MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes J1-220

Total Repeats: 60479

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021830	TTATG	2	10	34925	34934	20 %	60 %	20 %	0 %	525735305
502	NC_021830	TTG	2	6	34952	34957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525735305
503	NC_021830	GT	3	6	34960	34965	0 %	50 %	50 %	0 %	525735305
504	NC_021830	T	6	6	35203	35208	0 %	100 %	0 %	0 %	525735305
505	NC_021830	ATG	2	6	35242	35247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525735305
506	NC_021830	CGA	2	6	35255	35260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525735305
507	NC_021830	TAT	2	6	35304	35309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525735305
508	NC_021830	TGGA	2	8	35344	35351	25 %	25 %	50 %	0 %	525735305
509	NC_021830	AAC	2	6	35433	35438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525735305
510	NC_021830	GGCT	2	8	35466	35473	0 %	25 %	50 %	25 %	525735305
511	NC_021830	ATTG	2	8	35478	35485	25 %	50 %	25 %	0 %	525735305
512	NC_021830	TTTA	2	8	35506	35513	25 %	75 %	0 %	0 %	525735305
513	NC_021830	GTG	2	6	35546	35551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525735305
514	NC_021830	TGG	2	6	35604	35609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525732823
515	NC_021830	GAT	2	6	35766	35771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732823
516	NC_021830	GGT	2	6	35772	35777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525732823
517	NC_021830	AATT	2	8	35839	35846	50 %	50 %	0 %	0 %	525732823
518	NC_021830	TGG	2	6	35887	35892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525732823
519	NC_021830	TGA	2	6	35906	35911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732823
520	NC_021830	ATT	2	6	35962	35967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732823
521	NC_021830	TAA	2	6	36002	36007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525732823
522	NC_021830	A	6	6	36087	36092	100 %	0 %	0 %	0 %	525732823
523	NC_021830	AATG	2	8	36129	36136	50 %	25 %	25 %	0 %	525732823
524	NC_021830	TGG	2	6	36153	36158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525732823
525	NC_021830	GAA	2	6	36206	36211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732823
526	NC_021830	A	6	6	36333	36338	100 %	0 %	0 %	0 %	525732823
527	NC_021830	GAA	2	6	36375	36380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732823
528	NC_021830	AAT	2	6	36515	36520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525732823
529	NC_021830	G	6	6	36553	36558	0 %	0 %	100 %	0 %	525732823
530	NC_021830	ATAA	2	8	36594	36601	75 %	25 %	0 %	0 %	525732823
531	NC_021830	GAT	2	6	36624	36629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732823
532	NC_021830	A	7	7	36636	36642	100 %	0 %	0 %	0 %	525732823
533	NC_021830	TTAT	2	8	36654	36661	25 %	75 %	0 %	0 %	525732823
534	NC_021830	GAT	2	6	36735	36740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732823
535	NC_021830	TC	3	6	36782	36787	0 %	50 %	0 %	50 %	525732823
536	NC_021830	GAA	2	6	36801	36806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732823
537	NC_021830	GTA	2	6	36829	36834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732823
538	NC_021830	AAT	2	6	36864	36869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525732823
539	NC_021830	GAT	2	6	36960	36965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732823
540	NC_021830	AAG	2	6	37004	37009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732823
541	NC_021830	AAG	2	6	37027	37032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732823
542	NC_021830	TGA	2	6	37070	37075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732823
543	NC_021830	ATC	2	6	37119	37124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525732823
544	NC_021830	TTCTGA	2	12	37133	37144	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525732823
545	NC_021830	GAA	2	6	37338	37343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525735306
546	NC_021830	TCCA	2	8	37409	37416	25 %	25 %	0 %	50 %	525735306
547	NC_021830	ACA	2	6	37449	37454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525735306
548	NC_021830	AAT	2	6	37481	37486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525735306
549	NC_021830	TAT	2	6	37506	37511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525735306
550	NC_021830	CTT	2	6	37556	37561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525735306
551	NC_021830	A	6	6	37572	37577	100 %	0 %	0 %	0 %	525735306
552	NC_021830	TTTC	2	8	37625	37632	0 %	75 %	0 %	25 %	525735306
553	NC_021830	ATTTA	2	10	37663	37672	40 %	60 %	0 %	0 %	525735306
554	NC_021830	AAG	2	6	37699	37704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525735306
555	NC_021830	GAA	2	6	37752	37757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525735306
556	NC_021830	A	6	6	37814	37819	100 %	0 %	0 %	0 %	525735306
557	NC_021830	GTT	2	6	37834	37839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525735306
558	NC_021830	A	6	6	37875	37880	100 %	0 %	0 %	0 %	525735306
559	NC_021830	T	7	7	37895	37901	0 %	100 %	0 %	0 %	525735306
560	NC_021830	ATT	2	6	37967	37972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525735306
561	NC_021830	ATT	2	6	37990	37995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525735306
562	NC_021830	ATT	2	6	38023	38028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525735306
563	NC_021830	TA	3	6	38071	38076	50 %	50 %	0 %	0 %	525735306
564	NC_021830	TAC	2	6	38132	38137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525735306
565	NC_021830	ATG	2	6	38149	38154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525735306
566	NC_021830	TTA	2	6	38181	38186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525735306
567	NC_021830	CAG	2	6	38212	38217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525735306
568	NC_021830	AT	3	6	38250	38255	50 %	50 %	0 %	0 %	525735306
569	NC_021830	ATA	2	6	38269	38274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525735306
570	NC_021830	TAT	2	6	38304	38309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525735306
571	NC_021830	GAT	2	6	38325	38330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525735306
572	NC_021830	TAT	2	6	38388	38393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525735306
573	NC_021830	AAG	2	6	38443	38448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525735306
574	NC_021830	TAC	2	6	38469	38474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525735306
575	NC_021830	GTT	2	6	38511	38516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525735306
576	NC_021830	GGAA	2	8	38570	38577	50 %	0 %	50 %	0 %	525735306
577	NC_021830	TTA	2	6	38614	38619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525735306
578	NC_021830	ACAAA	2	10	38629	38638	80 %	0 %	0 %	20 %	525735306
579	NC_021830	GAAA	2	8	38700	38707	75 %	0 %	25 %	0 %	525735306
580	NC_021830	TTTAA	2	10	38711	38720	40 %	60 %	0 %	0 %	525735306
581	NC_021830	TAT	3	9	38796	38804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525735307
582	NC_021830	T	7	7	38829	38835	0 %	100 %	0 %	0 %	525735307
583	NC_021830	TAT	2	6	38841	38846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525735307
584	NC_021830	AGA	2	6	38899	38904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525735307
585	NC_021830	ATT	2	6	38976	38981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525735307
586	NC_021830	CTTT	2	8	39012	39019	0 %	75 %	0 %	25 %	525735307
587	NC_021830	ATG	2	6	39296	39301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732824
588	NC_021830	CTT	2	6	39389	39394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525732824
589	NC_021830	AGA	2	6	39519	39524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732824
590	NC_021830	CAA	2	6	39582	39587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525732824
591	NC_021830	AAG	2	6	39611	39616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732824
592	NC_021830	ATT	2	6	39661	39666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732824
593	NC_021830	GTTC	2	8	39700	39707	0 %	50 %	25 %	25 %	525732824
594	NC_021830	A	6	6	39748	39753	100 %	0 %	0 %	0 %	525732824
595	NC_021830	GCTTG	2	10	39787	39796	0 %	40 %	40 %	20 %	525732824
596	NC_021830	ATT	2	6	39904	39909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732824
597	NC_021830	ACT	2	6	39929	39934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525732824
598	NC_021830	ACA	2	6	39956	39961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525732824
599	NC_021830	CAA	2	6	40110	40115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525732824
600	NC_021830	A	6	6	40114	40119	100 %	0 %	0 %	0 %	525732824
601	NC_021830	TCG	2	6	40218	40223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732824
602	NC_021830	ATT	2	6	40237	40242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732824
603	NC_021830	ATG	2	6	40343	40348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732824
604	NC_021830	AAGAAA	2	12	40349	40360	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525732824
605	NC_021830	CAT	2	6	40365	40370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525732824
606	NC_021830	GAA	2	6	40387	40392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732824
607	NC_021830	ATT	2	6	40420	40425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732824
608	NC_021830	CTT	2	6	40440	40445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525732824
609	NC_021830	TCG	2	6	40497	40502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732824
610	NC_021830	CAA	2	6	40615	40620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525732824
611	NC_021830	AGT	2	6	40638	40643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732824
612	NC_021830	CAAA	2	8	40696	40703	75 %	0 %	0 %	25 %	525732824
613	NC_021830	CGT	2	6	40729	40734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732824
614	NC_021830	TGG	2	6	40752	40757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525732824
615	NC_021830	ACGTG	2	10	40788	40797	20 %	20 %	40 %	20 %	525732824
616	NC_021830	TTC	2	6	40872	40877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525732824
617	NC_021830	TAAA	2	8	40889	40896	75 %	25 %	0 %	0 %	525732824
618	NC_021830	CCG	2	6	40920	40925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525732824
619	NC_021830	AAAC	2	8	40937	40944	75 %	0 %	0 %	25 %	525732824
620	NC_021830	GATT	2	8	40959	40966	25 %	50 %	25 %	0 %	525732824
621	NC_021830	GTA	2	6	40996	41001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732824
622	NC_021830	AGA	3	9	41043	41051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732824
623	NC_021830	GAT	2	6	41173	41178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732824
624	NC_021830	TTG	2	6	41249	41254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525732824
625	NC_021830	TGC	2	6	41292	41297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732824
626	NC_021830	TCG	2	6	41355	41360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732824
627	NC_021830	AAG	2	6	41381	41386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732824
628	NC_021830	GTTC	2	8	41425	41432	0 %	50 %	25 %	25 %	525732824
629	NC_021830	GTT	2	6	41485	41490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525732824
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661	NC_021830	A	7	7	43527	43533	100 %	0 %	0 %	0 %	525732825
662	NC_021830	AGA	2	6	43577	43582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732825
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746	NC_021830	GAT	2	6	48077	48082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732827
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750	NC_021830	CGA	3	9	48211	48219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525732827
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752	NC_021830	GTC	2	6	48349	48354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732827
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