MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926

Total Repeats: 58897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021840	AAG	2	6	48690	48695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934254
1002	NC_021840	CGG	2	6	48730	48735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934254
1003	NC_021840	GGC	2	6	48755	48760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934254
1004	NC_021840	CAAA	2	8	48817	48824	75 %	0 %	0 %	25 %	525934254
1005	NC_021840	CAA	2	6	48972	48977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934254
1006	NC_021840	GATT	2	8	48987	48994	25 %	50 %	25 %	0 %	525934254
1007	NC_021840	CAC	2	6	48996	49001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525934254
1008	NC_021840	CAT	2	6	49007	49012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934254
1009	NC_021840	A	6	6	49057	49062	100 %	0 %	0 %	0 %	525934254
1010	NC_021840	TGC	2	6	49123	49128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934254
1011	NC_021840	GCG	2	6	49190	49195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934254
1012	NC_021840	AC	3	6	49250	49255	50 %	0 %	0 %	50 %	525934254
1013	NC_021840	GAA	2	6	49358	49363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934254
1014	NC_021840	CAC	2	6	49380	49385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525934254
1015	NC_021840	ATG	2	6	49406	49411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934254
1016	NC_021840	A	6	6	49472	49477	100 %	0 %	0 %	0 %	525934254
1017	NC_021840	CTT	2	6	49507	49512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934254
1018	NC_021840	ATG	2	6	49541	49546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934254
1019	NC_021840	ACT	2	6	49601	49606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934254
1020	NC_021840	A	6	6	49613	49618	100 %	0 %	0 %	0 %	525934254
1021	NC_021840	AT	3	6	49639	49644	50 %	50 %	0 %	0 %	525934254
1022	NC_021840	TGA	2	6	49669	49674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934254
1023	NC_021840	ACA	2	6	49708	49713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934254
1024	NC_021840	CG	3	6	49826	49831	0 %	0 %	50 %	50 %	525934254
1025	NC_021840	A	6	6	49862	49867	100 %	0 %	0 %	0 %	525934254
1026	NC_021840	TTG	2	6	49911	49916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934254
1027	NC_021840	TGG	2	6	50011	50016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934254
1028	NC_021840	ATTG	2	8	50020	50027	25 %	50 %	25 %	0 %	525934254
1029	NC_021840	TGG	2	6	50104	50109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934254
1030	NC_021840	GTG	2	6	50160	50165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934254
1031	NC_021840	TGT	2	6	50173	50178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934254
1032	NC_021840	AT	3	6	50206	50211	50 %	50 %	0 %	0 %	525934254
1033	NC_021840	AGT	2	6	50224	50229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934254
1034	NC_021840	TGG	2	6	50272	50277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934254
1035	NC_021840	ACAA	2	8	50294	50301	75 %	0 %	0 %	25 %	525934254
1036	NC_021840	CGA	2	6	50310	50315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934254
1037	NC_021840	ATCA	2	8	50324	50331	50 %	25 %	0 %	25 %	525934254
1038	NC_021840	AAC	2	6	50397	50402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934254
1039	NC_021840	ATTTT	2	10	50469	50478	20 %	80 %	0 %	0 %	525934254
1040	NC_021840	ATG	2	6	50501	50506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934254
1041	NC_021840	ACG	2	6	50519	50524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934254
1042	NC_021840	ATG	2	6	50547	50552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934254
1043	NC_021840	AG	3	6	50616	50621	50 %	0 %	50 %	0 %	525934254
1044	NC_021840	TGTAG	2	10	50791	50800	20 %	40 %	40 %	0 %	525934255
1045	NC_021840	TAATT	2	10	50841	50850	40 %	60 %	0 %	0 %	525934255
1046	NC_021840	ACT	2	6	50901	50906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934255
1047	NC_021840	AAT	2	6	50917	50922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934255
1048	NC_021840	CTG	2	6	50993	50998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934255
1049	NC_021840	ATT	2	6	51025	51030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934255
1050	NC_021840	GAA	2	6	51043	51048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934255
1051	NC_021840	CTC	2	6	51065	51070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525934255
1052	NC_021840	A	6	6	51073	51078	100 %	0 %	0 %	0 %	525934255
1053	NC_021840	TAAA	2	8	51143	51150	75 %	25 %	0 %	0 %	525934255
1054	NC_021840	A	6	6	51176	51181	100 %	0 %	0 %	0 %	525934255
1055	NC_021840	TGG	2	6	51192	51197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934255
1056	NC_021840	TTA	2	6	51199	51204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934255
1057	NC_021840	GAA	2	6	51271	51276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934255
1058	NC_021840	GCA	2	6	51301	51306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934255
1059	NC_021840	GC	3	6	51379	51384	0 %	0 %	50 %	50 %	525934255
1060	NC_021840	CGG	2	6	51471	51476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934255
1061	NC_021840	GGT	2	6	51520	51525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934255
1062	NC_021840	TG	3	6	51544	51549	0 %	50 %	50 %	0 %	525934255
1063	NC_021840	GAA	2	6	51679	51684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934255
1064	NC_021840	TTA	2	6	51722	51727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934255
1065	NC_021840	CTT	2	6	51734	51739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934255
1066	NC_021840	GTAGAA	2	12	51781	51792	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525934255
1067	NC_021840	AGAA	2	8	51804	51811	75 %	0 %	25 %	0 %	525934255
1068	NC_021840	AAC	2	6	51885	51890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934255
1069	NC_021840	TGC	2	6	51945	51950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934255
1070	NC_021840	AGC	2	6	52050	52055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934255
1071	NC_021840	ATA	2	6	52098	52103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934255
1072	NC_021840	ATT	2	6	52145	52150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934256
1073	NC_021840	TGC	2	6	52259	52264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934256
1074	NC_021840	TAA	2	6	52278	52283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934256
1075	NC_021840	TCG	2	6	52315	52320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934256
1076	NC_021840	TGC	2	6	52458	52463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934256
1077	NC_021840	ATC	2	6	52473	52478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934256
1078	NC_021840	TGG	2	6	52484	52489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934256
1079	NC_021840	CAA	2	6	52526	52531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934256
1080	NC_021840	AGC	2	6	52582	52587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934256
1081	NC_021840	ATC	2	6	52621	52626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934256
1082	NC_021840	TTTAAA	2	12	52665	52676	50 %	50 %	0 %	0 %	525934256
1083	NC_021840	GAA	2	6	52728	52733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934256
1084	NC_021840	T	6	6	52750	52755	0 %	100 %	0 %	0 %	525934256
1085	NC_021840	TAG	2	6	52826	52831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934256
1086	NC_021840	GA	3	6	52870	52875	50 %	0 %	50 %	0 %	525934256
1087	NC_021840	CG	3	6	52949	52954	0 %	0 %	50 %	50 %	525934256
1088	NC_021840	CAT	2	6	53005	53010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934257
1089	NC_021840	AAT	2	6	53036	53041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934257
1090	NC_021840	ATA	3	9	53046	53054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934257
1091	NC_021840	CAG	2	6	53080	53085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934257
1092	NC_021840	GATA	2	8	53122	53129	50 %	25 %	25 %	0 %	525934257
1093	NC_021840	AACG	2	8	53177	53184	50 %	0 %	25 %	25 %	525934257
1094	NC_021840	CTC	2	6	53186	53191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525934257
1095	NC_021840	GAA	2	6	53192	53197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934257
1096	NC_021840	CAAC	2	8	53201	53208	50 %	0 %	0 %	50 %	525934257
1097	NC_021840	ATC	2	6	53211	53216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934257
1098	NC_021840	TTG	2	6	53276	53281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934257
1099	NC_021840	GCT	2	6	53307	53312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934257
1100	NC_021840	ATA	2	6	53315	53320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934257
1101	NC_021840	AAT	2	6	53354	53359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934257
1102	NC_021840	TAG	2	6	53416	53421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934257
1103	NC_021840	TA	3	6	53494	53499	50 %	50 %	0 %	0 %	525934257
1104	NC_021840	CAA	2	6	53524	53529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934257
1105	NC_021840	AGA	2	6	53551	53556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934257
1106	NC_021840	ATC	2	6	53598	53603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934257
1107	NC_021840	AAT	2	6	53645	53650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934257
1108	NC_021840	ATA	2	6	53700	53705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934257
1109	NC_021840	CAA	2	6	53725	53730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934257
1110	NC_021840	AGCA	2	8	53792	53799	50 %	0 %	25 %	25 %	525934257
1111	NC_021840	AGA	2	6	53820	53825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934257
1112	NC_021840	TTTA	2	8	53867	53874	25 %	75 %	0 %	0 %	525934257
1113	NC_021840	T	6	6	53951	53956	0 %	100 %	0 %	0 %	525934258
1114	NC_021840	AAG	2	6	53957	53962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934258
1115	NC_021840	CAC	3	9	54010	54018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525934258
1116	NC_021840	GTA	2	6	54122	54127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934258
1117	NC_021840	ATC	2	6	54146	54151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934258
1118	NC_021840	CAT	2	6	54247	54252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934258
1119	NC_021840	CCA	2	6	54291	54296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525934258
1120	NC_021840	T	6	6	54317	54322	0 %	100 %	0 %	0 %	525934258
1121	NC_021840	CGC	2	6	54424	54429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525934258
1122	NC_021840	TAAC	2	8	54501	54508	50 %	25 %	0 %	25 %	525934258
1123	NC_021840	T	6	6	54524	54529	0 %	100 %	0 %	0 %	525934258
1124	NC_021840	T	6	6	54713	54718	0 %	100 %	0 %	0 %	525934258
1125	NC_021840	CGGTA	2	10	54727	54736	20 %	20 %	40 %	20 %	525934258
1126	NC_021840	AAT	2	6	54738	54743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934258
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