MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021872	TTA	2	6	273962	273967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232198
5002	NC_021872	CCT	2	6	273979	273984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526232198
5003	NC_021872	AATGA	2	10	274016	274025	60 %	20 %	20 %	0 %	526232198
5004	NC_021872	CAA	2	6	274058	274063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232198
5005	NC_021872	TTA	2	6	274083	274088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232198
5006	NC_021872	ATT	2	6	274261	274266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230897
5007	NC_021872	ATT	2	6	274273	274278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230897
5008	NC_021872	GGT	2	6	274345	274350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230897
5009	NC_021872	GAT	2	6	274389	274394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230897
5010	NC_021872	TTG	2	6	274421	274426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230897
5011	NC_021872	TTA	2	6	274463	274468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230897
5012	NC_021872	GTT	2	6	274482	274487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230897
5013	NC_021872	TTCTT	2	10	274502	274511	0 %	80 %	0 %	20 %	526230897
5014	NC_021872	CAGT	2	8	274521	274528	25 %	25 %	25 %	25 %	526230897
5015	NC_021872	AGCT	2	8	274530	274537	25 %	25 %	25 %	25 %	526230897
5016	NC_021872	CAA	2	6	274541	274546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230897
5017	NC_021872	TTTG	2	8	274551	274558	0 %	75 %	25 %	0 %	526230897
5018	NC_021872	TCG	2	6	274644	274649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230897
5019	NC_021872	TGT	2	6	274716	274721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230897
5020	NC_021872	TAC	2	6	274730	274735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230897
5021	NC_021872	TGC	2	6	274755	274760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230897
5022	NC_021872	TTG	2	6	274766	274771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230897
5023	NC_021872	GCT	2	6	274807	274812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230897
5024	NC_021872	GAT	2	6	274845	274850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230897
5025	NC_021872	ATTTT	2	10	274861	274870	20 %	80 %	0 %	0 %	526230897
5026	NC_021872	TTA	2	6	274952	274957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230897
5027	NC_021872	TGG	2	6	275296	275301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230898
5028	NC_021872	CTTG	2	8	275315	275322	0 %	50 %	25 %	25 %	526230898
5029	NC_021872	TCA	2	6	275382	275387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230898
5030	NC_021872	GTG	2	6	275467	275472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230898
5031	NC_021872	GGC	2	6	275513	275518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230898
5032	NC_021872	TAA	2	6	275522	275527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230898
5033	NC_021872	ATG	2	6	275545	275550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230898
5034	NC_021872	TGATGT	2	12	275657	275668	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	526230898
5035	NC_021872	TAT	2	6	275669	275674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230898
5036	NC_021872	CA	3	6	275758	275763	50 %	0 %	0 %	50 %	526230898
5037	NC_021872	AGA	2	6	275821	275826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230898
5038	NC_021872	CGT	2	6	275838	275843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230898
5039	NC_021872	GTT	2	6	275871	275876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230898
5040	NC_021872	GAC	2	6	275877	275882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230898
5041	NC_021872	GCG	2	6	275893	275898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230898
5042	NC_021872	TTGG	2	8	275946	275953	0 %	50 %	50 %	0 %	526230898
5043	NC_021872	GAA	2	6	276050	276055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230898
5044	NC_021872	GCA	2	6	276060	276065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230898
5045	NC_021872	ATT	2	6	276138	276143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230899
5046	NC_021872	GCT	2	6	276147	276152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230899
5047	NC_021872	ATT	2	6	276264	276269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230899
5048	NC_021872	TTG	2	6	276274	276279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230899
5049	NC_021872	AAC	2	6	276301	276306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230899
5050	NC_021872	AAC	3	9	276340	276348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230899
5051	NC_021872	CTT	2	6	276384	276389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230899
5052	NC_021872	TAT	2	6	276410	276415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230899
5053	NC_021872	ATT	2	6	276434	276439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230899
5054	NC_021872	AAC	2	6	276478	276483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230899
5055	NC_021872	CCA	2	6	276496	276501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230899
5056	NC_021872	ATG	2	6	276553	276558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230899
5057	NC_021872	TCG	2	6	276577	276582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230899
5058	NC_021872	TAT	2	6	276708	276713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230899
5059	NC_021872	TGA	2	6	276782	276787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230899
5060	NC_021872	TGAT	2	8	276883	276890	25 %	50 %	25 %	0 %	526230899
5061	NC_021872	AAC	2	6	276896	276901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230899
5062	NC_021872	ATT	2	6	277047	277052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230899
5063	NC_021872	AAG	2	6	277066	277071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230899
5064	NC_021872	AAG	2	6	277170	277175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230899
5065	NC_021872	GTA	2	6	277330	277335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230899
5066	NC_021872	TGC	2	6	277382	277387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230899
5067	NC_021872	ATATG	2	10	277418	277427	40 %	40 %	20 %	0 %	526230899
5068	NC_021872	TAA	2	6	277451	277456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230899
5069	NC_021872	AAG	2	6	277470	277475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230899
5070	NC_021872	TTA	2	6	277787	277792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230900
5071	NC_021872	TGG	2	6	277797	277802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230900
5072	NC_021872	TCG	2	6	277810	277815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230900
5073	NC_021872	GTG	2	6	277838	277843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230900
5074	NC_021872	GTTG	2	8	277909	277916	0 %	50 %	50 %	0 %	526230900
5075	NC_021872	ATT	2	6	277949	277954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230900
5076	NC_021872	CTC	2	6	278022	278027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526230900
5077	NC_021872	GTT	2	6	278072	278077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230900
5078	NC_021872	TGG	2	6	278092	278097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230900
5079	NC_021872	ATT	2	6	278147	278152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230900
5080	NC_021872	ATT	2	6	278195	278200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230900
5081	NC_021872	AAG	2	6	278216	278221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230900
5082	NC_021872	TAT	2	6	278224	278229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230900
5083	NC_021872	TGA	2	6	278233	278238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230900
5084	NC_021872	TGAT	2	8	278241	278248	25 %	50 %	25 %	0 %	526230900
5085	NC_021872	AGA	2	6	278299	278304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230900
5086	NC_021872	CAT	2	6	278313	278318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230900
5087	NC_021872	TAT	2	6	278331	278336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230900
5088	NC_021872	GTT	2	6	278381	278386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230900
5089	NC_021872	AAG	2	6	278543	278548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230900
5090	NC_021872	ACA	2	6	278725	278730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230901
5091	NC_021872	A	6	6	278743	278748	100 %	0 %	0 %	0 %	526230901
5092	NC_021872	CTA	2	6	278774	278779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230901
5093	NC_021872	AGT	2	6	278818	278823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230901
5094	NC_021872	TTC	2	6	278832	278837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230901
5095	NC_021872	TTC	2	6	278856	278861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230901
5096	NC_021872	TAA	2	6	278895	278900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230901
5097	NC_021872	TGA	2	6	278985	278990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230901
5098	NC_021872	CAT	2	6	279158	279163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230901
5099	NC_021872	AGCA	2	8	279172	279179	50 %	0 %	25 %	25 %	526230901
5100	NC_021872	GCAAC	2	10	279211	279220	40 %	0 %	20 %	40 %	526230901
5101	NC_021872	ATC	2	6	279222	279227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230901
5102	NC_021872	CTG	2	6	279230	279235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230901
5103	NC_021872	GTA	2	6	279271	279276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230901
5104	NC_021872	CAA	2	6	279277	279282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230901
5105	NC_021872	CAATA	2	10	279418	279427	60 %	20 %	0 %	20 %	526230901
5106	NC_021872	AT	3	6	279459	279464	50 %	50 %	0 %	0 %	526230901
5107	NC_021872	CAT	2	6	279567	279572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230902
5108	NC_021872	ATT	2	6	279574	279579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230902
5109	NC_021872	GTT	2	6	279587	279592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230902
5110	NC_021872	ATC	2	6	279667	279672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230902
5111	NC_021872	T	6	6	279706	279711	0 %	100 %	0 %	0 %	526230902
5112	NC_021872	TTC	2	6	279721	279726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230902
5113	NC_021872	CTTG	2	8	279755	279762	0 %	50 %	25 %	25 %	526230902
5114	NC_021872	TAAA	2	8	279778	279785	75 %	25 %	0 %	0 %	526230902
5115	NC_021872	CAT	2	6	279874	279879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230902
5116	NC_021872	TTC	2	6	279919	279924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230902
5117	NC_021872	CTT	2	6	280041	280046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230902
5118	NC_021872	TAA	2	6	280146	280151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230902
5119	NC_021872	GC	3	6	280248	280253	0 %	0 %	50 %	50 %	526230902
5120	NC_021872	T	7	7	280258	280264	0 %	100 %	0 %	0 %	526230902
5121	NC_021872	ATCGAT	2	12	280318	280329	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	526230902
5122	NC_021872	TAATT	2	10	280336	280345	40 %	60 %	0 %	0 %	526230902
5123	NC_021872	ATT	2	6	280349	280354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230902
5124	NC_021872	ATA	2	6	280372	280377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230903
5125	NC_021872	TTC	2	6	280404	280409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230903
5126	NC_021872	GAT	2	6	280595	280600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230903
5127	NC_021872	GTA	2	6	280641	280646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230903
5128	NC_021872	CAG	2	6	280661	280666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230903
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5130	NC_021872	ATC	2	6	280776	280781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230903
5131	NC_021872	AATAA	2	10	280800	280809	80 %	20 %	0 %	0 %	526230903
5132	NC_021872	A	6	6	280866	280871	100 %	0 %	0 %	0 %	526230903
5133	NC_021872	AT	3	6	280927	280932	50 %	50 %	0 %	0 %	526230903
5134	NC_021872	GGT	2	6	280949	280954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230903
5135	NC_021872	TCT	2	6	281032	281037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230903
5136	NC_021872	GCAT	2	8	281041	281048	25 %	25 %	25 %	25 %	526230903
5137	NC_021872	GAA	2	6	281096	281101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230903
5138	NC_021872	GATCAA	2	12	281105	281116	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	526230903
5139	NC_021872	AGT	2	6	281159	281164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230903
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5141	NC_021872	TGA	2	6	281248	281253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230903
5142	NC_021872	TTA	2	6	281284	281289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230903
5143	NC_021872	TGC	2	6	281297	281302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230903
5144	NC_021872	GGA	2	6	281393	281398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230903
5145	NC_021872	TCGT	2	8	281421	281428	0 %	50 %	25 %	25 %	526230903
5146	NC_021872	ATC	2	6	281430	281435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230903
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5152	NC_021872	TCT	2	6	281723	281728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230904
5153	NC_021872	TTA	2	6	281810	281815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230904
5154	NC_021872	TTG	2	6	281956	281961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230904
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5223	NC_021872	A	6	6	285812	285817	100 %	0 %	0 %	0 %	526230908
5224	NC_021872	TGA	2	6	285914	285919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230908
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5233	NC_021872	TGA	2	6	286382	286387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230908
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5241	NC_021872	GCA	2	6	287070	287075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230908
5242	NC_021872	CAAT	2	8	287088	287095	50 %	25 %	0 %	25 %	526230908
5243	NC_021872	CACCGT	2	12	287109	287120	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	526230908
5244	NC_021872	AAC	2	6	287130	287135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230908
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5260	NC_021872	CAAG	2	8	287852	287859	50 %	0 %	25 %	25 %	526230909
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5297	NC_021872	TTGG	2	8	290096	290103	0 %	50 %	50 %	0 %	526230911
5298	NC_021872	GCTC	2	8	290174	290181	0 %	25 %	25 %	50 %	526230911
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5315	NC_021872	TAC	2	6	291163	291168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230912
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5323	NC_021872	A	6	6	291782	291787	100 %	0 %	0 %	0 %	526230913
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5351	NC_021872	GAA	2	6	293527	293532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232200
5352	NC_021872	CAG	2	6	293540	293545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232200
5353	NC_021872	GTT	2	6	293627	293632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232200
5354	NC_021872	ACATGG	2	12	293633	293644	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	526232200
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5356	NC_021872	AGCA	2	8	293726	293733	50 %	0 %	25 %	25 %	526232200
5357	NC_021872	A	7	7	293767	293773	100 %	0 %	0 %	0 %	526232200
5358	NC_021872	TGA	2	6	293850	293855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232200
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5360	NC_021872	TGA	2	6	293885	293890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232200
5361	NC_021872	A	6	6	293917	293922	100 %	0 %	0 %	0 %	526232200
5362	NC_021872	GCA	3	9	293923	293931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232200
5363	NC_021872	ATC	2	6	293932	293937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232200
5364	NC_021872	TGG	2	6	293946	293951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232200
5365	NC_021872	TGC	2	6	294041	294046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232200
5366	NC_021872	ATG	2	6	294184	294189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232200
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5390	NC_021872	GCG	2	6	295198	295203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526232201
5391	NC_021872	GAA	2	6	295255	295260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232201
5392	NC_021872	ATT	2	6	295297	295302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232201
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5474	NC_021872	GTGC	2	8	299575	299582	0 %	25 %	50 %	25 %	526230917
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5482	NC_021872	AC	3	6	299970	299975	50 %	0 %	0 %	50 %	526230918
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5484	NC_021872	CGGA	2	8	300105	300112	25 %	0 %	50 %	25 %	526230918
5485	NC_021872	A	7	7	300144	300150	100 %	0 %	0 %	0 %	526230918
5486	NC_021872	GAA	2	6	300252	300257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230918
5487	NC_021872	TGC	2	6	300314	300319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230918
5488	NC_021872	TCA	2	6	300368	300373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230918
5489	NC_021872	CAA	2	6	300378	300383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230918
5490	NC_021872	TTAC	2	8	300389	300396	25 %	50 %	0 %	25 %	526230918
5491	NC_021872	AGA	2	6	300404	300409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230918
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