MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021872	CTA	2	6	300831	300836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230919
5502	NC_021872	A	6	6	300849	300854	100 %	0 %	0 %	0 %	526230919
5503	NC_021872	CGCAAT	2	12	300952	300963	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	526230919
5504	NC_021872	TGG	2	6	300989	300994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230919
5505	NC_021872	TGG	2	6	300997	301002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230919
5506	NC_021872	AGT	2	6	301010	301015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230919
5507	NC_021872	AGC	2	6	301087	301092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230919
5508	NC_021872	GAT	2	6	301177	301182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230919
5509	NC_021872	CTG	2	6	301206	301211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230919
5510	NC_021872	TA	3	6	301248	301253	50 %	50 %	0 %	0 %	526230919
5511	NC_021872	C	6	6	301312	301317	0 %	0 %	0 %	100 %	526230919
5512	NC_021872	TAA	2	6	301352	301357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230919
5513	NC_021872	ATGAAA	2	12	301508	301519	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	526230920
5514	NC_021872	GT	3	6	301590	301595	0 %	50 %	50 %	0 %	526230920
5515	NC_021872	CCA	2	6	301660	301665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230920
5516	NC_021872	TTA	2	6	301748	301753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230920
5517	NC_021872	TAC	2	6	301796	301801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230920
5518	NC_021872	GAC	3	9	301852	301860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230920
5519	NC_021872	TAA	2	6	301924	301929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230920
5520	NC_021872	CTT	2	6	301952	301957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230920
5521	NC_021872	CTT	2	6	302023	302028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230920
5522	NC_021872	TTA	2	6	302058	302063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230920
5523	NC_021872	TTC	2	6	302090	302095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230920
5524	NC_021872	ATT	2	6	302185	302190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230920
5525	NC_021872	AAT	2	6	302249	302254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230920
5526	NC_021872	CAA	2	6	302262	302267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230920
5527	NC_021872	GAA	2	6	302321	302326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230920
5528	NC_021872	TGGT	2	8	302340	302347	0 %	50 %	50 %	0 %	526230920
5529	NC_021872	TAA	2	6	302359	302364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230920
5530	NC_021872	AAGC	2	8	302420	302427	50 %	0 %	25 %	25 %	526230920
5531	NC_021872	TGC	2	6	302614	302619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230920
5532	NC_021872	AGA	2	6	302644	302649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230920
5533	NC_021872	ACC	2	6	302655	302660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230920
5534	NC_021872	AAG	2	6	302724	302729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230920
5535	NC_021872	CAT	2	6	302750	302755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230920
5536	NC_021872	TGC	2	6	302758	302763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230920
5537	NC_021872	CAA	2	6	302774	302779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230920
5538	NC_021872	GAA	2	6	302855	302860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230920
5539	NC_021872	GAA	2	6	303022	303027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230921
5540	NC_021872	GCT	2	6	303115	303120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230921
5541	NC_021872	ATT	2	6	303133	303138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230921
5542	NC_021872	AAG	2	6	303215	303220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230921
5543	NC_021872	AGT	2	6	303261	303266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230921
5544	NC_021872	TGG	2	6	303270	303275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230921
5545	NC_021872	ACA	2	6	303309	303314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230921
5546	NC_021872	TTG	2	6	303326	303331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230921
5547	NC_021872	AGA	2	6	303441	303446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230921
5548	NC_021872	CAT	2	6	303456	303461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230921
5549	NC_021872	GAT	2	6	303475	303480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230921
5550	NC_021872	CCA	2	6	303511	303516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230921
5551	NC_021872	ACT	2	6	303586	303591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230921
5552	NC_021872	CAT	2	6	303642	303647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230921
5553	NC_021872	TTGA	2	8	303655	303662	25 %	50 %	25 %	0 %	526230921
5554	NC_021872	GGGC	2	8	303949	303956	0 %	0 %	75 %	25 %	526230921
5555	NC_021872	CCA	2	6	304057	304062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230921
5556	NC_021872	GAA	2	6	304150	304155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230921
5557	NC_021872	AGC	2	6	304200	304205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230921
5558	NC_021872	GAAG	2	8	304224	304231	50 %	0 %	50 %	0 %	526230921
5559	NC_021872	AAT	2	6	304315	304320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230921
5560	NC_021872	TGG	2	6	304326	304331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230921
5561	NC_021872	CCG	2	6	304356	304361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230921
5562	NC_021872	TGG	2	6	304371	304376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230921
5563	NC_021872	GCAT	2	8	304416	304423	25 %	25 %	25 %	25 %	526230921
5564	NC_021872	AGA	2	6	304443	304448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230921
5565	NC_021872	A	6	6	304764	304769	100 %	0 %	0 %	0 %	526232202
5566	NC_021872	TAA	2	6	304770	304775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232202
5567	NC_021872	A	6	6	304774	304779	100 %	0 %	0 %	0 %	526232202
5568	NC_021872	CTTG	2	8	304857	304864	0 %	50 %	25 %	25 %	526232202
5569	NC_021872	ATA	2	6	304958	304963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232202
5570	NC_021872	CTA	2	6	304970	304975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232202
5571	NC_021872	AGT	2	6	304993	304998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232202
5572	NC_021872	AATC	2	8	305002	305009	50 %	25 %	0 %	25 %	526232202
5573	NC_021872	CAG	2	6	305072	305077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232202
5574	NC_021872	AATC	2	8	305143	305150	50 %	25 %	0 %	25 %	526232202
5575	NC_021872	TGC	2	6	305307	305312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232202
5576	NC_021872	AGA	2	6	305430	305435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232202
5577	NC_021872	TTA	2	6	305471	305476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232202
5578	NC_021872	AGT	2	6	305545	305550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232202
5579	NC_021872	TAA	2	6	305574	305579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232202
5580	NC_021872	TTGGT	2	10	305703	305712	0 %	60 %	40 %	0 %	526232202
5581	NC_021872	ACT	2	6	305779	305784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232202
5582	NC_021872	AAT	2	6	305809	305814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232202
5583	NC_021872	GAA	2	6	305860	305865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232202
5584	NC_021872	CAA	2	6	305884	305889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232202
5585	NC_021872	TAC	2	6	305901	305906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232202
5586	NC_021872	TGA	2	6	305928	305933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232202
5587	NC_021872	CTA	2	6	305993	305998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232202
5588	NC_021872	CTG	2	6	306101	306106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232202
5589	NC_021872	CTTA	2	8	306173	306180	25 %	50 %	0 %	25 %	526232202
5590	NC_021872	CTAT	2	8	306188	306195	25 %	50 %	0 %	25 %	526232202
5591	NC_021872	TAAT	2	8	306212	306219	50 %	50 %	0 %	0 %	526232202
5592	NC_021872	ATTA	2	8	306552	306559	50 %	50 %	0 %	0 %	526232202
5593	NC_021872	CTT	2	6	306668	306673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232202
5594	NC_021872	AAT	2	6	306799	306804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232202
5595	NC_021872	AGTA	2	8	306873	306880	50 %	25 %	25 %	0 %	526232202
5596	NC_021872	ACCAAT	2	12	306916	306927	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	526232202
5597	NC_021872	TGG	2	6	306978	306983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232202
5598	NC_021872	AGT	2	6	307015	307020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232202
5599	NC_021872	TGA	2	6	307026	307031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232202
5600	NC_021872	TTG	2	6	307064	307069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232202
5601	NC_021872	AGC	2	6	307092	307097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232202
5602	NC_021872	TAG	2	6	307133	307138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232202
5603	NC_021872	TGC	2	6	307140	307145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232202
5604	NC_021872	CAG	2	6	307148	307153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232202
5605	NC_021872	CTA	2	6	307170	307175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232202
5606	NC_021872	AAT	2	6	307249	307254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232202
5607	NC_021872	TGA	2	6	307272	307277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232202
5608	NC_021872	CAA	2	6	307329	307334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232202
5609	NC_021872	ACC	2	6	307501	307506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232202
5610	NC_021872	TAA	2	6	307509	307514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232202
5611	NC_021872	GAT	2	6	307606	307611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232202
5612	NC_021872	TAC	2	6	307618	307623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232202
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5614	NC_021872	GCT	2	6	307645	307650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232202
5615	NC_021872	CAG	2	6	307793	307798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232202
5616	NC_021872	AAAG	2	8	307819	307826	75 %	0 %	25 %	0 %	526232202
5617	NC_021872	TAA	2	6	307869	307874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232202
5618	NC_021872	ATA	2	6	307964	307969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232202
5619	NC_021872	GCT	2	6	308020	308025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232202
5620	NC_021872	TAC	2	6	308062	308067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232202
5621	NC_021872	GTA	2	6	308072	308077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232202
5622	NC_021872	ATA	2	6	308096	308101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232202
5623	NC_021872	ATTA	2	8	308272	308279	50 %	50 %	0 %	0 %	526232202
5624	NC_021872	ATA	2	6	308408	308413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232202
5625	NC_021872	CAAA	2	8	308444	308451	75 %	0 %	0 %	25 %	526232202
5626	NC_021872	TAC	2	6	308506	308511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232202
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5629	NC_021872	GCA	2	6	308629	308634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232202
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5632	NC_021872	AAGCA	2	10	308738	308747	60 %	0 %	20 %	20 %	526232202
5633	NC_021872	TAA	2	6	308757	308762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232202
5634	NC_021872	CTG	2	6	308771	308776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232202
5635	NC_021872	GCA	2	6	308827	308832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232202
5636	NC_021872	GCT	2	6	308896	308901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232202
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5644	NC_021872	A	6	6	309271	309276	100 %	0 %	0 %	0 %	526232202
5645	NC_021872	AAG	2	6	309377	309382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232202
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5649	NC_021872	AAG	2	6	309497	309502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232202
5650	NC_021872	AAC	2	6	309555	309560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232202
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5655	NC_021872	AAAG	2	8	309687	309694	75 %	0 %	25 %	0 %	526232202
5656	NC_021872	CTG	2	6	309713	309718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232202
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5720	NC_021872	AAGA	2	8	311659	311666	75 %	0 %	25 %	0 %	526232202
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5724	NC_021872	CAAA	2	8	311812	311819	75 %	0 %	0 %	25 %	526232202
5725	NC_021872	TGA	2	6	311820	311825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232202
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5728	NC_021872	TGA	2	6	311886	311891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232202
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5733	NC_021872	TGC	2	6	312045	312050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232202
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5736	NC_021872	GCA	2	6	312139	312144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232202
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5738	NC_021872	TGA	2	6	312213	312218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232202
5739	NC_021872	AATC	2	8	312231	312238	50 %	25 %	0 %	25 %	526232202
5740	NC_021872	AAGC	2	8	312239	312246	50 %	0 %	25 %	25 %	526232202
5741	NC_021872	AGC	2	6	312249	312254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232202
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5743	NC_021872	ATG	2	6	312293	312298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232202
5744	NC_021872	TGAC	2	8	312302	312309	25 %	25 %	25 %	25 %	526232202
5745	NC_021872	CTG	2	6	312428	312433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232202
5746	NC_021872	ATG	2	6	312515	312520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232202
5747	NC_021872	ACT	2	6	312526	312531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232202
5748	NC_021872	ATG	2	6	312536	312541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232202
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5750	NC_021872	TGC	2	6	312675	312680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232202
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5752	NC_021872	TGA	2	6	312735	312740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232202
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5758	NC_021872	TGC	2	6	312912	312917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232202
5759	NC_021872	ACT	2	6	312925	312930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232202
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5844	NC_021872	ATA	2	6	315998	316003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232202
5845	NC_021872	CTA	2	6	316040	316045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232202
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5849	NC_021872	AAGCAA	2	12	316180	316191	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	526232202
5850	NC_021872	GAA	3	9	316230	316238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232202
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5853	NC_021872	AAG	2	6	316336	316341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232202
5854	NC_021872	GAAA	2	8	316371	316378	75 %	0 %	25 %	0 %	526232202
5855	NC_021872	TGC	2	6	316395	316400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232202
5856	NC_021872	TTAA	2	8	316432	316439	50 %	50 %	0 %	0 %	526232202
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5858	NC_021872	CAA	2	6	316487	316492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232202
5859	NC_021872	CAA	2	6	316570	316575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232202
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5978	NC_021872	T	6	6	323031	323036	0 %	100 %	0 %	0 %	526230925
5979	NC_021872	TGA	2	6	323045	323050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230925
5980	NC_021872	AAT	2	6	323104	323109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230925
5981	NC_021872	GATT	2	8	323134	323141	25 %	50 %	25 %	0 %	526230925
5982	NC_021872	GCT	2	6	323201	323206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230925
5983	NC_021872	TAA	2	6	323214	323219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230925
5984	NC_021872	TGA	2	6	323231	323236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230925
5985	NC_021872	CTG	2	6	323307	323312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230925
5986	NC_021872	GTT	2	6	323333	323338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230925
5987	NC_021872	TCA	2	6	323348	323353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230925
5988	NC_021872	TAA	2	6	323400	323405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230925
5989	NC_021872	AT	3	6	323417	323422	50 %	50 %	0 %	0 %	526230925
5990	NC_021872	ATA	2	6	323479	323484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230926
5991	NC_021872	TAA	2	6	323500	323505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230926
5992	NC_021872	AAG	2	6	323506	323511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230926
5993	NC_021872	AAT	2	6	323525	323530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230926
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5998	NC_021872	CAT	2	6	324298	324303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230928
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6000	NC_021872	A	6	6	324348	324353	100 %	0 %	0 %	0 %	526230928

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