MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 1174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021872	TATAA	2	10	1116	1125	60 %	40 %	0 %	0 %	526230726
2	NC_021872	ACCAC	2	10	1255	1264	40 %	0 %	0 %	60 %	526230726
3	NC_021872	GTTAA	2	10	2404	2413	40 %	40 %	20 %	0 %	526230727
4	NC_021872	AAGAT	2	10	3097	3106	60 %	20 %	20 %	0 %	526230728
5	NC_021872	AATCA	2	10	7666	7675	60 %	20 %	0 %	20 %	526230731
6	NC_021872	AATTG	2	10	11026	11035	40 %	40 %	20 %	0 %	526232157
7	NC_021872	AAATT	2	10	11619	11628	60 %	40 %	0 %	0 %	526232157
8	NC_021872	AGATG	2	10	14997	15006	40 %	20 %	40 %	0 %	526230737
9	NC_021872	CGGAC	2	10	15208	15217	20 %	0 %	40 %	40 %	526230737
10	NC_021872	GACAA	2	10	15524	15533	60 %	0 %	20 %	20 %	526230737
11	NC_021872	AAAAT	2	10	18710	18719	80 %	20 %	0 %	0 %	526232158
12	NC_021872	AAAAT	2	10	18759	18768	80 %	20 %	0 %	0 %	526232158
13	NC_021872	AGCAG	2	10	23135	23144	40 %	0 %	40 %	20 %	526230744
14	NC_021872	TTCAT	2	10	24865	24874	20 %	60 %	0 %	20 %	526230745
15	NC_021872	CACGA	2	10	24911	24920	40 %	0 %	20 %	40 %	526230745
16	NC_021872	TAATT	2	10	25044	25053	40 %	60 %	0 %	0 %	526230745
17	NC_021872	GGATC	2	10	25377	25386	20 %	20 %	40 %	20 %	526230745
18	NC_021872	ATATT	2	10	26301	26310	40 %	60 %	0 %	0 %	526230746
19	NC_021872	ATGGA	2	10	27199	27208	40 %	20 %	40 %	0 %	526230747
20	NC_021872	ACAAT	2	10	30734	30743	60 %	20 %	0 %	20 %	526230750
21	NC_021872	AAAAG	2	10	31551	31560	80 %	0 %	20 %	0 %	526230751
22	NC_021872	AAAAG	2	10	38401	38410	80 %	0 %	20 %	0 %	526232162
23	NC_021872	GGGCT	2	10	38719	38728	0 %	20 %	60 %	20 %	526232162
24	NC_021872	AATAT	2	10	39181	39190	60 %	40 %	0 %	0 %	526232163
25	NC_021872	ATGGG	2	10	39454	39463	20 %	20 %	60 %	0 %	526232163
26	NC_021872	GTTTT	2	10	40361	40370	0 %	80 %	20 %	0 %	526230756
27	NC_021872	TTCTC	2	10	41600	41609	0 %	60 %	0 %	40 %	526232164
28	NC_021872	TCAAC	2	10	42618	42627	40 %	20 %	0 %	40 %	526232165
29	NC_021872	CAAAA	2	10	43667	43676	80 %	0 %	0 %	20 %	526230757
30	NC_021872	TCCTA	2	10	44858	44867	20 %	40 %	0 %	40 %	526232168
31	NC_021872	TATGA	2	10	46123	46132	40 %	40 %	20 %	0 %	526232169
32	NC_021872	AAAGT	2	10	47009	47018	60 %	20 %	20 %	0 %	526232170
33	NC_021872	GTTGG	2	10	49359	49368	0 %	40 %	60 %	0 %	526230760
34	NC_021872	TTTAA	2	10	53156	53165	40 %	60 %	0 %	0 %	526232171
35	NC_021872	CAAGC	2	10	55542	55551	40 %	0 %	20 %	40 %	526230763
36	NC_021872	TAACT	2	10	56665	56674	40 %	40 %	0 %	20 %	526230763
37	NC_021872	TTTAT	2	10	58853	58862	20 %	80 %	0 %	0 %	526230765
38	NC_021872	AAGAT	2	10	59562	59571	60 %	20 %	20 %	0 %	526230765
39	NC_021872	TTGCA	2	10	59619	59628	20 %	40 %	20 %	20 %	526230765
40	NC_021872	TTAAA	2	10	59982	59991	60 %	40 %	0 %	0 %	526230765
41	NC_021872	TATTC	2	10	61237	61246	20 %	60 %	0 %	20 %	526230766
42	NC_021872	TGAAT	2	10	61475	61484	40 %	40 %	20 %	0 %	526230766
43	NC_021872	CGGAA	2	10	62220	62229	40 %	0 %	40 %	20 %	526230766
44	NC_021872	AATTT	2	10	69159	69168	40 %	60 %	0 %	0 %	526230768
45	NC_021872	GGAAC	2	10	69795	69804	40 %	0 %	40 %	20 %	526230769
46	NC_021872	ATGCA	2	10	69813	69822	40 %	20 %	20 %	20 %	526230769
47	NC_021872	AGCAA	2	10	72621	72630	60 %	0 %	20 %	20 %	526230771
48	NC_021872	GAAAA	2	10	75331	75340	80 %	0 %	20 %	0 %	526232172
49	NC_021872	AGTCA	2	10	75441	75450	40 %	20 %	20 %	20 %	526232172
50	NC_021872	AAGAA	2	10	75739	75748	80 %	0 %	20 %	0 %	526232172
51	NC_021872	CTGGA	2	10	76696	76705	20 %	20 %	40 %	20 %	526230774
52	NC_021872	TATTT	2	10	76998	77007	20 %	80 %	0 %	0 %	526230774
53	NC_021872	AATTA	2	10	78716	78725	60 %	40 %	0 %	0 %	526232173
54	NC_021872	ATGCA	2	10	80013	80022	40 %	20 %	20 %	20 %	526230776
55	NC_021872	CTTGC	2	10	81508	81517	0 %	40 %	20 %	40 %	526230777
56	NC_021872	AAACA	2	10	84286	84295	80 %	0 %	0 %	20 %	526230779
57	NC_021872	ACTAA	2	10	84539	84548	60 %	20 %	0 %	20 %	526230779
58	NC_021872	GGATG	2	10	89403	89412	20 %	20 %	60 %	0 %	526230783
59	NC_021872	TAGCT	2	10	94228	94237	20 %	40 %	20 %	20 %	526232174
60	NC_021872	TGATT	2	10	94374	94383	20 %	60 %	20 %	0 %	526232174
61	NC_021872	GGAAA	2	10	95740	95749	60 %	0 %	40 %	0 %	526230788
62	NC_021872	TGAAT	2	10	97378	97387	40 %	40 %	20 %	0 %	526230789
63	NC_021872	TTTTA	2	10	100367	100376	20 %	80 %	0 %	0 %	526232175
64	NC_021872	CAATG	2	10	101661	101670	40 %	20 %	20 %	20 %	526232175
65	NC_021872	ATTTC	2	10	103996	104005	20 %	60 %	0 %	20 %	526230791
66	NC_021872	ATCTT	2	10	107371	107380	20 %	60 %	0 %	20 %	526230792
67	NC_021872	AACGA	2	10	112983	112992	60 %	0 %	20 %	20 %	526230796
68	NC_021872	TCAAG	2	10	115883	115892	40 %	20 %	20 %	20 %	526232176
69	NC_021872	CTTAA	2	10	116705	116714	40 %	40 %	0 %	20 %	526232176
70	NC_021872	AAGGT	2	10	123753	123762	40 %	20 %	40 %	0 %	526232176
71	NC_021872	AATAC	2	10	127870	127879	60 %	20 %	0 %	20 %	526232177
72	NC_021872	TTCAC	2	10	132109	132118	20 %	40 %	0 %	40 %	526232177
73	NC_021872	TGACT	2	10	137309	137318	20 %	40 %	20 %	20 %	526232177
74	NC_021872	ATCAA	2	10	137356	137365	60 %	20 %	0 %	20 %	526232177
75	NC_021872	CATTT	2	10	138537	138546	20 %	60 %	0 %	20 %	526232178
76	NC_021872	GAAAA	2	10	141860	141869	80 %	0 %	20 %	0 %	526230800
77	NC_021872	TACTA	2	10	141889	141898	40 %	40 %	0 %	20 %	526230800
78	NC_021872	TTATT	2	10	144434	144443	20 %	80 %	0 %	0 %	526230802
79	NC_021872	ATTAT	2	10	145088	145097	40 %	60 %	0 %	0 %	526230802
80	NC_021872	TTGGA	2	10	148182	148191	20 %	40 %	40 %	0 %	526230804
81	NC_021872	ATAAG	2	10	150424	150433	60 %	20 %	20 %	0 %	526230806
82	NC_021872	ATTTT	2	10	151784	151793	20 %	80 %	0 %	0 %	526230808
83	NC_021872	AACGG	2	10	152858	152867	40 %	0 %	40 %	20 %	526230809
84	NC_021872	ACGCA	2	10	152891	152900	40 %	0 %	20 %	40 %	526230809
85	NC_021872	TGCAA	2	10	154905	154914	40 %	20 %	20 %	20 %	526230812
86	NC_021872	AAAGG	2	10	158204	158213	60 %	0 %	40 %	0 %	526230815
87	NC_021872	TGGGA	2	10	158929	158938	20 %	20 %	60 %	0 %	526230816
88	NC_021872	ATGAT	2	10	159408	159417	40 %	40 %	20 %	0 %	526230816
89	NC_021872	CTGAA	2	10	159649	159658	40 %	20 %	20 %	20 %	526230817
90	NC_021872	TTACT	2	10	160223	160232	20 %	60 %	0 %	20 %	526230817
91	NC_021872	GCGGT	2	10	163028	163037	0 %	20 %	60 %	20 %	526230819
92	NC_021872	GATTG	2	10	163990	163999	20 %	40 %	40 %	0 %	526230820
93	NC_021872	ATCCC	2	10	171610	171619	20 %	20 %	0 %	60 %	526230828
94	NC_021872	AATTT	2	10	174156	174165	40 %	60 %	0 %	0 %	526230829
95	NC_021872	TATTG	2	10	174953	174962	20 %	60 %	20 %	0 %	526230829
96	NC_021872	ACTTT	2	10	176762	176771	20 %	60 %	0 %	20 %	526230830
97	NC_021872	TGACG	2	10	182940	182949	20 %	20 %	40 %	20 %	526232181
98	NC_021872	AATTA	2	10	183090	183099	60 %	40 %	0 %	0 %	526232181
99	NC_021872	TGATT	2	10	187447	187456	20 %	60 %	20 %	0 %	526230835
100	NC_021872	ATTCC	2	10	187490	187499	20 %	40 %	0 %	40 %	526230835
101	NC_021872	TCAAT	2	10	189489	189498	40 %	40 %	0 %	20 %	526230836
102	NC_021872	GGCAA	2	10	189782	189791	40 %	0 %	40 %	20 %	526230837
103	NC_021872	AAAGA	2	10	191444	191453	80 %	0 %	20 %	0 %	526230840
104	NC_021872	GAATT	2	10	192585	192594	40 %	40 %	20 %	0 %	526230840
105	NC_021872	AGCAC	2	10	196174	196183	40 %	0 %	20 %	40 %	526230843
106	NC_021872	CAAAT	2	10	197935	197944	60 %	20 %	0 %	20 %	526230844
107	NC_021872	GGCGA	2	10	198038	198047	20 %	0 %	60 %	20 %	526230844
108	NC_021872	GGTTG	2	10	199672	199681	0 %	40 %	60 %	0 %	526230846
109	NC_021872	AAGAT	2	10	200785	200794	60 %	20 %	20 %	0 %	526230847
110	NC_021872	TTGAT	2	10	202460	202469	20 %	60 %	20 %	0 %	526230848
111	NC_021872	CCATT	2	10	202511	202520	20 %	40 %	0 %	40 %	526230848
112	NC_021872	TCCTG	2	10	210628	210637	0 %	40 %	20 %	40 %	526232183
113	NC_021872	AAAGA	2	10	213917	213926	80 %	0 %	20 %	0 %	526232186
114	NC_021872	CAAAA	2	10	219523	219532	80 %	0 %	0 %	20 %	526230851
115	NC_021872	GTTAA	2	10	220291	220300	40 %	40 %	20 %	0 %	526232190
116	NC_021872	GAAAA	3	15	222263	222277	80 %	0 %	20 %	0 %	526232192
117	NC_021872	AAAGG	2	10	228048	228057	60 %	0 %	40 %	0 %	526232193
118	NC_021872	AAGCA	2	10	228186	228195	60 %	0 %	20 %	20 %	526232193
119	NC_021872	TCATT	2	10	230909	230918	20 %	60 %	0 %	20 %	526230859
120	NC_021872	TTTGC	2	10	232736	232745	0 %	60 %	20 %	20 %	526230861
121	NC_021872	AAAGC	2	10	234502	234511	60 %	0 %	20 %	20 %	526230862
122	NC_021872	TGCAT	2	10	235464	235473	20 %	40 %	20 %	20 %	526232194
123	NC_021872	TTTAC	2	10	237678	237687	20 %	60 %	0 %	20 %	526230864
124	NC_021872	CATTG	2	10	238089	238098	20 %	40 %	20 %	20 %	526230865
125	NC_021872	ATAAA	2	10	241073	241082	80 %	20 %	0 %	0 %	526230869
126	NC_021872	GTTTT	2	10	245395	245404	0 %	80 %	20 %	0 %	526230873
127	NC_021872	ACTTG	2	10	247541	247550	20 %	40 %	20 %	20 %	526230874
128	NC_021872	TTAGT	2	10	248649	248658	20 %	60 %	20 %	0 %	526230875
129	NC_021872	TTTCC	2	10	251016	251025	0 %	60 %	0 %	40 %	526230878
130	NC_021872	TTTTC	2	10	255642	255651	0 %	80 %	0 %	20 %	526230880
131	NC_021872	TGATT	2	10	256111	256120	20 %	60 %	20 %	0 %	526230880
132	NC_021872	GGACA	2	10	256125	256134	40 %	0 %	40 %	20 %	526230880
133	NC_021872	CTAAT	2	10	256329	256338	40 %	40 %	0 %	20 %	526230880
134	NC_021872	GATAA	2	10	256409	256418	60 %	20 %	20 %	0 %	526230880
135	NC_021872	AAATT	2	10	256876	256885	60 %	40 %	0 %	0 %	526230880
136	NC_021872	TGGTG	2	10	258255	258264	0 %	40 %	60 %	0 %	526230882
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149	NC_021872	CAATA	2	10	279418	279427	60 %	20 %	0 %	20 %	526230901
150	NC_021872	TAATT	2	10	280336	280345	40 %	60 %	0 %	0 %	526230902
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257	NC_021872	ATTAA	2	10	525662	525671	60 %	40 %	0 %	0 %	526232218
258	NC_021872	TTTGT	2	10	532424	532433	0 %	80 %	20 %	0 %	526232228
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260	NC_021872	AAAAG	2	10	532849	532858	80 %	0 %	20 %	0 %	526232229
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262	NC_021872	TAGTT	2	10	533092	533101	20 %	60 %	20 %	0 %	526232229
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264	NC_021872	AAGTT	2	10	535609	535618	40 %	40 %	20 %	0 %	526232231
265	NC_021872	AATTT	2	10	537174	537183	40 %	60 %	0 %	0 %	526232232
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332	NC_021872	TTAAT	2	10	625797	625806	40 %	60 %	0 %	0 %	526231169
333	NC_021872	TGCAA	2	10	627114	627123	40 %	20 %	20 %	20 %	526231170
334	NC_021872	TAATT	2	10	631163	631172	40 %	60 %	0 %	0 %	526231174
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379	NC_021872	ATCTT	2	10	719866	719875	20 %	60 %	0 %	20 %	526231252
380	NC_021872	TCTTA	2	10	720245	720254	20 %	60 %	0 %	20 %	526231253
381	NC_021872	CATGC	2	10	722265	722274	20 %	20 %	20 %	40 %	526231254
382	NC_021872	ATGGA	2	10	722633	722642	40 %	20 %	40 %	0 %	526231254
383	NC_021872	AATTT	2	10	724352	724361	40 %	60 %	0 %	0 %	526232242
384	NC_021872	TCAAT	2	10	724944	724953	40 %	40 %	0 %	20 %	526232242
385	NC_021872	TGATG	2	10	729073	729082	20 %	40 %	40 %	0 %	526231258
386	NC_021872	CCATT	2	10	734243	734252	20 %	40 %	0 %	40 %	526231263
387	NC_021872	ATTGC	2	10	734534	734543	20 %	40 %	20 %	20 %	526231263
388	NC_021872	TTTAC	2	10	735565	735574	20 %	60 %	0 %	20 %	526231264
389	NC_021872	TCTTT	2	10	736114	736123	0 %	80 %	0 %	20 %	526232243
390	NC_021872	TCAAT	2	10	736376	736385	40 %	40 %	0 %	20 %	526232243
391	NC_021872	AGGCA	2	10	737590	737599	40 %	0 %	40 %	20 %	526231265
392	NC_021872	AATGC	2	10	738332	738341	40 %	20 %	20 %	20 %	526231265
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