MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316 plasmid pLP-ZJ103

Total Repeats: 642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021912	AAAG	2	8	34176	34183	75 %	0 %	25 %	0 %	528838782
502	NC_021912	TAA	2	6	34249	34254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528838782
503	NC_021912	ACAA	2	8	34269	34276	75 %	0 %	0 %	25 %	528838782
504	NC_021912	CAA	2	6	34300	34305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528838782
505	NC_021912	ACC	3	9	34316	34324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838782
506	NC_021912	CAG	2	6	34361	34366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838782
507	NC_021912	TGA	2	6	34410	34415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838782
508	NC_021912	ACC	2	6	34417	34422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838782
509	NC_021912	TAAC	2	8	34429	34436	50 %	25 %	0 %	25 %	528838782
510	NC_021912	AAT	2	6	34461	34466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528838782
511	NC_021912	AAT	2	6	34498	34503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528838782
512	NC_021912	AACCA	2	10	34608	34617	60 %	0 %	0 %	40 %	528838782
513	NC_021912	TCT	2	6	34641	34646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838782
514	NC_021912	GCT	3	9	34683	34691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838782
515	NC_021912	CAG	2	6	34696	34701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838782
516	NC_021912	TAG	2	6	34718	34723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838782
517	NC_021912	AAT	2	6	34815	34820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528838782
518	NC_021912	ACC	2	6	34841	34846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838782
519	NC_021912	ACC	2	6	34870	34875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838782
520	NC_021912	TC	3	6	34944	34949	0 %	50 %	0 %	50 %	528838782
521	NC_021912	CAA	2	6	34997	35002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528838782
522	NC_021912	CAAA	2	8	35016	35023	75 %	0 %	0 %	25 %	528838782
523	NC_021912	TA	3	6	35044	35049	50 %	50 %	0 %	0 %	528838782
524	NC_021912	CAATA	2	10	35077	35086	60 %	20 %	0 %	20 %	528838782
525	NC_021912	AAC	2	6	35099	35104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528838782
526	NC_021912	TAG	2	6	35315	35320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838783
527	NC_021912	AGT	2	6	35345	35350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838783
528	NC_021912	TAA	2	6	35359	35364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528838783
529	NC_021912	GTT	2	6	35366	35371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528838783
530	NC_021912	ATC	2	6	35404	35409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838783
531	NC_021912	TAAT	2	8	35580	35587	50 %	50 %	0 %	0 %	528838783
532	NC_021912	GAA	2	6	35638	35643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838783
533	NC_021912	A	6	6	35731	35736	100 %	0 %	0 %	0 %	528838783
534	NC_021912	AT	3	6	35774	35779	50 %	50 %	0 %	0 %	528838783
535	NC_021912	ATC	2	6	35798	35803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838783
536	NC_021912	TAG	2	6	35811	35816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838783
537	NC_021912	AAT	2	6	35831	35836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528838783
538	NC_021912	GAG	2	6	35854	35859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838783
539	NC_021912	AAAT	2	8	35882	35889	75 %	25 %	0 %	0 %	528838783
540	NC_021912	GCT	2	6	35907	35912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838783
541	NC_021912	A	6	6	35915	35920	100 %	0 %	0 %	0 %	528838783
542	NC_021912	ACC	2	6	36014	36019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838783
543	NC_021912	AAC	2	6	36200	36205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528838783
544	NC_021912	T	6	6	36232	36237	0 %	100 %	0 %	0 %	528838783
545	NC_021912	GAT	2	6	36280	36285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838783
546	NC_021912	A	6	6	36300	36305	100 %	0 %	0 %	0 %	528838783
547	NC_021912	CAA	2	6	36337	36342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528838783
548	NC_021912	AAT	2	6	36355	36360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528838783
549	NC_021912	CAA	2	6	36363	36368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528838783
550	NC_021912	CTG	2	6	36384	36389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838783
551	NC_021912	GAT	2	6	36439	36444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838783
552	NC_021912	CAAA	2	8	36466	36473	75 %	0 %	0 %	25 %	528838783
553	NC_021912	ACT	2	6	36838	36843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838784
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555	NC_021912	GAGC	2	8	36892	36899	25 %	0 %	50 %	25 %	528838784
556	NC_021912	TTC	2	6	36930	36935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838784
557	NC_021912	GAA	2	6	36944	36949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838784
558	NC_021912	TCAA	2	8	36954	36961	50 %	25 %	0 %	25 %	528838784
559	NC_021912	ATA	2	6	37095	37100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528838784
560	NC_021912	TTGA	2	8	37102	37109	25 %	50 %	25 %	0 %	528838784
561	NC_021912	ACC	2	6	37163	37168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838784
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569	NC_021912	ACC	2	6	37914	37919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838786
570	NC_021912	AATT	2	8	37962	37969	50 %	50 %	0 %	0 %	528838786
571	NC_021912	T	6	6	37976	37981	0 %	100 %	0 %	0 %	528838786
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574	NC_021912	ATA	2	6	38054	38059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528838786
575	NC_021912	TGATAG	2	12	38106	38117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838786
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578	NC_021912	GAA	2	6	38158	38163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838786
579	NC_021912	AAT	2	6	38193	38198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528838786
580	NC_021912	ACC	2	6	38205	38210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838786
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583	NC_021912	TGA	2	6	38274	38279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838786
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585	NC_021912	GCT	2	6	38321	38326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838786
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589	NC_021912	AAT	2	6	38478	38483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528838786
590	NC_021912	CCG	2	6	38503	38508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838786
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592	NC_021912	GTC	2	6	38785	38790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838787
593	NC_021912	TA	3	6	38860	38865	50 %	50 %	0 %	0 %	528838787
594	NC_021912	GCC	2	6	38896	38901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838787
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596	NC_021912	TTG	2	6	38967	38972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528838787
597	NC_021912	CTT	2	6	38977	38982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838787
598	NC_021912	TAA	2	6	39020	39025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528838787
599	NC_021912	TTG	2	6	39095	39100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528838787
600	NC_021912	T	6	6	39199	39204	0 %	100 %	0 %	0 %	528838787
601	NC_021912	T	6	6	39273	39278	0 %	100 %	0 %	0 %	528838787
602	NC_021912	GAC	2	6	39315	39320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838787
603	NC_021912	AT	3	6	39342	39347	50 %	50 %	0 %	0 %	528838787
604	NC_021912	TAT	2	6	39463	39468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528838788
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608	NC_021912	CAT	2	6	39571	39576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838788
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610	NC_021912	ACA	2	6	39723	39728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528838788
611	NC_021912	AACC	2	8	39775	39782	50 %	0 %	0 %	50 %	528838788
612	NC_021912	GCG	2	6	39854	39859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838788
613	NC_021912	TGAAAC	2	12	39903	39914	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	528838788
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622	NC_021912	TCG	2	6	40674	40679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838789
623	NC_021912	CATC	2	8	40687	40694	25 %	25 %	0 %	50 %	528838789
624	NC_021912	T	6	6	40708	40713	0 %	100 %	0 %	0 %	528838789
625	NC_021912	TGA	2	6	40801	40806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838789
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627	NC_021912	GTA	2	6	40868	40873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838789
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629	NC_021912	CTTT	2	8	40903	40910	0 %	75 %	0 %	25 %	528838789
630	NC_021912	GTT	2	6	40916	40921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528838789
631	NC_021912	ATT	2	6	40973	40978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528838789
632	NC_021912	CAT	2	6	41066	41071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838789
633	NC_021912	CTG	2	6	41089	41094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838789
634	NC_021912	CTT	2	6	41095	41100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838789
635	NC_021912	CTT	2	6	41137	41142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838789
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639	NC_021912	CCAG	2	8	41260	41267	25 %	0 %	25 %	50 %	528838789
640	NC_021912	CATA	2	8	41289	41296	50 %	25 %	0 %	25 %	528838789
641	NC_021912	GAT	2	6	41315	41320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838789
642	NC_021912	AATT	2	8	41326	41333	50 %	50 %	0 %	0 %	528838789

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