MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 58948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021839	ACA	2	6	280234	280239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929855
5502	NC_021839	GTT	2	6	280255	280260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929855
5503	NC_021839	CCAA	2	8	280319	280326	50 %	0 %	0 %	50 %	525932249
5504	NC_021839	GAA	2	6	280331	280336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932249
5505	NC_021839	ATC	2	6	280339	280344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932249
5506	NC_021839	ACC	2	6	280357	280362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525932249
5507	NC_021839	AGA	2	6	280377	280382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932249
5508	NC_021839	ACAT	2	8	280435	280442	50 %	25 %	0 %	25 %	525932249
5509	NC_021839	AATG	2	8	280470	280477	50 %	25 %	25 %	0 %	525932249
5510	NC_021839	A	6	6	280603	280608	100 %	0 %	0 %	0 %	525932249
5511	NC_021839	CAG	2	6	280632	280637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932249
5512	NC_021839	T	6	6	280740	280745	0 %	100 %	0 %	0 %	525932249
5513	NC_021839	TAAAT	2	10	280845	280854	60 %	40 %	0 %	0 %	525932249
5514	NC_021839	AAGC	2	8	281050	281057	50 %	0 %	25 %	25 %	525932249
5515	NC_021839	GAA	2	6	281062	281067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932249
5516	NC_021839	GTT	2	6	281073	281078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932249
5517	NC_021839	ACG	2	6	281185	281190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932249
5518	NC_021839	GAA	2	6	281205	281210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932249
5519	NC_021839	GAA	2	6	281302	281307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932249
5520	NC_021839	A	6	6	281314	281319	100 %	0 %	0 %	0 %	525932249
5521	NC_021839	GTA	2	6	281321	281326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932249
5522	NC_021839	CAT	2	6	281340	281345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932249
5523	NC_021839	ACAA	2	8	281354	281361	75 %	0 %	0 %	25 %	525932249
5524	NC_021839	AGA	2	6	281431	281436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932249
5525	NC_021839	TAT	2	6	281437	281442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932249
5526	NC_021839	AGA	2	6	281463	281468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932249
5527	NC_021839	GAC	2	6	281488	281493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932249
5528	NC_021839	TGGGAT	2	12	281524	281535	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525932249
5529	NC_021839	TGTT	2	8	281648	281655	0 %	75 %	25 %	0 %	525932250
5530	NC_021839	GAA	2	6	281662	281667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932250
5531	NC_021839	AGC	2	6	281767	281772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932250
5532	NC_021839	ACT	2	6	281850	281855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932250
5533	NC_021839	ATT	2	6	281858	281863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932250
5534	NC_021839	A	6	6	281872	281877	100 %	0 %	0 %	0 %	525932250
5535	NC_021839	ATT	2	6	281882	281887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932250
5536	NC_021839	A	6	6	282196	282201	100 %	0 %	0 %	0 %	525929856
5537	NC_021839	CGT	2	6	282213	282218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929856
5538	NC_021839	ACG	2	6	282235	282240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929856
5539	NC_021839	TGC	2	6	282331	282336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929856
5540	NC_021839	ATC	2	6	282372	282377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929856
5541	NC_021839	GAA	2	6	282449	282454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929856
5542	NC_021839	ATT	2	6	282456	282461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929856
5543	NC_021839	CGC	2	6	282463	282468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525929856
5544	NC_021839	TACT	2	8	282471	282478	25 %	50 %	0 %	25 %	525929856
5545	NC_021839	GAC	2	6	282485	282490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929856
5546	NC_021839	AATC	2	8	282523	282530	50 %	25 %	0 %	25 %	525929856
5547	NC_021839	GAT	2	6	282590	282595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929856
5548	NC_021839	ATTT	2	8	282611	282618	25 %	75 %	0 %	0 %	525929856
5549	NC_021839	A	6	6	282661	282666	100 %	0 %	0 %	0 %	525929856
5550	NC_021839	TTG	2	6	282667	282672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929856
5551	NC_021839	CGT	2	6	282720	282725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929856
5552	NC_021839	TGAA	2	8	282730	282737	50 %	25 %	25 %	0 %	525929856
5553	NC_021839	GAA	2	6	282743	282748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929856
5554	NC_021839	ACGT	2	8	282846	282853	25 %	25 %	25 %	25 %	525929857
5555	NC_021839	GAA	2	6	282861	282866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929857
5556	NC_021839	AAC	2	6	282894	282899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929857
5557	NC_021839	TGACA	2	10	283087	283096	40 %	20 %	20 %	20 %	525929858
5558	NC_021839	GAA	2	6	283097	283102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929858
5559	NC_021839	AGA	2	6	283114	283119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929858
5560	NC_021839	ATTA	2	8	283231	283238	50 %	50 %	0 %	0 %	525929858
5561	NC_021839	CG	3	6	283342	283347	0 %	0 %	50 %	50 %	525929858
5562	NC_021839	AGA	3	9	283354	283362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929858
5563	NC_021839	CG	3	6	283425	283430	0 %	0 %	50 %	50 %	525929858
5564	NC_021839	ATT	2	6	283436	283441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929858
5565	NC_021839	CCA	2	6	283466	283471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525929858
5566	NC_021839	CG	3	6	283487	283492	0 %	0 %	50 %	50 %	525929858
5567	NC_021839	CGG	2	6	283506	283511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525929858
5568	NC_021839	A	6	6	283580	283585	100 %	0 %	0 %	0 %	525929858
5569	NC_021839	ACA	2	6	283619	283624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929858
5570	NC_021839	ACT	2	6	283663	283668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929858
5571	NC_021839	TATT	2	8	283807	283814	25 %	75 %	0 %	0 %	525929858
5572	NC_021839	T	7	7	283851	283857	0 %	100 %	0 %	0 %	525929859
5573	NC_021839	TAGA	2	8	283943	283950	50 %	25 %	25 %	0 %	525929859
5574	NC_021839	ATA	2	6	283981	283986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929859
5575	NC_021839	GAG	2	6	284010	284015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525929859
5576	NC_021839	TCC	2	6	284073	284078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525929859
5577	NC_021839	ATTT	2	8	284108	284115	25 %	75 %	0 %	0 %	525929859
5578	NC_021839	AGAAA	2	10	284159	284168	80 %	0 %	20 %	0 %	525929859
5579	NC_021839	AAT	2	6	284176	284181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929859
5580	NC_021839	AATC	2	8	284197	284204	50 %	25 %	0 %	25 %	525929859
5581	NC_021839	GTGG	2	8	284221	284228	0 %	25 %	75 %	0 %	525929859
5582	NC_021839	ACA	2	6	284241	284246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929859
5583	NC_021839	TTGTT	2	10	284255	284264	0 %	80 %	20 %	0 %	525929859
5584	NC_021839	T	6	6	284331	284336	0 %	100 %	0 %	0 %	525929859
5585	NC_021839	TAAA	2	8	284454	284461	75 %	25 %	0 %	0 %	525929859
5586	NC_021839	TAAA	2	8	284555	284562	75 %	25 %	0 %	0 %	525929859
5587	NC_021839	AAAT	2	8	284606	284613	75 %	25 %	0 %	0 %	525929859
5588	NC_021839	CGG	2	6	284680	284685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525929859
5589	NC_021839	T	6	6	284717	284722	0 %	100 %	0 %	0 %	525929859
5590	NC_021839	TTA	2	6	284942	284947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929860
5591	NC_021839	CCA	2	6	285019	285024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525929860
5592	NC_021839	AGA	2	6	285063	285068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929860
5593	NC_021839	TAC	2	6	285079	285084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929860
5594	NC_021839	AAC	2	6	285086	285091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929860
5595	NC_021839	AAC	2	6	285162	285167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929860
5596	NC_021839	ATCC	2	8	285249	285256	25 %	25 %	0 %	50 %	525929860
5597	NC_021839	A	6	6	285337	285342	100 %	0 %	0 %	0 %	525929860
5598	NC_021839	GGT	2	6	285343	285348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929860
5599	NC_021839	AGA	2	6	285372	285377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929860
5600	NC_021839	AATA	2	8	285394	285401	75 %	25 %	0 %	0 %	525929860
5601	NC_021839	CAA	2	6	285424	285429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929860
5602	NC_021839	CGG	2	6	285456	285461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525929860
5603	NC_021839	TACT	2	8	285469	285476	25 %	50 %	0 %	25 %	525929860
5604	NC_021839	TGG	2	6	285522	285527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929860
5605	NC_021839	CG	3	6	285577	285582	0 %	0 %	50 %	50 %	525929860
5606	NC_021839	GGC	2	6	285640	285645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525929860
5607	NC_021839	AGA	2	6	285654	285659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929860
5608	NC_021839	ATT	2	6	285677	285682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929860
5609	NC_021839	AAG	3	9	285686	285694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929860
5610	NC_021839	CTTG	2	8	285888	285895	0 %	50 %	25 %	25 %	525929860
5611	NC_021839	AAG	2	6	285953	285958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929860
5612	NC_021839	ATT	2	6	286051	286056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929860
5613	NC_021839	TGT	2	6	286101	286106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929860
5614	NC_021839	GGC	2	6	286114	286119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525929860
5615	NC_021839	CAG	2	6	286124	286129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929860
5616	NC_021839	AGC	2	6	286137	286142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929860
5617	NC_021839	CGG	2	6	286148	286153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525929860
5618	NC_021839	TGG	2	6	286200	286205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929860
5619	NC_021839	ATT	2	6	286262	286267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929860
5620	NC_021839	TTA	2	6	286304	286309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929860
5621	NC_021839	AAG	2	6	286427	286432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929860
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5623	NC_021839	CGG	2	6	286515	286520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525929860
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5994	NC_021839	TCT	2	6	305842	305847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929880
5995	NC_021839	TCT	2	6	305851	305856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929880
5996	NC_021839	TCA	2	6	305876	305881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929880
5997	NC_021839	GCCA	2	8	305886	305893	25 %	0 %	25 %	50 %	525929880
5998	NC_021839	CG	3	6	305928	305933	0 %	0 %	50 %	50 %	525929880
5999	NC_021839	TCA	2	6	305959	305964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929880
6000	NC_021839	AAC	2	6	305988	305993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929880

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