MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 58948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021839	GAA	2	6	306017	306022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929880
6002	NC_021839	GCT	2	6	306079	306084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929880
6003	NC_021839	CAT	2	6	306147	306152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929880
6004	NC_021839	GCG	2	6	306181	306186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525929881
6005	NC_021839	GGA	2	6	306246	306251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525929881
6006	NC_021839	CTG	2	6	306317	306322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929881
6007	NC_021839	TTCAG	2	10	306391	306400	20 %	40 %	20 %	20 %	525929881
6008	NC_021839	A	6	6	306436	306441	100 %	0 %	0 %	0 %	525929881
6009	NC_021839	GAT	2	6	306497	306502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929881
6010	NC_021839	AAT	2	6	306528	306533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929881
6011	NC_021839	TTG	2	6	306585	306590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929881
6012	NC_021839	A	6	6	306999	307004	100 %	0 %	0 %	0 %	525929882
6013	NC_021839	CGA	2	6	307024	307029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929882
6014	NC_021839	AT	3	6	307047	307052	50 %	50 %	0 %	0 %	525929882
6015	NC_021839	CAG	2	6	307060	307065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929882
6016	NC_021839	AGA	2	6	307073	307078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929882
6017	NC_021839	CAAG	3	12	307136	307147	50 %	0 %	25 %	25 %	525929882
6018	NC_021839	GCA	2	6	307204	307209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929882
6019	NC_021839	GGA	2	6	307232	307237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525929882
6020	NC_021839	CTT	2	6	307309	307314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929882
6021	NC_021839	ACTT	2	8	307317	307324	25 %	50 %	0 %	25 %	525929882
6022	NC_021839	GCTT	2	8	307508	307515	0 %	50 %	25 %	25 %	525929882
6023	NC_021839	TGA	2	6	307559	307564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929882
6024	NC_021839	TGC	2	6	307619	307624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929882
6025	NC_021839	AAAC	2	8	307693	307700	75 %	0 %	0 %	25 %	525929882
6026	NC_021839	GAT	2	6	307724	307729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929882
6027	NC_021839	ATG	2	6	307813	307818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929882
6028	NC_021839	GAT	2	6	307851	307856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929882
6029	NC_021839	AGA	2	6	307883	307888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929882
6030	NC_021839	TGA	2	6	307901	307906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929882
6031	NC_021839	ACC	2	6	307955	307960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525929882
6032	NC_021839	CGG	2	6	308035	308040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525929882
6033	NC_021839	AGA	2	6	308078	308083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929882
6034	NC_021839	GAT	2	6	308115	308120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929882
6035	NC_021839	CAG	2	6	308125	308130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929882
6036	NC_021839	AGT	2	6	308150	308155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929882
6037	NC_021839	TTA	2	6	308263	308268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929882
6038	NC_021839	A	6	6	308292	308297	100 %	0 %	0 %	0 %	525929882
6039	NC_021839	CGA	2	6	308315	308320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929882
6040	NC_021839	AGT	2	6	308384	308389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929882
6041	NC_021839	TGTGAC	2	12	308474	308485	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525929882
6042	NC_021839	CGG	2	6	308495	308500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525929882
6043	NC_021839	CCA	2	6	308517	308522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525929882
6044	NC_021839	AAG	2	6	308548	308553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929882
6045	NC_021839	CAA	2	6	308563	308568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929882
6046	NC_021839	AGA	2	6	308597	308602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929882
6047	NC_021839	GAAA	2	8	308609	308616	75 %	0 %	25 %	0 %	525929882
6048	NC_021839	AGA	2	6	308630	308635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929882
6049	NC_021839	CTT	2	6	308650	308655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929882
6050	NC_021839	AAC	2	6	308657	308662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929882
6051	NC_021839	GAAA	2	8	308663	308670	75 %	0 %	25 %	0 %	525929882
6052	NC_021839	A	6	6	308698	308703	100 %	0 %	0 %	0 %	525929882
6053	NC_021839	TAA	2	6	308747	308752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929882
6054	NC_021839	CTG	2	6	308796	308801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929882
6055	NC_021839	ATG	2	6	308923	308928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929883
6056	NC_021839	ATC	2	6	308936	308941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929883
6057	NC_021839	ATG	2	6	309080	309085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929883
6058	NC_021839	AGA	2	6	309093	309098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929883
6059	NC_021839	TTG	2	6	309182	309187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929883
6060	NC_021839	CAG	2	6	309227	309232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929883
6061	NC_021839	ATT	2	6	309250	309255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929883
6062	NC_021839	TCT	2	6	309307	309312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929883
6063	NC_021839	TAT	2	6	309315	309320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929883
6064	NC_021839	A	7	7	309356	309362	100 %	0 %	0 %	0 %	525929883
6065	NC_021839	TAT	2	6	309399	309404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929884
6066	NC_021839	AAGT	2	8	309417	309424	50 %	25 %	25 %	0 %	525929884
6067	NC_021839	CGC	2	6	309436	309441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525929884
6068	NC_021839	CGA	2	6	309475	309480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929884
6069	NC_021839	T	7	7	309481	309487	0 %	100 %	0 %	0 %	525929884
6070	NC_021839	CAT	2	6	309490	309495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929884
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6072	NC_021839	TAT	2	6	309592	309597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929884
6073	NC_021839	CTTC	2	8	309598	309605	0 %	50 %	0 %	50 %	525929884
6074	NC_021839	TAACGA	2	12	309838	309849	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525929884
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6080	NC_021839	TGC	2	6	310082	310087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929884
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6082	NC_021839	T	6	6	310145	310150	0 %	100 %	0 %	0 %	525929884
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6086	NC_021839	TAT	2	6	310249	310254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929884
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6088	NC_021839	T	7	7	310263	310269	0 %	100 %	0 %	0 %	525929884
6089	NC_021839	ACA	2	6	310350	310355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929884
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6091	NC_021839	TTG	2	6	310373	310378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929884
6092	NC_021839	TGCGGC	2	12	310385	310396	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525929884
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6094	NC_021839	T	6	6	310483	310488	0 %	100 %	0 %	0 %	525929884
6095	NC_021839	T	7	7	310566	310572	0 %	100 %	0 %	0 %	525929884
6096	NC_021839	TAAT	2	8	310597	310604	50 %	50 %	0 %	0 %	525929884
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6099	NC_021839	GATT	2	8	310746	310753	25 %	50 %	25 %	0 %	525929884
6100	NC_021839	TAA	3	9	310807	310815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929884
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6102	NC_021839	GCAG	2	8	311061	311068	25 %	0 %	50 %	25 %	525929885
6103	NC_021839	AAG	2	6	311093	311098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929885
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6105	NC_021839	T	6	6	311159	311164	0 %	100 %	0 %	0 %	525929885
6106	NC_021839	CTT	2	6	311182	311187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929885
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6111	NC_021839	CTTT	2	8	311445	311452	0 %	75 %	0 %	25 %	525929885
6112	NC_021839	GCT	2	6	311492	311497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929885
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6117	NC_021839	CAT	2	6	311741	311746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929885
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6120	NC_021839	CAAC	2	8	312068	312075	50 %	0 %	0 %	50 %	525929886
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6491	NC_021839	GGT	2	6	330174	330179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929901
6492	NC_021839	CATT	2	8	330190	330197	25 %	50 %	0 %	25 %	525929901
6493	NC_021839	GCA	2	6	330233	330238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929901
6494	NC_021839	AGC	2	6	330338	330343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929901
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