MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926

Total Repeats: 58897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021840	AAG	2	6	26550	26555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934235
502	NC_021840	CAA	2	6	26596	26601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934235
503	NC_021840	CGTA	2	8	26602	26609	25 %	25 %	25 %	25 %	525934235
504	NC_021840	GAA	2	6	26624	26629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934235
505	NC_021840	TCG	2	6	26680	26685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934235
506	NC_021840	GAA	2	6	26690	26695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934235
507	NC_021840	AAG	2	6	26727	26732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934235
508	NC_021840	CGA	2	6	26737	26742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934235
509	NC_021840	TAG	2	6	26769	26774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934235
510	NC_021840	ATTT	2	8	26775	26782	25 %	75 %	0 %	0 %	525934235
511	NC_021840	TGA	2	6	26785	26790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934235
512	NC_021840	ATG	2	6	26880	26885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934235
513	NC_021840	T	6	6	26921	26926	0 %	100 %	0 %	0 %	525934235
514	NC_021840	ATTAA	2	10	27062	27071	60 %	40 %	0 %	0 %	525934235
515	NC_021840	TCT	2	6	27089	27094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934235
516	NC_021840	A	6	6	27104	27109	100 %	0 %	0 %	0 %	525934235
517	NC_021840	TGG	2	6	27133	27138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934235
518	NC_021840	AGT	2	6	27151	27156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934235
519	NC_021840	GCAA	2	8	27316	27323	50 %	0 %	25 %	25 %	525934235
520	NC_021840	CCA	2	6	27326	27331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525934235
521	NC_021840	TAA	2	6	27337	27342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934235
522	NC_021840	ATT	2	6	27343	27348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934235
523	NC_021840	AGA	2	6	27352	27357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934235
524	NC_021840	TTAT	2	8	27538	27545	25 %	75 %	0 %	0 %	525934236
525	NC_021840	ATC	2	6	27567	27572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934236
526	NC_021840	AGCA	2	8	27607	27614	50 %	0 %	25 %	25 %	525934236
527	NC_021840	CAA	2	6	27637	27642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934236
528	NC_021840	GAT	2	6	27654	27659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934236
529	NC_021840	TGC	2	6	27668	27673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934236
530	NC_021840	GAA	2	6	27675	27680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934236
531	NC_021840	TCGAT	2	10	27692	27701	20 %	40 %	20 %	20 %	525934236
532	NC_021840	AGC	2	6	27710	27715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934236
533	NC_021840	TTA	2	6	27742	27747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934236
534	NC_021840	AGC	2	6	27866	27871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934236
535	NC_021840	TTA	2	6	27919	27924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934236
536	NC_021840	TTA	2	6	28004	28009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934236
537	NC_021840	AAAGTA	2	12	28050	28061	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525934236
538	NC_021840	TGG	2	6	28127	28132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934236
539	NC_021840	A	6	6	28138	28143	100 %	0 %	0 %	0 %	525934236
540	NC_021840	GAC	2	6	28164	28169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934236
541	NC_021840	TTA	2	6	28183	28188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934236
542	NC_021840	A	6	6	28194	28199	100 %	0 %	0 %	0 %	525934236
543	NC_021840	GAG	2	6	28243	28248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525934236
544	NC_021840	TTAT	2	8	28270	28277	25 %	75 %	0 %	0 %	525934236
545	NC_021840	AGA	2	6	28307	28312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934236
546	NC_021840	TTAA	2	8	28320	28327	50 %	50 %	0 %	0 %	525934236
547	NC_021840	TGG	2	6	28343	28348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934236
548	NC_021840	ACA	2	6	28379	28384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934236
549	NC_021840	GAT	2	6	28631	28636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934237
550	NC_021840	AAT	2	6	28637	28642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934237
551	NC_021840	T	7	7	28672	28678	0 %	100 %	0 %	0 %	525934237
552	NC_021840	AGA	2	6	28697	28702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934237
553	NC_021840	AGTA	2	8	28715	28722	50 %	25 %	25 %	0 %	525934237
554	NC_021840	TAA	2	6	28742	28747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934237
555	NC_021840	AAC	2	6	28758	28763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934237
556	NC_021840	ATA	2	6	28786	28791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934237
557	NC_021840	TATC	2	8	28798	28805	25 %	50 %	0 %	25 %	525934237
558	NC_021840	GCA	2	6	28809	28814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934237
559	NC_021840	CAA	2	6	28834	28839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934237
560	NC_021840	GATTT	2	10	28845	28854	20 %	60 %	20 %	0 %	525934237
561	NC_021840	GAA	2	6	28869	28874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934237
562	NC_021840	CTT	2	6	28891	28896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934237
563	NC_021840	GAA	2	6	28946	28951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934237
564	NC_021840	CAA	3	9	28990	28998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934237
565	NC_021840	A	6	6	29007	29012	100 %	0 %	0 %	0 %	525934237
566	NC_021840	GTG	2	6	29035	29040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934237
567	NC_021840	A	6	6	29059	29064	100 %	0 %	0 %	0 %	525934237
568	NC_021840	AGA	2	6	29078	29083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934237
569	NC_021840	CAA	2	6	29086	29091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934237
570	NC_021840	AAT	2	6	29094	29099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934237
571	NC_021840	TGA	2	6	29132	29137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934237
572	NC_021840	AGA	2	6	29177	29182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934237
573	NC_021840	CTAT	2	8	29233	29240	25 %	50 %	0 %	25 %	525934237
574	NC_021840	ATTT	2	8	29249	29256	25 %	75 %	0 %	0 %	525934237
575	NC_021840	AAG	3	9	29302	29310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934237
576	NC_021840	AT	3	6	29339	29344	50 %	50 %	0 %	0 %	525934237
577	NC_021840	A	6	6	29395	29400	100 %	0 %	0 %	0 %	525934238
578	NC_021840	ATA	2	6	29522	29527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934238
579	NC_021840	GAA	2	6	29687	29692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934238
580	NC_021840	CAG	2	6	29811	29816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934238
581	NC_021840	A	6	6	29826	29831	100 %	0 %	0 %	0 %	525934238
582	NC_021840	GCCAT	2	10	29835	29844	20 %	20 %	20 %	40 %	525934238
583	NC_021840	A	6	6	29898	29903	100 %	0 %	0 %	0 %	525934238
584	NC_021840	ATG	2	6	29940	29945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934238
585	NC_021840	AACA	2	8	29946	29953	75 %	0 %	0 %	25 %	525934238
586	NC_021840	AAC	2	6	30025	30030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934238
587	NC_021840	AGA	2	6	30052	30057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934238
588	NC_021840	AAC	2	6	30078	30083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934238
589	NC_021840	AACT	2	8	30087	30094	50 %	25 %	0 %	25 %	525934238
590	NC_021840	CAA	2	6	30263	30268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934238
591	NC_021840	GAA	2	6	30296	30301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934238
592	NC_021840	A	6	6	30353	30358	100 %	0 %	0 %	0 %	525934238
593	NC_021840	TAC	2	6	30442	30447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934238
594	NC_021840	AGA	2	6	30466	30471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934238
595	NC_021840	CCA	2	6	30527	30532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525934238
596	NC_021840	A	7	7	30583	30589	100 %	0 %	0 %	0 %	525934238
597	NC_021840	GTA	2	6	30590	30595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934238
598	NC_021840	GGC	2	6	30650	30655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934238
599	NC_021840	A	6	6	30665	30670	100 %	0 %	0 %	0 %	525934238
600	NC_021840	ACA	2	6	30698	30703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934238
601	NC_021840	ACA	2	6	31125	31130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934239
602	NC_021840	AGA	2	6	31235	31240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934239
603	NC_021840	ATG	2	6	31296	31301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934239
604	NC_021840	A	6	6	31311	31316	100 %	0 %	0 %	0 %	525934239
605	NC_021840	AAC	2	6	31360	31365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934239
606	NC_021840	ACGT	2	8	31387	31394	25 %	25 %	25 %	25 %	525934239
607	NC_021840	CAG	2	6	31417	31422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934239
608	NC_021840	TCAAA	2	10	31430	31439	60 %	20 %	0 %	20 %	525934239
609	NC_021840	GCG	2	6	31473	31478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934239
610	NC_021840	TTA	2	6	31560	31565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934239
611	NC_021840	GTG	2	6	31604	31609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934239
612	NC_021840	A	7	7	31627	31633	100 %	0 %	0 %	0 %	525934239
613	NC_021840	T	7	7	31654	31660	0 %	100 %	0 %	0 %	525934240
614	NC_021840	CTT	3	9	31694	31702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934240
615	NC_021840	TTC	2	6	31782	31787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934240
616	NC_021840	T	6	6	31793	31798	0 %	100 %	0 %	0 %	525934240
617	NC_021840	TAAA	2	8	31863	31870	75 %	25 %	0 %	0 %	525934240
618	NC_021840	T	6	6	31885	31890	0 %	100 %	0 %	0 %	525934240
619	NC_021840	GTT	2	6	31951	31956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934240
620	NC_021840	CGG	2	6	31987	31992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934240
621	NC_021840	GTT	2	6	32113	32118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934240
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623	NC_021840	T	6	6	32426	32431	0 %	100 %	0 %	0 %	525934241
624	NC_021840	GTT	2	6	32435	32440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934241
625	NC_021840	ATT	2	6	32460	32465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934241
626	NC_021840	TGT	2	6	32472	32477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934241
627	NC_021840	TG	3	6	32542	32547	0 %	50 %	50 %	0 %	525934241
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