MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-031

Total Repeats: 58862

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021837	TCA	2	6	323892	323897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525917175
6002	NC_021837	CTT	2	6	323899	323904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525917175
6003	NC_021837	AAT	3	9	323954	323962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525917175
6004	NC_021837	CCT	2	6	324054	324059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525917176
6005	NC_021837	AAT	2	6	324065	324070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525917176
6006	NC_021837	CTT	2	6	324092	324097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525917176
6007	NC_021837	CTT	2	6	324183	324188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525917176
6008	NC_021837	TGC	2	6	324278	324283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525917176
6009	NC_021837	CCA	2	6	324287	324292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525917176
6010	NC_021837	CTG	2	6	324448	324453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525917176
6011	NC_021837	T	7	7	324468	324474	0 %	100 %	0 %	0 %	525917176
6012	NC_021837	TAT	2	6	324495	324500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525917176
6013	NC_021837	CAT	2	6	324522	324527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525917176
6014	NC_021837	ACCGGA	2	12	324592	324603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525917176
6015	NC_021837	AGGA	2	8	324820	324827	50 %	0 %	50 %	0 %	525917177
6016	NC_021837	T	6	6	324841	324846	0 %	100 %	0 %	0 %	525917177
6017	NC_021837	TAC	2	6	324892	324897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525917177
6018	NC_021837	T	6	6	324910	324915	0 %	100 %	0 %	0 %	525917177
6019	NC_021837	TCT	2	6	324935	324940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525917177
6020	NC_021837	GTC	2	6	324961	324966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525917177
6021	NC_021837	T	6	6	325009	325014	0 %	100 %	0 %	0 %	525917177
6022	NC_021837	CAG	2	6	325038	325043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525917177
6023	NC_021837	GTC	2	6	325060	325065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525917177
6024	NC_021837	AC	3	6	325101	325106	50 %	0 %	0 %	50 %	525917177
6025	NC_021837	TTTC	2	8	325134	325141	0 %	75 %	0 %	25 %	525917177
6026	NC_021837	CTT	2	6	325191	325196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525917177
6027	NC_021837	TCTT	2	8	325199	325206	0 %	75 %	0 %	25 %	525917177
6028	NC_021837	CTA	2	6	325239	325244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525917177
6029	NC_021837	TG	3	6	325271	325276	0 %	50 %	50 %	0 %	525917177
6030	NC_021837	CTA	2	6	325407	325412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525917177
6031	NC_021837	ATA	2	6	325418	325423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525917177
6032	NC_021837	T	6	6	325450	325455	0 %	100 %	0 %	0 %	525917177
6033	NC_021837	CAA	2	6	325657	325662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525917178
6034	NC_021837	TTTC	2	8	325675	325682	0 %	75 %	0 %	25 %	525917178
6035	NC_021837	T	6	6	325692	325697	0 %	100 %	0 %	0 %	525917178
6036	NC_021837	ATC	2	6	325718	325723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525917178
6037	NC_021837	AC	3	6	325759	325764	50 %	0 %	0 %	50 %	525917178
6038	NC_021837	TTC	2	6	325790	325795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525917178
6039	NC_021837	ATTG	2	8	325814	325821	25 %	50 %	25 %	0 %	525917178
6040	NC_021837	TCC	2	6	325823	325828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525917178
6041	NC_021837	ATC	2	6	325841	325846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525917178
6042	NC_021837	TAC	2	6	325853	325858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525917178
6043	NC_021837	T	6	6	325897	325902	0 %	100 %	0 %	0 %	525917178
6044	NC_021837	ACG	2	6	325970	325975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525917178
6045	NC_021837	T	6	6	326062	326067	0 %	100 %	0 %	0 %	525917178
6046	NC_021837	CAC	2	6	326248	326253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525917178
6047	NC_021837	CAG	2	6	326254	326259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525917178
6048	NC_021837	ATG	2	6	326313	326318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525917178
6049	NC_021837	AGA	2	6	326336	326341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525917178
6050	NC_021837	ATA	2	6	326401	326406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525917178
6051	NC_021837	CGA	2	6	326439	326444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525917178
6052	NC_021837	TAA	2	6	326633	326638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525917179
6053	NC_021837	CTT	2	6	326696	326701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525917179
6054	NC_021837	TCA	2	6	326743	326748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525917179
6055	NC_021837	TCA	2	6	326765	326770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525917179
6056	NC_021837	T	6	6	326811	326816	0 %	100 %	0 %	0 %	525917179
6057	NC_021837	ATG	2	6	326976	326981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525917179
6058	NC_021837	TCAT	2	8	327055	327062	25 %	50 %	0 %	25 %	525917179
6059	NC_021837	CAT	3	9	327116	327124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525917179
6060	NC_021837	GAA	2	6	327146	327151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525917179
6061	NC_021837	TTTC	2	8	327203	327210	0 %	75 %	0 %	25 %	525917179
6062	NC_021837	CAAAT	2	10	327225	327234	60 %	20 %	0 %	20 %	525917179
6063	NC_021837	AAG	2	6	327249	327254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525917179
6064	NC_021837	ATC	2	6	327327	327332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525917179
6065	NC_021837	AAT	2	6	327342	327347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525917179
6066	NC_021837	TCAT	2	8	327368	327375	25 %	50 %	0 %	25 %	525917180
6067	NC_021837	TAA	2	6	327376	327381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525917180
6068	NC_021837	GCC	2	6	327529	327534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525917180
6069	NC_021837	T	7	7	327583	327589	0 %	100 %	0 %	0 %	525917180
6070	NC_021837	AGC	2	6	327621	327626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525917180
6071	NC_021837	T	6	6	327668	327673	0 %	100 %	0 %	0 %	525917180
6072	NC_021837	GT	3	6	327674	327679	0 %	50 %	50 %	0 %	525917180
6073	NC_021837	CAA	2	6	327763	327768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525917180
6074	NC_021837	CCG	2	6	327826	327831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525917180
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6076	NC_021837	GCTGCA	2	12	327931	327942	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525917180
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6078	NC_021837	CTT	2	6	328026	328031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525917180
6079	NC_021837	AGG	2	6	328036	328041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525917180
6080	NC_021837	TAAAT	2	10	328051	328060	60 %	40 %	0 %	0 %	525917180
6081	NC_021837	CGA	2	6	328063	328068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525917180
6082	NC_021837	TCT	2	6	328069	328074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525917180
6083	NC_021837	TTG	2	6	328154	328159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525917180
6084	NC_021837	TCA	2	6	328160	328165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525917180
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6087	NC_021837	GGAT	2	8	328521	328528	25 %	25 %	50 %	0 %	525917181
6088	NC_021837	ACC	2	6	328572	328577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525917181
6089	NC_021837	TCAATG	2	12	328586	328597	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525917181
6090	NC_021837	ATTT	2	8	328651	328658	25 %	75 %	0 %	0 %	525917181
6091	NC_021837	A	6	6	328785	328790	100 %	0 %	0 %	0 %	525917182
6092	NC_021837	ACG	2	6	328844	328849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525917182
6093	NC_021837	TCT	2	6	328949	328954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525917182
6094	NC_021837	TTC	2	6	328991	328996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525917182
6095	NC_021837	CTT	2	6	329185	329190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525917182
6096	NC_021837	AAT	2	6	329246	329251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525917182
6097	NC_021837	CTT	2	6	329329	329334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525917182
6098	NC_021837	ACT	2	6	329364	329369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525917182
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6101	NC_021837	GC	3	6	329476	329481	0 %	0 %	50 %	50 %	525917182
6102	NC_021837	GTTT	2	8	329507	329514	0 %	75 %	25 %	0 %	525917182
6103	NC_021837	T	7	7	329587	329593	0 %	100 %	0 %	0 %	525917182
6104	NC_021837	CTT	2	6	329609	329614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525917182
6105	NC_021837	TTC	2	6	329629	329634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525917182
6106	NC_021837	TCC	2	6	329665	329670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525917183
6107	NC_021837	CTA	2	6	329693	329698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525917183
6108	NC_021837	TTC	2	6	329703	329708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525917183
6109	NC_021837	GTT	2	6	329741	329746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525917183
6110	NC_021837	T	6	6	329783	329788	0 %	100 %	0 %	0 %	525917183
6111	NC_021837	CTC	2	6	329810	329815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525917183
6112	NC_021837	AAG	2	6	329817	329822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525917183
6113	NC_021837	AAAT	2	8	329849	329856	75 %	25 %	0 %	0 %	525917183
6114	NC_021837	T	6	6	330026	330031	0 %	100 %	0 %	0 %	525917183
6115	NC_021837	ATA	2	6	330058	330063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525917183
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6117	NC_021837	T	6	6	330092	330097	0 %	100 %	0 %	0 %	525917183
6118	NC_021837	CGTCC	2	10	330176	330185	0 %	20 %	20 %	60 %	525917183
6119	NC_021837	TTC	2	6	330355	330360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525917184
6120	NC_021837	GCC	2	6	330425	330430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525917184
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