MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes J1816

Total Repeats: 55189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021829	CAAC	2	8	156243	156250	50 %	0 %	0 %	50 %	525721390
3002	NC_021829	TTC	2	6	156590	156595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721391
3003	NC_021829	ATT	2	6	156615	156620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721391
3004	NC_021829	GAC	2	6	156641	156646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721391
3005	NC_021829	CTT	2	6	156652	156657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721391
3006	NC_021829	TAA	2	6	156713	156718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721391
3007	NC_021829	A	7	7	156717	156723	100 %	0 %	0 %	0 %	525721391
3008	NC_021829	TCT	2	6	156735	156740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721391
3009	NC_021829	T	6	6	156758	156763	0 %	100 %	0 %	0 %	525721391
3010	NC_021829	T	7	7	156841	156847	0 %	100 %	0 %	0 %	525721392
3011	NC_021829	T	6	6	156886	156891	0 %	100 %	0 %	0 %	525721392
3012	NC_021829	TAA	2	6	156917	156922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721392
3013	NC_021829	TTC	2	6	156929	156934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721392
3014	NC_021829	TTC	2	6	156971	156976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721392
3015	NC_021829	TCT	2	6	156987	156992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721392
3016	NC_021829	T	6	6	156994	156999	0 %	100 %	0 %	0 %	525721392
3017	NC_021829	TAT	2	6	157015	157020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721392
3018	NC_021829	GCT	2	6	157022	157027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721392
3019	NC_021829	T	6	6	157069	157074	0 %	100 %	0 %	0 %	525721392
3020	NC_021829	CAG	2	6	157192	157197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721392
3021	NC_021829	GTG	2	6	157262	157267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525721392
3022	NC_021829	TTTCTC	2	12	157315	157326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721392
3023	NC_021829	ATT	2	6	157397	157402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721392
3024	NC_021829	CGC	2	6	157468	157473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525721392
3025	NC_021829	TGC	2	6	157508	157513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721392
3026	NC_021829	TAC	2	6	157534	157539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721392
3027	NC_021829	CCAT	2	8	157554	157561	25 %	25 %	0 %	50 %	525721392
3028	NC_021829	TTTC	2	8	157567	157574	0 %	75 %	0 %	25 %	525721392
3029	NC_021829	TGTA	2	8	157579	157586	25 %	50 %	25 %	0 %	525721392
3030	NC_021829	TGCG	2	8	157619	157626	0 %	25 %	50 %	25 %	525721392
3031	NC_021829	GT	3	6	157628	157633	0 %	50 %	50 %	0 %	525721392
3032	NC_021829	AGC	2	6	157638	157643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721392
3033	NC_021829	CTT	2	6	157666	157671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721392
3034	NC_021829	TCA	2	6	157692	157697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721392
3035	NC_021829	ATCA	2	8	157712	157719	50 %	25 %	0 %	25 %	525721392
3036	NC_021829	TCT	2	6	157734	157739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721392
3037	NC_021829	A	6	6	157775	157780	100 %	0 %	0 %	0 %	525721392
3038	NC_021829	T	6	6	157804	157809	0 %	100 %	0 %	0 %	525721392
3039	NC_021829	A	6	6	158042	158047	100 %	0 %	0 %	0 %	525721393
3040	NC_021829	CTT	2	6	158051	158056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721393
3041	NC_021829	GAA	2	6	158124	158129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721393
3042	NC_021829	TCT	2	6	158137	158142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721393
3043	NC_021829	TTC	2	6	158143	158148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721393
3044	NC_021829	CTG	2	6	158156	158161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721393
3045	NC_021829	CTT	2	6	158162	158167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721393
3046	NC_021829	ACC	2	6	158223	158228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525721393
3047	NC_021829	CCATTA	2	12	158251	158262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721393
3048	NC_021829	TCA	2	6	158275	158280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721393
3049	NC_021829	ATTT	2	8	158288	158295	25 %	75 %	0 %	0 %	525721393
3050	NC_021829	TGCT	2	8	158611	158618	0 %	50 %	25 %	25 %	525721394
3051	NC_021829	CTT	2	6	158656	158661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721394
3052	NC_021829	TTG	2	6	158681	158686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721394
3053	NC_021829	CTT	2	6	158767	158772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721394
3054	NC_021829	CCG	2	6	158820	158825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525721394
3055	NC_021829	TA	3	6	158875	158880	50 %	50 %	0 %	0 %	525721394
3056	NC_021829	ATC	2	6	158882	158887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721394
3057	NC_021829	T	6	6	158890	158895	0 %	100 %	0 %	0 %	525721394
3058	NC_021829	GAA	2	6	158906	158911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721394
3059	NC_021829	TGA	2	6	158940	158945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721394
3060	NC_021829	ATT	2	6	159235	159240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721395
3061	NC_021829	TC	3	6	159281	159286	0 %	50 %	0 %	50 %	525721395
3062	NC_021829	ACC	2	6	159289	159294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525721395
3063	NC_021829	A	7	7	159363	159369	100 %	0 %	0 %	0 %	525721395
3064	NC_021829	ATA	2	6	159415	159420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721395
3065	NC_021829	A	6	6	159424	159429	100 %	0 %	0 %	0 %	525721395
3066	NC_021829	AGA	2	6	159440	159445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721395
3067	NC_021829	CTA	2	6	159490	159495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721395
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3069	NC_021829	A	7	7	159517	159523	100 %	0 %	0 %	0 %	525721395
3070	NC_021829	TGA	2	6	159596	159601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721395
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3072	NC_021829	TGG	2	6	159632	159637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525721395
3073	NC_021829	CGGA	2	8	159661	159668	25 %	0 %	50 %	25 %	525721395
3074	NC_021829	TTCGG	2	10	159674	159683	0 %	40 %	40 %	20 %	525721395
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3077	NC_021829	TAATA	2	10	159821	159830	60 %	40 %	0 %	0 %	525721395
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3081	NC_021829	ATT	2	6	159964	159969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721395
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3083	NC_021829	AATG	2	8	160034	160041	50 %	25 %	25 %	0 %	525721395
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3086	NC_021829	ATA	2	6	160096	160101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721395
3087	NC_021829	T	6	6	160119	160124	0 %	100 %	0 %	0 %	525721395
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3091	NC_021829	TGA	2	6	160267	160272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721395
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3093	NC_021829	ATG	2	6	160408	160413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721395
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3095	NC_021829	TTA	2	6	160486	160491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721395
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3102	NC_021829	ATTA	2	8	160682	160689	50 %	50 %	0 %	0 %	525721395
3103	NC_021829	GAA	2	6	160773	160778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721395
3104	NC_021829	AG	3	6	160805	160810	50 %	0 %	50 %	0 %	525721395
3105	NC_021829	AAGAAC	2	12	160819	160830	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525721395
3106	NC_021829	GAAA	2	8	160979	160986	75 %	0 %	25 %	0 %	525721395
3107	NC_021829	AGG	2	6	161032	161037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525721395
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3109	NC_021829	A	6	6	161097	161102	100 %	0 %	0 %	0 %	525721396
3110	NC_021829	ATT	2	6	161120	161125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721396
3111	NC_021829	GAT	2	6	161153	161158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721396
3112	NC_021829	TTGA	2	8	161180	161187	25 %	50 %	25 %	0 %	525721396
3113	NC_021829	A	6	6	161246	161251	100 %	0 %	0 %	0 %	525721396
3114	NC_021829	T	6	6	161295	161300	0 %	100 %	0 %	0 %	525721396
3115	NC_021829	TGA	2	6	161338	161343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721396
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3118	NC_021829	A	6	6	161489	161494	100 %	0 %	0 %	0 %	525721396
3119	NC_021829	GAAA	2	8	161540	161547	75 %	0 %	25 %	0 %	525721396
3120	NC_021829	ATT	3	9	161559	161567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721396
3121	NC_021829	ATT	2	6	161612	161617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721396
3122	NC_021829	AAC	2	6	161625	161630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721396
3123	NC_021829	A	6	6	161697	161702	100 %	0 %	0 %	0 %	525721396
3124	NC_021829	TAC	2	6	161757	161762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721396
3125	NC_021829	CAC	2	6	161763	161768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525721396
3126	NC_021829	TGAT	2	8	161826	161833	25 %	50 %	25 %	0 %	525721396
3127	NC_021829	GGT	2	6	161864	161869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525721396
3128	NC_021829	AGC	2	6	161893	161898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721396
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3132	NC_021829	GAC	2	6	162258	162263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721397
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3134	NC_021829	TAT	2	6	162301	162306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721397
3135	NC_021829	TA	3	6	162418	162423	50 %	50 %	0 %	0 %	525721397
3136	NC_021829	ATA	2	6	162425	162430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721397
3137	NC_021829	TAT	2	6	162444	162449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721397
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3140	NC_021829	A	6	6	162602	162607	100 %	0 %	0 %	0 %	525721397
3141	NC_021829	AGA	2	6	162630	162635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721397
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3144	NC_021829	TA	3	6	162836	162841	50 %	50 %	0 %	0 %	525721397
3145	NC_021829	AGG	2	6	162855	162860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525721397
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3148	NC_021829	CTG	2	6	162983	162988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721398
3149	NC_021829	TAT	2	6	163119	163124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721398
3150	NC_021829	GGAT	2	8	163127	163134	25 %	25 %	50 %	0 %	525721398
3151	NC_021829	TAA	3	9	163164	163172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721398
3152	NC_021829	TCGC	2	8	163188	163195	0 %	25 %	25 %	50 %	525721398
3153	NC_021829	TGA	2	6	163260	163265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721398
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3155	NC_021829	ATT	2	6	163423	163428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721399
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3162	NC_021829	TCG	2	6	163743	163748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721400
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3194	NC_021829	CA	3	6	165465	165470	50 %	0 %	0 %	50 %	525721402
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3198	NC_021829	CCA	2	6	165630	165635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525721402
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3200	NC_021829	AAG	2	6	165729	165734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721402
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3202	NC_021829	CTT	2	6	165780	165785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721402
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3224	NC_021829	A	6	6	167015	167020	100 %	0 %	0 %	0 %	525723691
3225	NC_021829	GCT	2	6	167097	167102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525723691
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3230	NC_021829	CTC	2	6	167281	167286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525723691
3231	NC_021829	CGG	2	6	167315	167320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525723691
3232	NC_021829	CTC	3	9	167323	167331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525723691
3233	NC_021829	AAT	2	6	167337	167342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723691
3234	NC_021829	CTC	2	6	167347	167352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525723691
3235	NC_021829	CGG	3	9	167381	167389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525723691
3236	NC_021829	TAT	2	6	167504	167509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723691
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3238	NC_021829	TAT	2	6	167655	167660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723691
3239	NC_021829	CTG	2	6	167764	167769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525723691
3240	NC_021829	TGC	2	6	167807	167812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525723691
3241	NC_021829	TGC	2	6	167846	167851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525723691
3242	NC_021829	TAT	2	6	167864	167869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723691
3243	NC_021829	TGG	2	6	167981	167986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525723691
3244	NC_021829	GTG	3	9	168031	168039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525723691
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3473	NC_021829	TA	3	6	179150	179155	50 %	50 %	0 %	0 %	525721413
3474	NC_021829	CCAAAT	2	12	179199	179210	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525721413
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3483	NC_021829	T	6	6	179632	179637	0 %	100 %	0 %	0 %	525721414
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3491	NC_021829	CTA	2	6	179896	179901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721414
3492	NC_021829	TAC	2	6	179941	179946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721414
3493	NC_021829	ATA	2	6	179968	179973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721414
3494	NC_021829	ATA	2	6	179985	179990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721414
3495	NC_021829	ACGA	2	8	180050	180057	50 %	0 %	25 %	25 %	525721414
3496	NC_021829	CAA	2	6	180109	180114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721414
3497	NC_021829	ATTT	2	8	180127	180134	25 %	75 %	0 %	0 %	525721414
3498	NC_021829	AATA	2	8	180191	180198	75 %	25 %	0 %	0 %	525721414
3499	NC_021829	TCAA	2	8	180225	180232	50 %	25 %	0 %	25 %	525721414
3500	NC_021829	GGA	2	6	180259	180264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525721414

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