %	530313921
535	NC_022045	T	6	6	28096	28101	0 %	100 %	0 %	0 %	530313921
536	NC_022045	CTC	2	6	28117	28122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530313921
537	NC_022045	T	7	7	28137	28143	0 %	100 %	0 %	0 %	530313921
538	NC_022045	CTT	2	6	28199	28204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313921
539	NC_022045	AT	3	6	28271	28276	50 %	50 %	0 %	0 %	530313921
540	NC_022045	TA	3	6	28292	28297	50 %	50 %	0 %	0 %	530313921
541	NC_022045	T	6	6	28299	28304	0 %	100 %	0 %	0 %	530313921
542	NC_022045	TGA	2	6	28431	28436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313921
543	NC_022045	TC	3	6	28449	28454	0 %	50 %	0 %	50 %	530313921
544	NC_022045	ATT	2	6	28476	28481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313921
545	NC_022045	TAAGC	2	10	28798	28807	40 %	20 %	20 %	20 %	530313876
546	NC_022045	TCA	2	6	28824	28829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313876
547	NC_022045	TGT	2	6	28902	28907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313876
548	NC_022045	TCA	2	6	28944	28949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313876
549	NC_022045	T	6	6	29006	29011	0 %	100 %	0 %	0 %	530313876
550	NC_022045	T	6	6	29020	29025	0 %	100 %	0 %	0 %	530313876
551	NC_022045	ACA	2	6	29035	29040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313876
552	NC_022045	CAC	2	6	29173	29178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313876
553	NC_022045	AAT	3	9	29216	29224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313876
554	NC_022045	CAT	2	6	29272	29277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313876
555	NC_022045	TAA	2	6	29333	29338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313876
556	NC_022045	AATT	2	8	29423	29430	50 %	50 %	0 %	0 %	530313876
557	NC_022045	AAT	2	6	29474	29479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313876
558	NC_022045	CAT	2	6	29758	29763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313876
559	NC_022045	T	6	6	29779	29784	0 %	100 %	0 %	0 %	530313876
560	NC_022045	T	6	6	29806	29811	0 %	100 %	0 %	0 %	530313876
561	NC_022045	TCGA	2	8	29823	29830	25 %	25 %	25 %	25 %	530313876
562	NC_022045	CTT	2	6	29831	29836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313876
563	NC_022045	TCC	2	6	29859	29864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530313876
564	NC_022045	GGC	2	6	29873	29878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530313876
565	NC_022045	T	6	6	29897	29902	0 %	100 %	0 %	0 %	530313876
566	NC_022045	TA	3	6	30011	30016	50 %	50 %	0 %	0 %	530313876
567	NC_022045	AAT	2	6	30025	30030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313876
568	NC_022045	GCC	2	6	30036	30041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530313876
569	NC_022045	CAT	2	6	30049	30054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313876
570	NC_022045	ACA	2	6	30063	30068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313876
571	NC_022045	TGA	2	6	30069	30074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313876
572	NC_022045	CAT	2	6	30148	30153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313876
573	NC_022045	CCA	2	6	30279	30284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313876
574	NC_022045	CAC	2	6	30289	30294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313876
575	NC_022045	TGA	2	6	30318	30323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313876
576	NC_022045	GAA	2	6	30332	30337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313876
577	NC_022045	AAT	2	6	30341	30346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313876
578	NC_022045	GCT	2	6	30354	30359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313876
579	NC_022045	TTC	2	6	30389	30394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313876
580	NC_022045	AATC	2	8	30436	30443	50 %	25 %	0 %	25 %	530313876
581	NC_022045	CGA	2	6	30511	30516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313876
582	NC_022045	ATT	2	6	30557	30562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313876
583	NC_022045	T	6	6	30689	30694	0 %	100 %	0 %	0 %	530313876
584	NC_022045	TAT	2	6	30733	30738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313876
585	NC_022045	ATTG	2	8	30853	30860	25 %	50 %	25 %	0 %	530313876
586	NC_022045	CAT	2	6	30865	30870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313876
587	NC_022045	TTG	2	6	30879	30884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313876
588	NC_022045	A	6	6	30885	30890	100 %	0 %	0 %	0 %	530313876
589	NC_022045	TAT	2	6	31367	31372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313877
590	NC_022045	A	7	7	31405	31411	100 %	0 %	0 %	0 %	530313877
591	NC_022045	CAG	2	6	31517	31522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313877
592	NC_022045	CTT	2	6	31532	31537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313877
593	NC_022045	CG	3	6	31559	31564	0 %	0 %	50 %	50 %	530313877
594	NC_022045	GAA	2	6	31717	31722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313922
595	NC_022045	GAA	2	6	31729	31734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313922
596	NC_022045	AGAGA	2	10	31738	31747	60 %	0 %	40 %	0 %	530313922
597	NC_022045	AAC	2	6	31783	31788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313922
598	NC_022045	T	8	8	31793	31800	0 %	100 %	0 %	0 %	530313922
599	NC_022045	TGC	2	6	31948	31953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313923
600	NC_022045	ACTTG	2	10	31988	31997	20 %	40 %	20 %	20 %	530313923
601	NC_022045	GCC	2	6	32008	32013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530313923
602	NC_022045	CTA	2	6	32141	32146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313923
603	NC_022045	AAAT	2	8	32151	32158	75 %	25 %	0 %	0 %	530313923
604	NC_022045	T	7	7	32190	32196	0 %	100 %	0 %	0 %	530313878
605	NC_022045	TCT	2	6	32225	32230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313878
606	NC_022045	TTC	2	6	32267	32272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313878
607	NC_022045	T	6	6	32295	32300	0 %	100 %	0 %	0 %	530313878
608	NC_022045	TTTC	2	8	32326	32333	0 %	75 %	0 %	25 %	530313878
609	NC_022045	ATT	2	6	32440	32445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313878
610	NC_022045	TTA	2	6	32471	32476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313878
611	NC_022045	A	6	6	32480	32485	100 %	0 %	0 %	0 %	530313878
612	NC_022045	TGACGC	2	12	32487	32498	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	530313878
613	NC_022045	TCA	2	6	32517	32522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313878
614	NC_022045	AAT	2	6	32536	32541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313878
615	NC_022045	GTC	2	6	32636	32641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313878
616	NC_022045	T	8	8	32647	32654	0 %	100 %	0 %	0 %	530313878
617	NC_022045	AATA	2	8	32656	32663	75 %	25 %	0 %	0 %	530313878
618	NC_022045	ATC	2	6	32668	32673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313878
619	NC_022045	GACC	2	8	32721	32728	25 %	0 %	25 %	50 %	530313878
620	NC_022045	TA	3	6	33066	33071	50 %	50 %	0 %	0 %	530313924
621	NC_022045	ATTTCT	2	12	33226	33237	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	530313924
622	NC_022045	TTTA	2	8	33330	33337	25 %	75 %	0 %	0 %	530313924
623	NC_022045	TTA	2	6	33352	33357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313924
624	NC_022045	ATC	2	6	33360	33365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313924
625	NC_022045	AATAA	2	10	33366	33375	80 %	20 %	0 %	0 %	530313924
626	NC_022045	GTT	2	6	33417	33422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313924
627	NC_022045	TTC	2	6	33453	33458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313924
628	NC_022045	GTTT	2	8	33469	33476	0 %	75 %	25 %	0 %	530313924
629	NC_022045	TAT	2	6	33494	33499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313924
630	NC_022045	GAA	2	6	33523	33528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313924
631	NC_022045	TTC	2	6	33543	33548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313924
632	NC_022045	GTT	2	6	33598	33603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313924
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753	NC_022045	TC	3	6	39231	39236	0 %	50 %	0 %	50 %	530313928
754	NC_022045	AGTCAG	2	12	39258	39269	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	530313928
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