MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-031

Total Repeats: 58862

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021837	CA	3	6	26663	26668	50 %	0 %	0 %	50 %	525919447
502	NC_021837	CT	3	6	26793	26798	0 %	50 %	0 %	50 %	525919447
503	NC_021837	ATT	2	6	26823	26828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525919447
504	NC_021837	AGT	2	6	26873	26878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525919447
505	NC_021837	TAA	3	9	26936	26944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525919447
506	NC_021837	AAT	2	6	26999	27004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525919447
507	NC_021837	CAA	2	6	27005	27010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525919447
508	NC_021837	TTG	2	6	27114	27119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525919448
509	NC_021837	GGAA	2	8	27130	27137	50 %	0 %	50 %	0 %	525919448
510	NC_021837	ATT	2	6	27160	27165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525919448
511	NC_021837	TAG	2	6	27184	27189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525919448
512	NC_021837	TTA	2	6	27231	27236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525919448
513	NC_021837	CAA	2	6	27272	27277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525919448
514	NC_021837	CAA	2	6	27313	27318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525919448
515	NC_021837	A	6	6	27342	27347	100 %	0 %	0 %	0 %	525919448
516	NC_021837	CAG	2	6	27348	27353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525919448
517	NC_021837	ATT	2	6	27367	27372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525919448
518	NC_021837	TC	3	6	27385	27390	0 %	50 %	0 %	50 %	525919448
519	NC_021837	GCT	2	6	27418	27423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525919448
520	NC_021837	AGA	2	6	27565	27570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525919448
521	NC_021837	TAT	2	6	27573	27578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525919448
522	NC_021837	A	6	6	27583	27588	100 %	0 %	0 %	0 %	525919448
523	NC_021837	GAAAAA	2	12	27628	27639	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525919448
524	NC_021837	GAAA	2	8	27683	27690	75 %	0 %	25 %	0 %	525919448
525	NC_021837	CAT	2	6	27700	27705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525919448
526	NC_021837	TGT	2	6	27715	27720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525919448
527	NC_021837	TTTAA	2	10	27743	27752	40 %	60 %	0 %	0 %	525919448
528	NC_021837	ATGA	2	8	27836	27843	50 %	25 %	25 %	0 %	525919448
529	NC_021837	AGA	2	6	27853	27858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525919448
530	NC_021837	AAG	2	6	27888	27893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525919448
531	NC_021837	TAA	2	6	27925	27930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525919448
532	NC_021837	ATT	2	6	27958	27963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525919448
533	NC_021837	AGT	2	6	27977	27982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525919448
534	NC_021837	ATTC	2	8	27997	28004	25 %	50 %	0 %	25 %	525919448
535	NC_021837	TATT	2	8	28059	28066	25 %	75 %	0 %	0 %	525916965
536	NC_021837	T	6	6	28137	28142	0 %	100 %	0 %	0 %	525916965
537	NC_021837	GAC	2	6	28187	28192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525916965
538	NC_021837	TGA	2	6	28193	28198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525916965
539	NC_021837	CAG	2	6	28289	28294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525916965
540	NC_021837	TCT	2	6	28366	28371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525916965
541	NC_021837	ACT	2	6	28408	28413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525916965
542	NC_021837	CTT	2	6	28460	28465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525916965
543	NC_021837	CTAG	2	8	28507	28514	25 %	25 %	25 %	25 %	525916965
544	NC_021837	AAAAT	2	10	28530	28539	80 %	20 %	0 %	0 %	525916965
545	NC_021837	CGC	2	6	28559	28564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525916965
546	NC_021837	A	6	6	28668	28673	100 %	0 %	0 %	0 %	525916965
547	NC_021837	TTGT	2	8	28706	28713	0 %	75 %	25 %	0 %	525916965
548	NC_021837	CTT	3	9	28724	28732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525916965
549	NC_021837	GCA	2	6	28738	28743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525916965
550	NC_021837	ACT	2	6	28810	28815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525916965
551	NC_021837	TG	3	6	28930	28935	0 %	50 %	50 %	0 %	525916966
552	NC_021837	CAT	2	6	28970	28975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525916966
553	NC_021837	TTC	2	6	29006	29011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525916966
554	NC_021837	TGGT	2	8	29035	29042	0 %	50 %	50 %	0 %	525916966
555	NC_021837	ACA	2	6	29049	29054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525916966
556	NC_021837	AAT	2	6	29202	29207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525916966
557	NC_021837	T	6	6	29236	29241	0 %	100 %	0 %	0 %	525916966
558	NC_021837	T	6	6	29248	29253	0 %	100 %	0 %	0 %	525916966
559	NC_021837	TGC	2	6	29315	29320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525916966
560	NC_021837	CAC	2	6	29344	29349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525916966
561	NC_021837	T	7	7	29368	29374	0 %	100 %	0 %	0 %	525916966
562	NC_021837	ATGTC	2	10	29382	29391	20 %	40 %	20 %	20 %	525916966
563	NC_021837	CTT	2	6	29395	29400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525916966
564	NC_021837	ACGC	2	8	29404	29411	25 %	0 %	25 %	50 %	525916966
565	NC_021837	TCA	2	6	29454	29459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525916966
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567	NC_021837	TGTT	2	8	29527	29534	0 %	75 %	25 %	0 %	525916966
568	NC_021837	TTG	2	6	29674	29679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525916966
569	NC_021837	TG	3	6	29726	29731	0 %	50 %	50 %	0 %	525916966
570	NC_021837	ATA	2	6	29763	29768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525916966
571	NC_021837	T	6	6	29878	29883	0 %	100 %	0 %	0 %	525916967
572	NC_021837	CTTC	2	8	29904	29911	0 %	50 %	0 %	50 %	525916967
573	NC_021837	TTG	2	6	29935	29940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525916967
574	NC_021837	TGC	2	6	29990	29995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525916967
575	NC_021837	TTC	2	6	29999	30004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525916967
576	NC_021837	CTG	2	6	30100	30105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525916967
577	NC_021837	ATA	2	6	30156	30161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525916967
578	NC_021837	CAT	2	6	30164	30169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525916967
579	NC_021837	CAT	2	6	30212	30217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525916967
580	NC_021837	ACA	2	6	30261	30266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525916967
581	NC_021837	CAC	2	6	30280	30285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525916967
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583	NC_021837	CTT	2	6	30373	30378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525916967
584	NC_021837	TAA	2	6	30496	30501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525916967
585	NC_021837	AAT	2	6	30538	30543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525916967
586	NC_021837	CCA	2	6	30600	30605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525916967
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588	NC_021837	GCT	2	6	30663	30668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525916967
589	NC_021837	CTG	2	6	30676	30681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525916967
590	NC_021837	CCG	2	6	30684	30689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525916967
591	NC_021837	ACA	2	6	30699	30704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525916967
592	NC_021837	AAT	2	6	30749	30754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525916967
593	NC_021837	CTTCGA	2	12	30782	30793	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525916967
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595	NC_021837	GCAA	2	8	30909	30916	50 %	0 %	25 %	25 %	525916967
596	NC_021837	CTT	3	9	31111	31119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525916967
597	NC_021837	AAT	2	6	31123	31128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525916967
598	NC_021837	TCT	2	6	31146	31151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525916967
599	NC_021837	GCC	2	6	31160	31165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525916967
600	NC_021837	GCA	2	6	31192	31197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525916967
601	NC_021837	CG	3	6	31223	31228	0 %	0 %	50 %	50 %	525916967
602	NC_021837	CCA	2	6	31278	31283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525916967
603	NC_021837	AGTA	2	8	31329	31336	50 %	25 %	25 %	0 %	525916967
604	NC_021837	CCG	2	6	31344	31349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525916967
605	NC_021837	TTG	2	6	31376	31381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525916967
606	NC_021837	TATT	2	8	31404	31411	25 %	75 %	0 %	0 %	525916967
607	NC_021837	TCT	2	6	31428	31433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525916967
608	NC_021837	T	6	6	31463	31468	0 %	100 %	0 %	0 %	525916967
609	NC_021837	TGGA	2	8	31548	31555	25 %	25 %	50 %	0 %	525916967
610	NC_021837	GTT	2	6	31638	31643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525916967
611	NC_021837	GTT	2	6	31714	31719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525916967
612	NC_021837	GTA	2	6	31721	31726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525916967
613	NC_021837	TTC	2	6	31736	31741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525916967
614	NC_021837	TGG	2	6	31781	31786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525916967
615	NC_021837	ATA	2	6	31857	31862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525916967
616	NC_021837	A	6	6	32083	32088	100 %	0 %	0 %	0 %	525916968
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618	NC_021837	AGCCT	2	10	32141	32150	20 %	20 %	20 %	40 %	525916968
619	NC_021837	TTTA	2	8	32243	32250	25 %	75 %	0 %	0 %	525916968
620	NC_021837	TTTA	2	8	32344	32351	25 %	75 %	0 %	0 %	525916968
621	NC_021837	GC	3	6	32360	32365	0 %	0 %	50 %	50 %	525916968
622	NC_021837	T	6	6	32431	32436	0 %	100 %	0 %	0 %	525916968
623	NC_021837	ATT	2	6	32455	32460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525916968
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625	NC_021837	AACAA	2	10	32541	32550	80 %	0 %	0 %	20 %	525916968
626	NC_021837	AGTT	2	8	32552	32559	25 %	50 %	25 %	0 %	525916968
627	NC_021837	GTT	4	12	32557	32568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525916968
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