MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 58948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021839	T	6	6	55739	55744	0 %	100 %	0 %	0 %	525932169
1002	NC_021839	TTC	2	6	55944	55949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929709
1003	NC_021839	CATTAT	2	12	55979	55990	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525929709
1004	NC_021839	AAG	2	6	56018	56023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929709
1005	NC_021839	ACA	2	6	56032	56037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929709
1006	NC_021839	CTT	2	6	56090	56095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929709
1007	NC_021839	CAT	2	6	56123	56128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929709
1008	NC_021839	CTT	2	6	56147	56152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929709
1009	NC_021839	ATC	2	6	56172	56177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929709
1010	NC_021839	ATA	2	6	56274	56279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929709
1011	NC_021839	CCA	2	6	56290	56295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525929709
1012	NC_021839	AGGTA	2	10	56331	56340	40 %	20 %	40 %	0 %	525929709
1013	NC_021839	AAAT	2	8	56421	56428	75 %	25 %	0 %	0 %	525929709
1014	NC_021839	TCTTTT	2	12	56440	56451	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525929709
1015	NC_021839	CTAG	2	8	56476	56483	25 %	25 %	25 %	25 %	525929709
1016	NC_021839	CAT	2	6	56502	56507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929709
1017	NC_021839	TAA	2	6	56551	56556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929710
1018	NC_021839	TTC	2	6	56560	56565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929710
1019	NC_021839	CAT	2	6	56585	56590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929710
1020	NC_021839	TGCG	2	8	56727	56734	0 %	25 %	50 %	25 %	525929710
1021	NC_021839	ACG	2	6	56847	56852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929710
1022	NC_021839	GTT	2	6	56899	56904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929710
1023	NC_021839	T	6	6	56925	56930	0 %	100 %	0 %	0 %	525929710
1024	NC_021839	TTTC	2	8	56951	56958	0 %	75 %	0 %	25 %	525929710
1025	NC_021839	T	6	6	56967	56972	0 %	100 %	0 %	0 %	525929710
1026	NC_021839	GTT	2	6	56991	56996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929710
1027	NC_021839	AAG	2	6	57081	57086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929710
1028	NC_021839	TCT	2	6	57127	57132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929710
1029	NC_021839	CATA	2	8	57170	57177	50 %	25 %	0 %	25 %	525929710
1030	NC_021839	TCCA	2	8	57178	57185	25 %	25 %	0 %	50 %	525929710
1031	NC_021839	TTC	2	6	57201	57206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929710
1032	NC_021839	TCG	2	6	57211	57216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929710
1033	NC_021839	GT	3	6	57260	57265	0 %	50 %	50 %	0 %	525929710
1034	NC_021839	TGG	2	6	57387	57392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929710
1035	NC_021839	CAA	2	6	57419	57424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929710
1036	NC_021839	AAT	2	6	57494	57499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929710
1037	NC_021839	TCA	2	6	57544	57549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929710
1038	NC_021839	AAT	2	6	57550	57555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929710
1039	NC_021839	TCA	2	6	57616	57621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929710
1040	NC_021839	TTCA	2	8	57651	57658	25 %	50 %	0 %	25 %	525929710
1041	NC_021839	TCT	2	6	57745	57750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929710
1042	NC_021839	AGT	2	6	57801	57806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929710
1043	NC_021839	TTTACC	2	12	57840	57851	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525929710
1044	NC_021839	TTTA	2	8	58063	58070	25 %	75 %	0 %	0 %	525929711
1045	NC_021839	TTCT	2	8	58150	58157	0 %	75 %	0 %	25 %	525929711
1046	NC_021839	CAT	2	6	58207	58212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929711
1047	NC_021839	GAT	2	6	58342	58347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929711
1048	NC_021839	CTT	2	6	58402	58407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929711
1049	NC_021839	ATA	2	6	58428	58433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929711
1050	NC_021839	TCT	2	6	58437	58442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929711
1051	NC_021839	TCA	2	6	58545	58550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929711
1052	NC_021839	CTT	2	6	58636	58641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929711
1053	NC_021839	TAA	2	6	58678	58683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929711
1054	NC_021839	GTCA	2	8	58712	58719	25 %	25 %	25 %	25 %	525929711
1055	NC_021839	CAA	2	6	58735	58740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929711
1056	NC_021839	CTT	2	6	58798	58803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929711
1057	NC_021839	ATC	2	6	58826	58831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929711
1058	NC_021839	AGT	2	6	58836	58841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929711
1059	NC_021839	ATCAAT	2	12	58847	58858	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525929711
1060	NC_021839	AAT	2	6	59008	59013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929712
1061	NC_021839	ATT	3	9	59091	59099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929712
1062	NC_021839	ATGAAA	2	12	59205	59216	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525929712
1063	NC_021839	TAG	2	6	59229	59234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929712
1064	NC_021839	CTT	2	6	59282	59287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929712
1065	NC_021839	TCA	2	6	59329	59334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929712
1066	NC_021839	CGG	2	6	59359	59364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525929712
1067	NC_021839	AGA	2	6	59443	59448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929712
1068	NC_021839	AAG	2	6	59481	59486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929712
1069	NC_021839	TAAA	2	8	59509	59516	75 %	25 %	0 %	0 %	525929712
1070	NC_021839	A	7	7	59514	59520	100 %	0 %	0 %	0 %	525929712
1071	NC_021839	T	7	7	59568	59574	0 %	100 %	0 %	0 %	525929713
1072	NC_021839	AAT	2	6	59621	59626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929713
1073	NC_021839	CTT	2	6	59632	59637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929713
1074	NC_021839	AGA	2	6	59659	59664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929713
1075	NC_021839	AGT	2	6	59683	59688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929713
1076	NC_021839	GTA	2	6	59719	59724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929713
1077	NC_021839	T	6	6	59795	59800	0 %	100 %	0 %	0 %	525929713
1078	NC_021839	GTA	2	6	59825	59830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929713
1079	NC_021839	AG	5	10	59887	59896	50 %	0 %	50 %	0 %	525929713
1080	NC_021839	TCTT	2	8	59910	59917	0 %	75 %	0 %	25 %	525929713
1081	NC_021839	A	6	6	60003	60008	100 %	0 %	0 %	0 %	525929713
1082	NC_021839	AT	3	6	60051	60056	50 %	50 %	0 %	0 %	525929713
1083	NC_021839	AC	3	6	60085	60090	50 %	0 %	0 %	50 %	525929713
1084	NC_021839	ATTGT	2	10	60161	60170	20 %	60 %	20 %	0 %	525929713
1085	NC_021839	CAT	2	6	60173	60178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929713
1086	NC_021839	CAA	2	6	60181	60186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929713
1087	NC_021839	T	6	6	60214	60219	0 %	100 %	0 %	0 %	525929713
1088	NC_021839	ATT	2	6	60471	60476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929714
1089	NC_021839	ACG	2	6	60512	60517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929714
1090	NC_021839	TTA	2	6	60521	60526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929714
1091	NC_021839	GCTTTT	2	12	60548	60559	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525929714
1092	NC_021839	TAA	2	6	60615	60620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929714
1093	NC_021839	TTG	2	6	60660	60665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929714
1094	NC_021839	TACT	2	8	60684	60691	25 %	50 %	0 %	25 %	525929714
1095	NC_021839	TTTG	2	8	60746	60753	0 %	75 %	25 %	0 %	525929714
1096	NC_021839	AAGG	2	8	60769	60776	50 %	0 %	50 %	0 %	525929714
1097	NC_021839	GTT	2	6	60814	60819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929714
1098	NC_021839	CAA	2	6	60852	60857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929714
1099	NC_021839	T	6	6	60919	60924	0 %	100 %	0 %	0 %	525929714
1100	NC_021839	TGT	2	6	60961	60966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929714
1101	NC_021839	ATT	2	6	61006	61011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929714
1102	NC_021839	CCA	2	6	61028	61033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525929714
1103	NC_021839	CTTTTA	2	12	61077	61088	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525929714
1104	NC_021839	T	7	7	61090	61096	0 %	100 %	0 %	0 %	525929714
1105	NC_021839	AAT	2	6	61098	61103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929714
1106	NC_021839	TCT	2	6	61151	61156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929714
1107	NC_021839	GCA	2	6	61226	61231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929714
1108	NC_021839	TAA	2	6	61285	61290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929714
1109	NC_021839	T	6	6	61306	61311	0 %	100 %	0 %	0 %	525929714
1110	NC_021839	CTCTT	2	10	61323	61332	0 %	60 %	0 %	40 %	525929715
1111	NC_021839	ATGAA	2	10	61333	61342	60 %	20 %	20 %	0 %	525929715
1112	NC_021839	GAT	2	6	61390	61395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929715
1113	NC_021839	CTG	3	9	61396	61404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929715
1114	NC_021839	TAA	2	6	61492	61497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929715
1115	NC_021839	T	7	7	61546	61552	0 %	100 %	0 %	0 %	525929715
1116	NC_021839	ATT	2	6	61580	61585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929715
1117	NC_021839	GAA	2	6	61593	61598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929715
1118	NC_021839	AGC	2	6	61628	61633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929715
1119	NC_021839	CAT	2	6	61657	61662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929715
1120	NC_021839	TCA	2	6	61704	61709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929715
1121	NC_021839	GAA	2	6	61790	61795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929715
1122	NC_021839	GGT	2	6	61800	61805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929715
1123	NC_021839	AGA	2	6	61834	61839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929715
1124	NC_021839	A	7	7	61839	61845	100 %	0 %	0 %	0 %	525929715
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