MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926

Total Repeats: 58897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021840	TCG	2	6	160490	160495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934333
3002	NC_021840	TTA	3	9	160519	160527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934333
3003	NC_021840	TGC	2	6	160532	160537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934333
3004	NC_021840	AAG	2	6	160565	160570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934333
3005	NC_021840	A	7	7	160633	160639	100 %	0 %	0 %	0 %	525934333
3006	NC_021840	ATT	2	6	160783	160788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934334
3007	NC_021840	ATT	2	6	160806	160811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934334
3008	NC_021840	TCA	2	6	160857	160862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934334
3009	NC_021840	CCAA	2	8	160911	160918	50 %	0 %	0 %	50 %	525934334
3010	NC_021840	TTA	2	6	160975	160980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934334
3011	NC_021840	ATT	2	6	161037	161042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934334
3012	NC_021840	CGT	2	6	161165	161170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934334
3013	NC_021840	AT	3	6	161175	161180	50 %	50 %	0 %	0 %	525934334
3014	NC_021840	GCA	2	6	161238	161243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934334
3015	NC_021840	CAT	2	6	161261	161266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934334
3016	NC_021840	ATG	3	9	161289	161297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934334
3017	NC_021840	AATG	2	8	161310	161317	50 %	25 %	25 %	0 %	525934334
3018	NC_021840	TAC	2	6	161371	161376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934334
3019	NC_021840	ATG	2	6	161397	161402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934334
3020	NC_021840	CTA	2	6	161495	161500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934334
3021	NC_021840	CTT	2	6	161567	161572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934334
3022	NC_021840	GTA	2	6	161712	161717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934334
3023	NC_021840	TCG	2	6	161944	161949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934334
3024	NC_021840	TCA	2	6	161977	161982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934334
3025	NC_021840	CGGA	2	8	162076	162083	25 %	0 %	50 %	25 %	525934334
3026	NC_021840	TAT	2	6	162116	162121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934334
3027	NC_021840	TCA	2	6	162136	162141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934334
3028	NC_021840	CAAC	2	8	162226	162233	50 %	0 %	0 %	50 %	525934334
3029	NC_021840	CAG	2	6	162239	162244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934334
3030	NC_021840	A	7	7	162263	162269	100 %	0 %	0 %	0 %	525934334
3031	NC_021840	AATT	2	8	162352	162359	50 %	50 %	0 %	0 %	525934334
3032	NC_021840	AGC	2	6	162373	162378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934334
3033	NC_021840	ACC	2	6	162526	162531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525934334
3034	NC_021840	GAA	3	9	162618	162626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934334
3035	NC_021840	A	6	6	162630	162635	100 %	0 %	0 %	0 %	525934334
3036	NC_021840	ATT	2	6	162727	162732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525936708
3037	NC_021840	AAGT	2	8	162768	162775	50 %	25 %	25 %	0 %	525936708
3038	NC_021840	TA	3	6	162887	162892	50 %	50 %	0 %	0 %	525936708
3039	NC_021840	TTC	2	6	162961	162966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525936708
3040	NC_021840	TTG	2	6	162984	162989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525936708
3041	NC_021840	GTTTT	2	10	163050	163059	0 %	80 %	20 %	0 %	525936708
3042	NC_021840	A	6	6	163104	163109	100 %	0 %	0 %	0 %	525936708
3043	NC_021840	AT	3	6	163149	163154	50 %	50 %	0 %	0 %	525936708
3044	NC_021840	GAG	2	6	163185	163190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525936708
3045	NC_021840	TA	3	6	163308	163313	50 %	50 %	0 %	0 %	525936708
3046	NC_021840	ATTTT	2	10	163415	163424	20 %	80 %	0 %	0 %	525936708
3047	NC_021840	GTT	2	6	163521	163526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525936708
3048	NC_021840	CAT	2	6	163587	163592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525936708
3049	NC_021840	GGA	2	6	163619	163624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525936708
3050	NC_021840	CTT	2	6	163626	163631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525936708
3051	NC_021840	T	7	7	163637	163643	0 %	100 %	0 %	0 %	525936708
3052	NC_021840	TGTT	2	8	163659	163666	0 %	75 %	25 %	0 %	525936708
3053	NC_021840	AGC	2	6	163669	163674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525936708
3054	NC_021840	T	6	6	163747	163752	0 %	100 %	0 %	0 %	525936708
3055	NC_021840	TTC	2	6	163952	163957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934335
3056	NC_021840	CATTAT	2	12	163987	163998	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525934335
3057	NC_021840	AAG	2	6	164026	164031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934335
3058	NC_021840	ACA	2	6	164040	164045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934335
3059	NC_021840	CTT	2	6	164098	164103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934335
3060	NC_021840	CAT	2	6	164131	164136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934335
3061	NC_021840	CTT	2	6	164155	164160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934335
3062	NC_021840	ATC	2	6	164180	164185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934335
3063	NC_021840	ATA	2	6	164282	164287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934335
3064	NC_021840	CCA	2	6	164298	164303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525934335
3065	NC_021840	AGGTA	2	10	164339	164348	40 %	20 %	40 %	0 %	525934335
3066	NC_021840	AAAT	2	8	164429	164436	75 %	25 %	0 %	0 %	525934335
3067	NC_021840	TCTTTT	2	12	164448	164459	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525934335
3068	NC_021840	CTAG	2	8	164484	164491	25 %	25 %	25 %	25 %	525934335
3069	NC_021840	CAT	2	6	164510	164515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934335
3070	NC_021840	TAA	2	6	164559	164564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934336
3071	NC_021840	TTC	2	6	164568	164573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934336
3072	NC_021840	CAT	2	6	164593	164598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934336
3073	NC_021840	TGCG	2	8	164735	164742	0 %	25 %	50 %	25 %	525934336
3074	NC_021840	ACG	2	6	164855	164860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934336
3075	NC_021840	GTT	2	6	164907	164912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934336
3076	NC_021840	T	6	6	164933	164938	0 %	100 %	0 %	0 %	525934336
3077	NC_021840	TTTC	2	8	164959	164966	0 %	75 %	0 %	25 %	525934336
3078	NC_021840	T	6	6	164975	164980	0 %	100 %	0 %	0 %	525934336
3079	NC_021840	GTT	2	6	164999	165004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934336
3080	NC_021840	AAG	2	6	165089	165094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934336
3081	NC_021840	TCT	2	6	165135	165140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934336
3082	NC_021840	CATA	2	8	165178	165185	50 %	25 %	0 %	25 %	525934336
3083	NC_021840	TCCA	2	8	165186	165193	25 %	25 %	0 %	50 %	525934336
3084	NC_021840	TTC	2	6	165209	165214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934336
3085	NC_021840	TCG	2	6	165219	165224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934336
3086	NC_021840	GT	3	6	165268	165273	0 %	50 %	50 %	0 %	525934336
3087	NC_021840	TGG	2	6	165395	165400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934336
3088	NC_021840	CAA	2	6	165427	165432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934336
3089	NC_021840	AAT	2	6	165502	165507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934336
3090	NC_021840	TCA	2	6	165552	165557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934336
3091	NC_021840	AAT	2	6	165558	165563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934336
3092	NC_021840	TCA	2	6	165624	165629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934336
3093	NC_021840	TTCA	2	8	165659	165666	25 %	50 %	0 %	25 %	525934336
3094	NC_021840	TCT	2	6	165753	165758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934336
3095	NC_021840	AGT	2	6	165809	165814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934336
3096	NC_021840	TTTACC	2	12	165848	165859	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525934336
3097	NC_021840	TTTA	2	8	166071	166078	25 %	75 %	0 %	0 %	525934337
3098	NC_021840	TTCT	2	8	166158	166165	0 %	75 %	0 %	25 %	525934337
3099	NC_021840	CAT	2	6	166215	166220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934337
3100	NC_021840	GAT	2	6	166350	166355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934337
3101	NC_021840	CTT	2	6	166410	166415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934337
3102	NC_021840	ATA	2	6	166436	166441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934337
3103	NC_021840	TCT	2	6	166445	166450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934337
3104	NC_021840	TCA	2	6	166553	166558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934337
3105	NC_021840	CTT	2	6	166644	166649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934337
3106	NC_021840	TAA	2	6	166686	166691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934337
3107	NC_021840	GTCA	2	8	166720	166727	25 %	25 %	25 %	25 %	525934337
3108	NC_021840	CAA	2	6	166743	166748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934337
3109	NC_021840	CTT	2	6	166806	166811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934337
3110	NC_021840	ATC	2	6	166834	166839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934337
3111	NC_021840	AGT	2	6	166844	166849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934337
3112	NC_021840	ATCAAT	2	12	166855	166866	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525934337
3113	NC_021840	AAT	2	6	167016	167021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934338
3114	NC_021840	ATT	3	9	167099	167107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934338
3115	NC_021840	ATGAAA	2	12	167213	167224	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525934338
3116	NC_021840	TAG	2	6	167237	167242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934338
3117	NC_021840	CTT	2	6	167290	167295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934338
3118	NC_021840	TCA	2	6	167337	167342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934338
3119	NC_021840	CGG	2	6	167367	167372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934338
3120	NC_021840	AGA	2	6	167451	167456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934338
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3122	NC_021840	TAAA	2	8	167517	167524	75 %	25 %	0 %	0 %	525934338
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3242	NC_021840	TCGT	2	8	173845	173852	0 %	50 %	25 %	25 %	525934344
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3487	NC_021840	A	6	6	186622	186627	100 %	0 %	0 %	0 %	525934356
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