MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-031

Total Repeats: 1080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021837	GCCGCA	2	12	4332	4343	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525916943
2	NC_021837	TCGTTA	2	12	4879	4890	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525916943
3	NC_021837	CTCACC	2	12	4990	5001	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	525916943
4	NC_021837	TAGTTC	2	12	5611	5622	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525916944
5	NC_021837	GCTTCT	2	12	18790	18801	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525916958
6	NC_021837	TCATTT	2	12	20816	20827	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525916960
7	NC_021837	TGCAAT	2	12	21254	21265	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525916961
8	NC_021837	CTTTCT	2	12	24269	24280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525916963
9	NC_021837	GAAAAA	2	12	27628	27639	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525919448
10	NC_021837	CTTCGA	2	12	30782	30793	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525916967
11	NC_021837	CTTCCA	2	12	44837	44848	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	525916978
12	NC_021837	GACACG	2	12	46444	46455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525916979
13	NC_021837	TTTTAT	2	12	51669	51680	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525916983
14	NC_021837	GTTTTA	2	12	53089	53100	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525916984
15	NC_021837	GCAAAT	2	12	53536	53547	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525916984
16	NC_021837	GGTGAG	2	12	54148	54159	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	525916984
17	NC_021837	AGTACA	2	12	54343	54354	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525916984
18	NC_021837	AAACAG	2	12	54443	54454	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525916984
19	NC_021837	GCATAA	2	12	56987	56998	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525916987
20	NC_021837	TTGATT	2	12	58415	58426	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525916988
21	NC_021837	AAGTCC	2	12	63887	63898	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525919456
22	NC_021837	TTGCTT	2	12	66817	66828	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525919457
23	NC_021837	TATCGC	2	12	67909	67920	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525919458
24	NC_021837	CATCAA	2	12	68296	68307	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525919458
25	NC_021837	CTAAAT	2	12	69391	69402	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525919458
26	NC_021837	TAATAT	2	12	71316	71327	50 %	50 %	0 %	0 %	525916995
27	NC_021837	ACCAAG	2	12	76242	76253	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525916999
28	NC_021837	TTTCTT	2	12	78199	78210	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525917002
29	NC_021837	GTAAAA	2	12	79037	79048	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525917002
30	NC_021837	ATTAAT	2	12	80949	80960	50 %	50 %	0 %	0 %	525919459
31	NC_021837	TTTTTC	2	12	81529	81540	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525919460
32	NC_021837	TTTTAC	2	12	86584	86595	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525917009
33	NC_021837	ATACCA	2	12	87901	87912	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525917010
34	NC_021837	AAATGT	2	12	88087	88098	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525917010
35	NC_021837	GAACGT	2	12	89511	89522	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525917012
36	NC_021837	AATAAA	2	12	89827	89838	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525917012
37	NC_021837	CAATAC	2	12	97933	97944	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525917018
38	NC_021837	ATATCG	2	12	103357	103368	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525917022
39	NC_021837	CAAAAA	2	12	106343	106354	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	525917026
40	NC_021837	ATTTGC	2	12	111634	111645	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525917032
41	NC_021837	TGTTGC	2	12	111673	111684	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525917032
42	NC_021837	TTGATA	2	12	113851	113862	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525917035
43	NC_021837	TGCTTG	2	12	115053	115064	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525917036
44	NC_021837	CATTTC	2	12	120017	120028	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525919465
45	NC_021837	TTTATA	2	12	123207	123218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525917042
46	NC_021837	GAAATC	2	12	126327	126338	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525917045
47	NC_021837	CTTTTA	2	12	127615	127626	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525917047
48	NC_021837	GCTTTT	2	12	131135	131146	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525919469
49	NC_021837	TTCATT	2	12	135284	135295	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525917050
50	NC_021837	GGTCTG	2	12	135959	135970	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525917051
51	NC_021837	TGTATT	2	12	139836	139847	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525917053
52	NC_021837	CTTTCG	2	12	140939	140950	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525917053
53	NC_021837	TTAATG	2	12	149154	149165	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525917064
54	NC_021837	TTGCTT	2	12	156157	156168	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525919479
55	NC_021837	AATCTA	2	12	162892	162903	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525919481
56	NC_021837	AAAGAT	2	12	164137	164148	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525919481
57	NC_021837	CAGTTT	2	12	169262	169273	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525919482
58	NC_021837	TTTTCT	2	12	170668	170679	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525917070
59	NC_021837	ATTTTC	2	12	178000	178011	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525917076
60	NC_021837	AACCAG	2	12	179352	179363	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525917078
61	NC_021837	ATACTA	2	12	181716	181727	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525919484
62	NC_021837	TATAAT	2	12	181962	181973	50 %	50 %	0 %	0 %	525919484
63	NC_021837	GTAAAA	2	12	182107	182118	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525919484
64	NC_021837	CATCTA	2	12	185265	185276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525919487
65	NC_021837	CAAGAA	2	12	186153	186164	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525919488
66	NC_021837	AATGGA	2	12	190453	190464	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525917082
67	NC_021837	CAATTG	2	12	199851	199862	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525917089
68	NC_021837	TGAATC	2	12	199882	199893	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525917089
69	NC_021837	CCCTTC	2	12	203528	203539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525917092
70	NC_021837	TTATTT	2	12	205325	205336	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525917093
71	NC_021837	AAATCA	2	12	208629	208640	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525917096
72	NC_021837	CGCAGC	2	12	209032	209043	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525917096
73	NC_021837	AGAATA	2	12	214656	214667	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525919496
74	NC_021837	AATTGA	2	12	215285	215296	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525919497
75	NC_021837	CGTTTT	2	12	217119	217130	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525917102
76	NC_021837	CAACGT	2	12	219027	219038	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525917103
77	NC_021837	TAAAAG	2	12	221904	221915	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525917106
78	NC_021837	TTTTCA	2	12	223776	223787	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525917108
79	NC_021837	ATTGAT	2	12	224135	224146	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525917109
80	NC_021837	TGAACT	2	12	224278	224289	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525917109
81	NC_021837	AAAAGA	2	12	226543	226554	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525917111
82	NC_021837	ATTTCG	2	12	229506	229517	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525917113
83	NC_021837	GTTTTT	2	12	232106	232117	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525917116
84	NC_021837	TAATTC	2	12	233805	233816	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525919498
85	NC_021837	ATTTGG	2	12	236412	236423	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525919500
86	NC_021837	CACGAA	2	12	242400	242411	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525917119
87	NC_021837	AGTGTA	2	12	243912	243923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525917119
88	NC_021837	TTTCTT	2	12	248156	248167	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525917120
89	NC_021837	ATTGTC	2	12	250740	250751	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525917121
90	NC_021837	GCTACA	2	12	255108	255119	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525917123
91	NC_021837	ATTTTT	2	12	257385	257396	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525917127
92	NC_021837	TTGTTT	2	12	258233	258244	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525917128
93	NC_021837	TACTGT	2	12	258609	258620	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525917129
94	NC_021837	TCCTTT	2	12	262776	262787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525917136
95	NC_021837	ACCTTT	2	12	263910	263921	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525917137
96	NC_021837	CTTTTA	2	12	266034	266045	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525917139
97	NC_021837	TCTTTT	2	12	270371	270382	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525917142
98	NC_021837	GGTAAA	2	12	273293	273304	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525917145
99	NC_021837	TGGTTC	2	12	287069	287080	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525917147
100	NC_021837	TTTTTC	2	12	287633	287644	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525917147
101	NC_021837	ATCAAT	2	12	288096	288107	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525917148
102	NC_021837	TGGAGA	2	12	290754	290765	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	525917150
103	NC_021837	TTCTGC	2	12	291592	291603	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525917151
104	NC_021837	CACCGA	2	12	294619	294630	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	525917153
105	NC_021837	CTTTAA	2	12	296597	296608	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525919506
106	NC_021837	CACTTG	2	12	298539	298550	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525917155
107	NC_021837	TCTCCT	2	12	300429	300440	0 %	50 %	0 %	50 %	525917157
108	NC_021837	CGAGTG	2	12	300691	300702	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525917157
109	NC_021837	TTTGTT	2	12	301390	301401	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525917158
110	NC_021837	CTTTTT	2	12	304366	304377	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525917158
111	NC_021837	TTTCCT	2	12	305273	305284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525917160
112	NC_021837	TTTTTC	2	12	305592	305603	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525917160
113	NC_021837	AAAGAA	2	12	307681	307692	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525917162
114	NC_021837	TTCTTT	2	12	314044	314055	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525917167
115	NC_021837	ACCGGA	2	12	324592	324603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525917176
116	NC_021837	GCTGCA	2	12	327931	327942	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525917180
117	NC_021837	TCAATG	2	12	328586	328597	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525917181
118	NC_021837	TTTTGT	2	12	331034	331045	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525917184
119	NC_021837	ACTTCA	2	12	336719	336730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525917188
120	NC_021837	TGTTTT	2	12	338758	338769	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525917188
121	NC_021837	TCTTTT	2	12	339089	339100	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525917188
122	NC_021837	TTTCTG	2	12	339165	339176	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525917188
123	NC_021837	AGCCAT	2	12	339839	339850	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525917188
124	NC_021837	ATCTTT	2	12	340964	340975	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525917189
125	NC_021837	GGATTG	2	12	342976	342987	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525917191
126	NC_021837	CTTTCG	2	12	346287	346298	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525917192
127	NC_021837	CTGTAA	2	12	348758	348769	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525917194
128	NC_021837	CTAGTA	2	12	348794	348805	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525917194
129	NC_021837	GTAAAA	2	12	349614	349625	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525919510
130	NC_021837	CACTTT	2	12	353803	353814	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525917195
131	NC_021837	TAATGC	2	12	354785	354796	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525917196
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133	NC_021837	GTAAAA	2	12	356053	356064	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525917198
134	NC_021837	TTTTAC	2	12	358100	358111	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525917202
135	NC_021837	AATTCG	2	12	361252	361263	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525917205
136	NC_021837	CACCGC	2	12	363887	363898	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	525917206
137	NC_021837	ATTTTA	2	12	368863	368874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525917209
138	NC_021837	CGCAAT	2	12	369537	369548	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525917210
139	NC_021837	CTGCAA	2	12	369599	369610	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525917210
140	NC_021837	GATAAT	2	12	379425	379436	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525917215
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143	NC_021837	AAATCA	2	12	395734	395745	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525917228
144	NC_021837	TAAAAC	2	12	397748	397759	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525917231
145	NC_021837	GTATTA	2	12	403128	403139	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525917239
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148	NC_021837	ATCCTT	2	12	406296	406307	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525917240
149	NC_021837	GTAATT	2	12	408382	408393	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525917242
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228	NC_021837	CAAGAA	2	12	620849	620860	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525917400
229	NC_021837	TGCTTC	2	12	621099	621110	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525917401
230	NC_021837	TTCAAT	2	12	623687	623698	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525917404
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232	NC_021837	AAGATA	2	12	630560	630571	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525917409
233	NC_021837	GGTTAT	2	12	631018	631029	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525917409
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