MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29001	NC_021872	ATATA	2	10	1551189	1551198	60 %	40 %	0 %	0 %	526231760
29002	NC_021872	ACT	2	6	1551228	1551233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231760
29003	NC_021872	ATAA	2	8	1551663	1551670	75 %	25 %	0 %	0 %	526232531
29004	NC_021872	TCA	2	6	1551700	1551705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232531
29005	NC_021872	CAGG	2	8	1551736	1551743	25 %	0 %	50 %	25 %	526232531
29006	NC_021872	CCA	2	6	1551841	1551846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232531
29007	NC_021872	CCT	2	6	1551875	1551880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526232531
29008	NC_021872	TGA	2	6	1551898	1551903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232531
29009	NC_021872	ATA	2	6	1551921	1551926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232531
29010	NC_021872	ATC	2	6	1551984	1551989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232531
29011	NC_021872	AG	3	6	1552016	1552021	50 %	0 %	50 %	0 %	526232531
29012	NC_021872	TGT	2	6	1552034	1552039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232531
29013	NC_021872	GATTA	2	10	1552056	1552065	40 %	40 %	20 %	0 %	526232531
29014	NC_021872	CGT	2	6	1552070	1552075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232531
29015	NC_021872	CAT	2	6	1552121	1552126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232531
29016	NC_021872	AGTT	2	8	1552257	1552264	25 %	50 %	25 %	0 %	526232531
29017	NC_021872	CTT	2	6	1552283	1552288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232531
29018	NC_021872	ATT	2	6	1552293	1552298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232531
29019	NC_021872	AATAA	2	10	1552300	1552309	80 %	20 %	0 %	0 %	526232531
29020	NC_021872	ATTG	2	8	1552330	1552337	25 %	50 %	25 %	0 %	526232531
29021	NC_021872	CCAT	2	8	1552346	1552353	25 %	25 %	0 %	50 %	526232531
29022	NC_021872	AAG	2	6	1552400	1552405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232531
29023	NC_021872	CTG	2	6	1552407	1552412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232531
29024	NC_021872	ACC	2	6	1552433	1552438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232531
29025	NC_021872	TAT	2	6	1552460	1552465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232531
29026	NC_021872	TAT	2	6	1552655	1552660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232531
29027	NC_021872	T	6	6	1552794	1552799	0 %	100 %	0 %	0 %	526232531
29028	NC_021872	AAT	2	6	1552811	1552816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232531
29029	NC_021872	AGC	2	6	1552839	1552844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232531
29030	NC_021872	TAA	2	6	1552934	1552939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232531
29031	NC_021872	GTT	2	6	1553011	1553016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232531
29032	NC_021872	CCAG	2	8	1553073	1553080	25 %	0 %	25 %	50 %	526232531
29033	NC_021872	TCA	2	6	1553227	1553232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232531
29034	NC_021872	ATT	2	6	1553259	1553264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232531
29035	NC_021872	GC	3	6	1553331	1553336	0 %	0 %	50 %	50 %	526232531
29036	NC_021872	TAG	2	6	1553375	1553380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232531
29037	NC_021872	TTGC	2	8	1553432	1553439	0 %	50 %	25 %	25 %	526232531
29038	NC_021872	TTA	2	6	1553464	1553469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232531
29039	NC_021872	T	6	6	1553525	1553530	0 %	100 %	0 %	0 %	526232531
29040	NC_021872	ACT	2	6	1553544	1553549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232531
29041	NC_021872	TAG	3	9	1553579	1553587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232531
29042	NC_021872	ATT	2	6	1553787	1553792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231761
29043	NC_021872	TTA	2	6	1553802	1553807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231761
29044	NC_021872	CAAT	2	8	1553820	1553827	50 %	25 %	0 %	25 %	526231761
29045	NC_021872	TCT	2	6	1553844	1553849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231761
29046	NC_021872	CTT	2	6	1553852	1553857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231761
29047	NC_021872	TGA	2	6	1553906	1553911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231761
29048	NC_021872	AAC	2	6	1553974	1553979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231761
29049	NC_021872	ACG	2	6	1554090	1554095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231761
29050	NC_021872	ATG	2	6	1554180	1554185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231761
29051	NC_021872	T	6	6	1554344	1554349	0 %	100 %	0 %	0 %	526231761
29052	NC_021872	CAG	2	6	1554430	1554435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231761
29053	NC_021872	TCT	2	6	1554481	1554486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231761
29054	NC_021872	CCA	2	6	1554820	1554825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231762
29055	NC_021872	CAAT	2	8	1554845	1554852	50 %	25 %	0 %	25 %	526231762
29056	NC_021872	GT	3	6	1554854	1554859	0 %	50 %	50 %	0 %	526231762
29057	NC_021872	TTG	2	6	1554918	1554923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231762
29058	NC_021872	TTG	2	6	1555025	1555030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231762
29059	NC_021872	ATT	2	6	1555234	1555239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231762
29060	NC_021872	TGA	2	6	1555315	1555320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231762
29061	NC_021872	TGG	2	6	1555442	1555447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231762
29062	NC_021872	CCG	2	6	1555554	1555559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526231762
29063	NC_021872	GGCTT	2	10	1555579	1555588	0 %	40 %	40 %	20 %	526231762
29064	NC_021872	GTG	2	6	1555726	1555731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231762
29065	NC_021872	AAC	2	6	1555735	1555740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231762
29066	NC_021872	AAT	2	6	1555786	1555791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231762
29067	NC_021872	GGTT	2	8	1555869	1555876	0 %	50 %	50 %	0 %	526232532
29068	NC_021872	GCA	2	6	1555879	1555884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232532
29069	NC_021872	CAT	2	6	1555976	1555981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232532
29070	NC_021872	AAG	2	6	1556029	1556034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232532
29071	NC_021872	GGT	2	6	1556069	1556074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232532
29072	NC_021872	CAA	2	6	1556135	1556140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232532
29073	NC_021872	TTTG	2	8	1556179	1556186	0 %	75 %	25 %	0 %	526232532
29074	NC_021872	GCT	2	6	1556188	1556193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232532
29075	NC_021872	TAAAGT	2	12	1556261	1556272	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	526232532
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29077	NC_021872	CGG	2	6	1556342	1556347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526232532
29078	NC_021872	TAA	2	6	1556351	1556356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232532
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29082	NC_021872	TTC	2	6	1556459	1556464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232533
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29084	NC_021872	TCT	2	6	1556528	1556533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232533
29085	NC_021872	GCT	2	6	1556585	1556590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232533
29086	NC_021872	CGTG	2	8	1556604	1556611	0 %	25 %	50 %	25 %	526232533
29087	NC_021872	CGC	2	6	1556706	1556711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526232533
29088	NC_021872	ACT	2	6	1556744	1556749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232533
29089	NC_021872	TTC	2	6	1556809	1556814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232533
29090	NC_021872	GCAT	2	8	1556825	1556832	25 %	25 %	25 %	25 %	526232533
29091	NC_021872	TCA	2	6	1556837	1556842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232533
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29094	NC_021872	GCT	2	6	1556915	1556920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232533
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29096	NC_021872	TGT	2	6	1556958	1556963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232533
29097	NC_021872	CAAA	2	8	1556974	1556981	75 %	0 %	0 %	25 %	526232533
29098	NC_021872	AAT	2	6	1557092	1557097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232533
29099	NC_021872	ATA	2	6	1557178	1557183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232533
29100	NC_021872	ATC	2	6	1557185	1557190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232533
29101	NC_021872	CCA	2	6	1557260	1557265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232533
29102	NC_021872	ATT	2	6	1557272	1557277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232533
29103	NC_021872	ACT	2	6	1558626	1558631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232534
29104	NC_021872	TGC	2	6	1558644	1558649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232534
29105	NC_021872	TTG	2	6	1558725	1558730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232534
29106	NC_021872	CAT	2	6	1558757	1558762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232534
29107	NC_021872	T	6	6	1558837	1558842	0 %	100 %	0 %	0 %	526232534
29108	NC_021872	ACA	2	6	1558843	1558848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232534
29109	NC_021872	TTG	2	6	1558870	1558875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232534
29110	NC_021872	ATT	2	6	1558926	1558931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232534
29111	NC_021872	GCT	2	6	1558978	1558983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232534
29112	NC_021872	TTAC	2	8	1559071	1559078	25 %	50 %	0 %	25 %	526232534
29113	NC_021872	AGT	2	6	1559103	1559108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232534
29114	NC_021872	CAG	2	6	1559156	1559161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232534
29115	NC_021872	AAT	2	6	1559252	1559257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232534
29116	NC_021872	AGC	2	6	1559280	1559285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232534
29117	NC_021872	CAT	2	6	1559399	1559404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232534
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29231	NC_021872	ATT	2	6	1565073	1565078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232537
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29471	NC_021872	CAA	2	6	1573872	1573877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232545
29472	NC_021872	ACA	2	6	1573881	1573886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232545
29473	NC_021872	TCT	2	6	1573928	1573933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232545
29474	NC_021872	CTA	2	6	1573953	1573958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232545
29475	NC_021872	ACG	2	6	1573963	1573968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232545
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