MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021872	AAG	2	6	222700	222705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230853
4002	NC_021872	TGC	2	6	222755	222760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230853
4003	NC_021872	TGA	2	6	222761	222766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230853
4004	NC_021872	AAT	2	6	222779	222784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230853
4005	NC_021872	GGC	2	6	222941	222946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230853
4006	NC_021872	AAG	2	6	223000	223005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230853
4007	NC_021872	GA	3	6	223012	223017	50 %	0 %	50 %	0 %	526230853
4008	NC_021872	CAA	2	6	223032	223037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230853
4009	NC_021872	A	6	6	223076	223081	100 %	0 %	0 %	0 %	526230853
4010	NC_021872	GTT	2	6	223086	223091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230853
4011	NC_021872	GAA	2	6	223149	223154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230853
4012	NC_021872	ATA	2	6	223249	223254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230853
4013	NC_021872	TGGA	2	8	223282	223289	25 %	25 %	50 %	0 %	526230853
4014	NC_021872	TCGG	2	8	223297	223304	0 %	25 %	50 %	25 %	526230853
4015	NC_021872	A	7	7	223369	223375	100 %	0 %	0 %	0 %	526230853
4016	NC_021872	TGG	2	6	223665	223670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230854
4017	NC_021872	GCC	2	6	223756	223761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230854
4018	NC_021872	TGA	2	6	223881	223886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230854
4019	NC_021872	TCAA	2	8	223896	223903	50 %	25 %	0 %	25 %	526230854
4020	NC_021872	AGG	2	6	223905	223910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230854
4021	NC_021872	ATA	2	6	223928	223933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230854
4022	NC_021872	AAG	2	6	223957	223962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230854
4023	NC_021872	GCT	2	6	223972	223977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230854
4024	NC_021872	CAA	2	6	224137	224142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230854
4025	NC_021872	GCG	2	6	224158	224163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230854
4026	NC_021872	TTGA	2	8	224179	224186	25 %	50 %	25 %	0 %	526230854
4027	NC_021872	GAT	2	6	224217	224222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230854
4028	NC_021872	TGA	2	6	224250	224255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230854
4029	NC_021872	TGC	2	6	224256	224261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230854
4030	NC_021872	AATC	2	8	224262	224269	50 %	25 %	0 %	25 %	526230854
4031	NC_021872	ATT	2	6	224280	224285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230854
4032	NC_021872	CGT	2	6	224296	224301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230854
4033	NC_021872	TAA	2	6	224364	224369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230854
4034	NC_021872	GTAA	2	8	224425	224432	50 %	25 %	25 %	0 %	526230854
4035	NC_021872	ATT	2	6	224512	224517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230854
4036	NC_021872	AGA	2	6	224606	224611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230855
4037	NC_021872	TTA	2	6	224673	224678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230855
4038	NC_021872	TAA	2	6	224687	224692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230855
4039	NC_021872	TGT	2	6	224696	224701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230855
4040	NC_021872	AAT	2	6	224751	224756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230855
4041	NC_021872	CTTT	2	8	224808	224815	0 %	75 %	0 %	25 %	526230855
4042	NC_021872	CAA	2	6	224823	224828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230855
4043	NC_021872	A	6	6	224884	224889	100 %	0 %	0 %	0 %	526230855
4044	NC_021872	GTC	2	6	224908	224913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230855
4045	NC_021872	T	6	6	224917	224922	0 %	100 %	0 %	0 %	526230855
4046	NC_021872	TG	3	6	224941	224946	0 %	50 %	50 %	0 %	526230855
4047	NC_021872	GGTTAA	2	12	224947	224958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230855
4048	NC_021872	TGC	2	6	225135	225140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230856
4049	NC_021872	TTA	2	6	225162	225167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230856
4050	NC_021872	ATT	2	6	225205	225210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230856
4051	NC_021872	CAA	2	6	225214	225219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230856
4052	NC_021872	ATC	2	6	225223	225228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230856
4053	NC_021872	TTA	2	6	225294	225299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230856
4054	NC_021872	CAT	2	6	225367	225372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230856
4055	NC_021872	GAA	2	6	225413	225418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230856
4056	NC_021872	A	6	6	225423	225428	100 %	0 %	0 %	0 %	526230856
4057	NC_021872	TATT	2	8	225482	225489	25 %	75 %	0 %	0 %	526230856
4058	NC_021872	ATT	2	6	225515	225520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230856
4059	NC_021872	TTA	2	6	225548	225553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230856
4060	NC_021872	AAG	2	6	225591	225596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230856
4061	NC_021872	CAA	2	6	225608	225613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230856
4062	NC_021872	CGG	2	6	225618	225623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230856
4063	NC_021872	GCG	2	6	225674	225679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230856
4064	NC_021872	ACC	2	6	225697	225702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230856
4065	NC_021872	A	6	6	225869	225874	100 %	0 %	0 %	0 %	526230856
4066	NC_021872	CGT	2	6	225884	225889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230856
4067	NC_021872	TA	3	6	225894	225899	50 %	50 %	0 %	0 %	526230856
4068	NC_021872	A	6	6	225923	225928	100 %	0 %	0 %	0 %	526230856
4069	NC_021872	CGA	2	6	225944	225949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230856
4070	NC_021872	GGC	2	6	225956	225961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230856
4071	NC_021872	ATTT	2	8	226017	226024	25 %	75 %	0 %	0 %	526230856
4072	NC_021872	CAA	2	6	226046	226051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230856
4073	NC_021872	GTG	2	6	226052	226057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230856
4074	NC_021872	CGA	2	6	226099	226104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230856
4075	NC_021872	GCA	3	9	226115	226123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230856
4076	NC_021872	TTGG	2	8	226165	226172	0 %	50 %	50 %	0 %	526230856
4077	NC_021872	GCT	2	6	226268	226273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230856
4078	NC_021872	TTA	2	6	226332	226337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230856
4079	NC_021872	GATT	2	8	226359	226366	25 %	50 %	25 %	0 %	526230856
4080	NC_021872	ACT	2	6	226404	226409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230856
4081	NC_021872	GGCA	2	8	226455	226462	25 %	0 %	50 %	25 %	526230856
4082	NC_021872	AGT	2	6	226532	226537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230856
4083	NC_021872	ATG	2	6	226649	226654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230856
4084	NC_021872	CAA	2	6	226685	226690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230856
4085	NC_021872	ATA	2	6	226797	226802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230856
4086	NC_021872	GCG	2	6	226822	226827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230856
4087	NC_021872	GAA	2	6	226886	226891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230856
4088	NC_021872	GGCA	2	8	226944	226951	25 %	0 %	50 %	25 %	526230856
4089	NC_021872	TAAC	2	8	226962	226969	50 %	25 %	0 %	25 %	526230856
4090	NC_021872	GCT	2	6	227143	227148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230856
4091	NC_021872	CAA	2	6	227237	227242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230856
4092	NC_021872	TGA	2	6	227278	227283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230856
4093	NC_021872	A	6	6	227329	227334	100 %	0 %	0 %	0 %	526230856
4094	NC_021872	TTG	2	6	227358	227363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230856
4095	NC_021872	ATC	2	6	227364	227369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230856
4096	NC_021872	TTA	2	6	227375	227380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230856
4097	NC_021872	AAC	2	6	227458	227463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230856
4098	NC_021872	CAAG	2	8	227494	227501	50 %	0 %	25 %	25 %	526230856
4099	NC_021872	TTA	2	6	227546	227551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230856
4100	NC_021872	AGA	2	6	227599	227604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230856
4101	NC_021872	TACC	2	8	227623	227630	25 %	25 %	0 %	50 %	526230856
4102	NC_021872	AGA	2	6	227641	227646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230856
4103	NC_021872	A	6	6	227646	227651	100 %	0 %	0 %	0 %	526230856
4104	NC_021872	CTAT	2	8	227658	227665	25 %	50 %	0 %	25 %	526230856
4105	NC_021872	AAT	2	6	227666	227671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230856
4106	NC_021872	CGTT	2	8	227687	227694	0 %	50 %	25 %	25 %	526230856
4107	NC_021872	AC	3	6	227703	227708	50 %	0 %	0 %	50 %	526230856
4108	NC_021872	TGA	2	6	227731	227736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230856
4109	NC_021872	TTGC	2	8	227747	227754	0 %	50 %	25 %	25 %	526230856
4110	NC_021872	TAT	2	6	227831	227836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230856
4111	NC_021872	AGA	2	6	227872	227877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230856
4112	NC_021872	TTGG	2	8	227879	227886	0 %	50 %	50 %	0 %	526230856
4113	NC_021872	A	6	6	227894	227899	100 %	0 %	0 %	0 %	526230856
4114	NC_021872	GGAT	2	8	227910	227917	25 %	25 %	50 %	0 %	526230856
4115	NC_021872	ACCA	2	8	227941	227948	50 %	0 %	0 %	50 %	526230856
4116	NC_021872	TGA	2	6	227949	227954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230856
4117	NC_021872	AAAGG	2	10	228048	228057	60 %	0 %	40 %	0 %	526232193
4118	NC_021872	TGGC	2	8	228106	228113	0 %	25 %	50 %	25 %	526232193
4119	NC_021872	TTA	2	6	228114	228119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232193
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4121	NC_021872	AGA	2	6	228178	228183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232193
4122	NC_021872	AAGCA	2	10	228186	228195	60 %	0 %	20 %	20 %	526232193
4123	NC_021872	ACA	2	6	228227	228232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232193
4124	NC_021872	TGA	2	6	228242	228247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232193
4125	NC_021872	ATA	2	6	228307	228312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232193
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4127	NC_021872	GTT	2	6	228468	228473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230857
4128	NC_021872	TAAA	2	8	228474	228481	75 %	25 %	0 %	0 %	526230857
4129	NC_021872	TTG	2	6	228501	228506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230857
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4132	NC_021872	CTTTTG	2	12	228678	228689	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	526230857
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4134	NC_021872	TTGG	2	8	228794	228801	0 %	50 %	50 %	0 %	526230857
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4144	NC_021872	GTT	2	6	229067	229072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230857
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4148	NC_021872	TG	3	6	229486	229491	0 %	50 %	50 %	0 %	526230857
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4153	NC_021872	ATA	3	9	229778	229786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230857
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4157	NC_021872	AAT	2	6	230237	230242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230858
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4163	NC_021872	CAG	2	6	230721	230726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230859
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4231	NC_021872	GA	3	6	234986	234991	50 %	0 %	50 %	0 %	526230862
4232	NC_021872	GAT	3	9	235087	235095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230862
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4234	NC_021872	TC	3	6	235207	235212	0 %	50 %	0 %	50 %	526230862
4235	NC_021872	CAA	2	6	235241	235246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230862
4236	NC_021872	T	6	6	235293	235298	0 %	100 %	0 %	0 %	526230862
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4241	NC_021872	TGCAT	2	10	235464	235473	20 %	40 %	20 %	20 %	526232194
4242	NC_021872	TAG	2	6	235543	235548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232195
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4244	NC_021872	GTTG	2	8	235576	235583	0 %	50 %	50 %	0 %	526232195
4245	NC_021872	GTC	2	6	235605	235610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232195
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4371	NC_021872	TAA	2	6	241410	241415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230869
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4487	NC_021872	ACTTG	2	10	247541	247550	20 %	40 %	20 %	20 %	526230874
4488	NC_021872	AGA	3	9	247553	247561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230874
4489	NC_021872	GCAA	2	8	247619	247626	50 %	0 %	25 %	25 %	526230874
4490	NC_021872	AAG	2	6	247788	247793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230875
4491	NC_021872	T	6	6	247818	247823	0 %	100 %	0 %	0 %	526230875
4492	NC_021872	TTG	2	6	247962	247967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230875
4493	NC_021872	CAG	2	6	248103	248108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230875
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4495	NC_021872	CAG	2	6	248190	248195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230875
4496	NC_021872	TGG	2	6	248230	248235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230875
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4500	NC_021872	TGG	2	6	248386	248391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230875

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