MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_021872	GAT	2	6	2141819	2141824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232152
40002	NC_021872	AAG	2	6	2141873	2141878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232152
40003	NC_021872	GTT	2	6	2141890	2141895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232152
40004	NC_021872	TCG	2	6	2141926	2141931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232152
40005	NC_021872	TTC	2	6	2141936	2141941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232152
40006	NC_021872	CAT	2	6	2141947	2141952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232152
40007	NC_021872	AAG	2	6	2142138	2142143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232152
40008	NC_021872	GAG	2	6	2142274	2142279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526232152
40009	NC_021872	CTT	2	6	2142310	2142315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232152
40010	NC_021872	TGC	2	6	2142473	2142478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232152
40011	NC_021872	A	7	7	2142528	2142534	100 %	0 %	0 %	0 %	526232152
40012	NC_021872	GTG	2	6	2142725	2142730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232153
40013	NC_021872	ATT	2	6	2142731	2142736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232153
40014	NC_021872	CGGG	2	8	2142768	2142775	0 %	0 %	75 %	25 %	526232153
40015	NC_021872	ACT	2	6	2142810	2142815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232153
40016	NC_021872	CTT	2	6	2142850	2142855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232153
40017	NC_021872	CGT	2	6	2142858	2142863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232153
40018	NC_021872	TGC	2	6	2142902	2142907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232153
40019	NC_021872	AT	3	6	2142925	2142930	50 %	50 %	0 %	0 %	526232153
40020	NC_021872	TAA	2	6	2143033	2143038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232153
40021	NC_021872	GCC	2	6	2143138	2143143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526232153
40022	NC_021872	TTC	2	6	2143232	2143237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232153
40023	NC_021872	TTA	2	6	2143267	2143272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232153
40024	NC_021872	CGT	2	6	2143293	2143298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232153
40025	NC_021872	GAA	2	6	2143330	2143335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232153
40026	NC_021872	CTTTT	2	10	2143385	2143394	0 %	80 %	0 %	20 %	526232153
40027	NC_021872	CTT	2	6	2143396	2143401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232153
40028	NC_021872	TTG	2	6	2143405	2143410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232153
40029	NC_021872	CCG	2	6	2143531	2143536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526232154
40030	NC_021872	TTCACG	2	12	2143606	2143617	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	526232154
40031	NC_021872	TAC	2	6	2143675	2143680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232154
40032	NC_021872	GAA	2	6	2143720	2143725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232154
40033	NC_021872	T	7	7	2143769	2143775	0 %	100 %	0 %	0 %	526232154
40034	NC_021872	TAA	2	6	2143806	2143811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232154
40035	NC_021872	AAT	2	6	2143817	2143822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232154
40036	NC_021872	GTA	2	6	2143843	2143848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232154
40037	NC_021872	CTT	2	6	2143989	2143994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232154
40038	NC_021872	TGA	2	6	2144047	2144052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232154
40039	NC_021872	GAG	2	6	2144079	2144084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526232154
40040	NC_021872	TCA	2	6	2144100	2144105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232154
40041	NC_021872	TTTG	2	8	2144111	2144118	0 %	75 %	25 %	0 %	526232154
40042	NC_021872	GAT	2	6	2144140	2144145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232154
40043	NC_021872	GAT	3	9	2144149	2144157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232154
40044	NC_021872	AGCA	2	8	2144286	2144293	50 %	0 %	25 %	25 %	526232154
40045	NC_021872	T	7	7	2144338	2144344	0 %	100 %	0 %	0 %	526232154
40046	NC_021872	T	6	6	2144373	2144378	0 %	100 %	0 %	0 %	526232155
40047	NC_021872	TAA	2	6	2144509	2144514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232155
40048	NC_021872	CGC	2	6	2144528	2144533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526232155
40049	NC_021872	T	6	6	2144567	2144572	0 %	100 %	0 %	0 %	526232155
40050	NC_021872	T	6	6	2144690	2144695	0 %	100 %	0 %	0 %	526232155
40051	NC_021872	ATA	2	6	2144862	2144867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232156
40052	NC_021872	CTT	2	6	2144962	2144967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232156

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.