MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 58948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021839	GAA	2	6	158549	158554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929778
3002	NC_021839	TCA	2	6	158610	158615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929778
3003	NC_021839	A	6	6	158668	158673	100 %	0 %	0 %	0 %	525929778
3004	NC_021839	TAG	2	6	158682	158687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929778
3005	NC_021839	ATTG	2	8	158702	158709	25 %	50 %	25 %	0 %	525929778
3006	NC_021839	AAG	2	6	158756	158761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929778
3007	NC_021839	A	6	6	158766	158771	100 %	0 %	0 %	0 %	525929778
3008	NC_021839	T	8	8	158800	158807	0 %	100 %	0 %	0 %	525929779
3009	NC_021839	AC	3	6	158874	158879	50 %	0 %	0 %	50 %	525929779
3010	NC_021839	CAT	2	6	158914	158919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929779
3011	NC_021839	TTC	2	6	158929	158934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929779
3012	NC_021839	GAG	2	6	158941	158946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525929779
3013	NC_021839	TTGAT	2	10	158959	158968	20 %	60 %	20 %	0 %	525929779
3014	NC_021839	ATC	2	6	159016	159021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929779
3015	NC_021839	AAT	2	6	159073	159078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929779
3016	NC_021839	TC	3	6	159128	159133	0 %	50 %	0 %	50 %	525929779
3017	NC_021839	GAT	2	6	159139	159144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929779
3018	NC_021839	CTT	2	6	159186	159191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929779
3019	NC_021839	AAAAT	2	10	159210	159219	80 %	20 %	0 %	0 %	525929779
3020	NC_021839	CCG	2	6	159290	159295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525929779
3021	NC_021839	CGT	2	6	159332	159337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929779
3022	NC_021839	TAA	2	6	159339	159344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929779
3023	NC_021839	CTT	2	6	159351	159356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929779
3024	NC_021839	T	6	6	159376	159381	0 %	100 %	0 %	0 %	525929779
3025	NC_021839	TGC	2	6	159393	159398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929779
3026	NC_021839	A	6	6	159671	159676	100 %	0 %	0 %	0 %	525929780
3027	NC_021839	ATT	2	6	159684	159689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929780
3028	NC_021839	TGG	2	6	159709	159714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929780
3029	NC_021839	ACA	2	6	159838	159843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929780
3030	NC_021839	AGA	2	6	159864	159869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929780
3031	NC_021839	GAA	2	6	159882	159887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929780
3032	NC_021839	GATTTC	2	12	159909	159920	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525929780
3033	NC_021839	ATG	2	6	159941	159946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929780
3034	NC_021839	TACT	2	8	159992	159999	25 %	50 %	0 %	25 %	525929780
3035	NC_021839	ATGA	2	8	160003	160010	50 %	25 %	25 %	0 %	525929780
3036	NC_021839	TGG	2	6	160074	160079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929780
3037	NC_021839	GGC	2	6	160198	160203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525929780
3038	NC_021839	AGA	2	6	160209	160214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929780
3039	NC_021839	A	6	6	160306	160311	100 %	0 %	0 %	0 %	525929780
3040	NC_021839	TCA	2	6	160321	160326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929780
3041	NC_021839	CTT	2	6	160428	160433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929780
3042	NC_021839	GAA	2	6	160513	160518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929780
3043	NC_021839	ATT	2	6	160528	160533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929780
3044	NC_021839	A	6	6	160613	160618	100 %	0 %	0 %	0 %	525929780
3045	NC_021839	T	6	6	160639	160644	0 %	100 %	0 %	0 %	525929780
3046	NC_021839	ATA	2	6	160652	160657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929780
3047	NC_021839	GAAT	2	8	160670	160677	50 %	25 %	25 %	0 %	525929780
3048	NC_021839	ATTT	2	8	160761	160768	25 %	75 %	0 %	0 %	525929780
3049	NC_021839	GAA	2	6	160813	160818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929780
3050	NC_021839	GAT	2	6	160831	160836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929780
3051	NC_021839	ATC	2	6	160913	160918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929780
3052	NC_021839	CATT	2	8	160925	160932	25 %	50 %	0 %	25 %	525929780
3053	NC_021839	TTG	2	6	160935	160940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929780
3054	NC_021839	GAA	2	6	161013	161018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929780
3055	NC_021839	A	7	7	161035	161041	100 %	0 %	0 %	0 %	525929780
3056	NC_021839	GGA	2	6	161097	161102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525929780
3057	NC_021839	AAC	2	6	161103	161108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929780
3058	NC_021839	AAG	2	6	161126	161131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929781
3059	NC_021839	TTA	2	6	161148	161153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929781
3060	NC_021839	TGG	2	6	161170	161175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929781
3061	NC_021839	TAT	2	6	161215	161220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929781
3062	NC_021839	TTA	2	6	161367	161372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929781
3063	NC_021839	TCT	2	6	161459	161464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929781
3064	NC_021839	TTG	2	6	161469	161474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929781
3065	NC_021839	TTCC	2	8	161495	161502	0 %	50 %	0 %	50 %	525929781
3066	NC_021839	AATC	2	8	161517	161524	50 %	25 %	0 %	25 %	525929781
3067	NC_021839	AGTT	2	8	161545	161552	25 %	50 %	25 %	0 %	525929781
3068	NC_021839	TCG	2	6	161574	161579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929781
3069	NC_021839	TAT	2	6	161581	161586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929781
3070	NC_021839	AAAC	2	8	161629	161636	75 %	0 %	0 %	25 %	525929781
3071	NC_021839	TTA	2	6	161676	161681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929781
3072	NC_021839	TTA	2	6	161718	161723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929781
3073	NC_021839	GAC	2	6	161818	161823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929781
3074	NC_021839	CTT	2	6	161836	161841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929781
3075	NC_021839	TTC	2	6	161867	161872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929781
3076	NC_021839	ATC	2	6	161964	161969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929781
3077	NC_021839	ATT	2	6	161984	161989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929781
3078	NC_021839	TTA	2	6	162047	162052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929781
3079	NC_021839	ATC	2	6	162143	162148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929781
3080	NC_021839	TTA	2	6	162180	162185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929781
3081	NC_021839	AAC	2	6	162217	162222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929781
3082	NC_021839	TAT	2	6	162227	162232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929781
3083	NC_021839	CAG	3	9	162237	162245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929781
3084	NC_021839	GAC	2	6	162280	162285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929781
3085	NC_021839	ATT	2	6	162293	162298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929781
3086	NC_021839	GC	3	6	162328	162333	0 %	0 %	50 %	50 %	525929781
3087	NC_021839	TTG	2	6	162357	162362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929781
3088	NC_021839	TATC	2	8	162373	162380	25 %	50 %	0 %	25 %	525929781
3089	NC_021839	A	6	6	162426	162431	100 %	0 %	0 %	0 %	525929781
3090	NC_021839	AAGG	2	8	162444	162451	50 %	0 %	50 %	0 %	525929781
3091	NC_021839	TTA	2	6	162475	162480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929782
3092	NC_021839	TAG	2	6	162512	162517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929782
3093	NC_021839	A	6	6	162518	162523	100 %	0 %	0 %	0 %	525929782
3094	NC_021839	AGC	2	6	162528	162533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929782
3095	NC_021839	AGT	2	6	162663	162668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929782
3096	NC_021839	TAAT	2	8	162692	162699	50 %	50 %	0 %	0 %	525929782
3097	NC_021839	GCG	2	6	162727	162732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525929782
3098	NC_021839	A	6	6	162764	162769	100 %	0 %	0 %	0 %	525929782
3099	NC_021839	GAAA	2	8	162929	162936	75 %	0 %	25 %	0 %	525929783
3100	NC_021839	A	6	6	162946	162951	100 %	0 %	0 %	0 %	525929783
3101	NC_021839	TGG	2	6	162992	162997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929783
3102	NC_021839	TATAAA	2	12	163029	163040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929783
3103	NC_021839	AT	3	6	163089	163094	50 %	50 %	0 %	0 %	525929784
3104	NC_021839	AGT	2	6	163114	163119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929784
3105	NC_021839	CAA	2	6	163120	163125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929784
3106	NC_021839	TCA	2	6	163140	163145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929784
3107	NC_021839	TGC	2	6	163245	163250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929784
3108	NC_021839	GAT	2	6	163277	163282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929784
3109	NC_021839	TCT	2	6	163395	163400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929784
3110	NC_021839	CAA	2	6	163414	163419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929784
3111	NC_021839	AGG	2	6	163497	163502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525929784
3112	NC_021839	TGGTT	2	10	163525	163534	0 %	60 %	40 %	0 %	525929784
3113	NC_021839	T	6	6	163574	163579	0 %	100 %	0 %	0 %	525929784
3114	NC_021839	T	6	6	163699	163704	0 %	100 %	0 %	0 %	525929784
3115	NC_021839	CGG	2	6	163723	163728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525929784
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3117	NC_021839	ATC	2	6	163778	163783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929784
3118	NC_021839	GTAG	2	8	163811	163818	25 %	25 %	50 %	0 %	525929784
3119	NC_021839	ATA	2	6	163821	163826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929784
3120	NC_021839	GT	3	6	163882	163887	0 %	50 %	50 %	0 %	525929784
3121	NC_021839	AGC	2	6	163968	163973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929784
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3492	NC_021839	A	6	6	181675	181680	100 %	0 %	0 %	0 %	525932211
3493	NC_021839	CAA	2	6	181793	181798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932211
3494	NC_021839	CAA	2	6	181829	181834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932211
3495	NC_021839	A	8	8	181970	181977	100 %	0 %	0 %	0 %	525932211
3496	NC_021839	AAAT	2	8	181980	181987	75 %	25 %	0 %	0 %	525932211
3497	NC_021839	GCGA	2	8	182255	182262	25 %	0 %	50 %	25 %	525932212
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