MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316 plasmid pLP-ZJ101

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021903	CCA	2	6	1152	1157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821547
2	NC_021903	GTT	2	6	1185	1190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821547
3	NC_021903	TAA	2	6	1226	1231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528821547
4	NC_021903	TTC	2	6	1239	1244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821547
5	NC_021903	TTG	2	6	1272	1277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821547
6	NC_021903	TCT	2	6	1412	1417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821547
7	NC_021903	ACC	2	6	1437	1442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821547
8	NC_021903	ATT	2	6	1789	1794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821548
9	NC_021903	TTC	2	6	1960	1965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821548
10	NC_021903	TAG	2	6	2032	2037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821548
11	NC_021903	GTT	2	6	2105	2110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821548
12	NC_021903	ACT	2	6	2119	2124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821548
13	NC_021903	ATT	2	6	2173	2178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821548
14	NC_021903	TCA	2	6	2345	2350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821548
15	NC_021903	ATT	2	6	2359	2364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821548
16	NC_021903	ATC	2	6	2422	2427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821548
17	NC_021903	CCA	2	6	3689	3694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821549
18	NC_021903	GAA	2	6	3718	3723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821549
19	NC_021903	GCC	2	6	3763	3768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821549
20	NC_021903	ATT	2	6	3826	3831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821549
21	NC_021903	CTT	2	6	3876	3881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821549
22	NC_021903	GGC	2	6	3909	3914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821549
23	NC_021903	CTG	3	9	3937	3945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821549
24	NC_021903	CAC	2	6	4027	4032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821549
25	NC_021903	GTG	2	6	4303	4308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528821549
26	NC_021903	ACC	2	6	4408	4413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821549
27	NC_021903	TGA	2	6	4418	4423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821549
28	NC_021903	TGG	2	6	4424	4429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528821549
29	NC_021903	TGG	2	6	4457	4462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528821549
30	NC_021903	CGG	2	6	4571	4576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821549
31	NC_021903	AAC	2	6	4621	4626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528821549
32	NC_021903	CCA	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821549
33	NC_021903	TGG	2	6	4757	4762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528821549
34	NC_021903	ATC	2	6	4792	4797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821549
35	NC_021903	TGA	2	6	4800	4805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821549
36	NC_021903	ATG	2	6	4837	4842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821549
37	NC_021903	GCG	2	6	4864	4869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821549
38	NC_021903	CGA	3	9	4878	4886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821549
39	NC_021903	GCC	2	6	4895	4900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821549
40	NC_021903	ATG	2	6	5038	5043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821549
41	NC_021903	GTC	2	6	5047	5052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821549
42	NC_021903	CGA	2	6	5241	5246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821549
43	NC_021903	AGC	2	6	5282	5287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821549
44	NC_021903	CAT	2	6	5313	5318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821549
45	NC_021903	CGC	2	6	5324	5329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821549
46	NC_021903	ACC	2	6	5353	5358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821549
47	NC_021903	TGA	2	6	5384	5389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821549
48	NC_021903	AGC	2	6	5477	5482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821549
49	NC_021903	AGC	2	6	5561	5566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821549
50	NC_021903	GCT	2	6	5647	5652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821549
51	NC_021903	CGC	2	6	5700	5705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821549
52	NC_021903	GAT	2	6	5722	5727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821549
53	NC_021903	CAC	2	6	5733	5738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821549
54	NC_021903	ACC	2	6	5809	5814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821549
55	NC_021903	GCT	2	6	5835	5840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821549
56	NC_021903	TGA	2	6	5855	5860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821549
57	NC_021903	GGC	2	6	5880	5885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821549
58	NC_021903	CAC	2	6	5886	5891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821549
59	NC_021903	ATG	2	6	5966	5971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821549
60	NC_021903	GCC	2	6	5997	6002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821549
61	NC_021903	TGC	2	6	6239	6244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821549
62	NC_021903	CGG	2	6	6260	6265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821549
63	NC_021903	CAT	2	6	6285	6290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821549
64	NC_021903	TTC	2	6	6295	6300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821549
65	NC_021903	TGC	2	6	6342	6347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821549
66	NC_021903	ATC	2	6	6559	6564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821550
67	NC_021903	CTA	2	6	6618	6623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821550
68	NC_021903	CAT	2	6	6994	6999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821551
69	NC_021903	AAC	2	6	7013	7018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528821551
70	NC_021903	AGA	2	6	7237	7242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821551
71	NC_021903	CTG	2	6	7616	7621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821552
72	NC_021903	GTT	2	6	7700	7705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821553
73	NC_021903	TGC	2	6	7781	7786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821553
74	NC_021903	TGC	2	6	7834	7839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821553
75	NC_021903	GTT	2	6	7847	7852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821553
76	NC_021903	GTC	2	6	7857	7862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821553
77	NC_021903	TTG	2	6	7880	7885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821553
78	NC_021903	TGA	2	6	7902	7907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821553
79	NC_021903	GTT	2	6	7909	7914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821553
80	NC_021903	TTG	2	6	8006	8011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821553
81	NC_021903	TGT	2	6	8188	8193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821553
82	NC_021903	GTC	2	6	8199	8204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821553
83	NC_021903	GCT	2	6	8285	8290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821553
84	NC_021903	CTT	2	6	8549	8554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821553
85	NC_021903	TGG	2	6	8771	8776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528821553
86	NC_021903	GTT	2	6	8791	8796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821553
87	NC_021903	ACC	2	6	8852	8857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821554
88	NC_021903	ATG	2	6	8867	8872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821554
89	NC_021903	TGA	2	6	8910	8915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821554
90	NC_021903	GCA	2	6	8937	8942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821554
91	NC_021903	CTT	2	6	8975	8980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821554
92	NC_021903	GTC	2	6	9096	9101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821554
93	NC_021903	TGA	2	6	9203	9208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821555
94	NC_021903	CCT	2	6	9209	9214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528821555
95	NC_021903	CAT	2	6	9469	9474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821555
96	NC_021903	CTT	2	6	9688	9693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821556
97	NC_021903	CAT	2	6	9703	9708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821556
98	NC_021903	ATT	2	6	9737	9742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821556
99	NC_021903	ACT	2	6	9777	9782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821556
100	NC_021903	CTT	2	6	9837	9842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821556
101	NC_021903	TGA	2	6	10181	10186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821557
102	NC_021903	AGC	2	6	10239	10244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821557
103	NC_021903	GCA	2	6	10340	10345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821557
104	NC_021903	CTG	2	6	10543	10548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821558
105	NC_021903	CAG	2	6	10557	10562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821558
106	NC_021903	TCA	2	6	10571	10576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821558
107	NC_021903	TTA	2	6	11088	11093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821559
108	NC_021903	AAT	2	6	11210	11215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528821559
109	NC_021903	GAA	2	6	11240	11245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821559
110	NC_021903	ATA	2	6	11277	11282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528821559
111	NC_021903	AGA	2	6	11401	11406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821559
112	NC_021903	TAA	2	6	11425	11430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528821559
113	NC_021903	AAT	2	6	11534	11539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528821560
114	NC_021903	TGA	2	6	11553	11558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821560
115	NC_021903	TTG	2	6	11609	11614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821560
116	NC_021903	GAA	2	6	11652	11657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821560
117	NC_021903	ATT	2	6	11658	11663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821560
118	NC_021903	CTG	2	6	11672	11677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821560
119	NC_021903	AGA	3	9	11703	11711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821560
120	NC_021903	ATG	2	6	11750	11755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821560
121	NC_021903	GTT	2	6	11795	11800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821560
122	NC_021903	ACA	2	6	11860	11865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528821560
123	NC_021903	GAT	2	6	11935	11940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821560
124	NC_021903	TAG	2	6	11961	11966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821560
125	NC_021903	TTG	2	6	12166	12171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821560
126	NC_021903	AAG	2	6	12208	12213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821560
127	NC_021903	TAA	2	6	12261	12266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528821560
128	NC_021903	AGA	2	6	12282	12287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821560
129	NC_021903	AAC	2	6	12339	12344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528821560
130	NC_021903	AGA	2	6	12351	12356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821560
131	NC_021903	ATA	2	6	12479	12484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528821560
132	NC_021903	TGA	2	6	12576	12581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821560
133	NC_021903	AGA	2	6	12753	12758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821560
134	NC_021903	CAA	2	6	12772	12777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528821560
135	NC_021903	TTA	2	6	12861	12866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821560
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149	NC_021903	ATT	2	6	14316	14321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821562

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.