MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926

Total Repeats: 38265

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021840	CTA	2	6	2201	2206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934213
2	NC_021840	ATA	2	6	2354	2359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934213
3	NC_021840	ATT	2	6	2401	2406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934213
4	NC_021840	TTA	2	6	2459	2464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934213
5	NC_021840	GAT	2	6	2556	2561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934213
6	NC_021840	ATT	2	6	2611	2616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934213
7	NC_021840	GGT	2	6	2668	2673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934213
8	NC_021840	CTG	2	6	2910	2915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934214
9	NC_021840	ATT	3	9	3083	3091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934214
10	NC_021840	GCG	2	6	3107	3112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934214
11	NC_021840	GAC	2	6	3139	3144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934214
12	NC_021840	GTG	2	6	3261	3266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934214
13	NC_021840	GCG	2	6	3287	3292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934214
14	NC_021840	AGA	2	6	3355	3360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934214
15	NC_021840	AGT	2	6	3374	3379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934214
16	NC_021840	TAT	2	6	3425	3430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934215
17	NC_021840	TGG	2	6	3431	3436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934215
18	NC_021840	GCG	2	6	3465	3470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934215
19	NC_021840	TAT	2	6	3488	3493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934215
20	NC_021840	GCT	2	6	3522	3527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934215
21	NC_021840	ATT	2	6	3546	3551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934215
22	NC_021840	ATG	2	6	3559	3564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934215
23	NC_021840	ATG	2	6	3634	3639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934215
24	NC_021840	CTG	2	6	3817	3822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934215
25	NC_021840	ACG	2	6	3847	3852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934215
26	NC_021840	ATG	2	6	3874	3879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934215
27	NC_021840	CAG	2	6	3895	3900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934215
28	NC_021840	TTG	2	6	3906	3911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934215
29	NC_021840	ATA	2	6	4033	4038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934215
30	NC_021840	GAA	2	6	4095	4100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934215
31	NC_021840	GCA	2	6	4259	4264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934215
32	NC_021840	TTG	2	6	4276	4281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934215
33	NC_021840	ATT	2	6	4396	4401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934215
34	NC_021840	AGA	2	6	4487	4492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934215
35	NC_021840	AGA	2	6	4655	4660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934216
36	NC_021840	ATG	2	6	4732	4737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934216
37	NC_021840	ATT	2	6	4896	4901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934216
38	NC_021840	CTA	2	6	4969	4974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934216
39	NC_021840	AAC	2	6	5138	5143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934216
40	NC_021840	GAA	2	6	5283	5288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934216
41	NC_021840	ATT	2	6	5460	5465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934216
42	NC_021840	GGC	2	6	5636	5641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934216
43	NC_021840	ATG	2	6	5644	5649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934216
44	NC_021840	TAG	2	6	5704	5709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934216
45	NC_021840	ATT	2	6	5724	5729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934216
46	NC_021840	GAA	2	6	5745	5750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934216
47	NC_021840	GAA	2	6	5783	5788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934216
48	NC_021840	AGA	2	6	5953	5958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934217
49	NC_021840	GAT	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934217
50	NC_021840	TAA	2	6	6046	6051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934217
51	NC_021840	AAG	2	6	6144	6149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934217
52	NC_021840	ATT	2	6	6155	6160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934217
53	NC_021840	GTT	2	6	6173	6178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934217
54	NC_021840	AGA	2	6	6220	6225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934217
55	NC_021840	TAG	2	6	6249	6254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934217
56	NC_021840	GAT	2	6	6269	6274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934217
57	NC_021840	ATG	2	6	6297	6302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934217
58	NC_021840	GCT	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934217
59	NC_021840	TAA	2	6	6373	6378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934217
60	NC_021840	ATT	2	6	6391	6396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934217
61	NC_021840	TCG	2	6	6544	6549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934217
62	NC_021840	AGG	2	6	6615	6620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525934217
63	NC_021840	AGA	2	6	6729	6734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934218
64	NC_021840	AGG	2	6	6863	6868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525934218
65	NC_021840	GAG	2	6	6955	6960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525934219
66	NC_021840	TAT	2	6	7077	7082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934219
67	NC_021840	AAT	2	6	7192	7197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934219
68	NC_021840	AAG	2	6	7268	7273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934219
69	NC_021840	ATT	2	6	7313	7318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934219
70	NC_021840	ATA	2	6	7352	7357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934219
71	NC_021840	ATG	2	6	7450	7455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934219
72	NC_021840	AGA	2	6	7476	7481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934219
73	NC_021840	ATT	2	6	7483	7488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934219
74	NC_021840	AGG	2	6	7538	7543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525934219
75	NC_021840	ATC	2	6	7851	7856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934220
76	NC_021840	CGG	2	6	7897	7902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934220
77	NC_021840	TGG	2	6	8059	8064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934220
78	NC_021840	GAA	2	6	8252	8257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934220
79	NC_021840	AAC	3	9	8262	8270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934220
80	NC_021840	CTG	2	6	8274	8279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934220
81	NC_021840	TTG	2	6	8309	8314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934220
82	NC_021840	GAT	2	6	8450	8455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934220
83	NC_021840	GAA	2	6	8549	8554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934220
84	NC_021840	TGT	2	6	8590	8595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934220
85	NC_021840	GAT	2	6	8612	8617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934220
86	NC_021840	ATT	2	6	8630	8635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934220
87	NC_021840	CAT	2	6	8636	8641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934220
88	NC_021840	AGT	2	6	8647	8652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934220
89	NC_021840	AGA	2	6	8680	8685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934220
90	NC_021840	AAG	2	6	8739	8744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934220
91	NC_021840	TGT	2	6	8872	8877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934220
92	NC_021840	GCG	2	6	8891	8896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934220
93	NC_021840	GCG	2	6	9005	9010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934220
94	NC_021840	TAG	2	6	9237	9242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934220
95	NC_021840	CAA	2	6	9350	9355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934220
96	NC_021840	CAA	2	6	9410	9415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934220
97	NC_021840	AGC	2	6	9610	9615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934220
98	NC_021840	GTA	2	6	9659	9664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934220
99	NC_021840	GAT	2	6	9671	9676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934220
100	NC_021840	AAC	2	6	9718	9723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934220
101	NC_021840	GAA	2	6	9784	9789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934221
102	NC_021840	ATC	2	6	9812	9817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934221
103	NC_021840	TAT	2	6	9838	9843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934221
104	NC_021840	ACA	2	6	9858	9863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934221
105	NC_021840	AAG	2	6	9872	9877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934221
106	NC_021840	AGC	2	6	9984	9989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934221
107	NC_021840	TTC	2	6	10068	10073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934221
108	NC_021840	AGA	3	9	10131	10139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934221
109	NC_021840	GCG	2	6	10294	10299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934221
110	NC_021840	ATT	3	9	10429	10437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934221
111	NC_021840	ATG	2	6	10439	10444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934221
112	NC_021840	GGA	2	6	10662	10667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525934221
113	NC_021840	TCA	2	6	10694	10699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934221
114	NC_021840	GAC	2	6	10839	10844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934221
115	NC_021840	GCG	2	6	10882	10887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934221
116	NC_021840	CCA	2	6	10912	10917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525934221
117	NC_021840	ATT	2	6	10979	10984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934221
118	NC_021840	TGA	2	6	10989	10994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934221
119	NC_021840	ATT	2	6	11005	11010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934221
120	NC_021840	GAA	2	6	11038	11043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934221
121	NC_021840	TAG	2	6	11048	11053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934221
122	NC_021840	TGG	2	6	11328	11333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934222
123	NC_021840	AGT	2	6	11347	11352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934222
124	NC_021840	ATT	2	6	11502	11507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934222
125	NC_021840	GGC	2	6	11611	11616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934222
126	NC_021840	CTG	2	6	11621	11626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934222
127	NC_021840	AAG	2	6	11723	11728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934222
128	NC_021840	GAA	2	6	12051	12056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934222
129	NC_021840	ATG	2	6	12215	12220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934222
130	NC_021840	AGG	2	6	12234	12239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525934222
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133	NC_021840	ACT	2	6	12332	12337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934223
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252	NC_021840	TGA	2	6	20362	20367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934230
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254	NC_021840	GAA	2	6	20472	20477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934230
255	NC_021840	GAA	3	9	20514	20522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934230
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