MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021872	CAT	2	6	51317	51322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230762
1002	NC_021872	CTT	2	6	51326	51331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230762
1003	NC_021872	ATT	2	6	51402	51407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230762
1004	NC_021872	GTG	2	6	51424	51429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230762
1005	NC_021872	ACT	2	6	51450	51455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230762
1006	NC_021872	TAT	2	6	51476	51481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230762
1007	NC_021872	TGC	2	6	51488	51493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230762
1008	NC_021872	CGG	2	6	51501	51506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230762
1009	NC_021872	CTGTTA	2	12	51514	51525	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	526230762
1010	NC_021872	CAAG	2	8	51532	51539	50 %	0 %	25 %	25 %	526230762
1011	NC_021872	CAC	2	6	51588	51593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230762
1012	NC_021872	GCT	2	6	51624	51629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230762
1013	NC_021872	CTG	2	6	51700	51705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230762
1014	NC_021872	AGC	2	6	51713	51718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230762
1015	NC_021872	AGA	2	6	51767	51772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230762
1016	NC_021872	AAG	2	6	51774	51779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230762
1017	NC_021872	GCT	2	6	51789	51794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230762
1018	NC_021872	AAGA	2	8	51795	51802	75 %	0 %	25 %	0 %	526230762
1019	NC_021872	GAA	2	6	51848	51853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230762
1020	NC_021872	AGA	2	6	51899	51904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230762
1021	NC_021872	TCG	2	6	52052	52057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230762
1022	NC_021872	ATT	2	6	52185	52190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230762
1023	NC_021872	GAT	2	6	52235	52240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230762
1024	NC_021872	CTG	2	6	52249	52254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230762
1025	NC_021872	TCG	2	6	52301	52306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230762
1026	NC_021872	ATT	2	6	52320	52325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230762
1027	NC_021872	CTT	2	6	52326	52331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230762
1028	NC_021872	TGA	2	6	52385	52390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230762
1029	NC_021872	TTA	2	6	52441	52446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230762
1030	NC_021872	GAA	2	6	52509	52514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230762
1031	NC_021872	TTAA	2	8	52518	52525	50 %	50 %	0 %	0 %	526230762
1032	NC_021872	ACT	2	6	52533	52538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230762
1033	NC_021872	TTG	2	6	52576	52581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230762
1034	NC_021872	TGCT	2	8	52630	52637	0 %	50 %	25 %	25 %	526230762
1035	NC_021872	AAG	2	6	52659	52664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230762
1036	NC_021872	TGA	2	6	52709	52714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230762
1037	NC_021872	TCG	2	6	52748	52753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230762
1038	NC_021872	TAC	2	6	52791	52796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230762
1039	NC_021872	ACC	2	6	52801	52806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230762
1040	NC_021872	TTG	2	6	52822	52827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230762
1041	NC_021872	TTG	2	6	52855	52860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230762
1042	NC_021872	AAG	2	6	52914	52919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230762
1043	NC_021872	GAA	2	6	52923	52928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230762
1044	NC_021872	AAG	2	6	52938	52943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230762
1045	NC_021872	GAA	2	6	52944	52949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230762
1046	NC_021872	AAG	2	6	52953	52958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230762
1047	NC_021872	AAGA	2	8	52971	52978	75 %	0 %	25 %	0 %	526230762
1048	NC_021872	TCT	2	6	53072	53077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232171
1049	NC_021872	TTTAA	2	10	53156	53165	40 %	60 %	0 %	0 %	526232171
1050	NC_021872	TAA	2	6	53175	53180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232171
1051	NC_021872	CG	3	6	53267	53272	0 %	0 %	50 %	50 %	526232171
1052	NC_021872	CAG	2	6	53300	53305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232171
1053	NC_021872	TGA	2	6	53312	53317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232171
1054	NC_021872	T	7	7	53337	53343	0 %	100 %	0 %	0 %	526232171
1055	NC_021872	CCA	2	6	53357	53362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232171
1056	NC_021872	TAT	2	6	53383	53388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232171
1057	NC_021872	CAAA	2	8	53449	53456	75 %	0 %	0 %	25 %	526232171
1058	NC_021872	TGT	2	6	53471	53476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232171
1059	NC_021872	ATG	2	6	53488	53493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232171
1060	NC_021872	GAG	2	6	53494	53499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526232171
1061	NC_021872	ATC	2	6	53500	53505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232171
1062	NC_021872	GTT	2	6	53517	53522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232171
1063	NC_021872	TGCC	2	8	53760	53767	0 %	25 %	25 %	50 %	526232171
1064	NC_021872	T	6	6	53776	53781	0 %	100 %	0 %	0 %	526232171
1065	NC_021872	CCA	2	6	53786	53791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232171
1066	NC_021872	TGAT	2	8	53806	53813	25 %	50 %	25 %	0 %	526232171
1067	NC_021872	TGC	2	6	53854	53859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232171
1068	NC_021872	ATT	2	6	53869	53874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232171
1069	NC_021872	TTC	2	6	53986	53991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232171
1070	NC_021872	TCA	2	6	54047	54052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232171
1071	NC_021872	TAA	2	6	54061	54066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232171
1072	NC_021872	AGT	2	6	54148	54153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232171
1073	NC_021872	AAT	2	6	54992	54997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230763
1074	NC_021872	CAG	2	6	55035	55040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230763
1075	NC_021872	ACC	2	6	55049	55054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230763
1076	NC_021872	ATA	2	6	55080	55085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230763
1077	NC_021872	AAGT	2	8	55101	55108	50 %	25 %	25 %	0 %	526230763
1078	NC_021872	TTAC	2	8	55119	55126	25 %	50 %	0 %	25 %	526230763
1079	NC_021872	CTG	2	6	55143	55148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230763
1080	NC_021872	CAA	2	6	55196	55201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230763
1081	NC_021872	TGC	2	6	55225	55230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230763
1082	NC_021872	TGC	2	6	55279	55284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230763
1083	NC_021872	AGAACA	2	12	55288	55299	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	526230763
1084	NC_021872	GCACAA	2	12	55313	55324	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	526230763
1085	NC_021872	CTA	2	6	55329	55334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230763
1086	NC_021872	GCT	2	6	55361	55366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230763
1087	NC_021872	CAA	3	9	55379	55387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230763
1088	NC_021872	CAA	3	9	55397	55405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230763
1089	NC_021872	GCA	2	6	55424	55429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230763
1090	NC_021872	GCT	2	6	55463	55468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230763
1091	NC_021872	CAA	2	6	55475	55480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230763
1092	NC_021872	CAA	2	6	55508	55513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230763
1093	NC_021872	CAAGC	2	10	55542	55551	40 %	0 %	20 %	40 %	526230763
1094	NC_021872	GCT	3	9	55556	55564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230763
1095	NC_021872	AAT	2	6	55565	55570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230763
1096	NC_021872	TGCTAA	2	12	55684	55695	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	526230763
1097	NC_021872	ACT	2	6	55715	55720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230763
1098	NC_021872	ATG	2	6	55722	55727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230763
1099	NC_021872	TTA	2	6	55873	55878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230763
1100	NC_021872	GCT	2	6	55916	55921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230763
1101	NC_021872	ATG	2	6	55983	55988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230763
1102	NC_021872	CTG	2	6	56016	56021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230763
1103	NC_021872	TAA	2	6	56131	56136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230763
1104	NC_021872	ATG	2	6	56139	56144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230763
1105	NC_021872	AGTA	2	8	56173	56180	50 %	25 %	25 %	0 %	526230763
1106	NC_021872	GTT	2	6	56210	56215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230763
1107	NC_021872	ATA	3	9	56241	56249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230763
1108	NC_021872	TAG	2	6	56293	56298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230763
1109	NC_021872	ATT	2	6	56300	56305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230763
1110	NC_021872	AAT	2	6	56306	56311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230763
1111	NC_021872	ACT	2	6	56390	56395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230763
1112	NC_021872	CTT	2	6	56417	56422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230763
1113	NC_021872	AC	3	6	56486	56491	50 %	0 %	0 %	50 %	526230763
1114	NC_021872	CTT	2	6	56513	56518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230763
1115	NC_021872	TGA	2	6	56563	56568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230763
1116	NC_021872	CAT	2	6	56613	56618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230763
1117	NC_021872	ATG	2	6	56658	56663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230763
1118	NC_021872	TAACT	2	10	56665	56674	40 %	40 %	0 %	20 %	526230763
1119	NC_021872	AAG	2	6	56676	56681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230763
1120	NC_021872	TAA	2	6	56758	56763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230763
1121	NC_021872	AAC	2	6	56826	56831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230763
1122	NC_021872	GCACAA	2	12	56852	56863	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	526230763
1123	NC_021872	AGCT	2	8	56896	56903	25 %	25 %	25 %	25 %	526230763
1124	NC_021872	AAC	2	6	56916	56921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230763
1125	NC_021872	ATG	2	6	56928	56933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230763
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1128	NC_021872	GTT	2	6	57017	57022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230763
1129	NC_021872	GCT	2	6	57089	57094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230763
1130	NC_021872	TGC	2	6	57103	57108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230763
1131	NC_021872	GCT	2	6	57284	57289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230763
1132	NC_021872	AGC	2	6	57325	57330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230763
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1141	NC_021872	TGC	2	6	57643	57648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230763
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1239	NC_021872	A	7	7	61943	61949	100 %	0 %	0 %	0 %	526230766
1240	NC_021872	TTG	2	6	61981	61986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230766
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1244	NC_021872	CAA	2	6	62208	62213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230766
1245	NC_021872	CGGAA	2	10	62220	62229	40 %	0 %	40 %	20 %	526230766
1246	NC_021872	CAGG	2	8	62265	62272	25 %	0 %	50 %	25 %	526230766
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1248	NC_021872	AGT	2	6	62363	62368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230766
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1252	NC_021872	TGA	2	6	62591	62596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230766
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1499	NC_021872	ACA	2	6	73931	73936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230771
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